Abstract
Окислительный стресс, который является результатом дисбаланса между производством и детоксикации активных форм кислорода, является одной из основных причин хронических заболеваний у человека, в том числе сердечно-сосудистых и нейродегенеративных заболеваний, диабета, старения и рака. Таким образом, важно, чтобы изучить окислительный стресс не только в клеточных системах, но и с помощью целых организмов. С. Элеганс является привлекательной моделью организм изучать генетику окислительных трансдукции сигнала напряжения, которые высоко эволюционно консервативных.
Здесь мы предоставляем протокол для измерения окислительного стрессоустойчивости С. Элеганс в жидкости. Вкратце, РОС-индуцирующие реагенты, такие как паракват (PQ) и H 2 O 2 растворяют в буфере M9, и аликвоты растворов в лунках микротитрационного планшета 96 скважины. Синхронное L4 / молодой взрослый С. Элеганс животные передаются в лунки (5-8 животных / а) и выживание измеряетсякаждый час до тех пор, большинство червей не мертвы. При выполнении окислительный стресс сопротивления анализа с использованием низкой концентрации стресса в пластинах, старение может повлиять на поведение животных После окислительного стресса, который может привести к неправильной интерпретации данных. Тем не менее, в исследовании, описанном в данном документе, эта проблема вряд ли произойдет, поскольку используются только L4 / молодых взрослых животных. Кроме того, этот протокол является недорогим и результаты получены в один день, что делает эту технику привлекательной для генетических экранов. В целом, это поможет понять, окислительные пути сигнала напряжение трансдукции, которые могут быть переведены на более характеристик окислительного стресса связанный человека заболеваний.
Introduction
У эукариот, окислительного фосфорилирования происходит в электрон-транспортной цепи митохондрий является основным фактором производства энергии в форме АТФ. Активные формы кислорода (АФК) являются естественным побочным продуктом этого процесса. Несмотря на их важную роль в качестве сигнальных молекул, чрезмерное АФК может привести к повреждению ДНК, белков карбонилирования и окисления липидов. Дисбаланс между АФК и детоксикации вызывает окислительный стресс, что приводит к истощению энергии, клеточных повреждений, и запускает клеточную гибель 1,2. Окислительный стресс способствует старению и развитию многих угрожающих жизни заболеваний, включая рак, диабет, сердечно-сосудистые и нейродегенеративные заболевания 3-9.
Клетки развивались ферментативные и неферментативные стратегии защиты, чтобы поддерживать надлежащий уровень АФК и защитить своих избирателей от окислительного повреждения 1,2. Супероксиддисмутазы (СОД) ферменты действуют первым удобстRT супероксид-Н 2 О 2, который затем преобразуется в воде каталазы или пероксидазы ферментов. Номера ферментативные оборонные стратегии включают в себя в основном молекулы, которые реагируют быстрее с АФК по сравнению с клеточными макромолекулами, защищающих основные клеточные компоненты. Несмотря на защитной роли АФК детоксикации ферменты, некоторые молекулы АФК избежать антиоксидантными защитные механизмы и привести к окислительному повреждению. Обнаружение, ремонт и деградация поврежденных клеточных компонентов основных стратегий защиты во время окислительного стресса 1,2.
Сигнальных путей, участвующих в стрессоустойчивости и специально окислительного стресса высоко эволюционно консервативны 10,11. В отличие от экспериментов культивирования клеток, где организменном условия лишь частично воспроизведена, исследования окислительного стресса в модельных организмов 12,13 имеет большое значение. С Элеганс является свободно живущих нематод, которые могут быть легко и недорого культывается на бактериальной газон на агаре. Это небольшой по размеру (около 1 мм в длину) и нормально растет в качестве самостоятельного удобрения гермафродита, что облегчает генетические манипуляции. Он имеет быстрый жизненный цикл и высокую репродуктивную способность, производя около 300 потомков на поколение, что делает его мощным инструментом для выполнения масштабных генетических экраны 14. С. Элеганс генома полностью секвенировали и 40-50% генов, по прогнозам, будет гомологов болезни генов, ассоциированных с человека 15-18. Нокдаун генов интерес, используя RNAi является быстрым и легким в С. Элеганс. Джин вниз регулирование может быть достигнуто путем кормления животных Е. палочки бактерии, которые укрывают плазмиды, выражающее двухцепочечной РНК, которая нацелена на мРНК интерес 19. Таким образом, определение функции генов с использованием крупномасштабных RNAi экраны имеет большое влияние на понимание заболеваний человека, включая рак 20,21.
