Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Bioengineering

مسبار دقيق للقياس الإشعاعي داخل الأنسجة لقياس الإشعاع في الموقع في الأنسجة الحية

Published: June 2, 2023 doi: 10.3791/64595

Summary

في هذا البحث ، تم وصف طريقة لقياس الإشراق في الموقع في الأنسجة الحية. يتضمن هذا العمل تفاصيل عن بناء مجسات صغيرة الحجم لقياسات مختلفة للإشعاع والإشعاع ، ويوفر إرشادات لتركيب الأنسجة لتوصيف الإشعاع ، ويحدد الطرق الحسابية لتحليل البيانات الناتجة.

Abstract

تبدو الكائنات الحية معتمة إلى حد كبير لأن طبقات أنسجتها الخارجية تتشتت بقوة للضوء الساقط. عادة ما يكون للصبغات الممتصة بقوة ، مثل الدم ، امتصاص ضيق ، بحيث يمكن أن يكون متوسط المسار الحر للضوء خارج قمم الامتصاص طويلا جدا. نظرا لأن الناس لا يستطيعون الرؤية من خلال الأنسجة ، فإنهم يتخيلون عموما أن الأنسجة مثل الدماغ والدهون والعظام تحتوي على القليل من الضوء أو لا تحتوي على أي ضوء. ومع ذلك ، يتم التعبير عن بروتينات أوبسين المستجيبة للضوء داخل العديد من هذه الأنسجة ، ووظائفها غير مفهومة بشكل جيد. الإشراق الداخلي للأنسجة مهم أيضا لفهم التمثيل الضوئي. على سبيل المثال ، يمتص المحار العملاق بقوة ولكنه يحافظ على عدد كثيف من الطحالب في عمق الأنسجة. يمكن أن يكون انتشار الضوء من خلال أنظمة مثل الرواسب والأغشية الحيوية معقدا ، ويمكن أن تكون هذه المجتمعات مساهما رئيسيا في إنتاجية النظام الإيكولوجي. لذلك ، تم تطوير طريقة لبناء مجسات دقيقة ضوئية لقياس الإشعاع القياسي (تدفق الفوتون يتقاطع مع نقطة) وإشعاع هبوط البئر (تدفق الفوتون الذي يعبر المستوى بشكل عمودي) لفهم هذه الظواهر داخل الأنسجة الحية بشكل أفضل. هذه التقنية قابلة للتتبع أيضا في المختبرات الميدانية. هذه المجسات الدقيقة مصنوعة من ألياف بصرية مسحوبة بالحرارة يتم تثبيتها بعد ذلك في ماصات زجاجية مسحوبة. لتغيير القبول الزاوي للمسبار ، يتم بعد ذلك تثبيت كرة بحجم 10-100 ميكرومتر من الإيبوكسي القابل للمعالجة بالأشعة فوق البنفسجية الممزوج بثاني أكسيد التيتانيوم في نهاية الألياف المسحوبة والمشذبة. يتم إدخال المسبار في الأنسجة الحية ، ويتم التحكم في موضعه باستخدام micromanipulator. هذه المجسات قادرة على قياس إشعاع الأنسجة في الموقع بدقة مكانية تتراوح بين 10 و 100 ميكرومتر أو على مقياس الخلايا المفردة. تم استخدام هذه المسابير لتوصيف الضوء الذي يصل إلى الخلايا الدهنية وخلايا الدماغ 4 مم تحت جلد الفأر الحي ولتوصيف الضوء الذي يصل إلى أعماق مماثلة داخل أنسجة البطلينوس العملاقة الغنية بالطحالب الحية.

Introduction

والمثير للدهشة أن الحيوانات البرية وسكان المحيطات الضحلة لديهم ما يكفي من الضوء داخل أجسامهم لعلم وظائف الأعضاء البصرية وحتى التمثيل الضوئي. على سبيل المثال ، يتم تخفيف مستويات الضوء في وسط رأس الفأر (خارج نطاقات امتصاص الهيموغلوبين القوية) بثلاثة أو أربعة أوامر من حيث الحجم بالنسبة للعالم الخارجي. هذا هو الفرق تقريبا بين مستويات الإضاءة في الداخل والخارج. لذا ، فإن عتامة الأنسجة أو المواد بسبب التشتت القوي ليست هي نفسها العتامة بسبب امتصاص الضوء القوي. يمكن للضوء أن يستمر في الانتشار لمسافات طويلة في نظام تشتت قوي إلى الأمام ، على غرار الضوء الذي ينتشر عبر الأنظمة المائية ذات التركيزات العالية من الخلايا والجسيمات1. هذه الملاحظة بارزة بشكل خاص في ضوء حقيقة أن بروتينات الأوبسين يتم التعبير عنها في كل مكان تقريبا في جميع أنسجة جميع الحيوانات. وبالتالي ، من المهم أن نفهم كيف وأين يتم تخفيف الضوء وتشتيته داخل الأنسجة الحية. ومع ذلك ، على عكس الأنظمة المائية ، مع الأنسجة الحية ، من المستحيل غمر أداة في عمود الماء والحصول على قياسات الإشعاع والإشعاع ، ومن الضروري استخدام تقنية جديدة.

تشمل الطرق الأخرى المستخدمة سابقا لتوصيف خصائص الامتصاص والتشتت للأنسجة الحية قياس مجسات انعكاس الأنسجة و / أو دمج المجالات2،3 ، والطرق المجهرية مثل المسح المجهري متحد البؤر4 ، وقياس انتشار ضوء الليزر على السطح5 ، وتقنيات النمذجة مثل النقل الإشعاعي لمونت كارلو6. غالبا ما تتطلب الطرق التجريبية المذكورة معدات محددة وكبيرة ومكلفة أو معرفة مفصلة حول بنية الأنسجة وهي محدودة بشكل عام في قدرتها على توصيف البنية المكانية للضوء في عمق الأنسجة.

هناك أيضا طرق مماثلة قائمة على المسبار تستخدم إبرة تحت الجلد لإدخال ألياف بصرية من خلال الأنسجة7،8،9. في تجربتنا ، الإبر المعدلة فعالة في ثقب الأنسجة ولكنها تتطلب قوة كبيرة وتمزق الأنسجة الحساسة بشكل عام عند المرور عبر الخلايا المعبأة بكثافة. لذلك ، تتطلب هذه الإبر عموما إجراء جراحيا لإدخال أكثر من ملليمتر أو نحو ذلك في طبقة الأنسجة. الطريقة الموصوفة هنا ، باستخدام دعامة زجاجية مشحمة ومسحوبة ، قادرة على الانزلاق بين الخلايا مع الحد الأدنى من جرح الأنسجة وبدون جراحة إضافية.

