Name: Sorunlu Tesisi, Oomiçet ve fungal Örnekleri için Elektron Mikroskobu (SEM) Protokoller tarayarak (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-02-03T13:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 57 s
Description: Öğrenin, bitki, oomycete ve mantar örneklerini tarama elektron mikroskobu için hazırlama yöntemini. Bu protokol, hassas dokuların bütünlüğünü koruyarak enfeksiyon süreçlerini görselleştirir.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu proje hibe sözleşmesi No. Bu yayın sadece yazarın görüşlerini yansıtmaktadır 634429. kapsamında Avrupa Birliği Ufku 2020 araştırma ve yenilik programı fon aldı ve Avrupa Komisyonu bilgilerin herhangi bir şekilde kullanımından sorumlu tutulamaz burada yer alan. Biz de gerçek Jardín Botánico, CSIC tarafından yapılan mali katkı kabul. SR Saprolegnia onun araştırma desteği için Avrupa Birliği [ITN-SAPRO-238550] minnettardır. Biz de nazik için Francisco Calonge teşekkür numuneleri (Şekil 5) işlemek için Phellorinia Herculanea görüntüleri ve B. Pueyo sağlamak istiyoruz. Tüm görüntüler Madrid Real Jardín Botánico-CSIC SEM hizmeti tarafından alınmıştır.

