Summary
生物学的試料からの幹細胞集団の特徴付けおよび単離を可能にする方法は、癌およびそれを超える幹細胞標的化治療の進歩にとって重要である。ここでは、色素誘発性の側方集団表現型を用いた癌幹細胞単離のための詳細なプロトコールを提供する。
Abstract
がんは幹細胞に起因する疾患であり、これらの細胞の根絶が主要な治療目標となっている。 Cancer Stem Cells(CSCs)の脆弱性を解読し、適切な分子標的を特定することは、細胞系やex vivo腫瘍組織などの異種試料での特異的差別を可能にする方法に依存しています。フローサイトメトリー/ FACSは、単一細胞レベルで生物学的サンプルをマルチパラメトリックに解剖するための強力な技術であり、下流の分析のために生きた細胞を回収するための選択方法である。 CD44およびCD133のような表面マーカーならびにアルデヒドデヒドロゲナーゼ酵素活性の検出は、FACSによる腫瘍サンプルからのCSCを定義および分類するためにしばしば用いられてきた。ここで方法論的詳細に示されている相補的アプローチは、一般に側方集団(SP)と呼ばれる蛍光dim細胞の明確な集団を同定するABC薬物トランスポーターによる機能的色素押出を利用する。 SPがん細胞は、標準的な幹細胞の特徴を示し、色素押し出し薬物輸送体(最も頻繁にはABCB1 / P-糖タンパク質/ MDR1 / CD243およびABCG2 / Bcrp1 / CD338)を阻害する物質を使用して廃止され、機能的に確認され得る。さらに、SPアッセイは、表面抗原の染色、アルデヒドデヒドロゲナーゼ検出、および死細胞識別( 例えば 、7-AADまたはヨウ化プロピジウム(PI))などの他のフローサイトメトリー評価と適合する。したがって、我々は、表現型パラメータではなく機能的に基づいて、CSC同定、単離およびサブキャラクタリゼーションを機械的に行うための価値ある、広く適用可能な方法を記載する。もともとHoechst 33342をトリガー色素として使用していましたが、ここではバイオレットレーザー光源を備えたフローサイトメーターで分解可能な、より新しいViolet色素に基づくSP表現型に焦点を当てます。
Introduction
原発性癌治療の有効性は、この疾患の遺伝的および分子的理解の魅力的進歩、治療用抗体および小分子阻害剤などの標的薬物の出現のために、過去10年間で実質的に改善されている。対照的に、転移性および再発性の疾患は依然として典型的に治癒不可能であり、罹患率および死亡率はこれらの臨床的状況において依然として高いままである。 CSCは、腫瘍内の別個の亜集団を表し、クローン原性/腫瘍原性、多剤耐性および非対称細胞分裂1,2などの標準的な幹細胞特性を付与される。したがって、CSCは、転移性の進行および腫瘍の異種性を促進するだけでなく、患者の再発の素因となる治療中も持続する。したがって、治療的CSC除去は、疾患の再発を予防し、がんの長期治癒を可能にする重要な医学的必要性である3
脆弱性の特定およびCSCを根絶する戦略の解明は、その後の発現プロファイリングおよび/または機能検査のための生物学的サンプルからの精製を可能にする方法に大きく依存する。次に、そのような方法は、これらの細胞に特異的な表面、細胞内または機能的マーカーに依存する。 CSC特異的表面マーカーには、CD44、CD133、CD24およびCD90が含まれるが、これらに限定されず、乳癌および大腸癌を含む様々な腫瘍実体におけるCSC集団を同定するために使用されてきた4 。別のマーカーであるアルデヒドデヒドロゲナーゼ(ALDH)は、細胞内局在を示し、機能的に検出することができ、その酵素的変換により光を生じるそれぞれの基質を提供することができる。この試験を用いて、CSC集団は多様な腫瘍実体においても同定されている5 。一般にSP分析と呼ばれ、ここではm ABC薬物輸送体による活性色素流出を利用して、蛍光dim型幹様細胞の小さな集団を同定する6,7,8。これを達成するために、所与の試料を、受動拡散によってすべての細胞に入り、結合のために核およびミトコンドリアDNAを標的とする親油性DNA結合フルオロフォアの存在下でインキュベートする。 