Исследования Oxidative стрессоустойчивость в С. Элеганс привели к идентификации консервативных механизмов резистентности к окислительному стрессу 13,22. Некоторые пути, выявленные общие пути, которые модулируют долговечность и устойчивость к другим стрессам, а также такие, как гипоксия, тепло, и осмотического стресса. Эти пути включают в себя секрецию инсулина, сигнализации TOR, и аутофагии. Другие ключевые пути привлечь детоксикации АФК, таких как супероксиддисмутаза ферментов и каталазы ферментов, или в репарации повреждений, таких как теплового шока и белков-шаперонов 11,13,22.
Этот протокол описывает, как определить устойчивость к окислительному стрессу С. Элеганс в жидкости. Мы использовали flcn-1 (ok975) и животных дикого типа, чтобы продемонстрировать протокол, так как мы показали ранее повышенную устойчивость к окислительному стрессу при потере flcn-1 (ok975) на C. Элеганс 23. Мы также показали, что повышенное сопротивление зависитна AMPK и аутофагии, оси сигнализации, что повышает клеточный биоэнергетику и способствует стрессоустойчивости 23. PQ является окислительный стресс, который влияет на электрон-транспортной цепи для производства видов реактивного кислорода 24. Анализ же могут быть адаптированы и другие источники ROS ROS или генерирующие соединения могут быть использованы, например, H 2 O 2 и ротенона. Аналогичные анализы были разработаны на пластинах, где низкие концентрации PQ используются 25,26. Преимущество такого анализа является то, что очень быстро, а результаты могут быть получены в один день. Кроме того, общий объем жидкости, используемой для выполнения окислительный стресс-устойчивости анализа в 96-луночных планшетах является низкой по сравнению с объемом, используемого для получения PQ-содержащие пластины. Таким образом, количество PQ используется в жидком тесте низкий, что делает этот анализ недорого и ограничивает производство токсичных отходов. Однако ограничения данного анализа по сравнению с пластинчатыми анализов включают ЛАCK пищи в жидком тесте и низкой концентрации кислорода в жидкости по сравнению с воздухом. Они являются важными факторами, которые в некоторых случаях, может повлиять на результаты. Таким образом, подтверждающие воспроизводимость с помощью других методов окислительного стресса сопротивления рекомендуется, чтобы поддержать результаты, полученные в этом тесте.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
1. Подготовка реагентов
- Подготовка средств массовой информации для С. Рост Элеганс (в данном случае, животных дикого типа и flcn-1 (ok975) мутантных животных).
- Готовят изменены только Бакто-пептон (грецкий) сухой смеси, содержащей Youngren 5,5 г Трис HCl, 2,4 г трис-основани, 31 г Bactopetone, 20 г NaCl и 0,08 г холестерина. Хорошо перемешать, встряхивая.
Примечание: Эта смесь является достаточным для получения 10 л MYOB среды.
Примечание: Нормальные ростовую среду (НГМ) пластины может быть использован вместо грецкий пластин 27. Тем не менее, тот же тип пластины должны быть использованы для сравнения между действительными и штаммов между независимыми повторами. В этом протоколе, мы использовали только грецкий пластины. - Подготовка 1 л MYOB среды путем добавления 6 г MYOB сухой смеси, 17 г агара и составляют до 1 л Н 2 О и автоклав в течение 45 мин при 122 ° С. Налейте пластин и дайте высохнуть при комнатной температуре в течение 2 дней.