NOT: Bu protokol, tüm (4-6) ortak prosedürler açıklayan belirli organizmaların (bölümler 1-3), ve üç üç adamış altı ana bölümden içerir. Yıldız (*) denemecileri modifiye adımları göstermektedir. 1. Gelişmekte Olan Araştırmalar ve Tam kurulan Bitki Yapıları <ol><li> Toplama ve sabitleme <ol><li> bitki materyali bir çeker ocak erişimi olmayan bir yerde toplanması halinde, tanıtmak ve santrifüj tüplerine% 70 etanol içinde malzemeyi batırmayın. İdeal olarak, etanol aşırı su kaybını önlemek için FAA 48 saat (1.1.1-1.1.3 adımlar) sonra malzemeyi daldırın. Bir duman dolap bitki materyali erişilebilir ise, bu adımı görmezden ve 1.1.1 ile devam edin. </li><li> bir aldehid filtre takılmış bir çeker ocak formalin-asetik-alkol (FAA) fiksatif hazırlayın. % 70 denatüre etanol içinde 85 kısım,% 60 formaldehid çözeltisi, 10 parça ve buzlu asetik asit 5 ölçü. FAA hazırlayınSadece uzun vadeli depolama, malzeme sabitleme önce 40 tavsiye edilmez. </li><li> çeker ocak altında, bireysel geniş ağız ve sızdırmaz plastik şişelere FAA stok dökün. Mevcut örnekler var gibi çok sayıda şişe kullanın ve örnek tanımlama etiketleri oluşturmak. </li><li> böcekler, mantarlar, ya da aşırı hava koşullarından zarar görmezler sağlanması, düzeltmek için çiçek veya vejetatif meristem seçin. , Dalları kesmek istenmeyen malzeme kaldırma ve FAA çözeltide hemen numuneyi mevduat. </li><li> 72-96 saat sonra, kimyasal bertaraf etmek için, plastik bir kap içine FAA dökün. Hemen sonra, herhangi bir kalıntı FAA çıkarmak için taze% 70 etanol ile numuneleri üç kez yıkayın. Sabit madde% 70 etanol içinde süresiz olarak saklanabilir. </li></ol></li><li> Diseksiyon ve dehidratasyon <ol><li> ne, ultra ince cımbız kullanarak stereomicroscope altında% 70 etanol sabit malzemeyi teşrihedles, forseps, fırçalar ve mikro-neşter (dokusunun maksimum boyutu yaklaşık 1 cm 3 veya düz malzeme için 2 cm olmalıdır). Kurutma dokuları önlemek için etanol ile kaplı bir Petri kabı içine örnekleri teşrih. Daha iyi kontrast beyaz dokuları görmek için kuru siyah silikon kaplı tabanı ile Petri kabı kullanın. </li><li> Kritik nokta kurutucu (CPD, Şekil 2a) için numune kapları disseke malzemeyi koyun. Bu noktada,% 70 etanol ile Petri kabı içine kapları batırmayın ve (kağıt ve kalem ile yapılan) örnek tanımlama etiketleri bulunmaktadır. Daha fazla manipülasyon için daha etkili kurutma için, aynı kapta genç ve olgun örnekleri karıştırma kaçının. * </li><li> kapların kapaklarını koyun ve% 70 etanol bol plastik santrifüj tüplerine bırakılması. Malzeme hemen işleme değilse bir gecede tüpleri saklayın. </li><li> Aşağıdaki etanol serisi ile disseke malzemeyi aktarın% 70,% 90,% 100 ve% 100: Hermetik kavanoz veya santrifüj tüplerine s. en az 1 saat boyunca, her çözelti içinde numune bırakın. % 100 etanol çözeltisi içinde bir gecede örnekleri tutun. </li><li> CPD (bölüm 4) malzeme ile kaplar aktarın. </li></ol></li><li> SEM gözlem için montaj ve hazırlanması bitki dokuları <ol><li> SEM numune tutucuları (yani, alüminyum koçanları) altında numune kimlik numarasını yazın. çift ​​taraflı bant ile koçanları üst kapağı. Bir örnek tutucu (Şekil 2b) içine taslakları yerleştirin. </li><li> Bir stereomikroskop altında, dikkatle zaten CPD kurutulmuş genç ve narin örnekleri taşıyan kapları açın. SMG tedavisinden sonra, numuneler elektrostatik daha hafif ve duyarlı hale gelmesi unutmayın. Numuneler toz veya kirleri önlemek için dışarı atılmıştır kez kapları kapatın. </li><li> , Taslakları yapışkan yüzeyinde örnekleri koymak öncesi planlama istenenpozisyon (örnekler yüzeyine dokunmayın kez bunları kaldırmak çok zordur). Bu noktada önemli bir diseksiyon taşımak kalkmayın; Sadece almak kolaydır istenmeyen doku kaldırmak. palinolojik çalışmalar için, anter incelemek ve koçanları üzerinde polen maruz açın. </li><li> Böyle yatay pozisyonda inflorescences olarak koymak uzun numuneler (örneğin, 2 cm uzunluğunda). Mümkün olduğunda, kutup, tarafı için aynı yapı ve alt görüşlerin şark örnekleri. saplama üzerindeki numuneler arasında yeterince boşluk bırakın. </li><li> Numuneler hemen işleme edilemiyorsa, * onları rehidrasyon (Şekil 2c) önlemek için silika jel ile hermetik kapta gecede korunmasını. Coat püskürtmeli kaplayıcı kullanılarak ve SEM aktarmak örnekleri (bölümler 5 ve 6). </li></ol></li></ol><img alt="şekil 2" src="/files/ftp_upload/55031/55031fig2.jpg" /> Şekil 2: Örnek işlenmesini Araçlarıve işleme SEM gözlem önce. GBM odası içinde etanol / CO2 değişimi için delikli duvarlı, (a) çelik yapımı numune kabı. (B) plastik numune tutucu içinde Çelik taslakları. (C) Cam kap nem ve tozdan korunmuş örnekleri tutmak için kullandı. Tabanda, silika jel bir bölme vardır. (D) Kritik Nokta Kurutucu. Önünde, manometre, güç düğmesi, sıcaklık kontrol sistemi, ve sıcaklık göstergesi (soldan sağa) vardır. CO 2 -etanol değişimi için olağan çalışma basıncı 60 bar (800 psi). üst, merkezi numune odasına yan dört valf (giriş, drenaj, havalandırma ve egzoz kontrolleri) vardır. Resimler Y. Ruiz-León ve MA Bello tarafından alınmıştır. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55031/55031fig2large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> &lt;<html> p class = &quot;jove_title&quot;&gt; 2. Farklı Yüzeylerde Saprolegnia (Omycetes) Kist Davranışının Çalışması <ol><li> Kistlere Büyüyen ve sabitleme <ol><li> (+) - - Glukoz (6 g) ve mikolojik pepton (3 g) * pepton ve glikoz (PG-l), D kullanılarak ortam 41 hazırlayın. Musluk suyu 900 mL toplayın ve 121 ° C&#39;de 40 dakika otoklavda. Daha önce otoklava çözelti A 50 mL (NaH 2 PO 4, 0.13 M) ve çözelti B 50 mL (Na 2 HPO 4, 0.13 M) dökün. </li><li> Pepton, glikoz, (PG-l olarak değil glikoz ve otoklav önce pepton Avrupa bakteriyolojik agar 10 g eklenerek hazırlanan PGA) ağar medyada tutulan Saprolegnia parasitica suşları stok kültürleri, 0.5 mL misel kolonileri büyümek Petri kutularında 20 ° C&#39;de 24-48 saat için PG-l damlacıklarının. C otoklavlanmış musluk suyu ile üç kere miselleri yıkama ve 20 ° C&#39;de 15 saat boyunca inkübe edilerek bunları sporlanmasını Uyarmaktadır= &quot;xref&quot;&gt; 42, 43. </li><li> yavaşça süspansiyon üst kısmını pipetleme tarafından yayımlanan ikincil zoosporlar toplayın ve 1 ml porsiyonlarda bunları havuz. İkincil kistlere 44 üretmek için vorteks kuvvetlice 30 saniye boyunca zoosporlar ajitasyon. </li><li> Daha önce (somon ve hake balık pulları, ayrı Petri kapları (p60) üzerine kistlerin dikenler diferansiyel büyümesini test etmek için, farklı yüzeyler (yani, karbon, altın ve bakır TEM ızgaraları üzerine ikincil kist süspansiyonu 0.5 mL koymak ağartılmış) ve cam kapak fişleri) *. yüzeye kistlerin eki yana 70 dakika, 20 ° C &#39;de kist inkübe edin. </li><li> sıvı çıkarın ve kistlerin tespiti için her bir yüzeye% 2 gluteraldehit 0.5 mL ekleyin. 1 saat boyunca bir çeker ocak altında oda sıcaklığında örnekleri tutun. </li><li> Glutaraldehit çıkarın ve bir etanol serisi (% 30,% 40,% 50,% 60,% 70,% 80 ile örnek dihidrat15 dakika boyunca, her etanol çözeltisi 5 ml ilave% 90,% 100 ve% 100). Son% 100 etanol çözeltisi içinde bir kez, numune bir sızdırmaz Petri kabındaki bir aya kadar saklanabilir. Bu aşamada, numuneler CPD kurutulabilir hazırdır. </li><li> Dikkatle CPD (Bölüm 4) için uygun bir tutucuya Petri kabı ızgaraları ve ölçekler aktarın. Bu adım için, birbirinden ayrılmış örnekleri tutmak GBM ızgara tutucu veya bir istifleme numune tutucu kullanın. kistler her zaman ızgaraları yukarı bakacak gerektiğini göz önünde tutarak, cımbız ile ızgaraları ve ölçekler atın. * </li></ol></li><li> SEM gözlem için montaj ve hazırlanması kist örnekleri <ol><li> Daha önce çift taraflı karbon bant ile kaplanmış ve altına etiketli alüminyum taslakları üzerinde ızgaraları ve ölçekler monte edin. </li><li> püskürtmeli kaplayıcı (bölüm 5) örnekleri aktarın. </li><li> SEM (bölüm 6) altında örnekleri dikkate alınız. </li></ol></li></ol>Phellorinia Herculanea Herbaryumun Mantar Sporlarının Çalışması <ol><li> Rehidrasyon ve sporların dehidratasyon <ol><li> Onları ezmek için özen ~ 0.5-1 cm 2 kalem-etiketli zarf oluşturan, filtre kağıdı ile dikkatlice her bir örnek sarın. ataç ile filtre kağıdı mühür. Bir Petri kabı dolu örnekleri aktarın ve sporlar etrafında dokuları rehydrate 10 mL su onları bırakın. </li><li> Hemen bir mikrodalga (yaklaşık 20 sn için 600 W) örnekleri koydu. su buharlaşmaya başlar kez malzemeyi çıkarın ve oda sıcaklığında soğumaya bırakın. </li><li> Aşağıdaki etanol dizi örnekleri geçirin:% 30,% 50,% 70,% 80,% 90,% 95,% 100 ve% 100. Numunelerin miktarına bağlı olarak, bu aşama için, bir bardak ya da santrifüj tüplerini kullanın. Her bir çözelti içinde 15 dakika boyunca numune bırakın. </li><li> CPD (bölüm 4) örnekleri yerleştirin. </li></ol></li><li> Montaj ve pSEM gözlem sporlar onarılması <ol><li> Zarfları açın. çift ​​taraflı bant ile önceden hazırlanmış saplama üzerinde sporları dökün. Alternatif olarak, * onları ezmek için özen koçanları yapışkan yüzeyi ile sporlar toplamak. </li><li> Örnekler birkaç sporlar içeren, önceki aşamasına ilave olarak, zarf (~ 1 ila 2 mm) ve küçük bir parça kesilmiş ve yeni bir saplama * üzerine yerleştirin. </li><li> püskürtmeli kaplayıcı (bölüm 5) içine dokuları yerleştirin. </li><li> SEM (bölüm 6) altında gözlemleyin. </li></ol></li></ol> Bir Kritik Nokta Kurutma Kullanılması Malzeme 4. Kurutma (CPD, Şekil 2d) <ol><li> havalandırılan bir alanda CPD kullanın ve makinenin tüm vanalar kapalı olduğunu doğrulayın. örnek odası boş ve temiz olup olmadığını kontrol edin. </li><li> Makinenin açın ve sıcaklık kontrol sistemi testi otomatik olarak gerçekleşir emin olun. SMG harici soğutma banyosu sistemi varsa, i açmadan önce su seviyelerini kontrolüzerinde t. </li><li> Etanol ve CO2 değişimi için kullanılan özel CPD üreticinin talimatlarına uyun. Güvenliğiniz için, makinenin kullanımı için eğitilmiş birinin gözetimi altında bu adımı devam. o hızlı basınç değişikliklerine maruz kaldığı, şiddetle dışarı darbe olabilir unutmayın. </li><li> örnekleri alınız ve bitki dokularında ile çalışan eğer adım 1.3 ile devam Oomycetes kistleri ile çalışan eğer 2.2 adım ve mantar sporları ile çalışan eğer 3.2 adımları. </li></ol> 5. Sputter Coater (Şekil 3a) kullanarak Altın Örnekleri Kaplama <ol><li> püskürtmeli kaplayıcı kontrol edin. altın katot hedefi iyi durumda olduğundan emin olun. Gerekirse vakum odasının duvarlarını ve oda kapağını temizlemek için% 90 etanol ile sırılsıklam bir tüy bırakmayan bir bez kullanın. </li><li> mikroskop altında örneklerin ileri tanımlama için her saplama deliği yanında sayılarla püskürtme tutucu işaretleyin. Dikkatle, sampl yüklü taslakları yerve es sabitleyin. düzensiz yüzeyleri olan numuneler üzerinde üniform bir kaplama sağlamak için, döner bir planeter örnek sahne kullanın. </li><li> Böyle bir çalışma mesafesi olarak ayarlarını yapmak için üreticinin talimatlarına uyun, operasyon gaz basıncı (örneğin, x 10 -1 5-7 x 10 -1 mbar) (örneğin, 30 mm.), Püskürtme süresi (örneğin, 50 s), altın tabakası (örneğin, 12 nm) güncel (örneğin, 15 mA) ve gerilim beslemesi (örneğin, 600 V) 45 kalınlığı. </li><li> taslakları çıkarın ve SEM (bölüm 6) götürün. Seçenek olarak ise, silika jel üzerinde (Şekil 2c) ile kapalı bir kap içine taslakları yerleştirin. </li></ol><img alt="Şekil 3," src="/files/ftp_upload/55031/55031fig3.jpg" /> Şekil 3: püskürtme kaplayıcıda (a) ve tarama elektron mikroskobu (B). (A) vakum odası (solda) önden görünümü, gaz valvE, zamanlayıcı, vakum ve mevcut kontroller. (Soldan sağa) SEM ana bileşenden (b) Yandan görünüm: numune odasına, kontrol grubu ile bilgisayar ekranı ve bölmenin monitör ile vakum sütun. Resimler Y. Ruiz-León tarafından alınmıştır. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55031/55031fig3large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> Tarama altında 6. Gözlem Elektron Mikroskobu (SEM, Şekil 3b) <ol><li> SEM başlatmak <ol><li> Başlangıç ve (bitkiler 2 mikron ve mantarlar ve Omycetes 4 mikron için, örneğin), çalışma gerilimine (örneğin, 15 kV) numune yüksekliği objektif diyafram çapı ayarlayarak, SEM ayarlamak için üreticinin talimatlarına uyun. </li><li> elektron ışını sisteminin doğru hizalanmasını kontrol edin ve eksenel hizalama ve üreticilerin endikasyona göre stigmators ayarlayın. t ayarlayıno alanın yeterli bir derinlik elde etmek için çalışma mesafesi. </li></ol></li><li> görüntü yakalama <ol><li> numunenin odaklanmış bir görüntü almak ve bir başlangıç ​​noktası olarak kullanabilirsiniz. maksimum seviyeye büyütme yakın arttırmak ve görüntüyü yeniden odaklanır. Bu tür delikler gibi yüzey düzensizlikler olan alanları seçin. Doğru astigmatizma ve optimum kontrast ve parlaklık ayarı. </li><li> yüksek çözünürlüklü SEM Resmi yakalayın. görüntü örnekleri ücret olduğunu gösterir eğer BSE dedektörü kullanın. Aksi takdirde, SE dedektörü ayarlayın. Üreticinin talimatlarını takip dedektörleri değiştirin. </li></ol></li></ol>

