오염이 심각하게 된 생태계는박테리아, 곰팡이, 식물과 같은 유기체에 의해 회복 또는 해독될 수 있는데,이러한 과정을 생물적 환경정화라고 합니다.예를 들어, 기름이 유출되고 난 뒤,과학자들은 자연적으로 발생하는 슈도모나스 박테리아의 성장을 촉진시킬 수 있습니다.환경에 영양분을 추가함으로써,유출된 석유 탄화수소를 분해하는 데 사용할 수 있도록 말입니다.하지만, 이러한 박테리아의 대부분은탄화수소를 이산화탄소로 분해하는데,이산화탄소 또한 주요 오염 물질 중 하나입니다.하지만 일부 과학자들은 현재 포도당 생산을 증가시키기 위해남세균의 대사 과정을 변경시키고 있습니다.그리고 그렇게 함으로써 대기 중의 이산화탄소를 더 많이 제거할 수 있습니다.