- Использование стерильных, привить 100 мл cultuRe Л.Б. бульона среде с Е. палочка OP50 бактерии и расти O / N на 37 ° C.
- Семя MYOB пластины с Е. палочка OP50 бактерий. Позвольте ему расти при комнатной температуре в течение 48 ч.
- Готовят изменены только Бакто-пептон (грецкий) сухой смеси, содержащей Youngren 5,5 г Трис HCl, 2,4 г трис-основани, 31 г Bactopetone, 20 г NaCl и 0,08 г холестерина. Хорошо перемешать, встряхивая.
- Подготовка к генной подавлением с использованием RNAi
- Подготовка грецкий РНК-интерференции кормления пластины. Действуйте, как в шагах 1.1.1 и 1.1.2. После автоклавирования среда позволяют охладиться до приблизительно 55 ° С и добавляют 1 мл 1 М изопропилового β-D-1-тиогалактопиранозида (IPTG) и 1 мл 100 мМ ампициллина.
- Е. подряд палочка HT115 бактерии, трансформированные плазмидой, которая экспрессирует либо управления EV или flcn-1 специфический RNAi на ампициллин (50 мкг / мл) / тетрациклин (15 мкг / мл) чашки с агаром. Выращивают культуры O / N при 37 ° С.
- Выберите колонии и привить Е. палочка HT115 бактерии, трансформированные плазмидой, которая выражает либо контроля Е.В. или flcn-1 РНК-интерференции конкретных и расти культуры в LB / ампициллин (50 мкг / мл) средних и O / N в 37 & #176; С.
- Семенной пластин с Е. палочка HT115 EV бактерии или HT115 flcn-1 RNAi бактерии.
ПРИМЕЧАНИЕ: Держите пластины 48 ч при комнатной температуре перед использованием. Если РНК-интерференции нокдаун от кормления в эффективной, использовать другие методы доставки DS-РНК 28.
- Стимулирование окислительный стресс, используя параквата (PQ):
- Подготовьте M9 буфер путем смешивания 3 г КН 2 РО 4, 6 г Na 2 HPO 4, 5 г NaCl и 0,25 г MgSO 4 · 7Н 2 О. Принесите до 1 л дистиллированной воды. Автоклав раствор в течение 45 мин при 122 ° С и хранить при комнатной температуре бутылок.
- В день анализа, подготовить M9 / PQ-содержащий раствор. Для этого протокола, используйте 100 мМ PQ (0,1028 г PQ, растворенного в 4 мл M9 буфера заполняет весь 96-луночных с 40 мкл / M9 PQ на лунку).
ВНИМАНИЕ: PQ является опасным и очень токсичен. Обращайтесь в соответствии с соответствующими руководящими принципами.
ПРИМЕЧАНИЕ: При первом запуске новых Sпоезд или новое состояние, рекомендуется для анализа выживаемости в увеличении концентрации PQ, чтобы определить наилучший концентрации, чтобы использовать для того, чтобы убить животных в 7-10 ч.
2. Подготовка Возраст синхронизированной L4 населения
- Передача 20 беременных взрослых гермафродитов на свежий MYOB пластины засеянного Е. палочка OP50 бактерий. Подготовьте несколько пластин в зависимости от количества червей, необходимых в процессе анализа.
- Позвольте им, чтобы отложить яйца в течение 6 ч, а затем с помощью платиновой проволоки червя выбрать Удалить матерей. Проверьте пластины под микроскопом, чтобы определить количество яиц.
- Разрешить яйца в люк и расти при 20 ° С в течение 48 ч. В это время, животные в конце L4 / молодой взрослой стадии. Выберите те же стадии животных и передать на PQ решений, содержащих скважин.