<ol><li>Endress, P. K., Baas, P., Gregory, M. <a target="_blank" href="https://www.jstor.org/stable/1224342">Systematic plant morphology and anatomy: 50 years of progress.</a> Taxon. 49 (3), 401-434 (2000).</li>
<li>Falk, R. H., Gifford, E. M., Cutter, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scanning+electron+microscopy+of+developing+plant+organs%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Scanning electron microscopy of developing plant organs.</a> Science. 168 (3938), 1471-1474 (1970).</li>
<li>Damblon, F. <a target="_blank" href="http://agris.fao.org/agris-search/search.do?recordID=US201302493527">Sputtering, a new method of coating pollen grains in scanning electron microscopy.</a> Grana. 15 (3), 137-144 (1975).</li>
<li>Everhart, T. E., Thornley, R. F. M. <a target="_blank" href="http://iopscience.iop.org/article/10.1088/0950-7671/37/7/307/meta;jsessionid=7E1AD627C2EB212EC20198D5ED6B0B6E.ip-10-40-1-105">Wide-band detector for micro-microampere low-energy electron currents.</a> J. Sci. Instrum. 37 (7), 37246-37248 (1960).</li>
<li>Collins, S. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advantages+of+environmental+scanning+electron+microscopy+in+studies+of+microorganisms%5BTitle%5D)+AND+%22Microsc.+Res.+Techniq%22%5BJournal%5D)">Advantages of environmental scanning electron microscopy in studies of microorganisms.</a> Microsc. Res. Techniq. 25 (5-6), 398-405 (1993).</li>
<li>Fannes, W., Vanhove, M. P. M., Huyse, T., Paladini, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+scanning+electron+microscope+technique+for+studying+the+sclerites+of+Cichlidogyrus%5BTitle%5D)+AND+%22Parasitol.+Res%22%5BJournal%5D)">A scanning electron microscope technique for studying the sclerites of Cichlidogyrus.</a> Parasitol. Res. 114 (5), 2031-2034 (2015).</li>
<li>Erbar, C., Leins, P. <a target="_blank" href="http://agris.fao.org/agris-search/search.do?recordID=US201301514989">Portioned pollen release and the syndromes of secondary pollen presentation in the Campanulales-Asterales complex.</a> Flora. 190 (4), 323-338 (1995).</li>
<li>Jansen, S., Smets, E., Baas, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Vestures+in+woody+plants%3A+a+review%5BTitle%5D)+AND+%22IAWA+Journal%22%5BJournal%5D)">Vestures in woody plants: a review.</a> IAWA Journal. 19 (4), 347-382 (1998).</li>
<li>Bortolin Costa, M. F., et al. <a target="_blank" href="http://link.springer.com/article/10.1007/s12229-014-9131-5">Stigma diversity in tropical legumes with considerations on stigma classification.</a> Bot. Rev. 80 (1), 1-29 (2014).</li>
<li>Almeida, O. J. G., Cota-Sánchez, J. H., Paoli, A. A. S. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1433831913000589">The systematic significance of floral morphology, nectaries, and nectar concentration in epiphytic cacti of tribes Hylocereeae and Rhipsalideae (Cactaceae).</a> Perspect. Plant Ecol. 15 (5), 255-268 (2013).</li>
<li>Konarska, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+the+structure+of+floral+nectaries+in+two+Euonymus+L.+species+%28Celastraceae%29%5BTitle%5D)+AND+%22Protoplasma%22%5BJournal%5D)">Comparison of the structure of floral nectaries in two Euonymus L. species (Celastraceae).</a> Protoplasma. 252 (3), 901-910 (2015).</li>
<li>Giuliani, C., Maleci Bini, L. <a target="_blank" href="http://link.springer.com/article/10.1007/s00606-008-0085-0">Insight into the structure and chemistry of glandular trichomes of Labiatae, with emphasis on subfamily Lamioideae.</a> Plant Syst. Evol. 276 (3-4), 199-208 (2008).</li>
<li>Li, K., Zheng, B., Wang, Y., Zhou, L. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/288712364_Breeding_system_and_pollination_biology_of_Paeonia_delavayi_Peaoniaceae_an_endangered_plant_in_the_Southwest_of_China">L.Breeding system and pollination biology of Paeonia delavayi (Paeoniaceae), an endangered plant in the Southwest of China.</a> Pak. J. Bot. 46 (5), 1631-1642 (2014).</li>
<li>García, L., Rivero, M., Droppelmann, F. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/290624987_Descripcion_morfologica_y_viabilidad_del_polen_de_Nothofagus_nervosa_Nothofagaceae">Descripción morfológica y viabilidad del polen de Nothofagus nervosa (Nothofagaceae).</a> Bosque. 36 (3), 487-496 (2015).</li>
<li>Prenner, G., Klitgaard, B. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Towards+unlocking+the+deep+nodes+of+Leguminosae%3A+floral+development+and+morphology+of+the+enigmatic+Duparquetia+orchidacea+%28Leguminosae%2C+Caesalpinioideae%29%5BTitle%5D)+AND+%22Am.+J.+Bot%22%5BJournal%5D)">Towards unlocking the deep nodes of Leguminosae: floral development and morphology of the enigmatic Duparquetia orchidacea (Leguminosae, Caesalpinioideae).</a> Am. J. Bot. 95 (11), 1349-1365 (2008).</li>
<li>Ratnayake, K., Joyce, D. C., Webb, R. I. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304423812001367">A convenient sample preparation protocol for scanning electron microscope examination of xylem-occluding bacterial biofilm on cut flowers and foliage.</a> Sci. Hortic-Amsterdam. 140 (1), 12-18 (2012).</li>
<li>Çolak, G., Celalettin Baykul, M., Gürler, R., Çatak, E., Caner, N. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/286296902_Investigation_of_the_effects_of_aluminum_stress_on_some_macro_and_micro-nutrient_contents_of_the_seedlings_of_Lycopersicon_Esculentum_mill_By_using_scanning_electron_microscope">Investigation of the effects of aluminium stress on some macro and micro-nutrient contents of the seedlings of Lycopersicon esculentum Mill. by using scanning electron microscope.</a> Pak. J. Bot. 46 (1), 147-160 (2014).</li>
<li>Arafa, S. Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Scanning+electron+microscope+observations+on+the+monogenean+parasite+Paraquadriacanthus+nasalis+from+the+nasal+cavities+of+the+freshwater+fish+Clarias+gariepinus+in+Egypt+with+a+note+on+some+surface+features+of+its+microhabitat%5BTitle%5D)+AND+%22Parasitol.+Res%22%5BJournal%5D)">Scanning electron microscope observations on the monogenean parasite Paraquadriacanthus nasalis from the nasal cavities of the freshwater fish Clarias gariepinus in Egypt with a note on some surface features of its microhabitat.</a> Parasitol. Res. 110 (5), 1687-1693 (2012).</li>
<li>Uppalapatia, S. R., Kerwinb, J. L., Fujitac, Y. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/249927031_Epifluorescence_and_Scanning_Electron_Microscopy_of_Host-Pathogen_Interactions_between_Pythium_porphyrae_Peronosporales_Oomycota_and_Porphyra_yezoensis_Bangiales_Rhodophyta">Epifluorescence and scanning electron microscopy of host-pathogen interactions between Pythium porphyrae (Peronosporales, Oomycota)and Porphyra yezoensis (Bangiales, Rhodophyta).</a> Bot. Mar. 44 (2), 139-145 (2001).</li>
<li>Meaney, M., Haughey, S., Brennan, G. P., Fairweather, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+scanning+electron+microscope+study+on+the+route+of+entry+of+clorsulon+into+the+liver+fluke%2C+Fasciola+hepatica%5BTitle%5D)+AND+%22Parasitol.+Res%22%5BJournal%5D)">A scanning electron microscope study on the route of entry of clorsulon into the liver fluke, Fasciola hepatica.</a> Parasitol. Res. 95 (2), 117-128 (2005).</li>
<li>Sundarasekar, J., Sahgal, G., Subramaniam, S. <a target="_blank" href="http://www.banglajol.info/index.php/BJP/article/view/11625">Anti-candida activity by Hymenocallis littoralis extracts for opportunistic oral and genital infection Candida albicans.</a> Bangladesh J. Pharmacol. 7 (3), 211-216 (2012).</li>
<li>Benhamou, N., Rey, P., Picard, K., Tirilly, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultrastructural+and+cytochemical+aspects+of+the+interaction+between+the+mycoparasite+Pythium+oligandrum+and+soilborne+plant+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Ultrastructural and cytochemical aspects of the interaction between the mycoparasite Pythium oligandrum and soilborne plant pathogens.</a> Phytopathology. 89 (6), 506-517 (1999).</li>
