Summary
Den roterende utøve kvantifisering System (REQS) kan indusere øvelse i Drosophila melanogaster gjennom rotasjon mens du samtidig måler mengden aktivitet utført av dyrene. Her presenterer vi en punkt-til-punkt-protokoll detaljering Hvordan måle aktivitetsnivå dyr opplever roterende øvelse behandlinger bruker REQS.
Abstract
Drosophila melanogaster er en ny modell organisme for studier i øvelsen biologi. Hittil har to viktigste trening systemer, har Power Tower og Treadwheel blitt beskrevet. Men har en metode for å måle mengden av flere dyr aktivitet indusert gjennom trening behandling manglet. Den roterende utøve kvantifisering System (REQS) fyller dette behovet, gir et mål på dyr aktivitet for dyr opplever roterende øvelse. Denne protokollen detaljer hvordan du bruker REQS for å vurdere dyr aktivitet under roterende trening og illustrerer hvilken datatype som kan genereres. Her viser vi hvordan REQS brukes til å måle sex - og belastning-spesifikk forskjellene i indusert treningsaktivitet. REQS kan også brukes til å evaluere virkningen av ulike andre eksperimentelle parametere som alder, diett eller befolkningen størrelse på indusert treningsaktivitet. I tillegg kan det brukes til å sammenligne effekten av ulike trening protokoller. Viktigere, gir det en mulighet til å standardisere øvelse behandlinger mellom stammer, slik at forskeren å oppnå like mye aktivitet mellom grupper hvis nødvendig. Dermed REQS er en bemerkelsesverdig ny ressurs for trening biologer arbeider med systemet Drosophila modell og utfyller eksisterende trening systemer.
Introduction
Forskere har nylig begynt å bruke frukt fly Drosophila melanogaster for å studere øvelse biologi. D. melanogaster har vært et genetisk modellsystem for over 100 år1,2. Drosophila forskning har imidlertid gjort bidrag til ikke bare genetikk, men også en rekke andre disipliner inkludert neurobiology, atferdsmessige biologi og fysiologi3. I 2009, makt tårnet, var den første treningsapparatet for Drosophila beskrevet4. Power tårnet utnytter dyrenes negative geotaxis svar. Når forstyrret, Drosophila pleier å flytte til toppen av sitt kabinett. Dette svaret er godt etablert og er grunnlaget for populære "RING" (rask iterativ Negative Geotaxis5) analysen som brukes til å anslå klatring evne og/eller fysisk trening i Drosophila. Power Tower bruker en mekanisk arm koblet til en motor enhet å gjentatte ganger løfte et sett med dyr i sine skap med flere inches og slippe dem tilbake i bakken for å indusere negative geotaxis svaret (Tinkerhess et al. 20126 gi en video som illustrerer bruken av makt tårnet). Langvarig behandling på makt tårnet dermed øker mengden av fysisk aktivitet (kjører eller flyr) dyrene utfører i forhold til ubehandlet kontrollen dyr og over tid fører til forbedret ytelse i RINGEN analysen for fysisk trening4. Derfor vist denne arbeid muligheten for med Drosophila som modell for trening biologi.
For å utvide repertoaret av verktøy tilgjengelig for Drosophila øvelse forskning, i 2016, beskrevet Mendez og kolleger en andre Drosophila treningsapparatet, Treadwheel7. Ligner Power Tower, Treadwheel utnytter negative geotaxis svar Drosophila. Men er dette svaret indusert av fortsatt rotasjon av dyr vedleggene, snarere enn ved å løfte og slippe dem i kraft tårnet. Denne induksjon metoden er skånsom og gir en mer utholdenhet orientert øvelse regime som unngår noen fysiske traumer som kan oppstå under øvelsen i kraft tårnet (se Katzenberger, R. J. et al. 20138 for virkningen av gjentatte fysiske Trauma på Drosophila helse). Lignende til Power Tower4, trening behandling av dyr på Treadwheel fører til en rekke fysiologiske responser, inkludert endringer i fysisk form, triglyseridnivåer og kroppen vekt7. Dermed er to utfyllende metoder tilgjengelig for Drosophila Biologer studerer øvelse.
