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JoVE Journal Genetics
A Murine Cell Line Based Model of Chronic CDK9 Inhibition to Study Widespread Non-Genetic Transcriptional Elongation Defects (TEdeff) in Cancers

Uma linha celular murine baseou o modelo da inibição CDK9 crônica para estudar defeitos não-genéticos difundidos do alongamento do transcriptional (TEdefinitivamente) nos cancros

Full Text
6,019 Views
10:49 min
September 26, 2019

DOI: 10.3791/59910-v

Vishnu Modur1, Navneet Singh1, Belal Muhammad1

1Division of Experimental Hematology and Cancer Biology, Cancer and Blood Diseases Institute,Cincinnati Children's Hospital Medical Center (CCHMC)

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

O protocolo detalha um modelo in vitro da carcinoma murino do alongamento defeituoso não-genético da transcrição. Aqui, a inibição crônica do CDK9 é usada para reprimar o alongamento produtivo do RNA Pol II ao longo dos genes de resposta pró-inflamatória para imitar e estudar o fenômeno TEdefinitivamente superatendido, presente em cerca de 20% de todos os tipos de câncer.

Dado que os cânceres de TEdeff são um obstáculo significativo contra a imunoterapia, nosso modelo farmacológico é uma ferramenta vantajosa porque imita adequadamente os defeitos transcricionais e epigenéticos generalizados observados em tais cânceres, e permite estudar essas anormalidades não genéticas para obter novas percepções, encontrar novos usos para drogas existentes ou encontrar novas estratégias contra tais cânceres. Trata-se de um modelo fácil de estabelecer e generalizável para estudar defeitos de alongamento transcricional em cânceres, permitindo estudar interações tumorais-imunes tanto in vitro quanto in vivo. Este método também pode ser aplicado às linhas de carcinoma humano.

Testamos isso em T47D e CAL51 para um curto prazo, dando origem a características semelhantes ao TEdeff. O protocolo que descrevemos aqui dá uma estrutura básica para minimizar as variáveis conhecidas críticas para a geração de recursos semelhantes a TEdeff pela inibição crônica do CDK9. No entanto, deve-se tomar cuidado para otimizar a dose subletal exata de flavopiridol para outras linhas murinas.

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