ABC薬物輸送体発現を欠いている非CSCsは染料を蓄積し、明るい蛍光をもたらし、CSCsは蛍光を減少させる染料を能動的に押し出す。薬物輸送体活性の薬理学的阻害は、SP表現型を排除し機能的に確認し、制御目的に使用すべきである。 SP特性を示すCSC集団が、とりわけ、卵巣癌9,10 、前立腺癌11 、> 12、乳癌13 、肺癌14 、子宮内膜癌15 、神経膠腫16,17および骨肉腫18 。重要なことには、特定の腫瘍細胞識別戦略(ある種の宿主細胞集団もSP特性を示すことができる)のような追加の課題があるにもかかわらず、SPアッセイは癌細胞株および原発腫瘍組織の両方に適合する19,20 。
2つの最も確立されたSPを与える薬物輸送体は、ABCB1 / P-糖タンパク質/ MDR1 / CD243およびABCG2 / Bcrp1 / CD338である。しかし、他の薬物トランスポーターもSP表現型の分子決定因子( 例えば 、ABCB5)であり得る22 。 ABCB1ABCG2の活性は、fumitremorgin C(FTC)6,19を用いて特異的に排除することができるが、ベラパミルで効率的にブロックすることができる。 SP分析の特別な強さは、他の染色( 例えば 、表面マーカーおよびALDH)と組み合わせることができ、生細胞の回収を可能にし、下流の機能検査と互換性があることである。さらに、SPC検出は、CSC集団の中でABC薬物輸送体の高い保存率のために広く適用可能である(9,23)。
もともと、SP検出は、Hoechst 33342をトリガー色素24として用いて行われている。この染料は優れた解像度を達成するが、紫外線レーザー励起を必要とする。したがって、その適用性は当然、ハイエンドフローサイトメトリー機器に限定される。 DyeCycle Violet(DCV) 25の登場により、新しいAvenuこの方法を紫外線レーザー源を欠く標準的なフローサイトメトリー機器(DCV-SP細胞を分解するのに紫色レーザー源で十分)に応用することができました。重要なことに、Hoechst 33342およびDCVは共通のポンプ特異性を共有しており、どちらの色素も同じ細胞集団を同定する必要があることを示しています。
ここでは、DCVベースのSP分析の詳細な実験プロトコルを提供し、独立したラボで素早く簡単に再生することができます。我々は、この有用な細胞生物学的方法の最適化と標準化に貢献すべきであるCSC研究者のための資料としてこの論文を認識する。
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Protocol
このプロトコルは、標準的な制度倫理審査委員会のガイドラインを完全に遵守しています。ここに示すプロトコールを用いてヒトまたは動物の組織を調査する場合、研究者はその機関または国の関連する審査委員会からの承認を得ることが義務付けられている。
注意:生物学的サンプルを安全に取り扱うための標準的な予防措置がこのプロトコルに適用されます。これには、手袋とラボコートを着用し、できる限りバイオセーフティキャビネットの下で作業を行うことが含まれます。
1.細胞の調製
- 癌細胞株
- 適切な培地( 例えば 、10%( v / v )FBS、2mM L-グルタミンおよび1×ペニシリン/ストレプトマイシンを補充したRPMI 1640)中で、37℃でそれぞれのヒトまたはマウス癌細胞株を培養し、収穫する0.05%トリプシン-EDTAまたはいくつかの他の脱アタッチメントによる消化を用いて、サブコンフルエンス( すなわち、 70〜90%)の細胞審査手続。細胞数を測定し、カウントチャンバーおよびトリパンブルー染色を使用して生存率をチェックする。生存細胞の割合は85%を超えるべきである。
注:SP区画を含むヒト癌細胞株の例には、MCF7 / HTB-22およびSKBR3 / HTB-30(乳癌)、A2780およびSKOV-3 / HTB-77(卵巣癌)およびA549(肺癌) 26が含まれる 。
