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Das hier vorgestellte Protokoll beschreibt die Isolierung von humanen Bronchialepithelzellen aus reseziertem Lungengewebe, eine Methode zur optimalen Expansion von Zellen ohne Verlust des Differenzierungspotentials, ein Kryokonservierungsverfahren und ein Verfahren zur Erzeugung gut differenzierter ALI-PBEC-Kulturen. Des Weiteren wird eine Beschreibung der Qualitätskontrolle sowie eine Anleitung zur Überwachung und Bewertung der differenzierten ALI-PBECs gegeben.
Das beschriebene Protokoll beginnt mit einem makroskopisch normalen, tumorfreien Bronchialring, der aus einem Lungenlappen von Patienten reseziert wird, die sich im Zusammenhang mit ihrer Lungenkrebsdiagnose einer Operation unterziehen. Es ist daher zu beachten, dass diese Ringe streng genommen nicht als gesundes Gewebe angesehen werden können, was daher die Eigenschaften der Zellkultur beeinträchtigen kann. Alternative Quellen zur Gewinnung von Bronchialepithelzellen sind die Verwendung von Bronchialepithelzellen, Bronchialbürsten oder Gewebe aus der Lunge eines transplantierten Spenders oder Empfängers. Unabhängig von der Quelle sollte bei der Verwendung von Lungengewebe das Risiko einer mikrobiellen Kontamination berücksichtigt werden, und daher werden Antibiotika in den verschiedenen Nährmedien verwendet, um das Risiko einer mikrobiellen Kontamination der Zellkultur zu verringern. Insbesondere Mykoplasmen stellen ein hohes und häufiges Risiko in Zellkulturen dar, da sie eine Vielzahl von Auswirkungen auf die Zellkultur haben, Resistenzen gegen Antibiotika, die üblicherweise in Zellkulturen verwendet werden, und die Tatsache, dass eine Mykoplasmenkontamination nur durch Mykoplasmennachweisassays bestätigt werden kann. Daher wird in der Anfangsphase der Zellkultur nach der Isolierung von Zellen aus Lungengewebe die antimikrobielle Breitbandformulierung Primocin verwendet, und während des Kulturprozesses werden zufällig ausgewählte Proben auf das Vorhandensein von Mykoplasmen getestet.
Das Isolationsverfahren, das mit einem Bronchialring beginnt, liefert ausreichend Ausgangsmaterial, um den Expansionsgrad dieser Primärzellen zu ermöglichen, der für den Start von Kulturen am ALI erforderlich ist, ohne die Differenzierungsfähigkeit zu beeinträchtigen. Der Beginn der Expansion der isolierten Epithelzellen mit einer begrenzten Anzahl von Zellen kann jedoch Probleme bei der Gewinnung einer ausreichenden Anzahl von Inserts mit genügend Zellen verursachen, die für die ALI-Kultur ausgesät werden können. Eine ausgedehnte Kultur und wiederholte Passage von Primärzellen kann zu einer replikativen Seneszenz führen. Es wurden verschiedene Lösungen vorgeschlagen, um diese Einschränkung zu überwinden. Horani et al. zeigten, dass der Rho-Kinase-Inhibitor (ROCK) Y-27632 die Proliferation von Basalzellen erhöhte30, Mou et al. nutzten die duale Smad-Hemmung, um basale Stammzellen zu vermehren und gleichzeitig die Eigenschaften der differenzierten Epithelzellschicht31 beizubehalten, und Sachs et al. haben ein Atemwegsorganoidsystem entwickelt, das verwendet werden kann, um Atemwegsepithelzellen zu erweitern und ihr Differenzierungspotenzial im Laufe mehrerer Passagen aufrechtzuerhalten32. Die letztgenannte Methode wurde auch verwendet, um Zellen aus Quellen mit sehr geringer Zellzahl, wie z. B. Trachealaspiate (TAs) von Frühgeborenen (<28. Schwangerschaftswoche) und bronchoalveoläre Lavageflüssigkeit (BAL), zu expandieren, bevor sie in die ALI-Kultur übertragen wurden, wie hier beschrieben33. Es zeigte sich, dass Zellen, die aus BAL und TAs isoliert wurden, eine ähnliche Differenzierungsfähigkeit aufwiesen wie Zellen, die aus Bronchialgewebe generiert wurden, obwohl Unterschiede beobachtet wurden, wenn die Differenzierung in Richtung eher bewimperter oder kelchzellhaltiger Kulturen unter Verwendung der Notch-Signalinhibition oder des Th2-Zytokins IL-1333 verzerrt wurde. Es wird daher empfohlen, bei der Kultivierung von ALI-PBECs aus einem Ausgangsmaterial mit geringer Epithelzellzahl unter Verwendung ähnlicher Ansätze die Kulturen immer auf die grundlegenden Qualitätskriterien zu überprüfen, wie in Abschnitt 6 des Protokolls erörtert. Wichtig ist, dass die Verwendung von Feeder-Zellen auch dazu beitragen kann, größere Zellzahlen zu erhalten, was in einer Umgebung für die Entwicklung von transplantierbaren Gerüsten, in der Zeit und Zellzahl entscheidend sind, unerlässlich ist. Dies wird durch eine Studie veranschaulicht, in der autologe Epithelzellen aus Biopsien eines Patienten mit Trachealerkrankung kultiviert und Zellen in Gegenwart einer murinen embryonalen Feederschicht (mitotisch inaktivierte 3T3-J2-Fibroblasten) und des oben erwähnten Inhibitors des Rho/ROCK-Signalwegs (Y-27632)34 schnell vermehrt wurden. Die resultierende Zellkultur erwies sich als nützlich für die Wiederbesiedlung von Trachealgerüsten und könnte daher als geeignetes Protokoll für ein Transplantationsmodell angesehen werden.