En begrensning Power Tower og Treadwheel er manglende evne til å måle hvor mye aktivitet av trening behandling. Analyse av video-opptak tatt fra Treadwheel viste at det var betydelige forskjeller mellom de ulike Drosophila stammene i hvordan de reagerer på trening behandling7. Spesielt stammene studerte skilte seg i hvor mye ekstra aktivitet dyrene utført når stimulert7. Denne observasjonen bedt oss å utvikle en tredje øvelsessystem, den roterende utøve kvantifisering System (REQS), som tillater oss å måle dyr aktivitet under rotasjon-indusert øvelse9. REQS benytter en kommersielt tilgjengelig aktivitet overvåking enhet som er installert på en roterende arm å stimulere trening gjennom rotasjon som Treadwheel. Innledende arbeid med REQS bekrefter at genetisk forskjellig Drosophila stammer-kjønn - kan ha betydelig forskjellige svar til roterende stimulering og dermed mengden av trening indusert er ikke identiske blant ulike genotyper9 . Dermed kan REQS nå Drosophila biologer å måle mengden av trening indusert av behandlingen, åpne en rekke nye forskning muligheter innen trening.
Her beskrive vi i detalj hvordan du bruker REQS for kvantifisering av roterende øvelse. REQS induserer roterende trening og måler samtidig aktivitetsnivåer av dyr blir behandlet. REQS er kjøpedyktig en mengde treningsprogrammer, varierer fra enkle 2t vedvarende trening regimet demonstrert her til mer komplekse intervall treningsmetoder som beskrevet av Mendez og kolleger7og stimulering kan justeres via Rotasjonshastighet (mellom ca 1-13 rotasjoner per min). Avhengig av aktiviteten skjermen enheten brukes til å produsere REQS, er denne metoden tilpasningsdyktig til analyse av enkelt fluer eller store bestander av dyr. På grunn av denne allsidigheten gir REQS Drosophila forskere med en rekke muligheter til å studere, for eksempel, ulike trening regimer, kosthold tiltak eller virkningen av befolkningstetthet.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
REQS består av en Drosophila Activity Monitor (for informasjon, vennligst se Tabellen for materiale) montert på en roterende arm som kontrolleres av en motor enhet (figur 1). Aktivitetsmonitor bestemmer hvor ofte i et gitt tidsrom utvalg av laserstråler dissekere midten av analysen røret blir forstyrret. For detaljerte tegninger og en detaljert karakterisering, se vår forrige publikasjonen9. Mens systemet bruker til LAM25H, kan REQS endres til andre Drosophila Activity Monitor enheter også.
1. testing oppsettet av REQS
- Last test flyr inn prøven BILLEDRØR anesthetizing dyrene med CO2 eller andre valgte metoden for håndtering, flytte dem inn i Tom rørene og capping rørene.
- Sett avkortet glass prøven rør inn i sporene av skjermen aktivitet. Sikre rørene ved hjelp gummi o-ringer (17-18 gauge) og/eller gummi band på begge sider av enheten å sikre rørene flytte ikke under rotasjon:
- Ta en O-ring over prøven røret og plasser O-ring nær midtpunktet av røret. Sett inn prøven røret i et spor av Aktivitetsmonitor forfra og Sentrer det.
- Flytt O-ring behov og sikre at når prøven røret er sentrert, vil o-ringen er gled så nær aktivitet skjermen enheten som mulig. Fastsette prøven røret på plass ved å stikke en andre O-ring over glassrør på baksiden, igjen flytte O-ring så nær aktivitet skjermen enheten som mulig.
- Starte rotasjon av REQS ved å bla strømbryteren på forsiden av enheten. Justere rotasjonshastigheten med skiven på forsiden av enheten til ønsket hastighet (4 rpm (rotasjoner per min) i dette eksemplet).
Merk: Rotasjonshastighet i dette eksemplet ble valgt å matche en tidligere publisert studie7. Som ulike rotasjonshastighet vil resultere i forskjellige dyr aktivitetsnivå, under initiering av en ny studie, kan optimalisering av rotasjonshastighet for den bestemte eksperimentelle set-up (genotype, lengden på trening bout, osv.) være nødvendig.
