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11.9:

siARN - petit ARN interférent

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siRNA – Small Interfering RNAs

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Les petits ARN interférents ou siARN sont des ARN non-codants d’environ 22 nucléotides de long qui régulent la synthèse et la stabilité de l’ARNm. Le siARN peut provenir de l’intérieur de la cellule par transcription de l’ADN, peut être traité à partir du virus ARN, ou peut être ajouté par des scientifiques à des fins expérimentales. Les siRNA sont traités à partir d’ARN long double brin.Ce ARN est clivé en plusieurs siARN courts à l’aide d’une endonucléase, Dicer. Chaque siARN se lie ensuite à argonaute avec avec d’autres protéines conduisant à la formation du RNA Induced Silencing Complex-ou RISC. Dans le RISC, le brin guide de l’ARN est séparé de son brin complémentaire et reste dans le complexe pour qu’il puisse ensuite se coupler avec l’ARNm cible.Puis l’ARNm cible est clivé à l’aide d’argonaute et ensuite dégradé dans le cytoplasme. Au cours de leur cycle de vie, les ARN viraux pénètrent dans une cellule hôte et produisent des ARN à double brin. Ce ARN est reconnu par Dicer et transformé en siARN.Ces siARN aident à lutter contre les infections virales en favorisant la dégradation des ARNm viraux. Dans le noyau, les répétitions d’ADN associées au centromère codent les transcriptions qui sont traitées par Dicer pour produire des types spécifiques de siARN. Contrairement au siARN cytoplasmique, ils inhibent la synthèse de l’ARNm et favorisent la formation d’hétérochromatine, qui peut réguler la transcription.Ces siARN se lient à plusieurs protéines, y compris argonaute, pour former le-RNA Induced Transcriptional Silencing-ou complexe RITS. Le siARN dirige les RITS vers un site de transcription actif, où il se lie à l’ARNm naissant. Cette liaison conduit ensuite au recrutement de protéines supplémentaires qui modifient les histones proches et favorisent la formation d’hétérochromatine.Cela rend inaccessibles des gènes spécifiques, inhibant l’initiation de la transcription dans la région cible et réduisant au silence les transposons. 60 00:02:14.170 La troisième voie, et la moins fréquente, implique le clivage interne d’un ARNm à l’aide d’endonucléases spécifiques. Les fragments de l’ARNm ont des extrémités cinq et trois prime non protégées.Des exonucléases spécifiques peuvent alors agir sur ces extrémités non protégées et dégrader l’ARNm. La dégradation d’ARNm se produit dans les corps protéiques agrégés appelés corps de traitement ou corps P.Ces corps P contiennent des enzymes, y compris celles impliquées dans le décoiffage et la dégradation de cinq prime à trois prime de l’ARNm.

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siARN - petit ARN interférent

Les petits ARN interférents, ou siARN, sont de courtes molécules d’ARN régulatrices qui peuvent réduire au silence les gènes après la transcription, ainsi que le niveau transcriptionnel dans certains cas. Les siARN sont importants pour protéger les cellules contre les infections virales et faire taire les éléments génétiques transposables.

Dans le cytoplasme, le siARN est traité à partir d’un ARN double brin, qui provient soit de la transcription d’ADN endogène, soit de sources exogènes comme un virus. Cet ARN double brin est ensuite clivé par la riboendonucléase dépendante de l’ATP, Dicer, en fragments longs de 21 à 23 nucléotides avec deux surplombs nucléotidiques aux deux extrémités. Ce siARN est ensuite chargé sur une autre protéine, Argonaute. Argonaute a quatre domaines différents – N-terminal, PAZ, Mid et PIWI. Son domaine PIWI a une activité RNase qui permet à Argonaute de cliver l’ARNm cible. Le complexe Argonaute-siARN se lie ensuite à une hélicase et à d’autres protéines pour former le complexe de silençage induit par l’ARN (RISC). Dans RISC, le brin sens est séparé du brin antisens, ou brin guide, que l’on pense être catalysé par l’hélicase. Le brin sens est dégradé dans le cytoplasme et le brin guide dirige RISC vers un ARNm cible complémentaire.

Le sort de l’ARNm cible est déterminé par le fait que l’ARNm guide présente un appariement de bases optimal ou sous-optimal avec l’ARNm cible. Si le brin guide présente un appariement de bases optimal avec l’ARNm cible, alors l’ARNm cible est clivé par Argonaute. Le complexe RISC est ensuite réutilisé pour cibler un autre ARNm. En revanche, si le brin guide présente un appariement de bases sous-optimal avec le brin d’ARNm cible, Argonaute ne clivera pas l’ARNm. Au lieu de cela, cela conduira à un arrêt de la traduction puisque le complexe RISC obstruera la liaison et la translocation du ribosome. Ces ARNm sont ensuite dirigés vers les corps de transformation (corps P) où ils sont progressivement dégradés. Dans le noyau, le siARN peut réduire au silence les éléments transposables de l’ADN et empêcher ainsi leurs insertions aléatoires indésirables et dangereuses dans le génome.

Applications de siARN

Comme le siARN fait taire des gènes spécifiques, il a des applications importantes à la fois dans la recherche en biologie moléculaire et dans les applications thérapeutiques. Dans la recherche, ils peuvent être utilisés pour étudier des fonctions génétiques spécifiques in vivo et in vitro en faisant taire ce gène. Ils peuvent également être utilisés pour réduire au silence les gènes des virus mortels et peuvent être utilisés comme agent antiviral efficace. Les siARN sont explorés comme traitement potentiel de plusieurs maladies, notamment des troubles neurologiques tels que la maladie d’Alzheimer et les cancers, en ciblant les gènes responsables de la maladie. Les siARN peuvent être utilisés dans la thérapie génique personnalisée car ils sont hautement spécifiques et peuvent être facilement conçus pour différents gènes cibles. De plus, les siARN thérapeutiques sont programmés pour cibler l’ARNm plutôt que l’ADN, ce qui réduit considérablement le risque de modification permanente de l’ADN. 

Suggested Reading

  1. Dana, Hassan, Ghanbar Mahmoodi Chalbatani, Habibollah Mahmoodzadeh, Rezvan Karimloo, Omid Rezaiean, Amirreza Moradzadeh, Narges Mehmandoost et al. "Molecular mechanisms and biological functions of siRNA." International Journal of Biomedical Science: IJBS 13, no. 2 (2017): 48.
  2. Claycomb, Julie M. "Ancient endo-siRNA pathways reveal new tricks." Current Biology 24, no. 15 (2014): R703-R715.
  3. Kurreck, Jens. "siRNA efficiency: structure or sequence—that is the question." BioMed Research International 2006 (2006).
  4. Ryther, R. C. C., A. S. Flynt, JA 3rd Phillips, and J. G. Patton. "siRNA therapeutics: big potential from small RNAs." Gene Therapy 12, no. 1 (2005): 5-11.
  5. Dykxhoorn, Derek M., and Judy Lieberman. "Running interference: prospects and obstacles to using small interfering RNAs as small molecule drugs." Annu. Rev. Biomed. Eng. 8 (2006): 377-402.