Extractie van biomarkers uit sedimenten - Versnelde oplosmiddelextractie

1. Verzamelen van de noodzakelijke materialen

1. Extract monsters. Voordat ze worden geëxtraheerd, worden monsters (in dit geval sediment) bevroren, gevriesdroogd, vermalen en gehomogeniseerd en worden ze in groepen geëxtraheerd om de efficiëntie te maximaliseren.
2. Gebruik, afhankelijk van de grootte van het monster, verzamelbuisjes met volumes van 40 of 60 mL. Voor dit experiment worden buisjes van borosilicaatglas (40 mL) en solvoombakken gebruikt. Verbrand buisjes, borosilicaatglaspipetten en weegtins bij 550 °C gedurende 6 uur om verwijdering van mogelijke organische verontreinigingen te garanderen.
3. Dichloormethanol (DCM) en methanol zijn gebruikelijk in de meeste laboratoria voor organische geochemie. Gebruik ze afzonderlijk, (methanol eerst, gevolgd door DCM) om laboratoriumgereedschappen en glaswerk te spoelen voor gebruik. Een mengsel van dichloormethanol en methanol (MeOH; 9:1) wordt in veel laboratoria gebruikt om biomarkers met een breed scala aan polariteiten efficiënt te extraheren. Oplosmiddelen moeten vrij zijn van organische verontreinigingen.
4. Verkrijg een versnelde solvext voor gebruik bij dit experiment.

2. Voorbereiding van monstercellen

1. Assembleer een monstercel voor elk monster dat moet worden geëxtraheerd, plus één blanco.
   1. Schroef voor elke cel een eindkappen op een uiteinde van de cellichaam.
   2. Plaats een verbrande glasvezelfilter op de top van elke cel met solvent-gespoelde pincetten. Druk vervolgens voorzichtig en langzaam de filter in de cel met behulp van de filterplunger.
   3. Label de cellichamen per nummer (bijv. 1 - 22) voor elk monster en schrijf 'blank' op de lege cel.
   4. Vul de blanco met diatomeeënaarde (of zand) en sluit af met een tweede eindkappen. Draai met de hand vast.

3. Voorbereiding van monsters

1. Plaats een verbrand weegtin op de laboratoriumweegschaal en nul.
2. Spuit de laboratoriumspatel met oplosmiddel en gebruik het vervolgens om een geschikte massa monster over te brengen naar de weegtin en noteer de massa.
   1. De massa van het monster varieert afhankelijk van het gehalte aan organisch materiaal. Relatief materiaal met een laag organische stofgehalte (mariene modder) kan enkele grammen vereisen, terwijl materiaal rijk aan organisch materiaal (bladweefsel) veel minder kan vereisen.
3. Breng al het materiaal in de weegtin over naar een voorbereide ASE-cel.
4. Plaats nog een glasvezelfilter op de bovenkant van de cel, druk vervolgens langzaam en voorzichtig naar beneden totdat deze de bovenkant van het monster bereikt met behulp van de filterplunger.
5. Voeg diatomeeënaarde (of zand) toe aan de cel tot het bijna vol is. Wees voorzichtig om eventueel puin van de draad van het cellichaam te verwijderen.
6. Bedek de bovenkant van de cel met een andere eindkappen.
7. Herhaal stappen 3.1 - 3.6 voor elk monster.

4. Voorbereiding van verzamelbuisjes

1. Label elk buisje met het nummer van een overeenkomstig cel (bijv. 1 - 22 of blanco) en sluit af met ASE-verzamelbuisjekap.

5. Extractie

1. Plaats elke monstercel in een genummerde sleuf op de bovenste ASE-lade.
2. Plaats het overeenkomstige verzamelbuisje in dezelfde nummersleuf op de onderste ASE-lade.
3. Maak de extractiemethode aan met behulp van de toetsen op de ASE. Extraheer bij 100 °C en 1.200 psi. Extraheer elk monster 3x met een statische houdtijd van 10 min en spoel het cellichaam met 50% van het totale volume tussen statische houdtijden.
4. Zorg ervoor dat de oplosmiddelfles voldoende oplosmiddel bevat om alle monsters te extraheren.
5. Spuit de ASE 3x door de knop 'spoelen' op het bedieningspaneel van de ASE in te drukken.
6. Druk op start.