In Eukaryoten ist doppelsträngige DNA speziell in einem membrangebundenen Kern angeordnet, um den begrenzten Raum der Zelle zu nutzen. Auf der ersten Stufe der Verdichtung wird die DNA eng um bestimmte Proteine, sogenannte Histone, gewickelt. Ein Histonkern und die um ihn gewickelte DNA werden zusammen als Nukleosom bezeichnet, die Grundeinheit der DNA-Verpackung. Die Nukleosomen sind durch Linker-DNA miteinander verbunden, was Perlen an einer Schnur zu ähnelt. In der nächsten Verpackungsebene wickeln sich Nukleosomen und Linker-DNA zu Chromatinfasern. Schließlich verdichten zusätzliche faserige Proteine das Chromatin noch weiter und lassen so lange DNA-Längen so dicht verbundenen Einheiten werden, die je nach Phase der Zellteilung als Chromosomen bezeichnet werden.