Merk: Det er viktig å sikre at rørene er riktig plassert slik at de ikke dra langs bunnen av REQS enheten under rotasjon. - Teste tilkoblingen til dataene samling systemet Drosophila Aktivitetsmonitor-enheten ved å åpne programmet DAMSystem308 og sikrer at tilkoblingen lyset forblir grønt for flere rotasjoner. Programvaren vil starte registrering av data til en tekstfil "monitorX" (X er hvor enheten hvis flere skjermer brukes) umiddelbart etter innvielsen. Innspillingen frekvensen kan justeres i kategorien "Preferences". vi vanligvis registrere i 5 min intervaller.
- Undersøke tekstfilen generert av DAMSystem308 å sikre at datatilkoblingen fungerer. Problemer med tilkoblingen føre utstansing tidspunkt der 0 aktivitet er registrert for alle stillinger i REQS (se Representant resultater og tabell 2). Hvis utklipp oppstår, endre datatilkoblingene fører til roterende telefonkontakten, som under rotasjon, denne tilkoblingen kan bli løs eller vridd. Vi finner at stabilisere tilkoblingen med tape bidrar til å forhindre at dette problemet.
2. forberedelse av dyr
Merk: Alle dyrene ble reist og testet under standard betingelser i en inkubator (25 ° C, 60-70% fuktighet, 12t lys/mørke syklus) på sirup/cornmeal media10.
- To uker før planlagt eksperimentet, definere ampuller med kontrollert dyr tetthet samle eksperimentelle fluene fra; vi vanligvis satt opp ampuller med 7 menn og 10 kvinner. Med en sunn lager, fra enkelt ampuller, kan ca 15 jomfru menn og 15 kvinner samles over en 4 dagers periode. Justere antall ampuller satt opp basert på antall dyr nødvendig for analysen; en typisk analysen i vårt laboratorium inneholder 10 sett med 10 virgin menn og kvinner per anleggspreg (100 menn og 100 kvinner).
Merk: Ikke-virgin fluer kan brukes avhengig av spesifikke eksperimentelle spørsmål. Hvis gjennomføre langsiktige eksperimenter med ikke-virgin dyr, kan gjennomgang Larvene forstyrre nøyaktig aktivitet avlytting. - Fjern de overordnede flyr en uke etter å sette opp hetteglass.
- Starter på dag 10 etter hetteglass, samle jomfru flyr fra hetteglass og lagre dem med sex.
- Samle nok dyr for eksperimentet og alder dem som trengte, 3 dager i dette eksemplet.
Merk: Vi vanligvis bedøve dyrene med CO2 for håndtering. CO2 er kjent for å påvirke dyr aktivitetsnivå for lengre perioder etter behandling (for eksempel se Bartholomew et al. 201511). Hvis CO2 effekten gjør planlagte nedstrøms analyser eller analyser, bruke en annen anestesi metode som isen anesthetization.
3. datainnsamlingen med REQS
- Bedøve dyrene skal brukes for trening kvantifisering studier med CO2 eller en annen anestesi metode. Dele dem inn i grupper etter behov og laste inn gruppene av dyr i tomt glass rør av skjermen aktivitet i dette eksemplet er 10 dyr på samme alder lastet per glassrør med 10 gjentak for hver dyr (sex/anleggspreg). Gjøre Husk hvilken dyr lastes i hver retning.
Merk: For lengre eksperimenter, mat kan bli inkludert i prøven rørene. I dette tilfellet er det viktig at maten er sikker og ikke skulle løsne under rotasjon. - Last analysen BILLEDRØR i REQS enheten og sikre dem med gummi o-ringer. Hvis arbeider med flere sex/anleggspreg, vil bruker en randomisert blokk design eller tilfeldiggjøring av plasseringen av dyrene i REQS eliminere potensielle posisjon påvirkninger. Randomisering kan oppnås ved å tilordne hvert hetteglass et tilfeldig tall, for eksempel fra en web-basert tilfeldig tall generator (f.eks https://www.randomizer.org/) eller i et regneark, og deretter bestille hetteglass basert på hvor tilfeldig.
- Plasser REQS i inkubator å sikre konstant temperatur, fuktighet og lys forhold. Kontroller at både data og strøm kabler er riktig koblet.