Примечание: С 48 ч инкубации относится только к мутантам, которые растут так же, как у животных дикого типа, важно контролировать развитияСкорость недавно протестированных мутантов, чтобы обеспечить его соответствие темпов развития дикого типа, в противном случае, другие сроки должны быть использованы. - Кроме того, использование методов синхронизации. Генерация синхронизированный население L1 личинок червей с использованием гипохлорита раствор (25 мл воды, 125 мл 5,25% раствора гипохлорита натрия, 50 мл 4 М NaOH; обернуть бутылку с алюминиевой фольгой, чтобы изолировать от света). Тем не менее, для этого анализа, не рекомендуется, так как интенсивное отбеливание может повлиять на поведение животных во время теста.
ВНИМАНИЕ: Обращайтесь раствор гипохлорита в соответствии с руководящими принципами.
ПРИМЕЧАНИЕ: При использовании RNAi вниз регулировать интерес ген, синхронизировать гермафродитов, как описано в разделе 2, за исключением передачи матерей к РНК-интерференции пластин, посеянных с конкретными бактерий РНК-интерференции. Когда нокдаун с РНК-интерференции является слабым, кормление нескольких поколений рекомендуется.
3. Выполнение окислительного стресса Сопротивление Пробирной </ P>
- Пипетка 40 мкл раствора мМ PQ 100 (полученного свежего) к каждой лунке 96-луночного планшета. Используйте по крайней мере 12 скважин, как повторяет каждого условия (лечения, мутанта, и т.д.). Использование платиновой проволоки червя выбор, передать 5-8 L4 личинок животных в каждую лунку с указанием времени начала и время окончания.
- При запуске еще одно условие, обратите внимание на время начала и время окончания. Поместите пластину на 20 ° C во время инкубации между передачи червей и забил мертвых животных через час с момента старта.
- Использование рассекает микроскоп, рассчитывать выживания каждый час. Слегка встряхните пластину, прежде чем начать рассчитывать. Укажите червей, которые не двигаются, даже после кровянистые выделения свет высокой интенсивности, а мертвых животных. Также укажите количество животных в живых.
ПРИМЕЧАНИЕ: Глядя на форму червя, хвосты и движения головы при сильном увеличении, поможет определить мертвые черви из живых. - Повторите этот шаг каждый час, пока большинство червей не мертвы.
- Рассчитать общее количество животных на каждое условие, добавив общее количество животных, передаваемых в каждую лунку. Не обращайте внимания на животных, которые были повреждены или погибли при передаче.
- Для каждого момента времени, вычислить общее количество погибших животных на каждое условие (сумма мертвых животных в 12 лунок). Для каждого момента времени, расчета процент смерти (число умерших животных, поделенное на общее число животных и умноженное на 100) и процент выживаемости (100 минус процент смерти).
- Повторите этот анализ не менее 3 независимых раза.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Сравнивая дикого типа С. Элеганс, чтобы flcn-1 (ok975) мутантных животных
Здесь мы использовали 100 мМ PQ для определения сопротивления дикого типа C. Элеганс животных по сравнению с flcn-1 (ok975), который, как было показано, чтобы противостоять окислительного стресса, тепла и аноксии 23. После 4 ч обработки, 48,3% дикого типа выжили, по сравнению с 77,8% выживаемости в flcn-1 (ok975) животных. Как и ожидалось, flcn-1 (ok975) мутантные животные были более стойкими к 100 мМ PQ сравнению с диким типом (рисунок 2 и таблица 1).
Сравнивая дикого типа животных кормили контрольной EV или flcn-1 RNAi бактерии
Как и в результате представленной в предыдущем разделе, вниз регулирования flcn-1 с помощью РНК-интерференции повышенной стойкости до 100 мм PQ. Этот результат показывает, что вниз регулирование функции гена, используя RNAi имитирует потери из-функций м utation (рисунок 2 и таблица 1).
Рисунок 1. Схема фигура метода определения стрессоустойчивости окислительного в 96-луночных в C. Элеганс.
Синхронные L4 / молодые взрослые животные, выращенные на пластинах и грецкий кормили E. Coli OP50 бактерий передаются в лунки микротитрационного планшета с 96 а, содержащего 100 мМ PQ и выживания измеряется почасовая пока большое количество червей не мертвы. В случае РНК-интерференции нокдаун, та же самая процедура, за исключением того, что синхронизированные животных выращивают на пластинах с добавлением IPTG, и подаются с Е. палочка HT115 бактерии, несущие плазмиду, котора будет нокдаун гена-мишени при экспрессии.