تقدم هذه المخطوطة طريقة مستوحاة من عمل يورغنسون وزملائه على قياس الضوء داخل حصائر الطحالب10،11، باستخدام مجسات مجهرية بصرية مدعومة بالزجاج وإلكترونيات محمولة قابلة للسبر العميق في الأنسجة الكثيفة والبناء والاستخدام في هذا المجال. يمكن بناء هذه المجسات لتوصيف الإشعاع القياسي (الضوء الذي يضرب نقطة من جميع الاتجاهات) وإشعاع هبوط القاع (الضوء الذي يتقاطع مع مستوى أفقي) داخل الأنسجة الحية بدقة مكانية عالية. تم تطوير هذه المسابير في الأصل لقياس الانتقال الإشعاعي داخل أنسجة المحار العملاق الضوئي12. لم تكن القياسات القياسية لامتصاص وانتقال الأنسجة الكلية كافية لتوصيف أداء التمثيل الضوئي للأنسجة ، لأنه يحدث فرقا كبيرا سواء تم امتصاص كل الضوء الساقط من قبل عدد قليل من الخلايا التي تعاني من كثافة عالية على سطح النسيج أو العديد من الخلايا التي تعاني من كثافة منخفضة في جميع أنحاء حجم النسيج. في مشروع ثان ، تم استخدام هذه المجسات لقياس الإشعاع في الجسم الحي داخل دماغ الفأر13,14 ، وبالتالي تمييز البيئة الضوئية للأوبسينات المعبر عنها في أعماق الدماغ. هذه المجسات الدقيقة صغيرة وحساسة بما يكفي لقياس الإشعاع داخل أنسجة دماغ الفأر مع سلامة جميع الفراء والجلد والعظام وإثبات أن مستويات الضوء الفسيولوجي مرتفعة بسهولة بما يكفي لتحفيز عمليات الدماغ العميقة.

يمكن أن يكون هذا المسبار البصري الدقيق وإعداد القياس مفيدا للباحثين الذين يحتاجون إلى تحديد وتوصيف الضوء الداخلي للأنسجة البيولوجية ، خاصة من أجل فهم أكثر دقة لعملية التمثيل الضوئي أو وظائف الأصباغ البصرية المعبر عنها خارج العينين. يمكن استخدام هذه الطريقة بمفردها أو بالاقتران مع تقنيات أخرى لتوصيف الخصائص البصرية وانتشار الضوء داخل الأنسجة الحية بشكل كامل بتكلفة منخفضة ، مع معدات محمولة صغيرة مدمجة داخليا وذات معلمات قابلة للتعديل تعتمد على المهام.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

تتوافق هذه الدراسة مع جميع اللوائح الأخلاقية ذات الصلة بجامعة ييل فيما يتعلق بأبحاث الحيوانات الفقارية واللافقارية.

1. بناء المسبار البصري الدقيق

  1. بناء الغلاف الزجاجي ، المادة: ماصة باستور ، 5.75 بوصة (انظر جدول المواد)
    1. باستخدام مشبك تمساح قابل للتركيب (جدول المواد) ، قم بتركيب الماصة الزجاجية من الطرف العريض بحيث يكون الطرف المدبب متجها لأسفل نحو الأرض ويكون اتجاه الماصة عموديا على الأرض.
    2. قبضة بلاستيكية 50 جم (جدول المواد) من الطرف المدبب للماصة. ضع وسادة من الشريط الكهربائي بين الماصة ومقبض الرذيلة للمساعدة في منع الانزلاق.
    3. قم بتسخين الطرف المدبب من الماصة باستخدام شعلة البوتان الصغيرة (جدول المواد). ضع اللهب 1 سم فوق قبضة الرذيلة. امسك الشعلة بحيث يكون ألمع جزء من اللهب على بعد 3 سم من الزجاج والزجاج عند طرف اللهب. عندما يزداد طول الماصة بحوالي 5 بوصات ، قم بإزالة اللهب على الفور.
    4. استخدم مقصا صغيرا أو قاطعا زجاجيا لتقليم الطرف المسحوب من الماصة عند النقطة التي يكون فيها القطر المسحوب الجديد ضعف قطر الألياف الضوئية المستخدمة في القسم التالي تقريبا (انظر الخطوة 1.2). قم بحفظ أي مناطق حادة من الطرف المشذب باستخدام ورق الكربوروندوم (جدول المواد). اشطف أي شظايا زجاجية صغيرة ناتجة أو غبار باستخدام زجاجة بخ من كحول الأيزوبروبيل متبوعة بالهواء المضغوط.
  2. سحب الألياف الضوئية (الشكل 1 د)
    1. استخدم شفرة حلاقة لقطع الألياف الضوئية ، وإزالة موصل SMA واحد من الألياف الضوئية المنتهية SMA بقطر 200 ميكرومتر (جدول المواد). قطع بالقرب من أحد نهايات SMA. بعد ذلك ، استخدم شفرة الحلاقة لإزالة 5 سم التالية من الغلاف البلاستيكي والألياف الزجاجية بحيث تتعرض الألياف الضوئية العارية وتبرز من بقية المجموعة السليمة.
    2. استخدم شعلة البوتان لحرق طلاء بوليمر بوليميد من الألياف الزجاجية. شطف مع الأيزوبروبانول. امسح الألياف الزجاجية العارية نظيفة باستخدام منديل خال من النسالة.
    3. الخطوة التالية هي تركيب الألياف العارية بحيث يمكن أيضا سحبها باللهب. قم بتركيب الطرف العاري للألياف الضوئية مباشرة في مشبك ذو طيات (جدول المواد) على طاولة أو حافة رف ، مع ترك الطرف المنتهي من SMA للألياف يتدلى نحو الأرض. أضف الأوزان للسحب على شكل مشبكين صغيرين (الوزن الإجمالي: 10 جم) على الطرف المغلف للألياف حوالي 12 بوصة لأسفل من حيث يتم تثبيت الألياف الضوئية العارية في المشبك ذو الكماة.
    4. لسحب الألياف ، ابدأ بشعلة شعلة البوتان. مع تشغيل اللهب ، أمسك شعلة البوتان على بعد 1 سم من الألياف العارية بحيث يكون اللهب عموديا على الألياف الضوئية و 3 سم لأسفل عموديا من حيث يحمل المشبك ذو الكماشة الألياف العارية. اسمح للألياف بالتمدد والسحب والانفصال والسقوط على الأرض.
    5. افحص نهاية الألياف الضوئية المسحوبة الناتجة. قم بصنفرة أي مخالفات برفق باستخدام ورق الكربوروندوم ، ونظف بكحول الأيزوبروبيل ومنديل خال من النسالة ، وجففه بالهواء المضغوط.
      ملاحظة: في هذه المرحلة ، يمكن للمرء استخدام المجهر لتوصيف وتوثيق حجم وشكل الألياف المسحوبة.
    6. استخدم قلما معتما للفيلم لتغميق جوانب الألياف ومنع دخول الضوء الشارد (جدول المواد). اسحب الألياف برفق عبر طرف القلم ، مع ترك مساحة صغيرة فقط عند الطرف مكشوفة.
  3. تركيب الألياف المسحوبة داخل غلاف الماصة الزجاجي (الشكل 1 أ)
    1. من خلال العمل تحت المجهر المجسم ، أدخل بعناية الألياف الضوئية المدببة من الخطوة 1.2 في الطرف العريض من الماصة الزجاجية المعدلة من الخطوة 1.1 ، وادفع الألياف حتى ~ 1 مم من الألياف العارية تخرج من الطرف المدبب للماصة.
    2. باستخدام الشريط الكهربائي ، قم بتأمين الطرف المغلف من الألياف الضوئية إلى الطرف العريض من الماصة.
    3. ضع قطرة من لاصق cyanoacrylate على إبرة صغيرة (جدول المواد). المس بعناية قطرة المادة اللاصقة على الحافة المقطوعة للماصة المسحوبة ، وتجنب النهاية العارية للألياف المسحوبة.
    4. اسمح للعمل الشعري بفتل المادة اللاصقة في الماصة ، مما يؤدي إلى ترطيب المنطقة الواقعة بين جدار الماصة والألياف الضوئية. اترك المادة اللاصقة تعالج لمدة 15 دقيقة على الأقل قبل تحريك مجموعة المسبار.
  4. تعديل طرف الألياف بكرة تشتت (الشكل 1C)
    1. قم بإنشاء المادة الخام لطرف الكرة المتناثر عن طريق خلط قطرة من مادة لاصقة قابلة للمعالجة بالأشعة فوق البنفسجية مع مسحوق ثاني أكسيد التيتانيوم (جدول المواد) عند ~ 1: 1 فولت / حجم.
    2. قم بتوصيل المسبار بجهاز مناولة دقيقة بحامل قضيب تثبيت (جدول المواد) بحيث يكون المسبار في اتجاه أفقي. قم بإعداد خزان عامل لمادة التشتت عن طريق غمس طرف سلك أو إبرة في خليط المادة اللاصقة / TiO2 المحضر أعلاه بحيث تتشكل قطرة من المادة اللاصقة. قم بتركيب السلك أو الإبرة مع القطرة بالقرب من طرف المسبار الأفقي. من الملائم القيام بذلك باستخدام مشبك تمساح مثبت على المقعد.
    3. إيداع كرة مبعثرة على طرف المسبار. استخدم المعالج الدقيق لدفع طرف الألياف الضوئية للمسبار ببطء وبعناية إلى قطرة المادة اللاصقة / TiO2. ثم ، اسحب الحافة بسرعة من الغراء. كرر مرتين إلى ثلاث مرات حتى يتم ترسيب قطرة كروية من المادة اللاصقة بالحجم المطلوب على طرف الألياف الضوئية.
      ملاحظة: ستكون كرة التشتت مستقرة بأقطار أكبر من مرتين إلى ثماني مرات من قطر الألياف الضوئية المدببة. يعتمد الحجم الأمثل النهائي على التطبيق النهائي المطلوب.
    4. عالج الكرة عن طريق توصيل الطرف المنتهي SMA للألياف الضوئية بمصدر ضوء الأشعة فوق البنفسجية المقترن بالألياف (جدول المواد).
      ملاحظة: كان مصدر الضوء المستخدم في هذه الدراسة بقوة 5.3 ميغاواط. عند هذه القوة ، يكون وقت العلاج الموصى به 12 ساعة على الأقل أو بين عشية وضحاها. بعد المعالجة هو الوقت المناسب لتوصيف وقياس حجم طرف المسبار البصري النهائي.

