בנוכחות חמצן, פירובט עובר למיטוכונדריה לאחר גליקוליזה, שם חמצון של מולקולת פירובט אחת אחד CoA-מייצר אצטיל, מולקולה אחת של CO2 פחמן דו-חמצני, או, אחד NADH-ו. CoA-לאחר מכן, אצטיל נכנס למעגל חומצת הלימון ועובר שינוי שמייצר CO2 שתי מולקולות של, NADHs שלושה, אחד FADH2-אחד, ו ATP, הנוספים לתוצרים הקודמים של גליקוליזה. כלומר התוצר של מולקולת גלוקוז אחת, או שתי מולקולות פירובט, לאחר חמצון הפירובט ומעגל חומצת הלימון, CO2 הוא שש מולקולות, NADHs שמונה, FADH2 ושתי מולקולות ATP שני.