-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

AR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

ar

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biochemistry
عاليه الانتاجيه الكلي الداخلية انعكاس الفلورية والتوجيه العشوائي البصرية أعاده البناء المجهري باس...
عاليه الانتاجيه الكلي الداخلية انعكاس الفلورية والتوجيه العشوائي البصرية أعاده البناء المجهري باس...
JoVE Journal
Biochemistry
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemistry
High-Throughput Total Internal Reflection Fluorescence and Direct Stochastic Optical Reconstruction Microscopy Using a Photonic Chip

عاليه الانتاجيه الكلي الداخلية انعكاس الفلورية والتوجيه العشوائي البصرية أعاده البناء المجهري باستخدام رقاقه فوتوسونيك

Full Text
7,460 Views
14:09 min
November 16, 2019

DOI: 10.3791/60378-v

David André Coucheron1, Øystein Ivar Helle1, Cristina Ionica Øie2, Jean-Claude Tinguely1, Balpreet Singh Ahluwalia1

1Department of Physics and Technology,UiT The Arctic University of Norway, 2Vascular Biology Research Group, Department of Medical Biology,UiT The Arctic University of Norway

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This article presents a novel chip-based super-resolution optical microscopy technique, focusing on TIRF microscopy and single-molecule localization microscopy. The protocols for chip preparation and imaging are detailed, highlighting the advantages of this approach in cost-effectiveness and throughput.

Key Study Components

Area of Science

  • Fluorescence microscopy
  • Super-resolution imaging
  • Photonic chip technology

Background

  • Traditional TIRF microscopy relies on objective lens illumination.
  • Photonic chips utilize optical waveguides for light guidance.
  • Evanescent waves enable high-resolution imaging at the surface level.
  • This method enhances imaging area and throughput.

Purpose of Study

  • To demonstrate a new imaging procedure using photonic chip-based TIRF microscopy.
  • To compare traditional methods with the chip-based approach.
  • To provide detailed protocols for chip preparation and imaging.

Methods Used

  • Preparation of photonic chips using optical waveguides.
  • Cell seeding and incubation protocols for sample preparation.
  • Imaging setup involving a microscope, laser, and camera.
  • Image capture and processing using Fiji software.

Main Results

  • Successful demonstration of high-throughput imaging capabilities.
  • Clear visibility of scattered light along the waveguide.
  • Effective localization of single molecules using the new setup.
  • Improved imaging resolution compared to traditional methods.

Conclusions

  • The chip-based approach offers significant advantages in fluorescence microscopy.
  • Decoupling illumination and collection enhances imaging possibilities.
  • This method paves the way for future advancements in super-resolution microscopy.

Frequently Asked Questions

What is TIRF microscopy?
TIRF microscopy is a technique that uses total internal reflection to illuminate a thin region of a sample, allowing for high-resolution imaging of surface phenomena.
How does the photonic chip improve imaging?
The photonic chip allows for uniform illumination over a large area and decouples the illumination from the imaging process, enhancing throughput and resolution.
What are evanescent waves?
Evanescent waves are light waves that decay exponentially away from a surface, enabling high-resolution imaging close to the surface in TIRF microscopy.
What is the significance of using PDMS in the setup?
PDMS is used to create a chamber for cell seeding, providing a controlled environment for imaging and ensuring minimal interference during the process.
How are images processed after capture?
Captured images are processed using Fiji software, where stacks of images can be averaged to enhance the quality and resolution of the final image.
What are the advantages of this new imaging technique?
The new technique offers cost-effectiveness, high throughput, and improved resolution compared to traditional microscopy methods.

المجهر البصري فائقه الدقة المستندة إلى الرقاقة هو نهج جديد للمجهر الفلوري ويقدم مزايا في فعاليه التكلفة والانتاجيه. هنا ، يتم عرض بروتوكولات لاعداد رقاقه والتصوير لمجهر TIRF والتعريب المستندة إلى المجهر فائقه الدقة.