2. تحضير وتركيب الأنسجة للقياسات البصرية (الشكل 2 والشكل 3)

  1. تحضير الأطباق لتركيب العينات للتجربة. قم بتسخين الطرف الكبير من ماصة باستور باستخدام شعلة البوتان لعمل ثقب لإذابة ثقب قطره 0.5 سم في قاع طبق بتري بلاستيكي 35 مم × 10 مم. أغلق الفتحة الموجودة على الجانب السفلي من الطبق بشريط كهربائي أو شريط مختبر. اصنع عدة في وقت واحد لتحقيق الكفاءة.
  2. تحضير الجيلاتين السائل (جدول المواد) وفقا للتعليمات الموجودة على العبوة.
    ملاحظة: الجيلاتين التجاري عديم النكهة من متجر البقالة أفضل لهذا الغرض من الجيلاتين الكيميائي من موردي المواد الكيميائية لأن الجيلاتين الكيميائي أقل وضوحا بصريا وأقل موثوقية ميكانيكيا من المنتج الغذائي.
  3. أداء تشريح وإعداد الأنسجة التي سيتم استخدامها.
    ملاحظة: من التجربة ، يمكن قياس أي نسيج مسطح يصل سمكه إلى 1 سم بنجاح في هذه التجربة باستخدام أي تقنية تشريح مناسبة لنظام الاهتمام. بالنسبة لأنسجة البطلينوس العملاقة ، تم استخدام خزعة 8 مم لعمل دائرة مسطحة ومنتظمة من أنسجة البطلينوس لاستخدامها في التجربة12. بالنسبة لهذا النظام ، يمكن تحضير عينة واحدة فقط بشكل فعال في كل مرة نظرا لطول الوقت اللازم لإكمال القياس للتأكد من أن العينة لا تزال في حالة نابضة بالحياة في نهاية التجربة.
  4. املأ طبقين من طبق بتري من الخطوة 2.1 ربع الطريق بالجيلاتين السائل ، واتركه يبرد إلى درجة حرارة الغرفة (RT) قبل قليل من الهلام. في طبق واحد ، ضع الخزعة في وسادة الجيلاتين اللزج الذي يتشكل في الفتحة الموجودة في قاع الطبق. استخدم ماصة باستور لإضافة جيلاتين RT برفق حول الخزعة حتى يمتلئ طبق بتري (الشكل 3). املأ الطبق الثاني بالجيلاتين لعمل عينة فارغة.
  5. ضع أطباق العينة في الثلاجة لمدة 10-30 دقيقة حتى يتم علاج الجيلاتين بالكامل ومرونة طفيفة عند لمسها.
    ملاحظة: في غرفة باردة ، قد لا يكون هذا ضروريا ؛ عند العمل في المناطق الاستوائية ، هذه الخطوة مطلوبة لعلاج الجيلاتين بالكامل.
  6. صنع حامل لطبق بتري على المناور الدقيق (الشكل 2)
    1. قطع مربع 6 سم × 6 سم من 1/4 في زجاج شبكي سميك (جدول المواد).
    2. حفر أو إذابة حفرة في مربع البلاستيك بنفس قطر طبق بتري (~ 35 مم). تأكد من أن طبق بتري يناسب هذه الحفرة بشكل مريح ويتم تثبيته في مكانه مع الاحتكاك. أضف شريطا إلى حواف الطبق لزيادة الحجم والاتصال الاحتكاكي قليلا.
    3. حفر أو إذابة حفرة قطرها 1/4 في زاوية المربع البلاستيكي. استخدم هذه الفتحة لربط المربع بالمناور الدقيق باستخدام 1/4 بوصة برغي ومسمار.
    4. قم بتغطية المربع البلاستيكي بشريط كهربائي أسود لتقليل الضوء الشارد الذي يصل إلى المسبار. وبالمثل ، استخدم الشريط لإنشاء تنورة حول جوانب المربع تمتد أسفل الجزء السفلي من الطبق المدرج (>10 مم) لتقليل الضوء الشارد (الشكل 2 ب).
    5. استخدم مسمارا وأجهزة مناسبة لتوصيل حامل أطباق بتري بمعالج دقيق يسمح بإجراء تعديلات ثلاثية الأبعاد وحركة رأسية جيدة الحل على مدى أكبر من سمك العينات (الجزء 1 والجزء 2 من المناور المذكور في جدول المواد أمثلة جيدة). قم بتثبيت هذا المكيف الدقيق على لوح تجارب بصري.