Файлы / ftp_upload / 52746 / 52746fig2.jpg "/>
Рисунок 2. Потеря FLCN-1 повышает устойчивость к окислительному стрессу в С. Элеганс. (A - B) Процент выживаемости до 100 мм PQ (а) и масс-flcn 1 (ok975) мутантных животных и (б) мас животных, обработанных контролем или flcn-1 RNAi.
Процент выживаемости до 100 мм PQ | |||||
1 час | Процедить, РНК-интерференции | Процент выживания (± SD) | Значение р | Количество экспериментов | Общее количество червей |
вес | 82,38 ± 1,31 | 0,0002 | 3 | 210 | |
flcn-1 (ok975) | 99.03 ± 1.67 | 3 | 224|||
вес; управления | 91.70 ± 0.55 | 0,0462 | 3 | 202 | |
мас; flcn-1 (RNAi) | 95.93 ± 2.48 | 3 | 207 | ||
2 ч | Процедить, РНК-интерференции | Процент выживания (± SD) | Значение р | Количество экспериментов | Общее количество червей |
вес | 72.13 ± 7.13 | 0,005 | 3 | 210 | |
flcn-1 (ok975) | 96.33 ± 2.28 | 3 | 224 | ||
вес; управления | 80.27 ± 5.34 | 0,0261 | 3 | 202 | |
мас; flcn-1 (RNAi) | 91.23 ± 1.42 | 3 | 207 | ||
3 ч | Процедить, РНК-интерференции | Процент выживания (± SD) | Значение р | Количество экспериментов | Общее количество червей |
вес | 55.37 ± 4.72 | 0,0004 | 3 | 210 | |
flcn-1 (ok975) | 87.00 ± 1.36 | 3 | 224 | ||
вес; управления | 70.77 ± 3.50 | 0,0027 | 3 | 202 | |
мас; flcn-1 (RNAi) | 87.63 ± 2.67 | 3 | 207 | ||
4 ч | Процедить, РНК-интерференции | Процент выживания (± SD) | Значение р | Количество экспериментов | Общее количество червей |
вес | 48.30 ± 6.39 | 0,002 | 3 | 210 | |
flcn-1 (ok975) | 77.80 ± 3.12 | 3 | 224 | ||
вес; управления | 63.77 ± 0.66 | 0,0122 | 3 | 202 | |
мас; flcn-1 (RNAi) | 80.57 ± 6.68 | 3 | 207 | ||
5 ч | Процедить, РНК-интерференции | Процент выживания (± SD) | Значение р | Количество экспериментов | Общее количество червей |
вес | 41.60 ± 8.33 | 0,0062 | 3 | ||
flcn-1 (ok975) | 67.43 ± 1.42 | 3 | 224 | ||
вес; управления | 60.53 ± 2.58 | 0,0313 | 3 | 202 | |
мас; flcn-1 (RNAi) | 71.53 ± 5.24 | 3 | 207 | ||
6 ч | Процедить, РНК-интерференции | Процент выживания (± SD) | Значение р | Количество экспериментов | Общее количество червей |
вес | 34.86 ± 5.88 | 0,0021 | 3210 | ||
flcn-1 (ok975) | 60.34 ± 2.05 | 3 | 224 | ||
вес; управления | 44.43 ± 3.93 | 0,0042 | 3 | 202 | |
мас; flcn-1 (RNAi) | 62.13 ± 3.44 | 3 | 207 |
Таблица 1. Резюме результатов и статистического анализа окислительного стрессоустойчивости на рисунке 2.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
C. Элеганс является привлекательным модельный организм для изучения генетически окислительный стресс устойчивость в естественных условиях, так как он может быть легко культивировать, и быстро приводит к большому количеству генетически идентичных потомков. Различные способы для измерения окислительного стресса сопротивление были описаны ранее, и они основаны на добавок культуральных планшетах с различных источников, таких как ROS PQ, ротеноном, H 2 O 2, и юглон 25,26,29-32. Здесь мы опишем протокол, который измеряет окислительный стресс сопротивление в жидкости в 96-луночных планшетах с использованием 100 мМ PQ. Подобный анализ был выполнен с помощью Greer соавт. 33. Этот анализ может быть дополнительно приспособлен для изучения окислительного стресса в жидкости с использованием других источников ROS. Например, мы показали, что потеря flcn-1 повышает устойчивость к нескольким H 2 O 2 концентрации, а также 23.