الهدف الرئيسي من هذه المخطوطة هو تقديم إجراء تصويري للمجهر TIRF الضوئي القائم على رقاقة المطورة حديثًا والمجهر المحلي أحادي الجزيء، مثل dSTORM. المكون الرئيسي هنا هو رقاقة الضوئية التي يتم إجراؤها من سلسلة من موجه الموجات الضوئية. يتم توجيه الضوء داخل موجه الموجات الضوئية على أساس الانعكاس الداخلي الكلي.

بعض الضوء موجود على السطح في شكل موجات متألقة. تلك الموجات المتألقة، تتحلل بشكل كبير بعيدا عن السطح، مع عمق اختراق بضع مئات من نانومتر. وهذا يجعلها مناسبة لإضاءة TIRF.

تتوفر إضاءة TIRF عبر موجه الموجات الضوئية على مساحة كبيرة للغاية ، والتي يتم تعريفها من خلال هندسة دليل الموجة ، وبالتالي فهي مناسبة بشكل مثالي للتصوير عالي الإنتاجية. الفرق الرئيسي بين TIRF التقليدية وإعداد dSTORM بالمقارنة مع نهجنا هو أننا نستخدم رقاقة ضوئية لإلقاء الضوء على العينة، بدلا من إرسال الضوء من خلال عدسة التصوير الهدف. نهجنا فصل الإضاءة وجزء ضوء جمع، وفتح إمكانيات التصوير الجديدة.

ضع الرقاقة في طبق بيتري الزجاجي باستخدام مُلقط رقاقة، واغطيها بالكامل بحل هيلمانيكس بنسبة 1٪. ضع طبق بيتري على الساخنة في 70 درجة لمدة 10 دقائق. بينما لا يزال على السطح الساخن، فرك السطح مع مسحة الأنسجة غرفة نظيفة.

إزالة رقاقة من طبق بيتري. شطف مع ما لا يقل عن 100 ملليلتر من الماء ديون. شطف مع ما لا يقل عن 100 ملليلتر من الايزوبروبانول، مع الحرص على أن المذيبات لا تجف على السطح لمنع بقع التبخر.

شطف مع ما لا يقل عن 100 ملليلتر من الماء ديون. انفخ الرقاقة ببندقية النيتروجين إعداد في وقت لاحق من 150 ميكرومتر PDMS عن طريق الغزل في طبق بيتري.

استخدم مشرطًا لقطع إطار 1.5 سنتيمترًا تقريبًا من طبقة PDMS. ارفع الإطار من طبق بيتري مع ملاقط. إيداعه شقة على رقاقة نظيفة ومصقول.

العينة جاهزة الآن لبذات الخلايا. بعد بذر الخلية، قم بإزالة الشريحة من الوسائط. استخدام الأنابيب لإزالة أي السوائل الزائدة من خارج غرفة PDMS.

إزالة السائل الحالي من داخل غرفة PDMS مع pipet في حين إضافة ما يقرب من 60 ميكرولتررس برنامج تلفزيوني نظيفة في نفس الوقت. استبدال برنامج تلفزيوني مع 60 microliters برنامج تلفزيوني نظيفة، والسماح لها احتضان لمدة دقيقة واحدة. كرر الخطوة السابقة، والسماح لها احتضان لمدة خمس دقائق هذه المرة.

إزالة برنامج تلفزيوني، واستبداله مع 60 ميكرولترات من محلول الصبغة. اترك العينة لاحتضانها لمدة 15 دقيقة، ولحمايةها من الضوء. اغسل العينة باستخدام برنامج تلفزيوني باستخدام الإجراء الموصوف مسبقًا.

إزالة برنامج تلفزيوني، واستبداله مع 40 ميكروليتر من المخزن المؤقت للتصوير في نفس الوقت. ضع غطاء على القمة، ومنع فقاعات الهواء من التشكل تحتها. اضغط بلطف على غطاء الأغطية مقابل غرفة التصوير لإزالة أي وسائط زائدة.