3. إعداد القياس لخزعات الأنسجة

  1. قم بتركيب مصدر ضوء فوق المنطقة التي يتم فيها القياس بحيث يتم موازاة الضوء عندما يصل إلى المستوى حيث سيتم وضع العينة (الشكل 2 أ). على سبيل المثال ، قم بتوصيل عدسة موازية مقاس 5 سم (جدول المواد) بدليل ضوء سائل 5 مم (جدول المواد) ، وارفعها فوق العينة بمقدار >0.6 متر باستخدام رذيلة وإطار متصلين بلوح تجارب بصري (جدول المواد). بعد ذلك، قم بتوصيل دليل الضوء بمصدر ضوء واسع النطاق، مثل مصدر ضوء البلازما المدرج في جدول المواد.
  2. قم بتوصيل المسبار بحامل موجه رأسيا بحيث يشير نحو مصدر الضوء. قم بتأمين المسبار بمشابك أو مشابك خرطوم أو شريط لاصق على عمود طاولة بصري.
    ملاحظة: في تجربة البطلينوس العملاق، يتم استخدام حامل قضيب مصمم خصيصا، مثل المناور الدقيق المدرج في جدول المواد. في هذا العمل ، تم تأمينه بواسطة مغناطيس إلى لوح بصري (جدول المواد). درجات الحرية الإضافية للمحاذاة التي تم الحصول عليها من خلال وجود كل من المسبار والعينة على المتلاعبين مريحة ولكنها ليست مطلوبة. احرص على عدم الإفراط في التثبيت على المنشور ، لأن هذا يمكن أن يكسر غلاف الماصة.
  3. ضع مناور العينة بالقرب من المسبار المثبت رأسيا. استخدم مناور العينة لضبط موضع مرحلة العينة بحيث يتمركز المسبار في فتحة 0.5 سم في الجزء السفلي من طبق بتري. توخ الحذر الشديد لتجنب لمس طرف المسبار المثبت أو ارتطامه.
    ملاحظة: يمكن أن يكون المجهر المجسم المثبت على ذراع الرافعة موضوعا فوق منطقة العينة مفيدا. بهذه الطريقة ، يمكن عرض المحاذاة من أعلى إلى أسفل لطرف المسبار والمرحلة والعينة قبل بدء التجربة (الشكل 2 أ).
  4. قم بتوصيل الطرف المنتهي ب SMA للألياف الضوئية للمسبار بمطياف الألياف الضوئية USB (جدول المواد) ، وقم بتوصيل مقياس الطيف بالكمبيوتر باستخدام كابل USB.