- 適切な培地( 例えば 、10%( v / v )FBS、2mM L-グルタミンおよび1×ペニシリン/ストレプトマイシンを補充したRPMI 1640)中で、37℃でそれぞれのヒトまたはマウス癌細胞株を培養し、収穫する0.05%トリプシン-EDTAまたはいくつかの他の脱アタッチメントによる消化を用いて、サブコンフルエンス( すなわち、 70〜90%)の細胞審査手続。細胞数を測定し、カウントチャンバーおよびトリパンブルー染色を使用して生存率をチェックする。生存細胞の割合は85%を超えるべきである。
- 生体外の腫瘍組織
- 新鮮な外科的腫瘍標本を採取するか、あるいは移植可能なまたは遺伝子操作されたマウス腫瘍モデルから腫瘍組織を採取する。 200〜1,000mgの組織を採取し、機械的解離( 例えば 、はさみまたはメスを使用)および酵素消化( 例えば 、コラゲナーゼ/ディスパーゼ/ DNaseカクテルを使用)によって単一細胞懸濁液を生成する。
- サンプルを70μmカットオフストレーナーでろ過する。細胞数を決定し、カウントチャンバーおよびトリパンblを用いて生存率をチェックする。染色する。
注:消化カクテルには、200μg/ mLコラゲナーゼP、0.8 U / mLディスパーゼおよび25μg/ mL DNase Iが含まれていることが多く、インキュベーション時間は通常20〜50分です。理想的には、組織解離は、調査中の組織27,28,29に最適化されたプロトコルに従って行われる。
2.サンプルのテスト
- 新鮮な培養液中で細胞濃度を1×10 6 cells / mLに調整してください(栄養素を含むビヒクルは、色素の抽出が活性なエネルギーを消費するプロセスで重要です)。最後に、1mLのサンプルを通常のフローサイトメトリー/ FACS丸底チューブ(「試験」と表示)に移す。
注:最適な結果を得るには、細胞濃度を滴定する必要があります(例えば、5 x 10 5 -1 x 10 6 -2.5 x 106細胞/ mL)が、19より高い解像度が得られる。最大数のSP細胞を回収するソートのアプリケーションでのみ、細胞濃度を1×10 7細胞/ mLまで上げることを推奨します。 - 穏やかなボルテックスまたは3〜5倍の再懸濁のいずれかにより、10μMのDCVを試料に加え、よく混合する。阻害コントロールに進む。
注:最適な結果はトリガー色素の滴定(例えば2.5; 5; 10;20μM)に依存するかもしれませんが、より高い色素濃度は一般により高い解像度19をもたらす。
3.阻害制御
- 250μLの色素含有細胞懸濁液を新しいフローサイトメトリー/ FACS丸底チューブ(「対照」と表示)に移す。 50μMのベラパミルまたは20μMのFTCを添加し、ピペッティングによりよく混合する。
注:ベラパミルおよびFTCは、SP分析のための最も確立された阻害剤であるが、異なる流出ポンプ特異性を有するy:ベラパミルは、ABCB1およびABCB5を含むいくつかのABC薬物トランスポーターを阻害するが、FTCはABCG2に特異的である(6,19)。個々のサンプルのSP状態が不明な場合、別のチューブでベラパミルとFTCの両方を使用することを推奨します。
4.染色
- 'テスト'チューブと 'コントロール'チューブの両方をキャップし、37℃で暗所で90分間インキュベートし、15分おきに穏やかに攪拌します。 SP細胞の色素抽出の大半は最初の45分以内に起こるが、非SP細胞(分解に寄与する)の色素蓄積は75〜90分後に最大である。
- 染色が完了した後、細胞を3〜4mLの氷冷PBSで洗浄し、100μL(PBSも同様)の容量でペレットを再懸濁する。細胞を暗所に保ち、氷上で冷却し、追加のマーカーの染色に進む。あるいは、フローサイトメトリーアナライト溶解。
5.他のマーカーの費用
- DCVで染色した細胞に所望の蛍光色素結合抗体パネルを加え、よく混合し、4〜4℃で暗所で20〜30分間インキュベートする。細胞を3〜4 mLの氷冷PBSで洗浄し、死細胞の識別に進む。