- Tillate dyr å gjenopprette fra anestesi og acclimatize til det nye miljøet 1t.
- Starte eksperimentet ved å starte rotasjon av REQS ønsket hastighet.
Merk: Et annet alternativ er å først samle opprinnelige aktivitetsdata fra dyrene før oppstart av rotasjon, etterfulgt av opptak aktivitetsnivå svar på roterende stimulering. - Starte innsamling av åpner DAMsystem308 (bare åpne programvare starter datainnsamling). Dataene skrives til en tekstfil med angi intervallet (her, 5 min); Hvis nødvendig, endrer innstillinger i kategorien "Preferences" (se trinn 1.4).
- For å sikre at dataene er overføres til datamaskinen, åpner tekstfilen generert av DAMsystem308 etter en eller to tidsintervaller har gått og bekrefte at data blir skrevet til filen. Lukk og åpne denne filen for å se data fra ekstra tid poeng på nytt. Samle inn data for det ønsket tid; i dette eksemplet 2T.
Merk: Ikke åpne inkubator i analysen perioden, dyr er svært følsomme for forstyrrelser og vil trolig reagere med økt aktivitet. - På slutten av øvelsen analysen, avslutte datainnsamling ved å lukke programmet DAMsystem308, så slå av REQS. Fjern dyrene fra analysen BILLEDRØR og rengjør rørene. Dyrene kan bli flyttet tilbake til mat ampuller hvis gjentatt tiltak på ulike aldersgrupper for.
Merk: Hvis dødsfall forekommer under trening regimet, det skal bli registrert, som tilstedeværelsen av død fluer kan påvirke aktivitet teller. Vår erfaring med DGRP2 fly linjer12,13, trene på 4 rpm for 2t ikke fører til noen dødsfall, men svakere stammer kan reagere annerledes.
4. dataanalyse
- Åpne txt-filen kalt "Monitor1" produsert av DAMSystem308.
- Kontrollere datafilen for eventuelle problemer som kan ha oppstått under datainnsamling (tapte tidspunkt, osv; Tabell 1). Om nødvendig kan du sensurere filen ved å fjerne datapunktene på begynnelsen og slutten av opptaket.
- Ved hjelp av statistisk programvare du ønsker (f.eks R) analysere dataene som samles inn. Generere Deskriptiv statistikk og utføre analyse av varians (ANOVA) å undersøke effekter som sex og genotype, hvis dataene er normalt distribuert. Hvis dataene ikke er normalt distribuert, bruk ikke-parametriske metoder, for eksempel Kruskal-Wallis tester, sammenligne grupper. Bestemt analysene som kreves, avhenger av spesifikke vitenskapelige spørsmål og eksperimentell design.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Utdataene fra en enkelt kjøre med REQS er en tabell produsert av DAMSystem308 programvare, som kalles "Monitor1.txt" som standard (for en eksempel se ekstra fil 1). Et utdrag fra slike tabeller er vist i tabell 1. Hver kolonne inneholder data fra en individuelle analysen rør, mens radene inneholder aktiviteten målt i hvert tidsintervall fra begynnelsen av eksperimentet (øverst) på slutten (nederst). De første tre datapunktene bør overvåkes i tilfelle at det er data utklipp (som de i tabell 2), som tilfellet kabelen må justeres.
Figur 2 viser resultatene fra et eksperiment sammenligne fire genetisk distinkte Drosophila linjer (DGRP2 linjer 371, 703, 810 og 89712,13). For hver av de fire linjene, ten duplisere målinger fra grupper av ti jomfru flyr av begge kjønn var samlet som beskrevet i delen protokollen. Fra utdatafilen DAMSystem308 programvaren, ble "Gjennomsnittlig aktivitet per 5 minutter per 10 fluer" beregnet ved å beregne aktivitet tiltak over hele 2 timers tidsrommet. Dette gjennomsnittet fra hver kolonne dermed gir et enkelt mål for hvert analysen kammer. Figur 2 basert på sammendragstabellen er gitt i tabell 3.