استخدام pipet لإزالة أي وسائط الزائدة خارج الغطاء. تنظيف المنطقة خارج غطاء مع مسحة رطبة للمياه لتجنب بلورات التي شكلتها بقايا وسائل الاعلام الغمر المجفف. يتكون هذا الإصدار من الإعداد من ثلاثة مكونات رئيسية.

المجهر مع حامل مرشح، مصدر الضوء الأبيض، وكاميرا، ومسدس الهدف. مرحلة اقتران، وهو عبارة عن مرحلة بيزو ثلاثية المحاور، مع ليزر الألياف مقرونة، وعدسة اقتران. مرحلة العينة، وهي مرحلة يدوية ذات محور واحد، مع طرف والميل، مع حامل فراغ.

يتم تركيب كل من مرحلة الالاقتران والعينة على مرحلة مزودة بمحركات من محورين لترجمة العينة. ضع الرقاقة على شاحنة التفريغ ، مع جانب اقتران نحو هدف اقتران. تأكد من أن الشريحة هي تقريباً البعد البؤري واحد بعيداً عن هدف اقتران.

تشغيل مضخة فراغ. تشغيل الليزر إلى ميلي واط واحد. ضبط تقريبا ارتفاع رقاقة بحيث يضرب شعاع على حافة منه.

أطفئ الليزر قم بتشغيل مصدر الضوء الأبيض. اختر عدسة هدف منخفضة التكبير، على سبيل المثال، 10x.

ركز المجهر على دليل الموجة. ترجمة المجهر على طول الموجة لمعرفة ما اذا كان الانحياز بشكل جيد مع المسار البصري. نقل المجهر إلى حافة اقتران.

قم بتشغيل الليزر عند ميللي واط أو أقل. ترجمة المجهر على طول حافة اقتران للعثور على ضوء الليزر. ركّز الشعاع على حافة الشريحة.

اضبط مرحلة الاقتران على طول المسار البصري في الاتجاه الذي يقلل من حجم بقعة شعاع الليزر حتى يختفي. الشعاع هو الآن إما فوق أو تحت سطح رقاقة. ضبط ارتفاع مرحلة اقتران حتى يظهر بقعة شعاع وتكبير.

كرر الخطوتين السابقتين حتى يشكل الليزر بقعة مركزة. نقل بقعة مركزة إلى موجه الموجة من الفائدة. ترجمة المجهر على مسافة قصيرة بعيدا عن الحافة بحيث بقعة شعاع مركزة لم تعد مرئية.

أطفئ الضوء الأبيض. ضبط التباين. إذا كان موجه الموجة هو توجيه، وينبغي أن الضوء المتناثرة على طول موجه الموجة تكون واضحة للعيان.

ضبط محور مرحلة اقتران لتعظيم كثافة الضوء المتناثرة. أطفئ الليزر تشغيل الضوء الأبيض.

اضبط التباين إذا لزم الأمر. انتقل إلى منطقة التصوير. التركيز مع الهدف المطلوب تخيل.

أطفئ الضوء الأبيض. أدخل فلتر الفلوريسنس، ثم قم بتحويل طاقة الليزر إلى ميلي واط واحد. تعيين وقت تعرض الكاميرا إلى ما يقرب من 100 مللي ثانية.

ضبط التباين حسب الحاجة. تأكد من أن اقتران لا يزال الأمثل. حدد موقع منطقة ذات أهمية للتصوير.

تشغيل المرحلة piezo حلقات إلى متوسط خارج العقد. التقط ما لا يقل عن 300 صورة. قم بتحميل مكدس الصور الملتقط إلى فيجي باستخدام مكدس ظاهري.

من قائمة الصور في فيجي، اختر مكدسات، و Z Project. احسب صورة TIRF عن طريق اختيار نوع الإسقاط، متوسط الكثافة. قم بتشغيل الليزر إلى ملليواط واحدة، ثم قم بتعيين وقت تعرض الكاميرا إلى 30 مللي ثانية.

ضبط التباين والتركيز. زيادة قوة الليزر حتى يتم ملاحظة الوميض. تكبير منطقة صغيرة من العينة.