Этот анализ может быть техническимLY сложным для некоторых штаммов, которые отображают подвижности дефектов или плавание, вызванной паралич фенотип таких как штаммы, несущие мутации в дофамина DAT-1 34. В этом случае, неспособность двигаться в заблуждение, поскольку это не обязательно означает снизился окислительный стресс устойчивость, а, скорее дефект моторику. Кроме того, подсчет убитых животных должны быть тщательно завершены, и исследователи должны обратить внимание на C. Элеганс поведенческие детали, такие как движения хвостом, и движений головы, или даже медленными движениями тела. Если концентрация PQ слишком высока, и смерть кинетика животных очень быстро, можно было бы рассмотреть уменьшении концентрации PQ, чтобы получить более низкие скорости смерти. Некоторые животные очень чувствительны к окислительному стрессу, таких как ОАО ААК-2 мутантных животных 26,33,35,36 то время как другие обладают высокой устойчивостью, например, DAF-2 мутантных животных 37. В этом случае, анализируя выживание с другом соncentrations из PQ должны быть рассмотрены.
Для РНК-интерференции экспериментов, отрицательные результаты могут быть из-за неэффективности лечения РНК-интерференции. В этом случае измерение уровней мРНК необходимо, чтобы определить ген нокдаун ли успешным.
Этот протокол может быть дополнительно приспособлен для высокопроизводительного скрининга окислительного стресса сопротивления с использованием детектора, который отслеживает поведение плавания С. Элеганс в жидком 38,39. Это потенциально позволит контролировать выносливость С. Элеганс и поведение плавание, таких как частота изгибы тела в условиях окислительного стресса. Более высокие темпы движения тела может указывать на более высокий червь фитнес под напряжением.
Подготовка, которые приводят к окислительному стрессоустойчивости низших эукариот высоко консервативны по эволюции и связаны с окислительным стрессом заболеваний, ассоциированных и старения в организме человека. Mitohormesis и сбалансированный Generatioп АФК необходимы для продления срока службы и повышения продолжительности здоровья. Однако чрезмерное АФК является весьма разрушительным для клеток, тканей / органов и организмов. Поиск путей, что, если изменены, обеспечивают оптимальный баланс АФК Таким образом, важно и экраны для препаратов, которые модулируют сопротивление окислительному стрессу может помочь развитию лекарств для нескольких заболеваний с общим знаменателем: окислительного стресса. Выполнение этих показов в С. Элеганс является выгодным быстрый, недорогой и надежный способ, который имеет большой потенциал и значение для понимания и лечения заболеваний человека, связанных с окислительным стрессом.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Acknowledgments
Мы признаем Caenorhabditis генетический центр для C. штаммы Элеганс. Финансовая поддержка была предоставлена Терри Фокс-исследовательского института. Мы также признаем, поддержку эксплуатацию ЕР от Роланд и Марсель Госслин Высшей студенчества и подготовки гранта CIHR / FRSQ в исследовании рака FRN53888 в Макгилл Комплексной программы подготовки исследования рака.