4. جمع البيانات

  1. الإعداد التجريبي
    1. اجعل المسبار والمتلاعبين في الموضع المحاذي الدقيق الذي سيتم فيه جمع البيانات ، كما في الخطوة 3.4.
    2. استخدم قطعة قطن أو إبرة قياس دقيقة لتطبيق كمية صغيرة من مواد تشحيم السيليكون بعناية (جدول المواد) على جزء المسبار الذي سيتم إدخاله في الأنسجة لتقليل الاحتكاك بين جوانب المسبار وعينة الأنسجة. أعد وضع مادة تشحيم السيليكون قبل كل قياس لخط الأساس أو الأنسجة.
    3. قم بإزالة الشريط الذي يغطي الفتحة الموجودة في طبق بتري للعينة الفارغة ، وضعه في حامل العينة (الخطوة 2.7) ، مع التأكد من تثبيته بإحكام في مكانه عن طريق الاحتكاك.
    4. استخدم المعالج الدقيق لخفض العينة على المسبار. اسمح للمسبار بدخول الجيلاتين عبر الفتحة الموجودة على الجانب السفلي من طبق بتري. استمر حتى يصبح المسبار حوالي 5 مم من أسفل طبقة الجيلاتين.
    5. قم بتشغيل مصدر الضوء. باستخدام برنامج مقياس الطيف ، اضبط وقت تكامل مقياس الطيف حتى تكون الإشارة عالية قدر الإمكان ولكنها غير مشبعة. اضبط متوسط عدد عمليات المسح الضوئي بين اثنين وخمسة وقيمة وحدات بكسل التجانس على ستة. يمكن أن تختلف أوقات التكامل القابلة للاستخدام في هذه المرحلة بين 1-50 مللي ثانية لهذا خط الأساس.
  2. جمع الأطياف المرجعية
    1. جمع قياس الظلام.
      1. بمجرد ضبط معلمات مقياس الطيف مع العينة الفارغة ، افصل ألياف المسبار عن مقياس الطيف ، وقم بتغطية المنفذ بالغطاء المعدني غير الشفاف المرفق مع مقياس الطيف.
      2. احصل على قياس مظلم من مقياس الطيف (غالبا باستخدام رمز المصباح الداكن في واجهة المستخدم الرسومية) لتوصيف ضوضاء مقياس الطيف بدون ضوء دخل. احفظ هذا القياس وفقا لاستراتيجية الحصول على البيانات.
    2. جمع قياس المصباح. أعد توصيل ألياف المسبار بمقياس الطيف ، وانتظر حتى تستقر الإشارة ، واحصل على طيف آخر. يميز هذا القياس الضوء الذي يصل إلى المسبار من خلال الجيلاتين في غياب الأنسجة.
  3. جمع أطياف الأنسجة
    1. قم بإزالة الشريط الموجود أسفل طبق بتري الخاص بالعينة، وضعه في حامل العينة.
    2. قم بمحاذاة طبق العينة مع المسبار باستخدام معالجة ثلاثية الأبعاد بحيث تتمركز خزعة الأنسجة فوق طرف المسبار.
    3. ضع هلام السيليكون على المسبار (انظر 4.1.2) ، وقم بخفض العينة ببطء على المسبار حتى يمر طرف المسبار عبر الجيلاتين الذي يدعم عينة الأنسجة ويدخل للتو عينة الأنسجة.
      ملاحظة: تسمح بعض أجهزة قياس الطيف وبرامج الكمبيوتر بمراقبة الضوء المكتشف في الوقت الفعلي. استخدم هذا لتحديد متى يدخل المسبار الأنسجة. ستنخفض شدة الطيف فجأة بمجرد أن يكون طرف المسبار على اتصال مباشر بالأنسجة.
    4. تحقق من أن وقت التكامل مناسب للقياس من خلال التأكد من أن الطيف المقاس ليس صاخبا جدا ولا مشبعا. قم بتغيير وقت التكامل إذا لزم الأمر.
      1. في أي وقت يتم ضبط وقت التكامل ، قم بإجراء وتخزين قياس مظلم جديد (الخطوة 4.2.1). لا تقم بتغيير عدد عمليات المسح الضوئي المتوسطة أو عدد وحدات البكسل الناعمة.
      2. بعد العثور على معلمات القياس المناسبة ، خذ القياسات واحفظ الطيف.
    5. حرك العينة لأسفل مسافة محددة باستخدام المعالج الدقيق. بالنسبة للمناور المستخدم في هذه الدراسة ، كانت كل علامة علامة صغيرة 0.001 بوصة أو 25.4 ميكرومتر. تم نقل العينة لأسفل من خلال خمس علامات تجزئة ، أو 127 ميكرومتر ، لكل قياس. كرر الخطوة 4.3.4.
    6. استمر في حفظ الأطياف في كل موضع رأسي داخل الأنسجة.
      ملاحظة: بالنسبة للنظام الموصوف هنا ، تراوحت أوقات التكامل المطلوبة بين 1 مللي ثانية إلى 5 ثوان للقياسات داخل عينة نسيج واحدة. في النهاية ، سيخرج طرف المسبار من الجزء العلوي من الأنسجة ويكون مرئيا هناك (الشكل 4 أ). هذا هو القياس النهائي ويميز الضوء الساقط في الجزء العلوي من الأنسجة.
  4. تحميل ومعالجة البيانات
    1. استخدم برنامج مقياس الطيف لتحويل جميع الأطياف المجمعة (الأطياف المظلمة وأطياف المصباح وقياسات الأنسجة) إلى ملفات نصية محددة.
    2. باستخدام Matlab أو لغة ترميز من اختيارك ، قم بتحميل جميع ملفات القياس للعينة. لكل طيف قياس الأنسجة ، اطرح الطيف المظلم مع وقت التكامل المطابق ، ثم قسمه على وقت التكامل.
      ملاحظة: في هذه الدراسة ، تم استخدام نص Matlab لتحميل ومعالجة البيانات (الملف التكميلي 1).
    3. احسب النسبة المئوية للضوء الساقط الذي يصل إلى كل موضع في الأنسجة بقسمة الأطياف التي تم الحصول عليها باستخدام المسبار داخل النسيج على طيف خط الأساس الذي تم الحصول عليه في الجيلاتين الفارغ.
      ملاحظة: يجب أن يكون القياس في الجزء العلوي من النسيج (الخطوة 4.3.6) مشابها جدا لقياس خط الأساس في الجيلاتين (الخطوة 4.1) ، وعند تقسيمه ، يجب أن يكون قريبا من 100٪. اعتمادا على السياق التجريبي ، يمكن استخدام طيف المصباح (الطيف من الجيلاتين الفارغ أو ذلك من أعلى الأنسجة) كمرجع. ومع ذلك ، لا يزال من المهم جمع طيف المصباح قبل بدء التجربة. هذا لأنه إذا انكسر المسبار أو فشلت التجربة بطريقة أخرى قبل الوصول إلى الجزء العلوي من الأنسجة ، فإن البيانات التي تم الحصول عليها قبل الفشل لا تزال قابلة للاستخدام ، وهذا ليس هو الحال إذا لم يكن هناك طيف مرجعي أولي مطابق للمصباح.
    4. تصور البيانات ؛ يمكن أن تكون المؤامرات الكنتورية مفيدة (الشكل 4 ب).

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

يصف هذا البروتوكول الإجراء الخاص ببناء مسبار بصري دقيق يمكن استخدامه لقياس إشعاع هبوط القاع (وصول الضوء إلى نقطة من اتجاه واحد) أو ، مع إضافة طرف كروي مشتت للضوء ، لقياس الإشعاع القياسي (الضوء الذي يصل إلى نقطة من جميع الاتجاهات). يمكن لهذه المجسات قياس الإشعاع بدقة مكانية تقترب من مقاييس طول الخلايا المفردة داخل الأنسجة الحية. يصف هذا البروتوكول أيضا طريقة تمثيلية لإعداد عينة الأنسجة لقياسات الإشعاع باستخدام المسبار الموصوف وطريقة تمثيلية لعرض البيانات وتحليلها.

يوضح الشكل 1 ناتج إنتاج المسبار الصغير. عند سحبها ، يجب أن تستدق الألياف الضوئية لحوالي 3 سم وألا تحتوي على أي خدوش على طول الاستدقاق. يجب أن تكون مسطحة أيضا في النهاية ويبلغ قطرها 15-30 ميكرومتر (الشكل 1 د). يمكن تحسين تسطيح الطرف عن طريق صنفرة الطرف بورق الكربوروندوم أو التسجيل والكسر مرة أخرى. وبالمثل ، يجب ألا يكون للماصة الزجاجية المسحوبة المستخدمة كغلاف للألياف أي حواف حادة أو مكسورة. عندما تتشكل كرة التشتت في نهاية الطرف المسطح والمقطوع للألياف ، يجب أن تكون كروية (الشكل 1C). قبل المعالجة ، يمكن إزالة تلك المشوهة عن طريق جولة أخرى من إدخال الكرة في القطرة اللاصقة الأم وسحب الألياف بسرعة. سرعة الحركة السريعة ستسحب كرة الغراء من نهاية الألياف. تؤدي الحركات البطيئة إلى بناء لاصق إضافي على الألياف. إن مشاهدة العملية باستخدام مجهر تشريح أثناء توصيل الألياف بمصدر ضوء مفيد لتصور العمل وتحديد ما إذا كانت العملية تعمل أم لا. من المهم تأمين الألياف داخل الماصة الزجاجية بالغراء والشريط الكهربائي قبل تطبيق المادة اللاصقة المتناثرة ؛ خلاف ذلك ، قد تنكسر الألياف ، أو قد تلطخ المادة اللاصقة بالألياف المتحركة (الشكل 1).

