Скрининг для функционального Некодирующих генетических вариантов Использование электрофоретической подвижности Сдвиг анализа (EMSA) и ДНК-сродства осадков Анализ (DAPA)

12.8K просмотров

Цитируется: 15

11:35 мин.

21 августа 2016 г.

10.3791/54093-v

21 августа 2016 г.

12.8K просмотров

Daniel E. Miller¹ , Zubin H. Patel¹^,²^,³ , Xiaoming Lu¹^,³ , Arthur T. Lynch¹ , Matthew T. Weirauch^*¹^,⁴ , Leah C. Kottyan^*¹

¹Center for Autoimmune Genomics and Etiology, Cincinnati Children's Hospital, ²Medical Scientist Training Program, University of Cincinnati, ³Immunology Graduate Program, University of Cincinnati, ⁴Divisions of Biomedical Informatics and Developmental Biology, Cincinnati Children's Hospital

^* These authors contributed equally

Мы представляем стратегический план и протокол для выявления некодирующих генетических вариантов, влияющих на связывание ДНК с фактором транскрипции (TF). Представлен подробный экспериментальный протокол для анализа электрофоретического сдвига подвижности (EMSA) и анализа аффинного осаждения ДНК (DAPA) генотип-зависимого связывания TF DNA.