High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)

10.4K weergaven

Geciteerd door 5

09:06 min.

5 oktober 2018

10.3791/58030-v

5 oktober 2018

10.4K weergaven
 ,  , 

De identificatie van de fysieke interacties tussen genen en regelgevende elementen is uitdagend maar heeft bevorderd door chromosoom conformatie opname methoden. Deze wijziging van het 4C-seq-protocol PCR bias vermindert door het minimaliseren van de over-amplificatie van PCR sjablonen en maximaliseert de mappability van leest door het opnemen van een toevoeging restrictie-enzym digest stap.

Meer video's verkennen

4C-seq-protocol

Chapters in this video

0:04

Titel

0:45

Formaldehyde-crosslinking en cellyse

1:59

Eerste restrictiedigestie en eerste ligatie

5:07

Omkeer van crosslinking, chromatinisolatie en verdere analyses

7:42

Resultaten: Representatief genomisch spoor van 4C-seq read-dekking

8:29

Conclusie

Related Videos