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DOI: 10.3791/52095-v
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MicroRNAs (miRNAs) são uma classe amplamente conservada de moléculas reguladoras. Aqui descrevemos um método de clonagem de miRNA que se baseia em duas etapas de ligação potentes seguidas de sequenciamento de alto rendimento. Nosso método permite a quantificação precisa de miRNAs em todo o genoma.
O objetivo geral deste procedimento é preparar microRNAs de forma imparcial para sequenciamento de alto rendimento. Isso é feito primeiro preparando ou comprando oligonucleotídeos de DNA que são competentes para ligação às três extremidades principais do micro RNA. O segundo passo é ligar os três oligonucleotídeos de DNA primários às três extremidades principais do micro RNA.
Em seguida, o produto de ligação é purificado em gel e o ligante de oligonucleotídeo de cinco RNA primários é ligado às cinco extremidades principais do micro RNA. A etapa final é converter as moléculas híbridas em CDNA e, em seguida, amplificar o CDNA por reação em cadeia da polimerase. Em última análise, a clonagem de microRNA e o sequenciamento de alto rendimento são usados para mostrar o perfil amplo do transcriptoma de microRNAs de maneira quantitativa na resolução de nucleotídeos individuais.
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