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Agar bacteriological grade | Multicell | 800-010-LG | |
Bacteriological peptone | Oxoid | LP0037 | |
Sodium chloride biotechnology grade | Bioshop | 7647-14-5 | |
Cholesterol | Sigma | C8503-25G | |
UltraPure tris hydrochloride | Invitrogen | 15506-017 | |
Tris aminomethane | Bio Basic Canada Inc | 77-86-1 | |
IPTG | Santa Cruz Biotechnology | sc-202185A | |
Ampicillin | Bioshop | 69-52-3 | |
Yeast extract | Bio Basic Inc. | 8013-01-2 | |
Methyl viologen dichloride hydrate | Aldrich chemistry | 856177-1G | |
Petri dish 60 x15 mm | Fisher | FB0875713A | |
Pipet 10 ml | Fisher | 1367520 | |
Potassium phosphate monobasic | G-Biosciences | RC-084 | |
Magnesium sulfate heptahydrate | Sigma | M-5921 | |
Sodium phosphate dibasic | Bioshop | 7558-79-4 | |
Discovery v8 stereo zeiss microscope | |||
96 well clear microtiter plate | |||
flcn-1 RNAi source | Ahringer Library |
References
- Schieber, M., Chandel, N. S. ROS function in redox signaling and oxidative stress. Curr Biol. 24, R453-R462 (2014).
- Alfadda, A. A., Sallam, R. M. Reactive oxygen species in health and disease. J Biomed Biotechnol. 2012, 936486 (2012).
- Finkel, T., Holbrook, N. J. Oxidants, oxidative stress and the biology of ageing. Nature. 408, 239-247 (2000).
- Di Carlo, M., Giacomazza, D., Picone, P., Nuzzo, D., San Biagio, P. L. Are oxidative stress and mitochondrial dysfunction the key players in the neurodegenerative diseases. Free Radic Res. 46, 1327-1338 (2012).
- Gandhi, S., Abramov, A. Y.
Mechanism of oxidative stress in neurodegeneration. Oxid Med Cell Longev. 2012, 428010 (2012). - Trushina, E., McMurray, C. T. Oxidative stress and mitochondrial dysfunction in neurodegenerative diseases. Neuroscience. 145, 1233-1248 (2007).
- Touyz, R. M., Briones, A. M. Reactive oxygen species and vascular biology: implications in human hypertension. Hypertens Res. 34, 5-14 (2011).
- Gorrini, C., Harris, I. S., Mak, T. W. Modulation of oxidative stress as an anticancer strategy. Nat Rev Drug Discov. 12, 931-947 (2013).
- Sosa, V., et al. Oxidative stress and cancer: an overview. Ageing research reviews. 12, 376-390 (2013).
- Van Raamsdonk, J. M., Hekimi, S. Reactive Oxygen Species and Aging in Caenorhabditis elegans: Causal or Casual Relationship. Antioxid Redox Signal. 13, 1911-1953 (2010).
- Baumeister, R., Schaffitzel, E., Hertweck, M. Endocrine signaling in Caenorhabditis elegans controls stress response and longevity. J Endocrinol. 190, 191-202 (2006).
- Markaki, M., Tavernarakis, N. Modeling human diseases in Caenorhabditis elegans. Biotechnol J. 5, 1261-1276 (2010).
- Rodriguez, M., Snoek, L. B., De Bono, M., Kammenga, J. E. Worms under stress: C. elegans stress response and its relevance to complex human disease and aging. Trends Genet. 29, 367-374 (2013).
- Hope, I. A. Practical approach series. , Oxford University Press. 282 (1999).
- C. elegans Sequencing Consortium. Genome sequence of the nematode C. elegans: a platform for investigating biology. Science. 282, 2012-2018 (1998).
- Ahringer, J.
Turn to the worm! Current opinion in genetics & development. 7, 410-415 (1997). - Wheelan, S. J., Boguski, M. S., Duret, L., Makalowski, W. Human and nematode orthologs--lessons from the analysis of 1800 human genes and the proteome of Caenorhabditis elegans. Gene. 238, 163-170 (1999).
- Culetto, E., Sattelle, D. B. A role for Caenorhabditis elegans in understanding the function and interactions of human disease genes. Hum Mol Genet. 9, 869-877 (2000).
- Fire, A., et al. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans. Nature. 391, 806-811 (1998).