注:DCVとの互換性があり実質的に補償を必要としない抗体フォーマットには、PerCPまたはPerCP-Cy5.5、PE-Cy7、APC、Alexa Fluor 647、APC-Cy7、APC-H7、BV711、Alexa Fluor 750およびBV786 。 DCVと互換性があるが補償が必要なフォーマットには、FITC、Alexa Fluor 488、PE、BV650などがあります。実質的にDCVと互換性のないフォーマットには、BV421、V450、V500などがあります。 - 特定の製造業者が推奨する濃度でDCV染色細胞に7-AAD(またはPI)を添加し、暗所で5〜10分間サンプルをインキュベートする。 70μmのカットオフストレーナーを通してサンプルを濾過し、フローサイトメトリー分析に進む。
フローサイトメトリー分析
注:染色工程中に各フローサイトメトリー機器をオンにしておくと、サンプルの準備が整うとすぐにすべてが設定されます。これには、システム性能の追跡やタンク補充などの標準保守手順も含まれます。
- フローサイトメーター上の細胞を取得し、二変量FSC / SSCドットプロット(図1B)でそれらをゲート。 FSCの異なるシグナル( すなわち、高さ、幅、面積)を比較することにより、ダブレットおよび凝集物を除外する(図1C)。
- 死細胞マーカーが含まれている場合、生存細胞画分( 例えば 、7-AAD陰性)上にゲートする( 図1D )。生存可能な一重項細胞を「青色」および「赤色」のDCV発光について二変量点プロット上で可視化する。この目的のために、y軸上に「青色」蛍光チャネル( 例えば 、450/50)を表示し、X軸上の「赤色」蛍光チャネル( 例えば 、525/50)。
- 両方のチャンネルをリニアモードに切り替え、それに対応して検出器の電圧を調整して、SPが左下象限のプロットの側面に位置するようにします。逆に、非SPは、細胞周期分布(G1およびG2)を反映するプロットの右上象限に位置する。 SPをゲートし、捕捉を停止する( 図1E )。
注:DCVで定義されたSP細胞は、紫色レーザー励起源( すなわち 、405nmレーザーライン)を備えたフローサイトメトリー機器を用いて検出することができる。放出された蛍光が線形モードで測定され、二変量ドットプロット上に表示された2つの別個のチャネルにおいて測定されることは、SP分析に特有のものである。 DCVの「青色」発光は約450nmで測定され( 例えば 、450/40標準フィルターで)、DCVの「赤色」発光は約510-585nmで測定される( 例えば 、510/50、a 525/50または585/15フィルター) 19 。アッセイの特定の化学的性質のために、SPおよび非SP細胞間の分離は、一般に、「赤色」蛍光チャネル19においてより高い。
- 禁止コントロールをロードし、データを取得します。 SP細胞は、現在消失しているか、または実質的に減少している( 図1F )。必要に応じて、これらのデータに基づいてSPゲートを調整します。
- SP細胞による表面マーカー発現を調べるために、x軸上にDCVの「赤色」蛍光を残し、対数モード( 例えば 、APC)でy軸上にそれぞれの蛍光チャネルを表示する。それに対応して検出器の電圧を調整し、調べられたマーカーについて陽性に染色されたSP細胞の画分をゲートする( 図1G )。 SP細胞による特定のマーカーの同時発現は、プロット30の左上象限にそれぞれのシグナルを生じる。
- そのSPセルをデータ化および/またはソートする。
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Representative Results
A2780細胞の代表的なSP分析であり、これは、以前に細胞の1%未満を占めるSPを保持することが示されたヒト卵巣癌細胞株である9 。細胞を、10%( v / v )FBS、2mM L-グルタミンおよび1×ペニシリン/ストレプトマイシンを補充したRPMI1640中で37℃で培養し、0.05%トリプシン-EDTAでの処理を用いて85%コンフルエンシーで採取した。細胞をPBSで洗浄し、70μmのカットオフストレーナーで濾過した。計数チャンバおよびトリパンブルー染色を使用して細胞数を測定し、1×10 6細胞/ mL(新鮮培地)を10μMDCVで暗所で37℃で90分間染色した。