<li>Singh, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((First+evidence+of+putrescine+involvement+in+mitigating+the+floral+malformation+in+mangoes%3A+A+scanning+electron+microscope+study%5BTitle%5D)+AND+%22Protoplasma%22%5BJournal%5D)">First evidence of putrescine involvement in mitigating the floral malformation in mangoes: A scanning electron microscope study.</a> Protoplasma. 251 (5), 1255-1261 (2014).</li>
<li>Xiang, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fine+mapping+of+a+palea+defective+1+%28pd1%29%2C+a+locus+associated+with+palea+and+stamen+development+in+rice%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Rep%22%5BJournal%5D)">Fine mapping of a palea defective 1 (pd1), a locus associated with palea and stamen development in rice.</a> Plant Cell Rep. 34 (12), 2151-2159 (2015).</li>
<li>Mendoza, L., Hernandez, F., Ajello, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Life+cycle+of+the+human+and+animal+oomycete+pathogen+Pythium+insidiosum%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Clin.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Life cycle of the human and animal oomycete pathogen Pythium insidiosum.</a> J. Clin. Microbiol. 31 (11), 2967-2973 (1993).</li>
<li>Bello, M. A., Rudall, P. J., González, F., Fernández, J. L. <a target="_blank" href="http://www.jstor.org/stable/10.1086/422046?seq=1#page_scan_tab_contents">Floral morphology and development in Aragoa (Plantaginaceae) andrelated members of the order Lamiales.</a> Int. J. Plant Sci. 165 (5), 723-738 (2004).</li>
<li>Bello, M. A., Hawkins, J. A., Rudall, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Floral+morphology+and+development+in+Quillajaceae+and+Surianaceae+%28Fabales%29%2C+the+species-poor+relatives+of+Leguminosae+and+Polygalaceae%5BTitle%5D)+AND+%22Ann.+Bot%22%5BJournal%5D)">Floral morphology and development in Quillajaceae and Surianaceae (Fabales), the species-poor relatives of Leguminosae and Polygalaceae.</a> Ann. Bot. 100 (4), 1491-1505 (2007).</li>
<li>Bello, M. A., Hawkins, J. A., Rudall, P. J. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/262313633_Floral_Ontogeny_in_Polygalaceae_and_Its_Bearing_on_the_Homologies_of_Keeled_Flowers_in_Fabales">Floral ontogeny in Polygalaceae and its bearing on the homologies of keeled flowers in Fabales.</a> Int. J. Plant Sci. 171 (5), 482-498 (2010).</li>
<li>Bello, M. A., Alvarez, I., Torices, R., Fuertes-Aguilar, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Floral+development+and+evolution+of+capitulum+structure+in+Anacyclus+%28Anthemideae%2C+Asteraceae%29%5BTitle%5D)+AND+%22Ann.+Bot%22%5BJournal%5D)">Floral development and evolution of capitulum structure in Anacyclus (Anthemideae, Asteraceae).</a> Ann. Bot. 112 (8), 1597-1612 (2013).</li>
<li>Bello, M. A., Martínez-Asperilla, A., Fuertes-Aguilar, J. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/boj.12391/abstract">Floral development of Lavatera trimestris and Malva hispanica reveals the nature of the epicalyx in the Malva generic alliance.</a> Bot. J. Linn. Soc. 181 (1), 84-98 (2016).</li>
<li>Calonge, F. D., Martínez, A. J., Falcó, I., Samper, L. E. <a target="_blank" href="http://bddoc.csic.es:8080/detalles.html?id=209351&bd=ICYT&tabla=docu">Phellorinia herculanea f. stellata f. nova encontrada en España.</a> Bol. Soc. Micol.Madrid. 35 (1), 65-70 (2011).</li>
<li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Deciphering+microbial+landscapes+of+fish+eggs+to+mitigate+emerging+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22ISME+J%22%5BJournal%5D)">Deciphering microbial landscapes of fish eggs to mitigate emerging diseases.</a> ISME J. 8 (10), 2002-2014 (2014).</li>
<li>Sandoval-Sierra, J. V., Diéguez-Uribeondo, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comprehensive+protocol+for+improving+the+description+of+Saprolegniales+%28Oomycota%29%3A+two+practical+examples+%28Saprolegnia+aenigmatica+sp.+nov.+and+Saprolegnia+racemosa+sp.+nov.%29%5BTitle%5D)+AND+%22PLOS+one%22%5BJournal%5D)">A comprehensive protocol for improving the description of Saprolegniales (Oomycota): two practical examples (Saprolegnia aenigmatica sp. nov. and Saprolegnia racemosa sp. nov.).</a> PLOS one. , (2015).</li>
<li>Endress, P. K. <a target="_blank" href="http://agris.fao.org/agris-search/search.do?recordID=US201303213009">Zur vergleichenden Entwicklungsmorphologie, Embryologie und Systematik bei Laurales.</a> Bot. Jahrb. Syst. 92 (2), 331-428 (1972).</li>
<li>Tucker, S. <a target="_blank" href="https://www.jstor.org/stable/2441644">Floral development in Saururus cernuus (Saururaceae):1. Floral initiation and stamen development.</a> Am. J. Bot. 62 (3), 993-1005 (1975).</li>
<li>Endress, P. K., Matthews, M. L. <a target="_blank" href="http://link.springer.com/article/10.1007/s00606-011-0576-2">Progress and problems in the assessment of flower morphology in higher-level systematics.</a> Plant Syst. Evol. 298 (2), 257-276 (2012).</li>
<li>Beakes, G. W., Glockling, S. L., Sekimoto, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+evolutionary+phylogeny+of+the+oomycete+%26%2334%3Bfungi%26%2334%5BTitle%5D)+AND+%22Protoplasma%22%5BJournal%5D)">The evolutionary phylogeny of the oomycete &#34;fungi&#34.</a> Protoplasma. 249 (1), 3-19 (2012).</li>
<li>Romansic, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+the+pathogenic+water+mold+Saprolegnia+ferax+on+survival+of+amphibian+larvae%5BTitle%5D)+AND+%22Dis.+Aquat.+Organ%22%5BJournal%5D)">Effects of the pathogenic water mold Saprolegnia ferax on survival of amphibian larvae.</a> Dis. Aquat. Organ. 83 (3), 187-193 (2009).</li>
<li>van West, P. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0269915X0600053X">Saprolegnia parasitica, an oomycete pathogen with a fishy appetite: new challengues for an old problem.</a> Mycologist. 20 (3), 99-104 (2006).</li>
<li>Johansen, D. A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aJohansen%2C+DA+%22Plant+microtechnique%22">Plant microtechnique</a>. , McGrow-Hill. New York. (1940).</li>
<li>Unestam, T. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1399-3054.1965.tb06911.x/full">Studies on the crayfish plague fungus Aphanomyces astaci. Some factors affecting growth in vitro.</a> Physiol. Plantarum. 18 (2), 483-505 (1965).</li>
<li>Cerenius, L., Söderhäll, K. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/222195448_Repeated_zoospore_emergence_from_isolated_spore_cysts_ofAphanomyces_astaci">Repeated zoospore emergence from isolated spore cysts of Aphanomyces astaci.</a> Exp. Mycol. 8 (4), 370-377 (1984).</li>
<li>Diéguez-Uribeondo, J., Cerenius, L., Söderhäll, K. <a target="_blank" href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0953756209810605">Repeated zoospore emergence in Saprolegnia parasitica.</a> Mycol. Res. 98 (7), 810-815 (1994).</li>
<li>Söderhäll, K., Svensson, E., Unestam, T. <a target="_blank" href="http://link.springer.com/article/10.1007/BF00443081">Chitinase and protease activities in germinating zoospore cysts of a parasitic fungus, Aphanomyces astaci, Oomycetes.</a> Mycopathologia. 64 (1), 9-11 (1978).</li>
<li>Echlin, P. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aEchlin%2C+P+%22Handbook+of+sample+preparation+for+scanning+electron+microscopy+and+X-Ray+Microanalysis%22">Handbook of sample preparation for scanning electron microscopy and X-Ray Microanalysis</a>. , Springer Science + Business Media, LLC. NY. (2009).</li>
<li>Osumi, M., et al. <a target="_blank" href="https://academic.oup.com/jmicro/article-abstract/32/4/321/837464/Preparation-for-Observation-of-Fine-Structure-of">Preparation for observation of fine structure of biological specimens by high-resolution SEM.</a> Microscopy. 32 (4), 321-330 (1983).</li>
<li>Rezinciuc, S. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22The+Saprolegniales+morpho-molecular+puzzle%3A+an+insight+into+markers+identifying+specific+and+subspecific+levels+in+main+parasites%22">The Saprolegniales morpho-molecular puzzle: an insight into markers identifying specific and subspecific levels in main parasites</a>. , Universidad Internacional Menéndez Pelayo. Doctoral Thesis (2013).</li>
</ol>