يوضح الشكل 2 جهاز القياس. في هذا المثال ، يتمتع حاملو كل من عينة الأنسجة والمسبار بقدرات ضبط في ثلاثة أبعاد (الشكل 2). يساعد إرفاق كل من العينة والمسبار بالمتلاعبين في المحاذاة ولكنه ليس ضروريا ؛ يمكن إرفاق المسبار بعمود ثابت. يجب توجيه الحركات الأكثر حلا للمعالجات في الاتجاه الرأسي z بحيث يمكن تحديد الموضع في الأنسجة و / أو مقدار تحركات المجسات بدقة (الشكل 2 أ). يمكن أن يكون المجهر المجسم المثبت على ذراع الرافعة مفيدا عند وضعه بحيث يمكن للمرء مشاهدة المرحلة والمسبار والعينة من خلال العدسة للتحقق من محاذاة المسبار مع المرحلة والطبق والعينة (الشكل 2 ب). من المفيد مشاهدة الأطياف في الوقت الفعلي أثناء إنزال العينة على المسبار لأنه إذا تغير الطيف الذي يقيسه المسبار فجأة ، فهذا يشير إلى أن العينة موجودة بنجاح داخل الأنسجة شديدة التشتت أو الامتصاص أو أن المسبار ينحني أو ينكسر. تشير التحولات المفاجئة في شكل وشدة الطيف على الأرجح إلى دخول الأنسجة ، بينما تشير التغيرات المفاجئة في الشدة دون تغيير في الشكل إلى أن المسبار ينحني أو ينكسر. في الجزء العلوي من أنسجة البطلينوس ، يوجد غشاء رقيق شفاف لا يستطيع المسبار اختراقه دون كسره. في مثل هذه الحالة ، يجب مراقبة الجزء العلوي من الأنسجة لمعرفة متى يكون المسبار على وشك الخروج ، ويجب إيقاف القياسات عند هذه النقطة حتى لا ينكسر المسبار.

يوضح الشكل 3 عينة خزعة الأنسجة المضمنة في طبق بتري من الجيلاتين ، كما هو موضح في القسم 2. يوجد ثقب في الجزء السفلي من طبق بتري للسماح بإدخال المسبار البصري في الأنسجة من الأسفل. يبلغ قطر الخزعة 8 مم وتتركز فوق الفتحة الموجودة في طبق بتري (الشكل 3 أ). توجد كمية صغيرة من الجيلاتين أسفل عينة الأنسجة ، ويتم ملء الجيلاتين إلى أعلى الطبق فوق الأنسجة (الشكل 3 ب).

يوضح الشكل 4 أ المسبار عندما يبدأ في الخروج من الجزء العلوي من النسيج ، ويوضح الشكل 4 ب البيانات التمثيلية. تم استخدام نص Matlab (الملف التكميلي 2) لإنشاء الآثار في الشكل 4B. المحور السيني هو الطول الموجي ، والمحور ص هو النسبة المئوية للضوء عند عمق الأنسجة بالنسبة إلى طيف خط الأساس. يشار إلى القياسات الفردية لعمق الأنسجة بالخطوط ذات التلوين الرمادي. يتم تمثيل القياسات المأخوذة بشكل أعمق في الأنسجة بخط أغمق. طيف خط الأساس هو القياس في عينة الجيلاتين فقط ويستخدم لتوصيف المصباح واستجابة المسبار للمصباح. الجيلاتين له امتصاص وتشتت طفيف ، مما يعني أن إشارة امتصاص الجيلاتين مقابل الطول الموجي ليست مسطحة تماما. لذلك ، فإن الأطياف المأخوذة في جميع أنحاء الأنسجة إما مقسمة على طيف المسبار في الجيلاتين أو على طيف المسبار في الجزء العلوي من النسيج بحيث تمثل البيانات الطيفية الموضحة في الشكل 4B النسبة المئوية للضوء فقط لعينة الأنسجة ، وبالتالي فهي مستقلة عن مصدر الضوء ، الجيلاتين ، وخصائص كل مسبار فردي.

Figure 1
الشكل 1: مراحل تصنيع مسبار القياس الإشعاعي البصري الدقيق داخل الأنسجة. أ: رسم تخطيطي للمسبار البصري. (ب) منظر للمسبار البصري النهائي. (ج) لقطة مقربة للكرة المبعثرة المتصلة بالألياف الضوئية المسحوبة داخل دعامة الماصة الزجاجية. د: الألياف الضوئية المسحوبة والمنظفة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

Figure 2
الشكل 2: صور ومخططات الإعداد التجريبي لقياس الإشعاع القياسي داخل النسيج . (أ) رسم تخطيطي عام وصورة للإعداد التجريبي. (ب) لقطة مقربة لعينة حامل طبق بتري. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

Figure 3
الشكل 3: خزعة أنسجة البطلينوس. (أ) منظر علوي و (ب) منظر جانبي لخزعة من أنسجة البطلينوس جاهزة للقياس في طبق بتري المعدل المملوء بالجيلاتين. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

Figure 4
الشكل 4: البيانات التمثيلية. أ: صورة مجهرية لشكل المسبار عند الصعود عبر الأنسجة. (ب) البيانات التمثيلية التي تم الحصول عليها باستخدام مسبار القياس الإشعاعي داخل الأنسجة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.

الملف التكميلي 1: برنامج Matlab النصي المستخدم لتحميل ومعالجة البيانات. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الملف.

الملف التكميلي 2: نص Matlab المستخدم لإنشاء الآثار في الشكل 4B. الرجاء الضغط هنا لتنزيل هذا الملف.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

يصف هذا البروتوكول تقنية لتوصيف البيئة البصرية بشكل منهجي من خلال حجم كبير من الأنسجة الحية بدقة مكانية تقريبا على نطاق الخلايا المفردة. يمكن أن تكون هذه الطريقة غير المكلفة والمرنة والقابلة للتتبع الميداني مفيدة لأي باحث يدرس انتشار الضوء داخل الأنظمة الحية. من التجربة ، مقارنة بالطرق الحالية7 ، تتطلب هذه المجسات مزيدا من الممارسة والمهارة للبناء ولكنها تؤدي إلى تلف أقل للأنسجة والقدرة على توصيف كميات أكبر من الأنسجة الكثيفة بشكل أكثر شمولا.