並行して、そのアリコートを全く同じ条件下で20μMのFTCの存在下でインキュベートした。細胞を4mLのPBSで洗浄し、ABCG2に対するAPC結合抗体を、事前に滴定した濃度で「試験管」に添加した。インキュベート後4℃で25分間、細胞をPBSで洗浄し、7-AADを添加して死細胞を標識した。試料を氷上で冷却し、FACS装置で分析した。描写されたゲーティング戦略は、組織標本からの試料のような非常に不均一な材料が特定の表面マーカー( 例えば 、EpCAM、CD45、CD31)を用いて標的細胞画分の事前定義を必要とする場合でも、多かれ少なかれ普遍的に他の試料に適用可能である。示された結果は、他のラボでのDCVベースのSP検出の基準となることを意図しています。したがって、調査された細胞集団の相対的な局在化は、独立した生物学的サンプルを有する他の研究者によって得られたものとほぼ同等であるが、必ずしも同一ではないはずである。
図1:ワークフローと代表的な結果 (A)DCV染色を用いたSP検出のための主要フローチャートg。追加のマーカーのコストはオプションですが、死細胞の識別が強く推奨されます。 ( BG )FACS装置で実施されたA2780ヒト卵巣癌細胞の代表的なSP分析。細胞は、FSC / SSC特性(B)に従ってゲートされ、ダブレットおよび凝集は、FSCの異なるパラメータ( 例えば 、高さおよび幅)( C )を比較することによって除外される。その後、7-AAD陰性(またはPI陰性)細胞画分( D )をゲーティングすることによって、死細胞を識別する。次いで、生存単一細胞を、青色および赤色のDCV発光のための線形二変量ドットプロット上に表示し、SP(および対応する非SP)をゲートする( E )。それぞれの阻害コントロール(この場合はFTCが使用された)で同じ分析が行われ、これはSPゲート( F )内の細胞のほぼ完全な消失をもたらすはずである。最後に、特定されたSPは、 例えば 、dete色素の押し出しの原因となる可能性のあるABC薬物トランスポーターを停止させ、それによってSP表現型(この場合、FTC感受性に沿ったABCG2)を付与する。 ( G )。 FTC、フミトレモリンC; ALDH、アルデヒドデヒドロゲナーゼ。 この図の拡大版を見るには、ここをクリックしてください。
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Discussion
癌の臨床管理の進歩は、CSCを標的とする治療様式の開発にも依存する。生物学的サンプルからのCSCの確実な単離を可能にする方法は、適切な標的の同定を促進し、したがって、この努力において非常に重要である。 SP分析は、ABCの薬物トランスポーターを発現するCSC集団を同定するための確立された、そして貴重な技術であり、DCVの実施は、標準的なフローサイトメトリー機器へのその適用性を拡大した。メカニズム的には、SP識別は、ABC薬物輸送体による活性色素流出を利用して、低い蛍光に基づいてCSCを検出し、対応する非SPに残されたプロットの下側に特徴的な局在を伴う。重要なことに、DCVベースのSP検出は、堅牢で直接的な方法であり、最も重要なステップは、細胞の調製(ii)染色プロセス(iii)適切な阻害剤の選択そして(iv)フローサイトメトリー分析。色素押出は活性なエネルギーを消費するプロセスであるため、特に良好な細胞生存率で開始することが重要です。生存可能な(薬物輸送体を発現する)細胞のみがSPを産生することができる。さらに、色素濃度と細胞密度との比を最適化し、それによってSP細胞の分離を増強することがしばしば意味をなさない(これは、DCVと細胞の両方の滴定を必要とする)。一般的な規則は、より高い色素濃度およびより低い細胞濃度の両方が、改善された分離をもたらすことである19 。成功したDCV実験の鍵は、ABC薬物トランスポーター活性の薬理学的阻害剤を用いたSPの機能的検証である。以前に述べたように、ベラパミルおよびFTCは、SP分析のための最も確立された阻害剤であり、異なるポンプ特異性を有する(FTCはABCG2に特異的であるが、ベラパミルはいくつかのポンプを阻害する)。