Oppgitt i tabell 3 ble analysert av ANOVA, teste effekten av genotype, sex og samspillet mellom kjønn og genotype. Som bare effekten av genotype var signifikant (p < 2 x 10-16), de to kjønnene ble kombinert i diagrammet vises i figur 2. VARIANSANALYSE oppdaget en sterk effekt av genotype, som er tydelig i diagrammet. Aktivitetsnivåer kan bety trening mellom alle fire genotyper er signifikant forskjellig fra hverandre (p < 0,05; Tukeys "HSD"), og dermed figur 2 viser hvordan REQS kan brukes til å oppdage en effekt av genotype på trening aktivitetsnivåer.
Figur 1: REQS. Vist i dette bildet er REQS brukt i denne fremgangsmåten. Aktivitet overvåking enheten (A) roterer rundt den vannrette aksen drevet av en roterende arm (B). Rotasjonshastigheten justeres via en ekstern (C), og driften av maskinen er kontrollert av en av/på-bryter (D). Rammemargen (E) viser et nærbilde av datatilkoblingen mellom aktivitet skjermen enheten og roterende telefonkontakten. Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
Figur 2: sammenligning av treningsaktivitet målt ved REQS i fire forskjellige DGRP stammer. X-akse: dyr genotype. Y-aksen: dyr aktivitet målt som strålen kryssinger per 10 dyr per 5 min. A: DGRP2 linje 897; B: DGRP2 linje 810; C: DGRP2 linje 703; D: DGRP2 linje 371. Grafen vises her kombinerer data fra menn og kvinner, som det var ingen betydelig sex effekt for disse bestemte linjer (ANOVA; p = 0.557). Men er det en sterk genotype effekt (ANOVA; p < 2 x 10-16), og alle personlige sammenligninger mellom de fire genotyper er svært betydelig (Tukeys "HSD"; p < 0,05). Black diamond: genotype mener; svart linje: +/-én SD (standardavvik). Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.
| Tid | Activity(1) | Activity(2) | Activity(3) | Activity(4) | Activity(5) |
| 12:25:00 | 21 | 86 | 48 | 32 | 76 |
| 12:30:00 | 31 | 55 | 58 | 74 | 119 |
| 12:35:00 | 27 | 45 | 47 | 80 | 125 |
| 12:40:00 | 28 | 55 | 34 | 83 | 91 |
| 12:45:00 | 36 | 56 | 45 | 67 | 103 |
Tabell 1: eksempel resultatet av nøyaktige data fra DAMSystem308 programvare. Hver "Activity(#)" kolonne representerer en flaske med 10 fluer, med aktivitet innspilt på 5 min intervaller.
| Tid | Activity(1) | Activity(2) | Activity(3) | Activity(4) | Activity(5) | Feil? |
| 12:00:00 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | ja |
| 12:05:00 | 98 | 1 | 36 | 0 | 8 | nei |
| 12:10:00 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | ja |
| 12:15:00 | 88 | 24 | 44 | 1 | 9 | nei |
| 12:20:00 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | ja |
| 12:25:00 | 106 | 51 | 41 | 0 | 15 | nei |
Tabell 2: Eksempel resultatet av feil data med pakketap fra DamSystem308 programvare. Hver kolonne representerer en flaske med 10 fluer, med aktivitet innspilt på 5 min intervaller. Rader 12:00:00, 12:10:00 og 12:20:00 viser "0" aktivitet opptak på tvers av alle kolonnene, indikerer et problem med datatilkoblingen (feil? "ja" i den siste kolonnen).
Tabell 3: eksempeldata brukes til å generere Figur 2. Klikk her for å laste ned denne filen.
