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3.3:

분자 모형

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Chemistry
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JoVE Core Chemistry
Molecular Models

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화학 물질의 구성과 분자 구조는 3차원 분자 모형을 사용하여 효과적으로 시각화되고 더 잘 이해될 수 있습니다. 공-막대모형과 공간 충전 모형은 화합물에서 원자의 기하학적 배열을 보여주는 두 가지 표준 형태의 분자 모형입니다. 이 모형들은 플라스틱이나 나무로 만들어진 물체나 가상 컴퓨터 시뮬레이션으로 만들어집니다.공-막대 모형은 구체나 공으로 원자를 묘사합니다. 구를 연결하는 막대는 화학적 결합을 나타내며, 막대 사이의 각도는 실제 화합물에서 결합 각도와 일치합니다. 두 개 또는 세 개의 막대는 각각 이중 결합과 삼중 결합을 나타냅니다.각 공의 중심 사이의 거리는 해당 원자핵 사이의 정확한 거리와 비례합니다. 이 공들은 다른 색깔을 사용하여 서로 다른 원소의 원자를 구별합니다. 색깔은 화학자들인 로버트 코리, 리너스 폴링, 월터 콜툰이 도입한 CPK 컬러링 규약에 맞게 지정됩니다.실례로 흰색, 검은색, 빨간색 공은 각각 수소, 탄소, 산소 원자를 나타냅니다. 공간 충전 모형은 보다 현실적이며 실물 크기로 된 구로 원자를 나타냅니다. 그러나 구들은 원자들 사이에 존재하는 화학적 결합과 결합 각도를 보여주지 않습니다.구들은 원자의 상대적 크기에 비례하여 만들어지며, 가시적 크기로 조정할 경우 각 원자의 실제 모양과 차지하는 공간에 대한 명확한 이해를 제공합니다. 이 공간 충전 모형에서 사용되는 색깔도 CPK 색상 규약을 따릅니다.

3.3:

분자 모형

화학 화합물의 분자 아키텍처를 나타내는 물리적 모델은 화학을 이해하는 데 필수적인 역할을합니다. 분자 모델을 사용하면 원자와 분자의 구조와 모양을 쉽게 시각화할 수 있습니다.

골격 모델

화학 화합물의 간단한 2 차원 표현은 골격 모델을 사용하여 수행됩니다. 이 그림은 원자를 명시적으로 표시하지 않고 분자 프레임워크 또는 결합만 보여 주습니다. 이 표현에서, 탄소 원자와 수소 원자의 대부분은 명시적으로 표시되지 않습니다. 그러나 원자의 위치는 채권의 접합부 또는 끝에 의해 암시됩니다. 이 모델은 더 크고 복잡한 화학 구조를 나타내는 데 도움이됩니다.

볼 앤 스틱 모델

볼 앤 스틱 모델은 원자가 다른 요소에 따라 색상으로 구분된 공이나 구체로 묘사되는 3차원 모델입니다. 원자를 연결하는 화학 결합은 막대로 표현되며 시각화하기가 더 쉽습니다. 이렇게 하면 공의 크기가 상대적으로 작아 실제 원자 크기와 비례 상관관계가 저하됩니다. 그러나 볼 앤 스틱 모델은 원자 사이의 각도를 정의하여 다른 분자 모델에 비해 더 복잡한 구조에 대한 분자 형상을 명확하게 묘사합니다.

공간 충전 모델

공간 충전 모델은 원자가 크기로 확장되어 서로 사이의 공간을 채우는 가장 사실적입니다. 이 모델의 원자의 크기와 위치는 본딩 특성및 반 데르 발스 반경 또는 접합 거리에 의해 결정됩니다. 반 데르 발스 반경은 공유 결합이 연결되지 않을 때 두 원자가 서로 얼마나 밀접하게 접근할 수 있는지 설명합니다. 이 모델의 구는 화합물 내에서 각 원자가 차지하는 상대 공간을 보여 주며 원자 사이의 각도는 명확하게 표시되지 않습니다.

먼저 화학자 로버트 코리와 리누스 폴링에 의해 설계, 나중에 월터 콜툰에 의해 개선, CPK 색칠 규칙은 각 요소의 원자에 특정 색상을 지정합니다. 예를 들어, CPK 협약에 따르면, 모든 수소 원자는 흰색으로 칠하고, 탄소 원자는 검은 색이고, 질소 원자는 파란색이고, 산소 원자는 빨간색이고, 황 원자는 짙은 노란색이며 인 원자는 보라색입니다. 알칼리성 흙금속은 짙은 녹색으로 표현되며, 알칼리 금속은 보라색으로 표시됩니다.

예를 들어, 아세트산(CH3 COOH)의 상이한 분자 모델은 다음과 같은 방법으로 나타낼 수 있다.

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골격 모델 볼 앤 스틱 모델 공간 충전 모델

 

이 텍스트는 다음과 같은 내용으로, Openstax, 화학 2e, 섹션 2.4: 화학 수식입니다.

Suggested Reading

  1. Berg, Jeremy M. “Appendix: Depicting Molecular Structures.” Biochemistry. 5th edition. U.S. National Library of Medicine, January 1, 1970.