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.

Standart SEM protokollere göre, burada sunulan prosedürler nispeten hızlı takip edilmesi kolay ve düşük maliyetli metodolojileri içerir. Numunelerin miktarı ve işleme kolaylığı bağlı olarak, kaliteli görüntüler elde etmek için dört-beş gün sürer. CPD ve SEM çalışması için yeterli güvenlik önlemleri de dahil olmak üzere, prosedürler ele kolaydır. Özellikle dikkat (1.1.3 ve protokolün 2.1.5 adımları 1.1.1 bakınız) formalin ve glutaraldehid ile alınmalıdır. Örnekleri zarar veya önceki adımları bozmadan gerekirse, süreç uzu...

Biyolojide, taramalı elektron mikroskobu kullanımı (SEM) yapısal evrimi, karşılaştırmalı morfoloji, organ gelişimi ve nüfus veya türlerin 1 karakterizasyonu çalışmalarına uzatıldı. Mikroskobik yapılar olan iki boyutlu görüntüsü, böyle bir mikromorffolojisinin ve sistematiği olarak alanlar 20. yüzyılın ikinci yarısından itibaren SEM tekniği avans yararlandı. Örneğin, 1970&#39;lerde püskürtmeli kaplama yönteminin tanıtımı olarak iletken olmayan dokularda 2, 3 görüntüleme yükseltmiş gibi sürgün uçları ve çiçekler gibi hassas malzemelerin olası gözlemler yapılmıştır. SEM yüksek vakumlu bir ortamda 4 topografya yeniden oluşturmak için numune yüzeyinden çıkarılır elektronları kullanır. SEM ile ilgili çalışmalar yapısal karakterlerin çıkarım ve growt yeniden inşası, hem de odaklanmışh süreçleri. Yeni yapısal taksonomi ile ilgili karakterler ve organizmaların geniş bir sistematiği SEM gözlemlerden tespit edilmiştir. Örneğin, bitki özellikleri gibi 10, 11, düzgün olmadan görüntülendi olamaz ahşap 5, stigma çeşitliliği 6, nectary ve çiçek morfolojisi 7, 8, pul detayları 9 ve polen taneleri ve vestured çukurlar olarak, türlerin teşhis veya Türüstü sınıflandırmaları için kullanılan SEM. Geleneksel SEM ile Başarılı gözlemler de uzun süre formalin ile fikse organizmalar 12 için elde edilmiş ve bitki herbaryum 13 numune. Öte yandan, SEM kullanılarak büyüme süreçlerinin yeniden yapılanma çalışmaları organ gelişimi 14, INFE gibi konularda, geniş bir yelpazede içerirBakterilerin 15, bitki kök fizyolojisi 16, parazit-konak bağlanma mekanizması 17, 18, parazitler 19, mycoparasitism ve antibiosis 20, 21, büyüme malformasyon 22 vahşi ve mutant bireylerin 23 karşılaştırmalı gelişme ve tüm yaşam döngülerini uyuşturucu etkileri tarafından uyarılan seksiyonlar 24. Çevre taramalı elektron mikroskopları (ESEM) 25 büyüme süreçlerinde ıslak biyolojik numunelerin gözlem için önemli avantajlara sahip olsa da, hassas malzeme dahi ESEM) düşük vakum koşullarında tehlikeye ve kaybını önlemek için yeterli işlenmesi gerekir olabilir değerli morfolojik gözlem. Bu yazıda, üç fark SEM gözlem için özel protokoller bir yorumdaÖrneklerin Erent tip sunulmuştur: floral meristemleri, Oomycetes (Saprolegnia), ve fungal madde. Bu protokoller belirli zorluklar ve alternatif çözümler bulunmuştur önceki SEM temelli çalışmalar 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, deneyimi derlemek. Bitki karşılaştırmalı gelişimsel ve yapısal çalışmaların durumunda, SEM kullanımı 1970&#39;li yıllarda 34, 35 yılında başlayan ve o zamandan beri, araştırmacılar belirli çiçek özellikleri, daha önce 36 düşünüldüğünden daha dayanıksız olduğunu keşfetti. çiçek gelişme İmar genç çiçek meristemler ve anthesis&#39;e arasındaki tüm aşamaların yakalama içerir. Bu amaca ulaşmak için, esse olduğunuÖrnek topografya ve hücre duvarı bütünlüğü fiksasyonu ve sonraki dehidratasyon sonra tehlikeye olmadığını ntial. Genç çiçek meristemler hücre duvarı çöküşüne özellikle savunmasız (Şekil 1a, 1b). Benzer şekilde, nectaries, yaprakları, püskülü ve Sporangium gibi hassas yapıların etkin ve undamaging protokolleri gerektirir. Bu yorum SEM görüntüleme için sağlam genç ve narin dokuları tutmak için optimal bir protokol özetlemektedir. Mikroplar ve bitkilerden omurgasızlar ve omurgalıların 37 arasında değişen ana Omycetes (Stramenopiles&#39;e) parazitlerin en farklı ve yaygın grupların olduğunuz kişiye durumunda - büyümek ve ıslak ortamda gelişebilir sporlar vardır. sporlar, standart SEM protokoller için uygun değildir yeterli alt tabaka gerektiğinden bu durum SEM gözlem için bir sorun teşkil etmektedir. Omycetes arasında Saprolegnia türleri özel ilgi onlar ca, çünkün su kültürlerinde, balıkçılık ve amfibi nüfus 38 ciddi azalmalar neden olur. Bu tür kistler çengel dikenler olarak mikromorfolojik özellikleri, enfeksiyon kontrolleri ve potansiyel tedaviler 39 kurmak esastır Saprolegnia, türlerini belirlemek için yararlı olduğu tespit edilmiştir. Burada, farklı yüzeylerde kistlerin omurga büyümesinin kalıplarını karşılaştırmak ve kritik nokta kurutma (CPD) hazırlanması ve daha sonraki SEM gözlem için örnek işlemek için bir deneysel protokol var. Üçüncü durumda, mantarlar Phellorinia Herculanea f sporların bir incelemeden sonra geldi ilginç bulgular vardır. stellata f. nova (Agaricales) 31. Birlikte sporlarla, beklenmedik kreş hücrelerinin bir grup SEM altında tespit edilmiştir. önceki geleneksel protokoller ve işlenmemiş malzeme ile, hemşire hücreleri ou geldit tamamen (Şekil 1c) çöktü. Sporların ilişkili belirli dokular hakkında ayrıntılı çıkarımlarda burada açıklanan (Şekil 1d) standart yaklaşımlara basit ama önemli değişiklikler yapılabilir. Bu derlemede, SEM gözlem ile ilgili farklı sorunlarla başa çıkmak için kullanılabilecek ayrıntılı SEM protokolleri vardır angiospermleri, bu tür hücre çöküşü ve meristematik doku daralması, kist dikenler optimum olmayan büyüme ve imha olarak Oomycetes ve Agaricales, sırasıyla geçici dokular. <img alt="Şekil 1" src="/files/ftp_upload/55031/55031fig1.jpg" /> Şekil 1: (A, C) ve (B, D) protokolü FAA-etanol-CPD olmadan muamele edilmiş numunelerin karşılaştırılması. (A - b) anacyclus clavatus, orta gelişme Çiçek tomurcukları. Tomurcuk ozmiyum tetroksit 46 &lt;ile işlemden geçirildi/ sup&gt; (a) ve FAA-CPD protokolü (B) ile muamele evlat. (C - d) Phellorinia Herculanea f sporlarla Hemşire hücreleri. stellata. Herhangi bir işleme (C) &#39;olmayan burada Agaricales&#39;e (d) için tarif edilen protokol ile örnekleri kurutulmuştur. turuncu sporlar. Ölçekler: (ab) 100 mikron (cd) 50 mikron. Resimler Y. Ruiz-León tarafından alınmıştır. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55031/55031fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a>