ضبط التباين. التقط بعض الصور لمعرفة ما إذا كانت الوميض منفصلة بشكل جيد. ضبط وقت تعرض الكاميرا للوميض الأمثل.

بدوره على مرحلة بيزو حلقات. تسجيل كومة صور لا تقل عن 30000 إطار، وذلك حسب كثافة الوميض. افتح فيجي، ثم قم بتحميل مكدس dSTORM كصور افتراضية.

اضبط التباين إذا لزم الأمر. استخدم أداة المستطيل لتحديد المساحة التي تريد إعادة بنائها. فتح تحليل تشغيل في البرنامج المساعد ThunderSTORM في فيجي.

ضبط إعدادات الكاميرا الأساسية في ThunderSTORM، المقابلة لجهازك. المعلمات الافتراضية المتبقية عادة ما تكون مرضية. ابدأي إعادة الإعمار

تتم تصفية قائمة التعريب التي توفرها برامج إعادة البناء لإزالة التعريبات غير اِنّت. يتم تطبيق تصحيح انجراف إضافية إذا لزم الأمر. والفرق الرئيسي بين التصوير القائم على الرقاقة والتصوير التقليدي هو في الأجهزة وحيازة البيانات.

ولذلك يمكن تقييم جودة الصور المعاد بناؤها بنفس الطريقة التي يتم بها تقييم صورة من مجهر تجاري فائق الدقة. وبما أن هناك عدة مؤشرات موجية تستخدم في وضعية متعددة، فإن الصورة الناتجة قد تظهر مع ذلك استثارة غير متجانسة إذا تم جمع عدد قليل جداً من الصور. ويظهر ذلك في اللوحة a.

وينبغي أن تؤدي زيادة مقدار أنماط الإثارة إلى إثارة غير متجانسة، كما هو مبين في الفريق ب. هنا لدينا صورة الكبد الخلوية خلية البطانية، مع غشاء البلازما المسمى الفلورسنت. اللوحات a و b هي صور محدودة الانعراج.

يُظهر اللوحة c صورة محدودة الانعراج للانكسار في اللوحة b. لوحة d يظهر صورة dSTORM من نفس المنطقة. خلايا البطانية الجيوب الأنفية في الكبد لها مناظير نانو الحجم في غشاء البلازما، والتي هي واضحة للعيان في صورة فائقة الدقة في لوحة د.

واحدة من المزايا الرئيسية للتصوير فائق الدقة القائم على الرقاقة هو مجال الرؤية الكبير الذي يمكن تحقيقه. لوحة يظهر 500 ميكرون من قبل 500 ميكرون كبيرة dSTORM صورة للخلايا البطانية في الجيوب الأنفية في الكبد مع ميكروتوبولين المسمى الفلورسنت. يُظهر اللوحة b الزبن الأرجواني من اللوحة a، مع كل من الصور المحدودة للانعراج والوضوح الفائق للمقارنة.

يُظهر اللوحة c اللون الأخضر من اللوحة a. دقة الصورة الملتقطة هي 77 نانومتر. في هذا الفيديو، قمنا بتنفيذ حقل كبير من عرض TIRF وتصوير dSTORM للخلايا البطانية الجيوب الأنفية في الكبد باستخدام رقاقة ضوئية للإضاءة.

أسلوبنا هو أقل تعقيدا وأكثر إحكاما وأكثر مرونة من الطريقة التقليدية لأداء TIRF باستخدام هدف المجهر من الفتحة العددية المحددة سلفا وانخفاض مجال الرؤية. المجهر المحلي ، مثل dSTORM ، هو واحد من العديد من تقنية التصوير فائقة الدقة التي استكشفناها باستخدام رقاقة ضوئية. على سبيل المثال، يمكن أن يكون الضوء محصورًا بإحكام داخل مادة دليل الموجات الضوئية ذات المؤشر العالي الانكسار أكثر مما هو ممكن باستخدام عدسة التصوير الموضوعية.

