Back to chapter

11.9:

миРНК - малые интерферирующие РНК

JoVE Core
Molecular Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Core Molecular Biology
siRNA – Small Interfering RNAs

Languages

Share

Небольшие интерферирущие РНК или siРНК являются некодирующими РНК длиной около 22 нуклеотидов, которые регулируют синтез мРНК и её стабильность. siРНК может произведена внутри клетки путём транскрипции ДНК, может быть получена при обработке вирусной РНК или она может быть добавлена учеными в экспериментальных целях. siРНК вырабатываются из длинной двухцепочечной РНК.Эта РНК расщеплена на несколько коротких siРНК с помощью эндонуклеазы Дайсер”Затем каждая siРНК прикрепляется к белку-аргонавту вместе с другими белками, и это приводит к образованию РНК-индуцированного комплекса выключения гена-или RISC. В RISC, ведущая цепь РНК отделена от своей дополняющей цепи и остается в комплексе, так что, она может образовать пару с целевой мРНК. Затем происходит расщепление целевой мРНК с помощью аргонавта и последующая деградация в цитоплазме.В течение своего жизненного цикла основанные на РНК вирусы попадают в клетку-хозяина и производят двуцепочечную РНК. Эта РНК распознаётся Дайсером и перерабатывается в siРНК. Эти siРНК помогают бороться с вирусными инфекциями путем продвижения деградации вирусной мРНК.В ядре, ассоциированная с центромером ДНК повтор кодирование транскриптов, которые обработаны компаниейДайсером для производства специальных типов siРНК. В отличие от цитоплазмической сиРНК, они блокируют синтез мРНК и способствуют формированию гетерохроматина, который может регулировать транскрипцию. Эти сиРНК связываются с несколькими белками, в том числе аргонавтом, для формирования РНК-Индуцируемого транскрипционного выключения гена или комплекса RITS.сиРНК направляет RITS на сайт активной транскрипции где она связывается с зарождающейся мРНК. Это связывание затем ведет к набору дополнительных белков, которые модифицируют близлежащие гистонные белки и способствуют формированию гетерохроматина. Это делает специфические гены недоступными, ингибируя инициацию транскрипции в целевой области и выключая транспозоны.

11.9:

миРНК - малые интерферирующие РНК

Малые интерферирующие РНК, или siРНК, представляют собой короткие регуляторные молекулы РНК, которые могут посттранскрипционно подавлять гены, а в некоторых случаях и на уровне транскрипции . siРНК важны для защиты клеток от вирусных инфекций и подавления мобильных генетических элементов.

В цитоплазме siРНК процессируется из двухцепочечной РНК, которая поступает либо от эндогенной транскрипции ДНК, либо из экзогенных источников, таких как вирус. Затем эта двухцепочечная РНК расщепляется АТФ-зависимой рибоэндонуклеазой Dicer на фрагменты длиной 21–23 нуклеотида с двумя выступающими нуклеотидами на обоих концах. Затем эта siРНК загружается на другой белок, Argonaute. Argonaute имеет четыре разных домена – N-концевой, PAZ, Mid и PIWI. Его домен PIWI обладает активностью РНКазы, что позволяет Argonaute расщеплять целевую мРНК. Комплекс Argonaute-siРНК затем связывается с геликазой и другими белками с образованием РНК-индуцируемого комплекса выключения гена (RISC). В RISC смысловая цепь отделяется от антисмысловой, или направляющей цепи, что, как полагают, катализируется геликазой. Смысловая цепь разрушается в цитоплазме, а направляющая цепь подводит RISC к комплементарной целевой мРНК.

Судьба целевой мРНК определяется тем, демонстрирует ли направляющая мРНК оптимальное или субоптимальное спаривание оснований с целевой мРНК. Если направляющая цепь показывает оптимальное спаривание оснований с целевой мРНК, то целевая мРНК расщепляется Argonaute. Затем комплекс RISC снова используется для нацеливания на другую мРНК. Напротив, если направляющая цепь показывает неоптимальное спаривание оснований с целевой цепью мРНК, Argonaute не будет расщеплять мРНК. Вместо этого произойдет остановка трансляции, поскольку комплекс RISC будет препятствовать связыванию и транслокации рибосом. Затем эти мРНК направляются в тельца процессинга (P-тельца), где они постепенно разрушаются. В ядре siРНК может подавлять мобильные ДНК элементы и тем самым предотвращать их нежелательные и опасные случайные вставки в геном.

Использование siРНК

Поскольку siРНК подавляет конкретные гены, она имеет важное применение как в исследованиях молекулярной биологии, так и в терапевтических целях. В исследованиях их можно использовать для изучения конкретных функций гена in vivo и in vitro путем подавления этого гена. Их также можно использовать для подавления генов смертоносных вирусов и использовать в качестве эффективного противовирусного агента. siРНК исследуются в качестве потенциального средства лечения нескольких заболеваний, включая неврологические расстройства, такие как болезнь Альцгеймера, и раки, путем воздействия на соответствующие гены, вызывающие заболевания. siРНК могут использоваться в персонализированной генной терапии, поскольку они высокоспецифичны и могут быть легко сконструированы для различных генов-мишеней. Кроме того, терапевтические siРНК запрограммированы для нацеливания на мРНК, а не на ДНК, и, следовательно, значительно снижается риск необратимой модификации ДНК. 

Suggested Reading

  1. Dana, Hassan, Ghanbar Mahmoodi Chalbatani, Habibollah Mahmoodzadeh, Rezvan Karimloo, Omid Rezaiean, Amirreza Moradzadeh, Narges Mehmandoost et al. "Molecular mechanisms and biological functions of siRNA." International Journal of Biomedical Science: IJBS 13, no. 2 (2017): 48.
  2. Claycomb, Julie M. "Ancient endo-siRNA pathways reveal new tricks." Current Biology 24, no. 15 (2014): R703-R715.
  3. Kurreck, Jens. "siRNA efficiency: structure or sequence—that is the question." BioMed Research International 2006 (2006).
  4. Ryther, R. C. C., A. S. Flynt, JA 3rd Phillips, and J. G. Patton. "siRNA therapeutics: big potential from small RNAs." Gene Therapy 12, no. 1 (2005): 5-11.
  5. Dykxhoorn, Derek M., and Judy Lieberman. "Running interference: prospects and obstacles to using small interfering RNAs as small molecule drugs." Annu. Rev. Biomed. Eng. 8 (2006): 377-402.