<table><tbody><tr><td>Asetik asit Belirli</td><td>bir tedarikçi</td><td></td> yok <td>Cilt tahrişi, göz tahrişi</td></tr><tr><td>alüminyum saplamalar</td><td>Ted Pella, Inc.</td><td>16221</td><td>www.tedpella.com</td></tr><tr><td>Santrifüj tüpleri</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Kritik Nokta Kurutucu</td><td>Polaron Quatum Technologies</td><td>CPD7501</td><td></td></tr><tr><td>D-(+)-Glikoz</td><td>Merck</td><td>1.083.421.000</td><td></td></tr><tr><td>Çift taraflı sellobant</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Etanol mutlak</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td> <td>yokYanıcı</td></tr><tr><td>Avrupa bakteriyolojik agar</td><td>Conda</td><td>1800.00</td><td>www.condalab.com</td></tr><tr><td>Filtre kağıdı</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Forseps</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Formalin 4%</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td> yok <td>Zararlı, akut toksisite, cilt hassasiyeti, kanserojenlik. Yanıcı</td></tr><tr><td>Cam kapak kaymaları</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Cam hermetik kap&nbsp;</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Gluteraldehit% 25 DC 253857.1611&nbsp; (L)</td><td>Dismadel Sl</td><td>3336</td><td>www.dismadel.com Mikolojik</td></tr><tr><td>pepton</td><td>Conda</td><td>1922.00</td><td>www.condalab.com</td></tr><tr><td>iğneler</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Petri kapları</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Plastik kaplar</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Kritik nokta kurutucu için kapaklı&nbsp; numune tutucu&nbsp;</td><td>Ted Pella, Inc.</td><td>4591</td><td>www.tedpella.com</td></tr><tr><td>neşterler</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Taramalı Elektron Mikroskobu</td><td></td> SEM <td></td> için Hitachi S3000N <td></td></tr><tr><td>Yazılımı</td> Çözüm A: NaH2PO4Çözüm B: Na2HPO<>sub4<td></td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Numune tutucular</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Püskürtme kaplayıcı</td><td>Balzers</td><td>SCD 004</td><td></td></tr><tr><td>Stereomikroskop</td><td>Belirli bir tedarikçi</td><td></td><td></td>yok</tr><tr><td>Transmisyon Elektron Mikroskobu (TEM) ızgaraları</td><td>Elektron Mikroskobu Bilimleri</td><td>G200 (Kare Mesh)</td><td></td></tr><tr><td>www.emsdiassum.com Cımbız</td><td>Belirli bir tedarikçi</td> <td>yok</td><td></td></tr></tbody></table>

sorunlu tesisi, oomiçet ve fungal Örnekleri için elektron mikroskobu (sem) protokoller tarayarak

Scanning Electron Microscopy (SEM) Protocols for Problematic Plant, Oomycete, and Fungal Samples

taramalı elektron mikroskobu (SEM) ile gözlemler için biyolojik numunelerin işlem en sık karşılaşılan sorunlardır hücre çökme ıslak mikroçevrelerde ve hücre tahrip örnekler işlemden geçirilmesini içerir. SEM altında fotoğraf çekimi için örnek tedavisinde başlıca zorluklardan bazıları üstesinden burada açıklanmıştır narin örnekleri işlemek için, belirli protokoller genç çiçek dokuları, oomiset kistler ve örnek olarak mantar sporları (Agaricales) kullanma. FAA ile tespit Çiçek meristemler (Formalin-Alkol-Asetik) ve Kritik Nokta Kurutma (CPD) ile işlenmiş hücresel duvarlar ya da bozuk organları çöktü göstermezse vermedi. Bu sonuçlar çiçek gelişiminin yeniden inşası için büyük önem taşımaktadır. Böyle glutaraldehit sabit oomiset kistleri gibi ıslak mikroçevrelerde, alınan örneklerin benzer bir CPD-temelli tedavi, su farklı türde tanısal özelliklerini diferansiyel büyümesini (örneğin, kist dikenleri) test etmek en uygunudurbstrates. mantar sporları bağlı hemşire hücrelerinin imha rehidrasyon, dehidratasyon ve CPD tedavisi, bu hücrelerin daha fonksiyonel çalışmalar için önemli bir adım sonra kaçınıldı. Burada ayrıntılı protokoller düşük maliyetli ve büyüme süreçlerini yeniden ve tanı özelliklerini incelemek için iyi kalitede görüntüler elde edilmesi için hızlı alternatifleri temsil etmektedir.

Çiçek Gelişim ve Geliştirme Fiksasyon ve Tam kurulan Bitki Yapıları Burada anlatılan FAA-CPD protokolü kullanarak, genç ve olgun bitki dokuları optimal sabit ve SEM görüntüleme için susuz vardır. Tomurcuklarının topografya ve şekli küçülen hücre (Şekil 1b, 1d, 4a-f) tarafından deforme olmaz çünkü bu tür çiçek gelişme olarak Süreçler yeniden inşa edilebilir. Karmaşık şekilli yapılar başarılı başka bir ulaşılamaz ...

Taramalı elektron mikroskobu gözlemi için biyolojik örneklerin işlenmesindeki sorunlar arasında hücre çökmesi, ıslak mikro ortamlardan alınan örneklerin işlenmesi ve hücre tahribatı yer alır. Çiçek meristemleri, oomycete kistleri ve mantarlar (Agaricales) gibi zorlu numunelerin hazırlanması için uygun düşük maliyetli ve nispeten hızlı protokoller burada derlenmiş ve detaylandırılmıştır.

Sorunlu Tesisi, Oomiçet ve fungal Örnekleri için Elektron Mikroskobu (SEM) Protokoller tarayarak

Common problems in the processing of biological samples for observations with the scanning electron microscope (SEM) include cell collapse, treatment of ...

