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10.5:

Ativadores e Repressores Transcricionais Procarióticos

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Molecular Biology
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Prokaryotic Transcriptional Activators and Repressors

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Procariotas possuem um genoma circular onde, em ue se ligam a extensões específicas curtas de DNA não-codificado, conhecidas como sequências reguladoras cis. Estes componentes essenciais para a regulação genética estão presentes em todo o genoma. Os reguladores transcricionais podem ligar às sequências reguladoras cis no DNA em sua forma dupla de hélice.A forma helicoidal do DNA tem dois sulcos que diferem no tamanho. O sulco mais largo, sabido como o sulco principal, é mais acessível do que o sulco menor, de menor tamanho, resultando na maioria das interações que ocorrem no sulco principal. As bordas das bases nitrogenadas são expostas ao longo dos sulcos e são capazes de realizar ligações de hidrogénio e outras interações não covalentes.esta ligação dos reguladores transcricionais é específica da sequência. No entanto, sequências intimamente relacionadas também são reconhecidas. Esta associação é altamente estável devido às múltiplas interações não covalentes envolvidas.As sequências reguladoras CIS podem governar cada aspecto da transcrição do gene, incluindo a inibição ou iniciação da transcrição, bem como a taxa de transcrição. Elas podem ser amplamente classificadas nessas que estão em estreita proximidade com o local da transcrição e aquelas que estão a milhares de pares de base de distância. As que estão próximas são geralmente parte das sequências do promotor que inicia a transcrição do gene.Aquelas que estão mais distantes podem participar na melhoria ou no silenciamento da transcrição. Frequentemente, a embalagem compacta do DNA e do cromossomo faz com que estas sequências sejam espacialmente próximas ao gene que regulam, mesmo que estejam longe na sequência. Uma combinação de várias sequências de regulamentação cis controla a expressão da maioria dos genes.Raramente, um gene estará sob o controle de apenas uma única sequência.

10.5:

Ativadores e Repressores Transcricionais Procarióticos

A organização de genes procarióticos no seu genoma é notavelmente diferente da de eucariotas. Genes procarióticos estão organizados de forma a que os genes para proteínas envolvidas no mesmo processo ou função bioquímica estejam localizados juntos em grupos. Este grupo de genes, juntamente com os seus elementos reguladores, são coletivamente conhecidos como operão. Os genes funcionais em um operão são transcritos juntos para originar uma única cadeia de mRNA conhecido como mRNA policistrónico.

A transcrição de genes procarióticos em um operão é regulada por dois tipos de proteínas de ligação ao DNA, conhecidas como ativadores e repressores. Os ativadores ligam-se ao promotor, o local de iniciação da transcrição, e auxiliam na ligação da RNA polimerase, a enzima-chave envolvida na transcrição.  Os repressores ligam-se aos operadores, sequências de regulação curtas no operão entre o promotor e os genes, e inibem a ligação da RNA polimerase ao promotor.

Um pré-requisito estrutural para ativadores e promotores é que eles devem poder existir em duas conformações alternativas, uma que podem ligar ao DNA e outra que não podem. Outra característica específica dos ativadores é que têm duas superfícies de ligação para ligar simultaneamente à RNA polimerase e ao DNA. Este recrutamento das duas moléculas aproxima a polimerase do promotor e auxilia na sua ligação. Os ativadores não têm um papel catalisador na transcrição e a sua função está limitada a facilitar a ligação entre a enzima e o DNA. Na ausência de um ativador, a RNA polimerase pode ainda ligar-se ao DNA e mostrar baixos níveis de expressão. Se um repressor estiver presente neste sistema, então a expressão basal desse gene é impedida.

A regulação da expressão de genes procarióticos depende em grande parte da disponibilidade de nutrientes e das necessidades dos organismos. Estes nutrientes controlam a ligação de ativadores e repressores ao operão e garantem que apenas o conjunto de genes necessário é expresso. Por exemplo, a presença de triptofano em uma célula leva à sua ligação a um repressor que impede a transcrição do operão trp e a subsequente produção de triptofano.

Suggested Reading

  1. Alberts et al., 6th edition; pages 380-383
  2. Shaw, K. (2008) Negative transcription regulation in prokaryotes. Nature Education 1(1):122