Ekstra fil 1: Ubehandlet utdatafilen som produseres av DAMSystem308. Kolonne 1 registrerer hvor tidspunkt. Kolonne 2 poster datoen for eksperimentet og kolonne 3 poster tiden hvert tidspunkt er registrert. Kolonner 4-10 brukes ikke, og kolonnene 11-42 representerer opptakene fra 32 sporene av Aktivitetsmonitor. Klikk her for å laste ned denne filen.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Som representant resultatene illustrere, er REQS stand til å måle nøyaktig aktiviteten til trener Drosophila. REQS er fleksibel og tillater forskere å løse en rekke problemstillinger knyttet til øvelse biologi eller øvelse intervensjoner. Det er to avgjørende skritt i protokollen for å markere. Først er det viktig å teste oppsett av FORESP slik at dataoverføring fra FORESP til DAMSystem308 fungerer. Hvis ikke riktig satt opp, datakabelen kan bli sammenfiltrede i rotasjon, og noen ganger forbindelsen mellom REQS og DAMSystem308 avbrytes på roterende tilkoblingen på grunn av slitasje (selv med nesten daglig bruk av REQS, har vi hatt erstatte koblingen i to år). Det er forsvarlig å holde reservedeler på hånden. Andre er konsistensen av miljømessige parametere avgjørende for suksess for eksperimenter. Drosophila er svært følsomme for støy eller vibrasjon, og det er derfor viktig at eksperimentet ikke er forstyrret under datainnsamlingen. Dermed ideelt kjøres eksperimenter i en dedikert inkubator som ikke er tilgjengelig under en eksperimentell kjøre. Oppmerksomhet til disse to viktige trinn vil sikre at høy kvalitet dataene samles inn fra REQS.
Mens vi viser her hvordan REQS kan brukes til å måle dyr aktivitet under en 2 timers vedvarende trening behandling fra grupper av dyr, er REQS fleksibel i at tid og intensiteten av øvelsen kan justeres for ulike øvelse behandlinger. I tillegg avhengig aktivitet skjermen brukes, kan det endres for å måle aktivitet fra enkelt fluer eller svært store populasjoner av dyr. I tillegg kan til REQS brukes til å teste design og optimalisering av trening regimer. Det kan også brukes til å måle effekten av flere variabler som tid på dagen, dyr alder, kosthold, populasjonsstørrelse eller behandling på indusert aktivitet og mosjon svar. Den nøyaktige eksperimentelle oppsett, dvs. lengde på øvelse regime og timing, kan REQS også brukes forstyrrer naturlig søvn mønstre av Drosophila. Disse eksemplene viser allsidig natur REQS og noen potensielle bruker i Drosophila forskning. Andre små dyr forskningsmiljøer kan også være interessert i å tilpasse REQS for deres formål, således utvide nytten av dette nye verktøyet.
En begrensning av REQS er foreløpig begrenset antall eksempler som kan behandles om gangen, som bestemmes av aktivitet skjermer brukes, som analysen maksimalt 32 prøver. Bruk av flere REQS enheter er mulig, å tillate REQS brukes til store genetiske skjermer eller lignende programmer, ville utvikling av en høyere gjennomstrømming versjon av REQS være ideelt.
På grunn av sin evne til å måle aktivitetsnivå indusert i en identisk måte til Treadwheel, REQS kan brukes i kombinasjon med Treadwheel, noe som gir noe høyere gjennomstrømming (48 prøver kan behandles om gangen). Arbeidstest-protokoller kan optimaliseres bruker REQS og deretter implementert på Treadwheel for ytterligere studier. Dermed kan Treadwheel og REQS brukes utfyllende behov for konkret studie design.
REQS er et viktig skritt i Drosophila øvelse forskning som gjør det mulig for kvantifisering av indusert aktiviteten. Å ha en maskin som samtidig kan indusere trening og måle denne øvelsen var et klart må Drosophila utøve-feltet som en tysk gruppe forskere uavhengig utviklet en svært lik enheten, kalt "swing båt," bruker som også en aktivitet overvåke for å måle aktivitet under trening indusert av rotasjon14. På "swing båt" bruker ikke komplett rotasjoner, men i stedet svinger aktivitet skjermen enheten tilbake og tilbake ca 30 grader rundt en rotasjonsaksen. Derfor den "swing båt," som REQS, bruker rotasjonen til kontinuerlig indusere negative geotaxis svar og øke dyr aktivitet. REQS og "swing båt" utfyller eksisterende video-sporing metoder til analysen Drosophila etter stimulering, som Drosophila opphisselse sporing system (DART)15. Både REQS og "swing båten" forbedre systemer som DART, som spore aktivitet etter opphør av stimulans. Dermed er REQS og "swing båt" nye, viktige verktøy for forskere innen Drosophila øvelse, som kan brukes sammen med de eksisterende Treadwheel og Power Tower-enhetene.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Forfatterne ikke avsløre.