未知のSP状態を有するサンプルについては、したがって、両方を使用することが推奨されるインヒビターを別々のチューブに入れる。別の選択肢は、pan-ABC薬物輸送体阻害剤レセルピン4の使用である。しかし、研究者は、この化合物の自家蛍光が潜在的にDCVシグナル19を妨げる可能性があることを認識すべきである19 。細胞が青色および赤色のDCV発光について分析されたら、両方の集団( すなわち SPおよび非SP)が最大の分離で見えるように、検出器電圧を調整しなければならない。画像が奇妙に見える場合は、対数スケーリングが理由です(この場合、両方のチャンネルをリニアモードに戻す)。
また、DCVベースのSPアッセイは、癌に特異的でもなく、もともと腫瘍学に応用するために開発されたものでもないことに注意することも重要です。代わりに、それはABCの薬物輸送体に特異的であり、したがって、系統- Sca-1 + c-kit +細胞のような生理学的(組織)幹細胞の検出および単離も容易にする。造血幹細胞25 。さらに、重大な身体部位に専用障壁を確立する分化細胞タイプも、SP特性を示す可能性がある20 。したがって、DCVに基づくSP検出を原発組織に適用することは、適切なマーカーを用いて標的細胞集団の特異的な識別を必要とする。
CSC集団9,23の間での薬物流出ポンプの高い保存性を考慮すると、DCVベースのSP検出は広範に適用可能であり、これはまた、異なる胚葉起源の物質を含む腫瘍実体(例えば、 18 。他の利点には、(i)薬物耐性に直接関係する細胞が同定される(特に、疾患再発を媒介する臨床的に関連する癌細胞サブセットに取り組むために重要である(ii)静的ではなく機能的なパラメータの検出は、より多くのアッセイ特異性を付与し、解像度を改善することができることを示している19,31,32。概念的/技術的側面から、DCVに基づくSP検出は抗体媒介性の表面染色とは明らかに異なる:(i)標的構造は細胞内局在を示し、タンパク質ではなく核酸を表す。 (ii)アッセイは、単なる存在または密度ではなく、タンパク質活性を検出する。 (iii)標的細胞は、陽性シグナルではなく、低蛍光のために定義される。 (iv)DNA結合色素として、DCVは染色中の細胞または色素濃度のわずかな変動にも敏感である19 。 (v)DCV蛍光は線形モードで測定され、対数的には測定されない。 (vi)DCV蛍光( すなわち 、単一の蛍光団によって生成された蛍光)を、2つの別々のチャネル、すなわちn単一の波長範囲内にある。これらの詳細にもかかわらず、DCVベースのSP分析は容易に実行でき、明らかにCSC研究のためのフローサイトメトリーツールボックスを拡張します。
DCVベースのSP分析はまた、従来の抗体媒介性表面染色(可能な多数のフォーマット)およびALDH酵素活性を検出する商業的アッセイの両方に適合する、他のマーカーの費用をかけるための多くの可能性を提供する。しかしながら、ここでは表面染色に焦点を当て、ALDH活性の共検出に関する方法論的詳細を見るために、読者は公開された文献4を参照する。いずれの場合でも、DCV誘発性SP分析は死細胞識別と組み合わせなければならず、この目的のための明白な試薬は7-AADおよびPIである。
注目すべきは、対応するフローサイトメトリー機器の選別アプリケーションを使用して、DCV規定SP細胞(および非SP対照細胞)をライブ精製することができることである。 SPアッセイは機能的PAを検出するので生存細胞のみが産生するラメラでは、回収されたSP細胞の生存率は一般的に高い(時にはほぼ100%)と予想される。それにもかかわらず、仕分け後の生存性に問題がある場合は、ソーターノズルのサイズ、緩衝剤の性質、選別中の温度など、さまざまな技術的パラメータを確認することができます。より大きなノズルは依然として非常に微妙な細胞に役立つかもしれない)。回収された細胞は、qRT-PCR、ウェスタンブロッティングおよび包括的発現プロファイリング( 例えば 、遺伝子アレイまたはより最近のRNASeq技術を使用する)などの下流分析に供され得る。さらに、単離されたSP細胞は、機能性幹細胞の特性( 例えば単細胞のクローン原性および連続移植)について調べることができ、または数ヶ月間安定しているかもしれない豊富または純粋なSP細胞の細胞系を樹立するために継代培養される。私たちの中で本発明者らは、通常の培地および従来の2Dプラスチックフラスコを用いてDCV規定のCSC 9を継代培養したが、足場非依存性/ 3D培養条件および特殊培地などの幹細胞選択様式もまた実現可能である。我々は、所定のSPコンパートメントのインビトロ拡大のための最も好ましい条件は、個々の基準でチェックする必要があることを提案する。
