微生物タンパク質および特殊代謝産物データの分析にオープンソースのMALDI TOF-MS IDBacパイプラインを使用
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09:29 分
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2019年5月15日
2019年5月15日
•IDBacは、細菌コロニーから掻き取られた細胞材料に収集された、無傷のタンパク質と特殊な代謝スペクトルの両方からのデータを統合するオープンソースの質量分析ベースのバイオインフォマティクスパイプラインです。このパイプラインにより、研究者は数百から数千の細菌コロニーを種置分類群に迅速に組織し、特殊な代謝産物生産に基づいてそれらをさらに区別することができます。
Chapters in this video
0:04
Title
1:10
Preparation of MALDI Target Plates and Data Acquisition
2:02
Installing the IDBac Software and Starting with Raw Data
2:47
Work with Previous Experiments
3:22
Setting up Protein Data Analysis and Creating Mirror Plots
4:07
Clustering Samples Using Protein Data
4:49
Customizing the Protein Dendrogram and Inserting Samples from a Separate Experiment into the Dendrogram
5:32
Analyzing Specialized Metabolite Data and Metabolite Association Networks (MANs)
6:51
Results: Analysis of Microbial Protein and Specialized Metabolite Data by IDBac
8:28
Conclusion
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