Bei der Verwendung des in diesem Beitrag beschriebenen Protokolls, aber auch bei der Verwendung anderer Kulturprotokolle, wird zwangsläufig ein Selektionsbias eingeführt. Es ist wichtig zu wissen, dass Unterschiede in den Protokolldetails, wie z. B. die Herkunft der Zellen, die zur Initiierung von Kulturen verwendet werden, die Zusammensetzung des Mediums und andere Protokolldetails zu Veränderungen in der zellulären Zusammensetzung der Kulturen und damit zu Veränderungen in der Reaktion der ALI-Kultur führen können33,35. Darüber hinaus wurden auch Unterschiede in den Zelleigenschaften beobachtet, wenn verschiedene Medien zur Differenzierung der Atemwegszellen verglichenwurden 10,11. Beim Vergleich von PneumaCult und cBD-Medium wurden Unterschiede in den mRNA-Markern für Becherzellen und Keulenzellen, den TEER-Werten und der Zellschichtdicke beobachtet. Aufgrund dieser Beobachtungen wurde trotz fehlender statistischer Untermauerung, aufgrund der geringen Anzahl der verwendeten Spender, der den Kunden unbekannten Zusammensetzung des Mediums und der höheren Kosten des PneumaCult-Mediums, in unserem Labor die Entscheidung getroffen, cBD-Medium zu verwenden.
Wie bereits erwähnt, können Zellen zunächst mit Hilfe von Organoidkulturen expandiert und anschließend in das 2D-ALI-Insert-System überführt werden. Dies ist wichtig, da Atemwegsepithelorganoide nicht für die Exposition gegenüber luftgetragenen Substanzen geeignet sind, während die Verwendung des ALI 2D-Systems die Bewertung der Auswirkungen von luftgetragenen Substanzen wie Zigarettenrauch23,36 auf kultivierte Atemwegsepithelzellen ermöglicht. Ein anderer Ansatz zur Etablierung von ALI-Atemwegsepithelzellkulturen besteht darin, Atemwegsepithelzellen durch die Differenzierung menschlicher pluripotenter Stammzellen (hiPS-Zellen) zu erzeugen37. In solchen Protokollen können in der letzten Phase des Differenzierungsprotokolls nach der Differenzierung zu proximalen Atemwegsvorläuferzellen Zellen durch Kultur zum ALI differenziert werden, wobei ähnliche Verfahren wie die hier beschriebenen verwendet werden.
Im aktuellen Protokoll wird cBD-Medium für die Kultur am ALI verwendet. cBD-Medium ist ein serumfreies Medium, das durch Zugabe einer Mischung aus verschiedenen Nahrungsergänzungsmitteln hergestellt wird, inspiriert von Fulcher et al.38 sowie anderen Studien. Die Ergänzungslösung enthält 52 μg/ml Rinderhypophysenextrakt (BPE), 0,5 μg/ml Hydrocortison, 0,5 ng/ml humanes EGF, 0,5 μg/ml Epinephrin, 10 μg/ml Transferrin, 5 μg/ml Insulin, 6,5 ng/ml Trijodthyronin und 0,1 ng/ml RA39. Da es sich bei BPE um einen Gewebeextrakt handelt, der chargenweise Schwankungen unterliegt, kann das Medium nicht als vollständig definiertes Medium betrachtet werden und ist auch nicht tierversuchsfrei. Ein vollständig definiertes Zellkulturmedium wird bevorzugt, um Unterschiede von Charge zu Charge zu minimieren. Im Hinblick auf den Übergang zur tierversuchsfreien Forschung ist es wichtig, dass Anstrengungen unternommen werden, um definierte Medien zu produzieren, die keine tierischen Produkte enthalten und für die Wissenschaft erschwinglich sind.