Bu metodolojinin amacı, Taramalı Elektron Mikroskobu veya SEM altında en iyi gözlemleri için bitkilerden, oomycetes'ten ve mantarlardan elde edilen hassas dokuları ele almaktır. Bu yöntem, hemen hemen her mantar, mikrop, mor-forite ve bunların nasıl enfekte oldukları, kolonize oldukları ve konakçılarına nasıl bağlandıkları ile ilgili soruları yanıtlamamıza yardımcı olabilir. Geliştirilmiş metodolojimizdeki teknik, sucul ekosistemlerdeki mi-toh-minlerin bulunduğu numuneleri sabitlemek içindir.Bu tekniğin temel avantajı, pahalı ve kolay erişilebilir kaynakları kullanarak enfeksiyonun temel yönlerini görselleştirmemize izin vermesidir. Bu yöntemin görsel gösterimi kritik öneme sahiptir, çünkü adımlar geleneksel protokollerden çılgınca değiştirilmiştir. Ve yayınlanmış yöntemler, ayrıntılar olmadan genel prosedürleri açıklar.Başlamak için, formol ve asetik alkolü veya FAA sabitleyiciyi bir aldehit filtresi ile donatılmış bir çeker ocakta hazırlayın. 85 kısım %70 denatüre etanol, 10 kısım %60 formaldehit çözeltisi ve beş kısım buzlu asetik asit. Çeker ocak altında, FAA stoğunu ayrı kaplara dökün.Böcekler, mantarlar veya aşırı hava koşullarından zarar görmediklerinden emin olarak düzeltmek için çiçek veya vejetatif meristemleri seçin. İstenmeyen materyali çıkararak dalları kesin ve numuneyi hemen FAA solüsyonuna koyun. 72 ila 96 saat sonra, FAA'yı kimyasal bertaraf için plastik bir kaba dökün.Kalan FAA'yı çıkarmak için numuneleri hemen üç kez taze %70 etanol ile yıkayın. Sabit malzeme% 70 etanolde süresiz olarak saklanabilir. Dokuların kurumasını önlemek için numuneleri etanol ile kaplı bir Petri kabına inişleyin.Kontrast beyaz dokuyu daha iyi görmek için tabanı kuru, siyah bir silikonla kaplı bir Petri kabı kullanın. Dokuyu ayrı kaplara aktarın ve ardından bunları %70 etanol içeren bir Petri kabına daldırın. Kapakları kapların üzerine koyun ve bol miktarda %70 etanol içeren plastik santrifüj tüpüne koyun.Kesilen materyali hermetik kavanozlarda veya santrifüj tüplerinde bir etanol serisinden geçirin. Numuneleri her çözeltide en az bir saat bekletin. Daha sonra numuneleri gece boyunca %100 etanol solüsyonunda saklayın.Etanol serisini takiben, malzeme içeren kapları CPD'ye aktarın. SEM numune tutucularının altına numune kimlik numarasını yazın. Ardından saplamaların üstünü çift taraflı bantla kapatın.Saplamaları bir numune tutucuya yerleştirin. Stereo mikroskop altında, CPD'de önceden kurutulmuş olan genç ve hassas numuneleri taşıyan kapları dikkatlice açın. CPD işleminden sonra numunelerin daha hafif ve elektrostatiklere karşı hassas hale geldiğini unutmayın.Toz veya yabancı maddeleri önlemek için numuneler çıkarıldıktan sonra kapları kapatın. İstenilen pozisyon için önceden planlama yaparak numuneleri saplamaların yapışkan yüzeyine koyun. Numuneler yüzeye temas ettiğinde, onları çıkarmak çok zordur.Bu noktada büyük bir diseksiyon yapmaya çalışmayın. Sadece alınması kolay olan istenmeyen dokuyu çıkarın. Palinolojik çalışmalar için, anterleri inceleyin ve saplamalardaki polenleri ortaya çıkarmak için açın.Yeniden hidrasyonu önlemek için numuneleri gece boyunca silika jel içeren hermetik bir kapta koruyun. Numuneleri gözcü-kaplayıcı kullanarak kaplayın ve metin protokolünde açıklandığı gibi SEM'e aktarın. Kistlerin dikenlerinin diferansiyel büyümesini ayrı Petri kaplarında test etmek için, farklı yüzeylere 0,5 mililitre ikincil kist süspansiyonu koyun.Yüzeyler karbon, altın ve bakır transmisyon elektron mikroskobu ızgaralarını içerebilir. Önceden, ağartılmış somon ve hake balığı pulları ve cam kapak kaymaları. Kistleri 20 santigrat derecede 70 dakika inkübe edin, bu da kistlerin yüzeye yapışmasını kolaylaştırır.Sıvıyı çıkarın ve kistlerin sabitlenmesi için her yüzeye 0,5 mililitre% 2 glutaraldehit ekleyin. Numuneleri oda sıcaklığında çeker ocak altında bir saat bekletin. Glutaraldehiti çıkarın ve numuneleri bir etanol serisinden dehidre edin, 15 dakika boyunca etanol çözeltilerinin her birinden beş mililitre ekleyin.Son %100 etanol çözeltisine girdikten sonra, numune kapalı bir Petri kabında bir aya kadar saklanabilir. Izgaraları ve ölçekleri Petri kabından, numuneleri birbirinden ayrı tutan CPD'ye uygun bir tutucuya, örneğin bir CPD ızgara tutucusuna veya bir istifleme numune tutucusuna dikkatlice aktarın. Izgarayı ve tartıları cımbızla alın, kistlerin her zaman ızgaralara bakması gerektiğini unutmayın.Metin protokolünde açıklandığı gibi, farklı yüzeylerdeki davranışlarını gözlemlemek için oositlerin SEM numune hazırlığını gerçekleştirmeden önce CPD'yi kullanarak materyali kurutmaya devam edin. Her numuneyi filtre kağıdı ile dikkatlice sarın ve yaklaşık 0,5 ila bir santimetre kare kurşun kalem etiketli zarflar oluşturun. Numuneleri ezmemeye dikkat edin.Filtre kağıdını ataşlarla kapatın. Daha sonra paketlenmiş örnekleri bir Petri kabına aktarın ve sporların etrafındaki dokuyu yeniden sulandırmak için 10 mililitre suya batırın. Numuneleri hemen bir mikrodalgaya koyun.Su buharlaşmaya başladığında malzemeyi çıkarın ve oda sıcaklığında soğumaya bırakın. Daha sonra numuneyi bir etanol serisinden geçirin. Numune miktarına bağlı olarak, bu adım için bir beher veya santrifüj tüpü kullanın.Numuneleri her çözeltide 15 dakika bekletin. Ardından, örnekleri metin protokolünde açıklandığı gibi CPD'ye yerleştirin. SEM gözlemi için sporları monte etmek için zarfları açın.Daha sonra sporları saplamaların yapışkan yüzeyi ile toplayın ve ezmemeye dikkat edin. Son olarak, metin protokolünde ayrıntılı olarak açıklandığı gibi numunelerin altın kaplamasını ve SEM gözlemini gerçekleştirin. Burada, osmiyum tetroksit ile muamele edilen ve bu videoda gösterilen FAA CPD protokolü kullanılarak hazırlanan anacyclus clavatus'un çiçek tomurcukları gösterilmektedir.Ayrıca, herhangi bir tedavi olmaksızın kurutulmuş phellorinia herculanea örnekleri ve bu videoda gösterildiği gibi tedavi edilen mantar sporları da gösterilmiştir. Bu şekil, SEM altında yakalanan erken, orta ve geç çiçek gelişimini göstermektedir. Bu görüntü, genç bir reh-cim'in üstten görünümüdür.Burada jinezyum farklılaşması sırasında bir çiçek tomurcuğu ve antezde bir çiçek gösterilmiştir. Bazı yapıların SEM altında görüntüleme için düzeltilmesi ve korunması zor olabilir. Örnekler arasında ıslak ortamlardan gelenlerin yanı sıra süslemeli olanlar ve indumenta olanlar sayılabilir.Burada, saprolegnia parasitica'nın dikenlerinin cam, karbon, bakır, altın, mezgit pulları ve somon pulları üzerindeki diferansiyel büyüme modelleri gösterilmiştir. Bu, saprolegnia parasitica'nın aseksüel yaşam döngüsünü gösteren bir videodur. Eşeysiz yaşam döngüsü, bu organizmaların sucul veya nemli ortamlarında dağılması için önemlidir.Ayrıca, bu aşamada üretilen hayvanat bahçesi spoorları, saprolegnials takımının parazitik türlerinde birincil enfeksiyon birimini temsil eder. Bu teknikte ustalaşmak üç ila beş gün içinde yapılabilirken, düzgün bir şekilde gerçekleştirildiği gibidir. Madrid'deki Kraliyet Botanik Bahçesi'nde bu zaman diliminde dış kullanıma sağlanan SEM terapilerini tamamlamak için para kullandık.Bu videoyu izledikten sonra, araştırmacılar SEM gözlemi için hassas biyolojik materyali nasıl etkili bir şekilde toplayacaklarını ve düzelteceklerini bileceklerdi. Hücrelerin tahrip olması, organ bozulması veya ıslak ortamlardan alınan numunelerin kötü korunması bu prosedürle kolayca aşılabilir. Bu prosedürü denerken, SEM yoluyla yapılan gözlemin yüzeylerin yüksek büyütmeli çalışmasıyla sınırlı olduğunu hatırlamak önemlidir.Ayrıca CPD tedavisinden önce, contalar şok edici değişikliklerden ve hava ile doğrudan temastan korunmalıdır. Geliştirilmesinden sonra, bu teknik, fitoloji alanındaki araştırmacıların, özellikle balıkçılığa ilgi duyan türlerde, bulaşıcı süreç sırasında spor yapısını keşfetmelerinin yolunu açtı. Bu prosedürü takiben, hücre bileşiminin iç yapısının belirli bir organda veya hücrelerde veya polende nasıl olduğu gibi ek soruları yanıtlamak için İletim Mikroskobu veya TM gibi diğer yöntemler uygulanabilir.Formalin ve gluteraldehitin manipüle edilmesinin son derece tehlikeli olabileceğini ve bu prosedürü gerçekleştirirken çeker ocak altında çalışmak ve maske, laboratuvar önlüğü ve eldiven kullanmak gibi önlemlerin her zaman alınması gerektiğini unutmayın.