وقد وجدت هذه الخاصية من الإضاءة رقاقة تطبيق في زيادة قرار من أسلوب المجهر البصرية القائمة على كثافة التقلبات والمجهر الإضاءة المنظم. بالإضافة إلى ذلك ، فوائد رقائق الضوئية أيضا من التصغير ، وفعالية التكلفة ، والإعداد البصرية بسيطة. كونها تقنية متكاملة يجعلها متوافقة مع غيرها من الوظائف البصرية على رقاقة.

تماما, هذا يجعل هو يمكن ل إعادة تجهيز داخل تقليديّة حيود-مجاهر محدودة, يسمح ل فائقة -قرار في منخفضة حساب.

Explore More Videos

الكيمياء الحيوية الإصدار 153 الفلوري إجمالي الانعكاس الداخلي المجهر البصري فائق الدقة تنظير النانو الموجات البصريات المتكاملة

Related Videos

نيون الميكروسكوب Lensless على رقاقة

11:23

نيون الميكروسكوب Lensless على رقاقة

Related Videos

18.2K Views

تقنية الفحص المجهري للTIRF التصوير، في الوقت الحقيقي في وقت واحد من TCR وما يرتبط بها من البروتينات اشارة

16:10

تقنية الفحص المجهري للTIRF التصوير، في الوقت الحقيقي في وقت واحد من TCR وما يرتبط بها من البروتينات اشارة

Related Videos

24.5K Views

Lensfree الميكروسكوب تصوير الشعاعي الطبقي على رقاقة ويعمل لدى الشركة متعددة زاوية الإضاءة وبكسل سوبر قرار

08:41

Lensfree الميكروسكوب تصوير الشعاعي الطبقي على رقاقة ويعمل لدى الشركة متعددة زاوية الإضاءة وبكسل سوبر قرار

Related Videos

12K Views

واحدة جزيء مضان المجهر على مستو المعتمدة طبقات ثنائية

20:00

واحدة جزيء مضان المجهر على مستو المعتمدة طبقات ثنائية

Related Videos

14.5K Views

دليل لهيكلة الإضاءة TIRF المجهري بسرعة عالية مع الألوان متعددة

11:15

دليل لهيكلة الإضاءة TIRF المجهري بسرعة عالية مع الألوان متعددة

Related Videos

26.3K Views

تنفيذ نظام متماسك مكافحة ستوكس رامان نثر (CARS) على تي: الياقوت وOPO بالليزر القائم ستاندرد الليزر الضوئي مجهر

12:54

تنفيذ نظام متماسك مكافحة ستوكس رامان نثر (CARS) على تي: الياقوت وOPO بالليزر القائم ستاندرد الليزر الضوئي مجهر

Related Videos

11.7K Views

التصوير خيوط متوسطة وميكروتوبوليس مع الفحص المجهري 2-الأبعاد التعمير البصرية العشوائية المباشرة

14:23

التصوير خيوط متوسطة وميكروتوبوليس مع الفحص المجهري 2-الأبعاد التعمير البصرية العشوائية المباشرة

Related Videos

11.5K Views

إجراء وسائط تصوير متعددة مع واحد Fluorescence المجهر

08:32

إجراء وسائط تصوير متعددة مع واحد Fluorescence المجهر

Related Videos

10.3K Views

تصور تشكيل الالتصاق في الخلايا من خلال متقدم الغزل مجهرية Fluorescence انعكاس الداخلية القرص--المجموع

10:19

تصور تشكيل الالتصاق في الخلايا من خلال متقدم الغزل مجهرية Fluorescence انعكاس الداخلية القرص--المجموع

Related Videos

7K Views

انعكاس التداخل المتزامن والمجهر الفلوري للانعكاس الداخلي الكلي لتصوير الأنابيب الدقيقة الديناميكية والبروتينات المرتبطة بها

06:43

انعكاس التداخل المتزامن والمجهر الفلوري للانعكاس الداخلي الكلي لتصوير الأنابيب الدقيقة الديناميكية والبروتينات المرتبطة بها

Related Videos

4K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code