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Análise Sholl automatizado de Morfologia Neuronal Digitized em múltiplas escalas
JoVE Journal
Neurociência
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JoVE Journal Neurociência
Automated Sholl Analysis of Digitized Neuronal Morphology at Multiple Scales
DOI:

11:41 min

November 14, 2010

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Capítulos

  • 00:00Título
  • 00:20Introduction
  • 01:20Preparations for Automated Sholl Analysis
  • 02:14Tracing Neurons in NeuronJ
  • 04:52Using Bonfire to Build Preliminary .swc Files from NeuronJ Data
  • 06:27Using NeuronStudio to Finalize .swc Files
  • 07:57Using ‘bonfire’ to Extract Morphological Data and ‘bonfire_results’ to View the Data
  • 09:06Using ‘bonfire_export’ to Export Data into Excel
  • 11:21Conclusion

Summary

Tadução automática

Nós desenvolvemos um programa de computador para analisar a morfologia neuronal. Em combinação com dois existentes ferramentas de análise de código aberto, o nosso programa realiza análise de Sholl e determina o número de neurites, pontos de ramificação, e dicas de neurite. As análises são realizadas para que as mudanças locais na morfologia neurite pode ser observado.

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