تتكون هذه الطريقة من أربعة أجزاء. الجزء الأول ، بناء المسبار ، مستوحى من تصميمات الأجهزة السابقة10,11. تم تطوير النهج الحالي لإجراء فحوصات منهجية أقل تدميرا لكامل الأنسجة السميكة ، حيث يمكن للإبرة الزجاجية المسحوبة أن تنزلق برفق بين الخلايا. كما أنه قابل للاستخدام في مختبر ميداني12،13،14. ينتج عن هذا البروتوكول مجسات ذات أطراف قطرها ~ 20 ميكرومتر لقياس إشعاع هبوط القاع وكرة تشتت اختيارية بقطر 50-100 ميكرومتر لقياس الإشعاع القياسي. يمكن تطوير كرات إشعاع عددية أكبر أو أصغر عن طريق تعديل المواد المستخدمة ، على سبيل المثال ، مادة لاصقة قابلة للمعالجة بالأشعة فوق البنفسجية بلزوجة أولية مختلفة. يمكن تعديل الوزن في كل من سحب الماصة وعملية الألياف لينتج عنها تفتق أكثر أو أقل. يمكن أيضا تعديل معدل التسخين من خلال المسافة من لهب الشعلة لضبط عملية السحب والاستدقاق الناتج.

تتطلب تقنية بناء المسبار بعض المهارات اليدوية والتجربة والخطأ لإتقانها ولكن يمكن أن تصبح موثوقة وسريعة مع الممارسة. هنا ، يتم تقديم بعض الفروق الدقيقة في استكشاف الأخطاء وإصلاحها التي تم تطويرها بمرور الوقت. يؤدي سحب الألياف الضوئية لأسفل من الطرف المغلف إلى تناقص تدريجي أكثر اتساقا. من المهم تطبيق القلم المعتم قبل إضافة طرف التشتت الكروي ، لأن خصائص ترطيب الحبر غير الشفاف تؤثر بشكل إيجابي على تكوين كرة مرتبة من المادة اللاصقة عند طرف الألياف. إذا كانت الكرة اللاصقة الناتجة مشوهة ، فمن الممكن سحبها والمحاولة مرة أخرى. للقيام بذلك ، يمكن استخدام micromanipulator لتحريك الكرة بأكملها في الخزان اللاصق ثم سحبها ببطء شديد. عادة ما يؤدي هذا إلى سحب المحاولة الأولى المشوهة ، وتركها في الخزان اللاصق وجعل من الممكن المحاولة مرة أخرى.

يمكن استخدام هذه المجسات بعناية لعينات مختلفة. الخطر الأكبر هو ضرب طرف المسبار عن طريق الخطأ في شيء ما أثناء تحريكه. بين القياسات ، يجب تنظيفها من الحطام الخلوي باستخدام كحول الأيزوبروبيل والهواء المضغوط. يمكن أيضا تخزين المجسات لأسابيع طالما أن طرف المسبار لا يلمس أي شيء ولا توجد قوى على مجموعة الألياف الضوئية التي قد تسحب الشريط والغراء الذي يحمل المسبار داخل الغلاف الزجاجي. يمكن تحقيق ذلك عن طريق تثبيت ماصة الألياف والزجاج في عدة أماكن على حافة الرف العالي.

يتضمن الجزءان الثاني والثالث من هذه الطريقة الجوانب الميكانيكية البصرية للتجربة وتأمين الأنسجة للقياس. تم تطوير هذا الجزء من الطريقة خصيصا لقياس الإشعاع القياسي داخل الأنسجة داخل أنسجة البطلينوسالعملاقة 12. هنا ، يتم تقديم تفاصيل لاستكشاف أخطاء هذه الجوانب من الطريقة وإصلاحها. أولا ، يجب أن تكون الخزعة كبيرة بالنسبة للمسبار. هذا يمنع المسبار من تحريك الأنسجة أثناء عبورها. بالإضافة إلى ذلك ، يجب أن يجلس النسيج في الجزء السفلي من طبق بتري بحيث تتحد مرونة ووزن الجيلاتين للحفاظ على الأنسجة في مكانها أثناء القياس. من المهم أيضا أن تكون الغرفة باردة بدرجة كافية للحفاظ على الجيلاتين في حالة مرنة وصلبة تحت مصدر الضوء التجريبي. وبالمثل ، فإنه يساعد على استخدام LED أو مصدر آخر مع توليد حرارة قليل نسبيا بالنسبة للضوء المرئي.

المعلمات الهندسية والبصرية للطريقة مرنة للغاية. على سبيل المثال ، تم استخدام مسبار الإشعاع القياسي لقياس الإشعاع داخل دماغ الفأر السليم والأنسجة الدهنية13,14. للقيام بذلك ، تم تركيب المسبار على المتلاعبين على إطار قياسي للقوارض التجسيمية ، وتم تركيب مصدر الضوء مشيرا إلى منصة الماوس. في أي هندسة ، فإن مفتاح الاستخدام الناجح لهذه الطريقة هو دائما جمع أطياف مرجعية مناسبة للمصباح والظلام في بداية أي قياس معين. إذا انكسر المسبار أثناء قياس الأنسجة ولم يكن هناك توصيف أولي بدون وجود الأنسجة في مكانها ، فسيكون من الصعب أو المستحيل تفسير البيانات ، وسيكون من الضروري البدء من جديد بمسبار جديد. في المقابل ، مع وجود المراجع المناسبة في البداية ، فإن القياسات الجزئية هي بيانات قابلة للاستخدام.

الجزء الأخير من هذه الطريقة يتعلق بالحصول على البيانات. يتم وصف استخدام مطياف الألياف الضوئية لمراقبة الإشارات من المسبار ، مما يضمن سهولة اقتران SMA ويوفر معلومات الطول الموجي الطيفي بالكامل. ومع ذلك ، بالنسبة للأنظمة ذات التدفق المنخفض للفوتون ، من الممكن أيضا إقران هذه المجسات بأنابيب المضاعف الضوئي أو الثنائيات الضوئية للانهيار الجليدي. على أي حال ، تتطلب جميع أجهزة الكشف قياسات مرجعية لكل قياس جديد. لذلك ، مع تعديلات طفيفة فقط على طرق جمع البيانات الموصوفة ، يمكن تمييز جميع الأنواع المختلفة من المعلمات البصرية.

يمكن أن تكون الاستخدامات المستقبلية المثيرة للاهتمام لهذه الطريقة هي القياس الكمي للضوء في أعماق أجسام الثدييات الأكبر حجما وداخل النباتات ذات خصائص النقل الإشعاعي المعقدة ، مثل العصارة.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

لا يوجد تضارب في المصالح.

