Быстрый и количественный метод для столб-поступательные изменения и вариант включено сопоставление пептидов в геномов

10.8K просмотров

Цитируется: 3

09:10 мин.

22 мая 2018 г.

10.3791/57633-v

22 мая 2018 г.

10.8K просмотров
 ,  ,  ,  , 

Здесь мы представляем средство proteogenomic PoGo и протоколы для быстрого, количественных, столб-поступательные изменения и вариант включено сопоставление пептидов, выявленных с помощью масс-спектрометрии на ссылку геномов. Этот инструмент имеет для интеграции и визуализации proteogenomic и личных протеомических исследований взаимодействия с данными ортогональных геномики.

Больше видео

Программное обеспечение PoGo

Chapters in this video

0:05

Название

0:51

Картирование пептидов с помощью PoGoGUI

2:36

Визуализация в Integrative Genomics Viewer

3:57

Картирование пептидов, идентифицированных с помощью специализированной базы данных вариантов, на референсный геном

4:44

Картирование пептидов из нескольких файлов с помощью PoGoGUI

5:48

Создание Track Hub на основе картированных пептидов и визуализация Track Hub в UCSC Genome Browser

6:50

Результаты: картирование пептидов на геномы с учетом посттрансляционных модификаций и вариантов

8:21

Заключение

Related Videos