Je nach Fragestellung können verschiedene Versuchsaufbauten auf Basis des ALI-Modells eingesetzt werden. Um beispielsweise die Auswirkungen von Verbindungen zu untersuchen, die den Differenzierungsprozess beeinflussen können, kann dies durch Zugabe der Verbindungen zur Kultur während der verschiedenen Stadien der submersen Kultur, während der Differenzierung oder in der gut differenzierten Phase behoben werden. Die zelluläre Zusammensetzung der ALI-PBEC-Kultur kann durch die Zugabe spezifischer Verbindungen beeinflusst werden; So führt beispielsweise die Differenzierung von ALI-PBECs in Gegenwart von IL-13 zu einer Kultur mit mehr Becherzellen und weniger Flimmerzellen, während die Behandlung mit dem γ-Sekretase-Inhibitor DAPT (der zur Blockierung des Notch-Signalwegs verwendet wird) während der Differenzierung zu einer Kultur mit mehr Flimmerzellen auf Kosten der Becherzellen führt 23,40,41,42.
Darüber hinaus können Wirkstoffe, die Zellen stimulieren oder bestimmte Prozesse blockieren, entweder auf das basale Kompartiment oder (in sehr kleinem Volumen) auf das apikale Kompartiment der Kultur appliziert werden. Zellen können auch von der apikalen Seite luftgetragenen Substanzen ausgesetzt werden. Solche Expositionsdesigns wurden verwendet, um die Wirkung von Dieselabgasen oder ganzem Zigarettenrauch auf PBECszu untersuchen 23,43,44. Das Medium kann jedes Mal geerntet werden, wenn das Medium gewechselt wird, um die sezernierten Proteine auf der Basalseite zu überwachen. Gleiches gilt für die apikale Seite der Zellen, die mit PBS gewaschen wird, während das Basalmedium aufgefrischt wird. Der sogenannte apikale Wash wird geerntet und optional Dithioerythrit (DTE) hinzugefügt, um den Schleim, der von den Becherzellen produziert wird, effizienter zu dissoziieren. Zelllysate können für die Isolierung von Gesamtprotein, RNA sowie chromosomaler und mitochondrialer DNA gewonnen werden. Die Zellen können unter Verwendung von Antikörpern für spezifische Marker weiter untersucht werden, indem die Polyethylenterephthalat (PET)-Membran aus dem Kunststoffeinsatz geschnitten und diese Membran für mehrere Immunfluoreszenzfärbungen weiter in kleinere Stücke geschnitten wird45. Darüber hinaus kann die Durchflusszytometrie oder FACS auch nach Trypsinisierung der Zellen in den Inserts eingesetzt werden. Während der ALI-Phase kann die Entwicklung der zellulären Barriere durch Messung des elektrischen Widerstands und anschließende Berechnung des TEER überwacht werden, wobei der elektrische Widerstand umgekehrt proportional zur Oberfläche des Membraneinsatzes ist. Die Berechnung basiert auf dem Ohmschen Gesetz unter Verwendung der folgenden Formel:
, wobei Rm der gemessene elektrische Widerstand, Rb der elektrische Grundwiderstand eines Einsatzes ohne Beschichtung und Zellen und SA die Oberfläche der Membran des Einsatzes ist. Die Messung des elektrischen Widerstands mit EVOM2- und STX/Essstäbchen-Elektroden ist unkompliziert, hängt aber stark von den Handhabungsverfahren beim Einführen in das Bohrloch ab. Auch wurde vorgeschlagen, dass die Form der Elektrode die Messung der Barrierefunktion der relativ großen Oberfläche17 beeinflusst.
Eine weitere Verbesserung des ALI-Zellkultursystems, die darauf abzielt, die genaue Geweberepräsentation zu erhöhen, umfasst die Kokultur zusätzlicher Zelltypen wie Leukozyten, Fibroblasten oder Endothelzellen46,47,48. Es wurde beobachtet, dass die Kokultur von ALI-PBEC mit dem Granulozyten-Makrophagen-Kolonie-stimulierenden Faktor (GM-CSF) oder M-CSF-differenzierten Makrophagen die angeborenen Epithelreaktionen und -reparaturen deutlich beeinflusst48. Es ist wichtig zu beachten, dass in solchen Kokulturmodellen die Medienkompatibilität ein Problem darstellen kann. Da das für die Atemwegsepithelzellkultur verwendete Medium speziell für PBECs entwickelt wurde und für andere Zelltypen möglicherweise nicht optimal geeignet ist, ist eine Optimierung erforderlich. Eine weitere Art von Fortschritt auf dem Gebiet der Atemwegsbiologie, für die isolierte PBECs verwendet werden können, ist die Verwendung der Organs-on-Chips (OoC)-Technologie49,50. Mit dieser Technologie kann der Einfluss der mechanischen Kräfte der Atmung und des Blutflusses, wie z. B. Dehnung, Luft und mittlerer Durchfluss, untersucht werden 29.