要約すると、ここでは、DCVベースのSP分析によるCSC識別/分離の詳細な実験的ワークフローを示す。我々の論文は、CSC研究者がこの有用な方法を自分たちの研究室で実施し、確立することを支援し、癌の臨床管理改善のための治療的抗CSC戦略の解明を促進しなければならない。
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Disclosures
著者らは宣言する利益相反はない。原稿の作成には、著者以外の人の関与もない。
Acknowledgments
Maximilian Boeschはオーストリア科学基金FWFのErwinSchrödingerFellowship(助成金番号J-3807)の支援を受けています。
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Vybrant DyeCycle Violet | Thermo Fisher Scientific | V35003 | Ready to use |
Verapamil hydrochloride | Sigma-Aldrich | V4629 | Dissolve in ethanol |
Fumitremorgin C | Sigma-Aldrich | F9054 | Dissolve in DMSO |
7-AAD (or propidium iodide - PI) | BioLegend | 420403 | Ready to use |
Standard cell culture reagents (e.g., medium, FBS, L-glutamine, antibiotics, PBS, trypsin-EDTA, etc.) | Different suppliers | ||
Sample/cells of interest (e.g., human or murine cancer cell line, human or murine tumor tissue) | Different suppliers | ||
Flow cytometric instrument (FACS; analyzer or cell sorter) | Different suppliers | Violet laser source required | |
FACS tubes (round-bottom) | Different suppliers | Tubes with cap recommended | |
70 µm cut-off strainers | Different suppliers | Optional but recommended | |
Digestion enzyme mix (e.g., collagenase/dispase/Dnase) | Different suppliers | Only relevant for tissue dissociation | |
Flurochrome-conjugated antibodies against surface markers of interest | Different suppliers | Optional | |
ALDEFLUOR Kit | STEMCELL Technologies | 01700 | Optional |
References
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