-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

PT

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

pt_BR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Uma interface de usuário gráfica para rastreamento assistido por software da concentração de prot...
Uma interface de usuário gráfica para rastreamento assistido por software da concentração de prot...
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
A Graphical User Interface for Software-assisted Tracking of Protein Concentration in Dynamic Cellular Protrusions

Uma interface de usuário gráfica para rastreamento assistido por software da concentração de proteínas em protrusões celulares dinâmicas

Full Text
7,806 Views
08:12 min
July 11, 2017

DOI: 10.3791/55653-v

Tanumoy Saha1, Isabel Rathmann1, Milos Galic1

1DFG Cluster of Excellence 'Cells in Motion', (EXC 1003), Institute of Medical Physics and Biophysics,University of Muenster

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article presents a software solution for semi-automated tracking of protein concentration along dynamic cellular protrusions. The software enables parallel analysis of protrusion dynamics and protein localization, enhancing our understanding of cell biology.

Key Study Components

Area of Science

  • Cell Biology
  • Image Analysis
  • Protein Dynamics

Background

  • Understanding protrusion dynamics is crucial in cell biology.
  • Filopodia play a significant role in cellular extension and retraction.
  • Quantitative assessment of protein localization is essential for studying cellular processes.
  • Adaptive shape tracking algorithms can improve analysis accuracy.

Purpose of Study

  • To develop a method for analyzing protein concentration along filopodia.
  • To enhance understanding of the proteins involved in protrusion dynamics.
  • To provide a tool for researchers studying cell behavior.

Methods Used

  • Culture neurons, HeLa, or COS cells in supplemented medium.
  • Transvect cells with constructs using a transvection reagent.
  • Incubate transvected cells at 37°C and 5% CO2 for 15-18 hours.
  • Utilize the software for tracking protein concentration and protrusion dynamics.

Main Results

  • The software allows for quantitative assessment of protein localization.
  • It provides insights into the dynamics of cellular protrusions.
  • Adaptive tracking enhances the accuracy of measurements.
  • The method can be applied to various cell types.

Conclusions

  • The developed software is a valuable tool for studying protein dynamics.
  • It aids in understanding the mechanisms of cell protrusion and retraction.
  • This method can facilitate future research in cell biology.

Frequently Asked Questions

What types of cells can be used with this software?
The software can be used with neurons, HeLa, or COS cells.
How does the adaptive shape tracking algorithm work?
It allows for accurate tracking of protein localization along protrusions.
What is the incubation condition for transvected cells?
Transvected cells should be incubated at 37°C and 5% CO2 for 15-18 hours.
What is the main advantage of this image analysis software?
It enables parallel analysis of protrusion dynamics and protein concentration.
Can this method be applied to other cell types?
Yes, it can be adapted for various cell types beyond those mentioned.

Apresentamos uma solução de software para o rastreamento semi-automatizado da concentração relativa de proteína ao longo do comprimento de protrusões celulares dinâmicas.

O objetivo geral deste software de análise de imagens é a análise paralela da dinâmica de protrusão e da concentração relativa de proteínas ao longo de todo o comprimento filopodial. Este método pode realmente nos ajudar a entender questões-chave em biologia celular, especialmente as proteínas individuais envolvidas na extensão e retração de filopódios. A principal vantagem da técnica é que o algoritmo de rastreamento de forma adaptativa fornecido permite a avaliação quantitativa da dinâmica de protrusão e localização de proteínas espacialmente resolvida.

Para começar, cultive neurônios, células HeLa ou COS, em meio suplementado, conforme detalhado no protocolo de texto. Uma vez que 40% de confluência é alcançado, transvect as células com as construções de escolha, usando um reagente de transvecção de acordo com as instruções do fabricante. Mantenha as células transvectadas em uma incubadora a 37 graus Celsius e 5% de CO2 por 15 a 18 horas.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Biologia molecular edição 125 análise de imagens filopodium espaço-temporal interface gráfica do usuário rastreamento análise ratiométrica kymograph casco convexo

Related Videos

In vivo Detecção de interações proteína-proteína em Micro-padrão Superfícies

07:42

In vivo Detecção de interações proteína-proteína em Micro-padrão Superfícies

Related Videos

11.2K Views

Visualizando interações DNA-proteína em células bacterianas ao vivo usando fotoativado única molécula de Rastreamento

16:21

Visualizando interações DNA-proteína em células bacterianas ao vivo usando fotoativado única molécula de Rastreamento

Related Videos

18.4K Views

De alta resolução espacial e temporal Análise de Receptor Dynamics por uma única molécula de microscopia de fluorescência

15:13

De alta resolução espacial e temporal Análise de Receptor Dynamics por uma única molécula de microscopia de fluorescência

Related Videos

11.9K Views

Visualizando Endocitose clatrina mediada por receptores acoplados à proteína a resolução de evento único através de microscopia TIRF

12:40

Visualizando Endocitose clatrina mediada por receptores acoplados à proteína a resolução de evento único através de microscopia TIRF

Related Videos

81.1K Views

Etiqueta-Free Imaging de único proteínas secretadas de células vivas através de iSCAT microscopia

10:55

Etiqueta-Free Imaging de único proteínas secretadas de células vivas através de iSCAT microscopia

Related Videos

18.6K Views

Processamento de imagem protocolo para análise de difusão e o tamanho do Cluster de receptores de membrana por microscopia de fluorescência

12:15

Processamento de imagem protocolo para análise de difusão e o tamanho do Cluster de receptores de membrana por microscopia de fluorescência

Related Videos

9.3K Views

Microscopia de seguimento da único-molécula-uma ferramenta para determinar os Estados diffusive de moléculas cytosolic

10:20

Microscopia de seguimento da único-molécula-uma ferramenta para determinar os Estados diffusive de moléculas cytosolic

Related Videos

8.9K Views

Medindo a dinâmica de saliência da borda celular durante a disseminação usando microscopia de células vivas

05:50

Medindo a dinâmica de saliência da borda celular durante a disseminação usando microscopia de células vivas

Related Videos

2.9K Views

Rastreamento de partículas sensíveis à massa para caracterizar dinâmicas de macromolécula associadas à membrana

13:30

Rastreamento de partículas sensíveis à massa para caracterizar dinâmicas de macromolécula associadas à membrana

Related Videos

5K Views

Rastreamento de proteínas individuais em bicamadas lipídicas usando microscopia de fluorescência

08:39

Rastreamento de proteínas individuais em bicamadas lipídicas usando microscopia de fluorescência

Related Videos

854 Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code