- Lamitina, T. Functional genomic approaches in C. elegans. Methods Mol Biol. 351, 127-138 (2006).
- Poulin, G., Nandakumar, R., Ahringer, J. Genome-wide RNAi screens in Caenorhabditis elegans: impact on cancer research. Oncogene. 23, 8340-8345 (2004).
- Moreno-Arriola, E., et al. Caenorhabditis elegans: A Useful Model for Studying Metabolic Disorders in Which Oxidative Stress Is a Contributing Factor. Oxid Med Cell Longev. , 705253 (2014).
- Possik, E., et al. Folliculin regulates ampk-dependent autophagy and metabolic stress survival. PLoS Genet. 10, e1004273 (2014).
- Fukushima, T., Tanaka, K., Lim, H., Moriyama, M.
Mechanism of cytotoxicity of paraquat. Environ Health Prev Med. 7, 89-94 (2002). - Van Raamsdonk, J. M., Hekimi, S. Superoxide dismutase is dispensable for normal animal lifespan. Proc Natl Acad Sci U S A. 109, 5785-5790 (2012).
- Schulz, T. J., et al. Glucose restriction extends Caenorhabditis elegans life span by inducing mitochondrial respiration and increasing oxidative stress. Cell Metab. 6, 280-293 (2007).
- Brenner, S.
The genetics of Caenorhabditis elegans. Genetics. 77, 71-94 (1974). - Timmons, L. Delivery methods for RNA interference in. C. elegans. Methods Mol Biol. 351, 119-125 (2006).
- Wang, B. Y., et al. Caenorhabditis elegans Eyes Absent Ortholog EYA-1 Is Required for Stress Resistance. Biochemistry (Mosc). 79, 653-662 (2014).
- Paz-Gomez, D., Villanueva-Chimal, E., Navarro, R. E. The DEAD Box RNA helicase VBH-1 is a new player in the stress response in C. elegans. PLoS One. 9, 97924 (2014).
- Ward, J. D., et al. Defects in the C. elegans acyl-CoA synthase, acs-3, and nuclear hormone receptor, nhr-25, cause sensitivity to distinct, but overlapping stresses. PLoS One. 9, 92552 (2014).
- Staab, T. A., Evgrafov, O., Knowles, J. A., Sieburth, D. Regulation of synaptic nlg-1/neuroligin abundance by the skn-1/Nrf stress response pathway protects against oxidative stress. PLoS Genet. 10, e1004100 (2014).
- Greer, E. L., et al. An AMPK-FOXO pathway mediates longevity induced by a novel method of dietary restriction in. C. elegans. Curr Biol. 17, 1646-1656 (2007).
- Allen, E., Walters, I. B., Hanahan, D. Brivanib, a dual FGF/VEGF inhibitor, is active both first and second line against mouse pancreatic neuroendocrine tumors developing adaptive/evasive resistance to VEGF inhibition. Clin Cancer Res. 17, 5299-5310 (2011).
- Apfeld, J., O'Connor, G., McDonagh, T., DiStefano, P. S., Curtis, R. The AMP-activated protein kinase AAK-2 links energy levels and insulin-like signals to lifespan in C. elegans. Genes Dev. 18, 3004-3009 (2004).
- Lee, H., et al. The Caenorhabditis elegans AMP-activated protein kinase AAK-2 is phosphorylated by LKB1 and is required for resistance to oxidative stress and for normal motility and foraging behavior. J Biol Chem. 283, 14988-14993 (2008).
- Honda, Y., Honda, S. The daf-2 gene network for longevity regulates oxidative stress resistance and Mn-superoxide dismutase gene expression in Caenorhabditis elegans. FASEB J. 13, 1385-1393 (1999).
- Restif, C., Metaxas, D. Tracking the swimming motions of C. elegans worms with applications in aging studies. Med Image Comput Comput Assist Interv. 11, 35-42 (2008).
- Buckingham, S. D., Sattelle, D. B. Fast, automated measurement of nematode swimming (thrashing) without morphometry. BMC Neurosci. 10, 84 (2009).