Journal
/
Biologie
/
Gerichte RNA Sequencing Assay Gene Expression en Genomic Wijzigingen karakteriseren
JoVE Journal
Biologie
Zum Anzeigen dieser Inhalte ist ein JoVE-Abonnement erforderlich.  Melden Sie sich an oder starten Sie Ihre kostenlose Testversion.
JoVE Journal Biologie
Targeted RNA Sequencing Assay to Characterize Gene Expression and Genomic Alterations
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Gerichte RNA Sequencing Assay Gene Expression en Genomic Wijzigingen karakteriseren

DOI:
10.3791/54090-v

•

11:52 min

•

August 04, 2016

•

, , ,
1Department of Internal Medicine, Division of Medical Oncology, Comprehensive Cancer Center,The Ohio State University, 2Department of Pharmacology,The Ohio State University

Kapitel

  • 00:05Titel
  • 01:08Hybridization
  • 03:02Target Capture
  • 06:56Post Capture PCR Amplification
  • 09:45Results: The Capture Method Has Multiple Advantages over Non-targeted RNAseq
  • 11:13Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Automatische Übersetzung

We describe a targeted RNA sequencing-based method that includes preparation of indexed cDNA libraries, hybridization and capture with custom probes and data analysis to interrogate selected transcripts for gene expression, mutations, and gene fusions. Targeted RNAseq permits cost-effective, rapid evaluation of selected transcripts on a desktop sequencer.

Tags

Targeted RNA SequencingGene ExpressionGenomic AlterationsRibosomal RNA DepletionChemical FragmentationCDNA SynthesisBarcoded LibrariesHybridizationTarget CaptureMultiplexed SequencingGene FusionsSingle Nucleotide VariationsAlternative SplicingCustom ProbesCot-1 DNABlocking OligosHybridization BufferStreptavidin Beads

Article

Embed

ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Verwandte Videos

De vervaardiging van primaire hematopoietische cellen culturen uit Murine Bone Marrow voor Elektroporatie

RNA isolatie van embryonale zebravis en cDNA synthese voor de analyse van genexpressie

Met behulp van de Gene Puiser MXcell Elektroporatie systeem om primaire cellen transfecteren met een hoog rendement

Met behulp van een geautomatiseerde cel Counter aan Gene Expression Studies Vereenvoudigen: siRNA Knockdown van IL-4 Afhankelijk van genexpressie in cellen Namalwa

Paraffine ingebedde en vriescoupes van Drosophila Adult Spieren

In vitro reconstitutie van de Active T. castaneum Telomerase

Concurrerende Genomische Schermen van streepjescode Gist Bibliotheken

Analyse van Global RNA synthese in de Single Cell Level volgende Hypoxie

Next-generation sequencing van het 16S ribosomaal RNA Gene Amplicons

-Faag gemedieerde Levering van gerichte sRNA Constructen voor het neerslaan van Gene Expression<em> E. coli</em

Read Article