scanning-electron-microscopy-sem-protocols-for-problematic-plant

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Bu protokol büyümek ve niteliksel konfokal ve elektron mikroskobu ile mantar hif bakteri biyofilm analiz etmek için yeni bir yöntem açıklanır.

Yeni Bir Yöntem Filamentli Mantar kolonileri ile ilgili Bakteriyel Biyofilmler Niteliksel Çok ölçekli Analizi için kullanılması Eşodaklı ve Elektron Mikroskobu

SEM analiz tür kimlik ya da fenotipik ayrımcılık yardım etmek için etkili bir yöntemdir. Bu iletişim kuralı organizmalar üç temsilcisi tür özel morfolojik detayları inceleyerek yöntemlerini açıklar ve birçok organizma özelliklerinin incelenmesi için genel olarak geçerli olacaktır ve doku türleri.

Elektron mikroskobu (SEM) tarama morfolojik analiz için kimyasal kurutma kullanarak prokaryotik ve ökaryotik organizmaların hazırlanması

Burada iki örnek işleme teknikleri, buz gibi yüksek basınç birleştirmek için bir iletişim kuralı mevcut ve mikrodalga destekli örnek işleme, veri odaklı iyon demeti Taramalı elektron mikroskobu (FIB-SEM) ile edinme için gömme en az reçine izledi. Bu bir fare tibial sinir örnek ve Caenorhabditis eleganskullanarak gösterilmiştir.

Yüksek basınç dondurucu, mikrodalga destekli kontrast geliştirme ve en az reçine birim görüntüleme için katıştırma tarafından biyolojik örnek hazırlama

Çalışmada böcek sensillasının ultrayapısını gözlemlemek amacıyla tarama ve iletim elektron mikroskobu (sırasıyla SEM ve TEM) örnek hazırlama protokolü sunulmuştur. SEM.Floresan mikroskopide örnek deformasyonu önlemek için fiksatife ara 20 eklenmiştir.

Woodboring Böceği uzantıları için Tarama ve İletim Elektron Mikroskobu Örnek Hazırlama Yöntemi

Burada, seri blok yüz ve odaklanmış iyon ışını tarama elektron mikroskobu ile ilgi alanını hedefleyen bir protokolü etkin bir şekilde birleştirmek için bir protokol sıyoruz. Bu, üç boyutlu olarak verimli arama yapılmasına ve geniş bir görüş alanında nadir olayları bulmanızı sağlar.

Seri Blok Yüz ve Odaklanmış Iyon ışını Scan Elektron Mikroskobu Kullanılarak Yapılan Hedefli Çalışmalar

Burada taramalı elektron mikroskobu (SEM) kullanılarak hassas doku örneklerinin görüntülenmesi için ayrıntılı işleme protokolleri salıyoruz. Üç farklı işleme yöntemi, yani, hexamethyl disilazana (HMDS) kimyasal kurutma, basit hava kurutma, ve kritik nokta kurutma sert yumurta kabukları hazırlamak için açıklanmıştır, erken gelişim aşamalarında embriyolar, ve mantar kültürleri sırasıyla.

Taramalı Elektron Mikroskobu için Embriyo, Yumurta Kabuğu ve Mantar Kültürünün İşlenmesi

Mikro-BT, bitki yapılarını üç boyutlu olarak analiz edebilen tahribatsız bir araçtır. Mevcut protokol, parazitik bitki yapısını ve işlevini analiz etmek için mikro-BT'den yararlanmak için numune hazırlamayı açıklamaktadır. Belirli preparatlarla birleştirildiğinde bu yöntemin avantajlarını vurgulamak için farklı türler kullanılır.

Parazitik bitki-konakçı etkileşimlerini analiz etmek için mikro-BT taramasından yararlanma

Bu protokol, mikoheterotrofik bitki örneklerinin toplanması, sabitlenmesi ve sürdürülmesi için ayrıntılı prosedürler sağlamayı, mikorizal mantarlarla çimlenmiş bitki dokularında ve tohumlarda mantar kolonizasyonunu incelemek için tarama ve iletim elektron mikroskobu, ışık, konfokal ve floresan mikroskobu gibi farklı mikroskopi tekniklerini uygulamayı amaçlamaktadır.

Mikoheterotrofik Bitki Dokularında Mantar Kolonizasyonunu Yorumlamak ve Tohumların Simbiyotik Çimlenmesi için Mikroskopi Teknikleri

Mikrobiyota ve biyofilm ile birlikte bitki ve mantar biyokütlesi içeren oldukça heterojen ve hassas numuneleri görselleştirmek için optimize edilmiş bir Taramalı Elektron Mikroskobu protokolü öneriyoruz. Bu protokol, mikrobiyota organizasyonunun mekansal boyutlarının tanımlanmasına izin verir.

Attine Karıncalarının Bahçelerinin Mikrobiyotası: Elektron Mikroskobunu Tarayarak Mikrobiyal Bir Manzarayı Görselleştirmek

Yüksek kaliteli transmisyon elektron mikroskobu görüntüleri elde etmek, özellikle bol miktarda büyük su dolu vakuollere ve havalandırılmış alanlara sahip bitki hücreleri söz konusu olduğunda zordur. Tandem yüksek basınçlı dondurma ve hızlı dondurma ikamesi, mükemmel ultrastrüktürel korumaya sahip numuneler üretirken TEM için tesis numunelerinin hazırlanma süresini büyük ölçüde azaltır.

Tandem Yüksek basınçlı Donma ve Transmisyon Elektron Mikroskobu için Bitki Doku Hızlı Dondurma Değişiklik

Öğrenin, bitki, oomycete ve mantar örneklerini tarama elektron mikroskobu için hazırlama yöntemini. Bu protokol, hassas dokuların bütünlüğünü koruyarak enfeksiyon süreçlerini görselleştirir.

Sorunlu Tesisi, Oomiçet ve fungal Örnekleri için Elektron Mikroskobu (SEM) Protokoller tarayarak

Daha fazla video keşfet