Acknowledgments
Arbeidet ble støttet av prisen nummer P30DK056336 fra National Institute for Diabetes og fordøyelsesenzymer og nyre sykdommer gjennom en pilot stipend fra ernæring og fedme Research Center ved University of Alabama i Birmingham for NCR.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Drosophila Activity Monitor | Trikinetics | LAM25H | REQS component |
| Telephone Cord Detangler | Uvital | uv20170719 | REQS component |
| Vial closures (flugs) | Genesee Scientific | 49-102 | Drosophila culture supplies |
| Vials | Genesee Scientific | 32-120 | Drosophila culture supplies |
| Drosophila culture netting | Carolina Biological Supply | 173090 | Drosophila culture supplies |
| Cornmeal | Pepsico | 43375 | Drosophila media |
| Molasses | Golden Barrel | BLA-GAL | Drosophila media |
| Agar | Apex Bioresearch | 66-103 | Drosophila media |
| Inactive Dry Yeast | Genesee Scientific | 62-106 | Drosophila media |
| Tegosept | Apex Bioresearch | 20-258 | Drosophila media |
| Propionic acid | Genesee Scientific | 20-271 | Drosophila media |
References
- Rieder, L. E., Larschan, E. N.
- Ugur, B., Chen, K., Bellen, H. J. Drosophila tools and assays for the study of human diseases. Dis Model Mech. 9 (3), 235-244 (2016).
- Hales, K. G., Korey, C. A., Larracuente, A. M., Roberts, D. M. Genetics on the fly: A primer on the Drosophila Model System. Genetics. 201 (3), 815-842 (2015).
- Piazza, N., Gosangi, B., Devilla, S., Arking, R., Wessells, R. Exercise-training in young Drosophila melanogaster reduces age-related decline in mobility and cardiac performance. PLoS One. 4 (6), e5886 (2009).
- Gargano, J. W., Martin, I., Bhandari, P., Grotewiel, M. S. Rapid iterative negative geotaxis (RING): a new method for assessing age-related locomotor decline in Drosophila. Exp Gerontol. 40 (5), 386-395 (2005).
- Tinkerhess, M. J., Ginzberg, S., Piazza, N., Wessells, R. J. Endurance training protocol and longitudinal performance assays for Drosophila melanogaster. J Vis Exp. (61), (2012).
- Mendez, S., et al. The TreadWheel: A novel apparatus to measure genetic variation in response to gently induced exercise for Drosophila. PLoS One. 11 (10), e0164706 (2016).
- Katzenberger, R. J., et al. A Drosophila model of closed head traumatic brain injury. Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (44), E4152-E4159 (2013).
- Watanabe, L. P., Riddle, N. C. Characterization of the Rotating Exercise Quantification System (REQS), a novel Drosophila exercise quantification apparatus. PLoS One. 12 (10), e0185090 (2017).
- Reed, L. K., et al. Genotype-by-diet interactions drive metabolic phenotype variation in Drosophila melanogaster. Genetics. 185 (3), 1009-1019 (2010).
- Bartholomew, N. R., Burdett, J. M., VandenBrooks, J. M., Quinlan, M. C., Call, G. B. Impaired climbing and flight behaviour in Drosophila melanogaster following carbon dioxide anaesthesia. Sci Rep. 5, 15298 (2015).
- Huang, W., et al. Natural variation in genome architecture among 205 Drosophila melanogaster Genetic Reference Panel lines. Genome Res. 24 (7), 1193-1208 (2014).
- Mackay, T. F., et al. The Drosophila melanogaster Genetic Reference Panel. Nature. 482 (7384), 173-178 (2012).
- Berlandi, J., et al. Swing Boat: Inducing and recording locomotor activity in a Drosophila melanogaster model of Alzheimer's disease. Front Behav Neurosci. 11, 159 (2017).
- Faville, R., Kottler, B., Goodhill, G. J., Shaw, P. J., van Swinderen, B. How deeply does your mutant sleep? Probing arousal to better understand sleep defects in Drosophila. Sci Rep. 5, 8454 (2015).
