Non invasive di visualizzazione 3D con sub-micron Risoluzione Utilizzando sincrotrone a raggi-X, la tomografia

Hello.My nome è Michelle Ov del Bats Lab dell'Università del Tubing, e in questa presentazione voglio parlare della visualizzazione tridimensionale non invasiva dell'organizzazione interna dei micro AHR utilizzando la tomografia a raggi X di sincrotrone con una risoluzione submicronica. Il sistema modello con cui stiamo lavorando è l'acaro orbitato Aus Long osis, un micro COLYER AHR con una potenza di 800 micron a un millimetro di dimensioni corporee. Questa è un'immagine presa da tutte le colture di laboratorio dove si possono vedere gli animali che si nutrono di alghe.

Per studiare l'organizzazione interna di Argos, utilizziamo la radiazione a raggi X di sincrotrone per produrre dati VOX tomografici presso l'SRF e Grable. Qui si vede un'immagine dell'ESRF con il grande anello di stoccaggio e nell'angolo in alto a destra si vede la sala sperimentale dell'ID 19, che si trova all'esterno dell'anello Per le misurazioni, i campioni sono stati puntati a destra e montati su perni di plastica utilizzando una super colla. Gli esperimenti sono stati condotti a 20,5 KEV e sono state effettuate 1.500 proiezioni per le ricostruzioni.

Qui vedete la fotocamera con un chip CCD co-freelance, gamma dinamica a 14 bit e quattro megapixel. Il simulatore mostrato nella parte inferiore di questa immagine traduce i raggi X in luce visibile. Questo è un primo piano sul portacampione e sulla tavola rotante.

Il campione è montato sulla testa del misuratore Goya per consentire un corretto orientamento del campione nel raggio. Una descrizione dettagliata della configurazione sperimentale è fornita nel nostro articolo del 2007 sul Journal of Microscopy. In questa presentazione, mi concentrerò sugli analizzatori di dati per quanto riguarda la visualizzazione tridimensionale utilizzando il software Fiji Studio Max.

Innanzitutto, ti mostrerò come rimuovere i valori di grigio dallo sfondo per estrarre le informazioni del campione. Nell'istogramma si vede un grande picco, che appartiene principalmente ai valori di grigio dello sfondo. Dopo aver rimosso questo picco dall'istogramma, è possibile vedere il campione che esce dal cubo grigio.

Successivamente, ti mostrerò come ruotare l'oggetto utilizzando il key framer VG studio. Max ha una serie di traiettorie della telecamera predefinite. Qui uso il cerchio XY per generare la rotazione attorno alle X verticali, e questa è l'animazione finale.

La grande struttura sul retro dell'animale corrisponde alla superficie della super colla. Ora ti mostrerò come impostare un piano di taglio virtuale per poter avere uno sguardo tridimensionale nell'organizzazione interna del campione. Ci sono tre orientamenti in cui un piano di taglio può essere impostato frontalmente zelo reale.

Qui uso il piano frontale e trovo una posizione di taglio da qualche parte nel mezzo dell'animale, nella regione del, questo piano di taglio non deve essere statico. Anche in questo caso, utilizzando il key framer, può essere spostato lungo qualsiasi asse. In questo esempio, utilizzo la clip preimpostata Z per spostare il piano di taglio lungo un asse longitudinale del campione, ed è così che appare l'animazione finale passo dopo passo, puoi vedere e seguire l'organizzazione 3D di tutte le strutture interne con una risoluzione P di soli 0,7 micron.

Oltre alle traiettorie predefinite della telecamera, è anche possibile generare percorsi della telecamera specifici per l'utente. Per fare ciò, scegli la modalità di visualizzazione della fotocamera gratuita e regola la fotocamera e la distanza focale dell'obiettivo virtuale in qualsiasi posizione desiderata. Passo dopo passo, è possibile definire nuove posizioni della telecamera per seguire un percorso individuale di qualsiasi complessità.

La finestra 3D in alto a sinistra mostra l'effetto di tutte le impostazioni della fotocamera in tempo reale. L'ultimo esempio ti porta in un volo virtuale seguendo l'intero sistema digestivo attraverso l'animale. Qui si vedono alcune parti della gma, la miniera di carbone, il labrum e la rotella.

Ci stiamo avvicinando ed entriamo nella bocca dell'animale. Qui puoi vedere i PHN sul lato dorsale. Ora stiamo passando attraverso l'esofago per entrare nei ventricoli.

I nostri acari rivettati hanno due grandi ker. Si tratta di strutture simili con funzione digestiva. Entriamo nel punto giusto.

Attraverso la sua piccola apertura, è possibile vedere numerose celle IDE. Questi svolgono un ruolo importante nella digestione, anche se la funzione e il meccanismo completi non sono ancora completamente compresi. Tornando ai ventricoli, vediamo una struttura particolare, la valvola Isal attraverso la quale siamo effettivamente entrati nei ventricolari un minuto fa, proprio al confine tra i ventricolari e il colon.

Si può vedere un toro alimentare, che è compattato e circondato da una membrana atrofica. Dietro il bolo alimentare, si vede una tavolozza fecale. Stiamo volando attraverso questa tavolozza FE in questo momento.

Successivamente, abbiamo superato il breve punto e virgola e siamo entrati nel post colon. Qui si vede il grande e caratteristico microbicamente. Infine, qui puoi vedere la superficie interna dei particolari piatti di animali, proprio come una tavolozza fe.

Lasciamo l'apparato digerente. Ora diamo un breve sguardo finale al lato ventrale esterno dell'animale e vediamo le placche di un animale, le placche AAL e le placche genitali.