Die Variabilität zwischen den Spendern kann bei der Verwendung von PBECs von verschiedenen Spendern signifikant sein, und daher ist es wichtig, die Verwendung von Zellen von mehreren Spendern in Betracht zu ziehen, um diese Variabilität in Epithelzellkulturstudien zu berücksichtigen. Da die Kultivierung von ALI-PBECs zeitaufwändig und mit erheblichen Kosten verbunden ist, wird die Möglichkeit geprüft, ALI-PBEC-Kulturen durch Mischen von Zellen verschiedener Spender in einem Zellkultureinsatz zu etablieren. Auf diese Weise können Pilotexperimente mit Primärzellen durchgeführt werden, bevor die Reaktionen von Kulturen analysiert werden, die von verschiedenen Einzelspendern stammen. Darüber hinaus können Spender mit unterschiedlichen Merkmalen (z.B. unterschiedliche Alterskategorie oder Geschlecht) für explorative Studien gruppiert werden. Bei der Verwendung von Spendermischungen ist es wichtig, darauf zu achten, dass die gleiche Zellzahl verschiedener Spender vorhanden ist, um zu verhindern, dass ein Spender aufgrund einer höheren Proliferationsrate die Ergebnisse dominiert. Daher werden Zellen von einzelnen Spendern separat expandiert und mit einer höheren Dichte im Einsatz ausgesät als bei der Aussaat von Zellen eines einzelnen Spenders, um die Proliferation im Insert vor dem Übergang zum ALI zu minimieren. Das Ansprechen von Spendermischungen und entsprechenden Einzelspendern wurde durch Untersuchung der Infektionskinetik von SARS-CoV-2 verglichen. Mit Hilfe von RT-qPCR und Immunfluoreszenzfärbung wurde beobachtet, dass die Spendermischung eine gute Repräsentation der verschiedenen einzelnen Spender lieferte, indem sie eine ähnliche Anzahl von produzierten Viruspartikeln und eine ähnliche Anzahl infizierter Zellen aufwies28.
Um eine akzeptable Alternative für Tiermodelle zu werden, sollte die Genom-Editierung von kultivierten Bronchialepithelzellen durchführbar sein51. Die RNA-Interferenztechnologie unter Verwendung kleiner interferierender RNAs (siRNAs) in ALI-PBECs wird untersucht, da die Zellen jedoch während der submersen Phase der Kultur mit siRNA transfiziert werden müssen, wird der Knockdown während der ALI-Kultur aufgrund der langen Kulturdauer nicht ausreichend aufrechterhalten, es sei denn, die siRNA-Transfektion wird während der Kultur häufig wiederholt52. Nichtsdestotrotz können siRNAs erfolgreich zur Modifikation der Genexpression in submersen Basalzellen eingesetzt werden. Andere haben die CRISPR/Cas9-Technologie erfolgreich eingesetzt, um Genom-Editierung in primären ALI-Epithelzellkulturen der Atemwege mit Ribonukleoprotein (RNP)-Abgabe zu erreichen 53. Bei der Anwendung solcher Techniken ist es wichtig, dass die Zellen ihre volle Differenzierungsfähigkeit behalten. Da primäre Atemwegszellkulturen nicht unbegrenzt passieren können, ist die klonale Expansion der geneditierten Zellen nicht einfach und die Zugabe von Medium zur Auswahl der transfizierten Zellen ist umständlich. Daher ist es schwierig, den gewünschten Knockdown in allen kultivierten Zellen zu erreichen. Eine Alternative zur Erzeugung von Knockout-Klonen ist die Verwendung von Knock-out-Strategien in hiPS-Zellen54 und die Verwendung dieser Zellen zur Erzeugung von Atemwegsepithelzellen. Eine weitere, wenn auch suboptimale Alternative ist die Etablierung einer immortalisierten PBEC-Linie, um geneditierte Zellen klonal zu vermehren55.
Das hier vorgestellte Protokoll ist eine Möglichkeit, ein gut differenziertes pseudostratifiziertes ALI-PBEC zu erzeugen, aber es wurden auch andere Protokolle gefunden, die eine solche Kultur etablieren, mit kleineren und größeren Unterschieden im Vergleich zum vorgestellten Protokoll. Unserer Meinung nach sind die laborübergreifende Validierung von Kulturmethoden und eine strenge Qualitätskontrolle unerlässlich, damit das ALI-PBEC-System und ähnliche Kultursysteme von Atemwegsepithelzellen eine valide Alternative für Tierversuche darstellen können.