8.12: ATP产量
细胞呼吸每个葡萄糖分子产生30-32个ATP分子。虽然大部分ATP来自氧化磷酸化和电子传递链（ETC），但预先获得4个ATP（2个来自糖酵解，2个来自柠檬酸循环）。
ETC嵌入线粒体内膜，由四种主要蛋白复合物和一种ATP合酶组成。NADH和FADH2将电子传递给这些复合物，从而将质子泵入膜间空间。质子的这种分布在整个膜上产生浓度梯度。当质子通过ATP合酶流回线粒体基质时，梯度驱动ATP的产生。
NADH每进入复合物I输入2个电子，复合物I和III各泵送4个质子，复合物IV泵送2个质子，共10个质子。复合物II不参与NADH引发的电子链。然而，FADH2将2个电子传递给复合物II，因此每个FADH2共泵送6个质子；4个质子通过复合物III，2个质子通过复合物IV。
合成1个ATP需要4个质子。由于每个NADH泵入10个质子，1个NADH产生2.5（10/4）ATP。每个FADH2泵送六个质子，因此1个 FADH2产生1.5（6/4）ATP。
细胞呼吸每个葡萄糖分子产生最多10个NADH和2个FADH2 。由于一个NADH产生2.5个ATP，一个FADH2产生1.5个ATP，因此25个ATP+ 3 ATP由氧化磷酸化产生。在氧化磷酸化之前产生四的ATP，每葡萄糖分子产生32 ATP的最大值。
重要的是，糖酵解发生在细胞质中，ETC位于线粒体（真核生物）中。线粒体膜对NADH不具有渗透性，因此糖酵解产生的2个NADH的电子需要穿梭到线粒体中。一旦进入线粒体，电子就可能被传递到NAD+或FAD。根据电子载体的不同，细胞呼吸的总产量为每葡萄糖分子30-32 ATP。