Acknowledgments

يشكر المؤلفون ساناز فاهيدينيا على تعريفنا بزملاء الدكتور يورغنسن وعمله. تم دعم هذا البحث بمنح من مكتب أبحاث الجيش (رقم W911NF-10-0139) ، ومكتب البحوث البحرية (من خلال جائزة MURI رقم N00014-09-1-1053) ، وجائزة NSF-INSPIRE NSF-1343158.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
1" travel ball bearing center+D11+A2:D31+A2:A2:D31 Edmond Optics 37-935 Part 2 of manipulator for lowering sample
1/4" thick acrylic sheet McMaster-Carr 8505K754 For making Petri dish holder
3/4" mini spring clamp Anvil 99693 Use as weight for pulling optical fiber
8 mm biopsy punch Fisher Scientific NC9324386 For tissue sample
Butane Torch McMaster-Carr MT-51 Heat source for pulling fiber and pipette
Collimating lens Thorlabs LLG5A1-A To collimate light source through liquid light guide
Compressed air McMaster-Carr 7437K35 For drying pulled fiber and pipette
Cyanoacrylate glue - liquid McMaster-Carr 66635A31 For securing tapered fiber end at top of pulled pipette
Electrical tape McMaster-Carr 76455A21 For securing fiber in pipette and for adding grip to clamps
Fine grade carborundum paper McMaster-Carr 4649A24 Small triangle on exacto knife holder works well
Gelatin Knox 10043000048679 For securing the tissue biopsy in the petri dish
Glass Pasteur Pipete Fisher Scientific 13-678-20B Disposable glass pipette 5.75" in length
Insulin syringes, 31G needle BD 320440 For applying glue
Isopropanol McMaster-Carr 54845T42 For cleaning pulled fiber and pipette
Kimwipe Cole-Parmer SKU 33670-04 For wiping optical fiber and glass pipette clean
LED driver Thorlabs LEDD1B For powering the UV LEDs
Light source for measurements Cole-Parmer UX-78905-05 Low heat white light source for measurements
Linear metric X-Y-Z axis rack and pinion stage Edmond Optics 55-023 Part 1 of manipulator for lowering sample
Liquid light guide Thorlabs LLG5-4T For light source in measurements
Magnetic feet Siskiyou MGB 8-32 For use with magnetic strips
Magnetic strips Siskiyou MS-6.0 For mounting magnetically to breadboard
Manipulator #1 Siskiyou MX10R 4-axis manipulator with pipette holder
Opaquer pen, small WindowTint TOP01 For opaquing side of optical fiber to prevent stray light from enter probe
Optical breadboard Edmond Optics 03-640 For stable affixation of probe holder, sample, microscope and light source
Optical fibers Ocean Optics P-100-2-UV-VIS About 4 fibers are good to have
Plasma light source Thorlabs HPLS345 For tissue radiometry measurements
Plastic plier clamp McMaster-Carr 5070A11 Plier clamp used for weight in pulling pipette
Polystyrene Petri dishes Thomas scientific 3488N10 Sample holders, enough volume to hold sample thickness plus ~10 mm of gelatin on top
Razor blades McMaster-Carr 3962A3 For stripping jacketing from optical fiber
Silicone oil lubricant Thomas scientific 1232E30 For reducing friction between probe and tissue
Software for analyzing data Matlab Chosen software for data analysis
Spectrometer + spectrometer software Avantes AvaSpec-2048L Spectrometer can be any brand, this one is compatible with sma-terminated optical fibers and comes with its own software for running the spectrometer
Titanium dioxide powder Sigma Aldrich 718467-100G For making scattering sphere
Toolour tabletop clip Toolour Toolour0004 For holding pipette while pulling and for holding finished probes
Trigger-action bar clamps mcMaster-Carr 51755A2 Good for holding optical fibers while pulling or curing
UV curable adhesive Delo Photobond GB368 For making scattering sphere
UV light source Thorlabs M365FP1 Light source for curing adhesive in scattering ball, this one is sma-fiber compatible, higher intensity = less cure time
White LED light source Thorlabs MCWHF2 For characterizing pulled fiber and scattering sphere

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Williams, J. Optical properties of the ocean. Reports on Progress in Physics. 36 (12), 1567-1608 (2001).
  2. Solonenko, M., et al. In vivo reflectance measurement of optical properties, blood oxygenation and motexafin lutetium uptake in canine large bowels, kidneys and prostates. Physics in Medicine & Biology. 47 (6), 857-873 (2002).
  3. Vásquez-Elizondo, R. M., Enríquez, S. Light absorption in coralline algae (Rhodophyta): A morphological and functional approach to understanding species distribution in a coral reef lagoon. Frontiers in Marine Science. 4, 393 (2017).
  4. Samatham, R. Optical properties of mutant versus wild-type mouse skin measured by reflectance-mode confocal scanning laser microscopy (rCSLM). Journal of Biomedical Optics. 13 (4), 041309 (2008).
  5. Dimofte, A., Finlay, J. C., Zhu, T. C. A method for determination of the absorption and scattering properties interstitially in turbid media. Physics in Medicine & Biology. 50 (10), 2291-2311 (2005).
  6. Wang, L., Jacques, S. L., Zheng, L. MCML-Monte Carlo modeling of light transport in multi-layered tissues. Computer Methods and Programs in Biomedicine. 47 (2), 131-146 (1995).
  7. Wangpraseurt, D., Larkum, A. W. D., Ralph, P. J., Kühl, M. Light gradients and optical microniches in coral tissues. Frontiers in Microbiology. 3, 316 (2012).
  8. Garcia-Pichel, F. A SCALAR IRRADIANCE FIBER-OPTIC MICROPROBE FOR THE MEASUREMENT OF ULTRAVIOLET RADIATION AT HIGH SPATIAL RESOLUTION. Photochemistry and Photobiology. 61 (3), 248-254 (1995).
  9. Rickelt, L. F. Fiber-Optic Probes for Small-Scale Measurements of Scalar Irradiance. Photochemistry and Photobiology. 92 (2), 331-342 (2016).
  10. Jorgensen, B. B. A simple fiber-optic microprobe for high resolution light measurements: Application in marine sediment. Limnology and Oceanography. 31 (6), 1376-1383 (1986).
  11. Kühl, M., Lassen, C., Jørgensen, B. B. Optical properties of microbial mats: Light measurements with fiber-optic microprobes. Microbial Mats. NATO ASI Series. 35, Springer. Berlin, Heidelberg. (1994).
  12. Holt, A. L., Vahidinia, S., Gagnon, Y. L., Morse, D. E., Sweeney, A. M. Photosymbiotic giant clams are transformers of solar flux. Journal of the Royal Society Interface. 11 (101), 20140678 (2014).
  13. Nayak, G., et al. Adaptive thermogenesis in mice is enhanced by opsin 3-dependent adipocyte light sensing. Cell Reports. 30 (3), 672-686 (2020).
  14. Zhang, K. X., et al. Violet-light suppression of thermogenesis by opsin 5 hypothalamic neurons. Nature. 585 (7825), 420-425 (2020).

Tags

الهندسة الحيوية، العدد 196،
مسبار دقيق للقياس الإشعاعي داخل الأنسجة لقياس الإشعاع في <em>الموقع في</em> الأنسجة الحية
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Holt, A. L., Gagnon, Y. L., Sweeney, More

Holt, A. L., Gagnon, Y. L., Sweeney, A. M. An Intra-Tissue Radiometry Microprobe for Measuring Radiance In Situ in Living Tissue. J. Vis. Exp. (196), e64595, doi:10.3791/64595 (2023).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter