خلال التكرار،يمكن للفيروسات أن تتطور جينياًأيضاًنتيجة للطفرات،وهي تغييرات دائمية في المادة الورائية. تحصل أخطاء لحظية أكثر عندما يتواجد الحمض النووي الريبي لأن التكرار يتطلب انزيم النسخ العكسي،الذي لا يصحح،مؤدياًالى فرصة أكبر للتطور السريع ومقاومة الدواء. تلك هي الحال بالنسبة لفيروس نقص المناعة البشري،التي تجعل من الصعوبة جداًهزيمته.