Name: Optimización de la reacción de Ugi mediante la síntesis en paralelo y manejo de líquidos automatizados (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2008-11-11T00:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 24 s
Description: Aprende a optimizar la reacción de Ugi mediante síntesis en paralelo y manejo de líquidos automatizado con MiniMapper y MiniBlock. Este método mejora el rendimiento y permite caracterizar productos por RMN e IR.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Asistencia de Andrew Lang en la representación gráfica de los datos se aprecia. Gracias a Mettler-Toledo para la provisión de equipos y materiales para llevar a cabo el trabajo experimental.

Introducción La reacción de Ugi ha demostrado ser una manera conveniente de crear rápidamente diversas bibliotecas de compuestos (1-3). Se trata de la reacción de una amina, aldehído, un ácido carboxílico y un isonitrilo normalmente en metanol a temperatura ambiente. La reacción de Ugi ha utilizado a menudo como una herramienta en la síntesis de moléculas farmacológicamente activas, y lo hemos aprovechado para acceder rápidamente a los compuestos en la búsqueda de nuevos agentes anti-malaria (4). Se ha observado que los productos Ugi a veces se precipitan en forma pura de la mezcla de reacción (1,5). Este es un resultado muy afortunado ya que la reacción puede ser fácilmente ampliado sin necesidad de costosos procesos de purificación, como la cromatografía. Sería más beneficioso para optimizar el rendimiento del producto Ugi como se obtiene directamente de filtrar la mezcla de reacción sin tratamiento adicional. Con este fin se utilizó un 48 ranura Mettler-Toledo MiniBlock (6) equipados con tubos de filtración. A Mettler-Toledo MiniMapper (7) manejador de líquidos automatizados se utilizan para entregar los reactivos y disolventes. Los parámetros de interés fueron la concentración, la composición del disolvente y el exceso de algunos de los reactivos. Experimental El manejador de MiniMapper líquido automatizado fue programado para entregar líquidos en el siguiente orden de vaciar los tubos de filtro en una MiniBlock de 48 posiciones: disolvente adicional, furfurylamine (2M en metanol), benzaldehído (2 M en metanol), boc-glicina (2 M en metanol) y t-butylisocyanide (2M en metanol). Además el volumen por defecto es 100 microlitros. Si un reactivo se observa como se añade en exceso, 120 microlitros fueron entregados. El MiniBlock fue colocado en un agitador durante 16 horas antes de ser filtrado con vacío de la casa. Dos lavados se llevan a cabo mediante la adición de metanol (1 mL) a cada tubo, seguido de 15 min agitando antes de filtrado. Los tubos se secó en alto vacío en un desecador durante al menos 30 min. El rendimiento se calcula a partir del aumento en el peso de los tubos del filtro. La pureza se evaluó mediante RMN de una muestra de cada sistema de disolvente y la concentración. Las reacciones se realizaron por triplicado (8-10) y los rendimientos promedio se reportan en la Tabla 1. La caracterización del producto Ugi <a href="http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.21106059.html">terc-butilo (2 - {[2 - (terc-butilamino)-2-oxo-1-fenil] (furan-2-ilmetil) amino}-2-oxoetil) carbamato</a> : sólido blanco, punto de fusión (11) desde 202 hasta 204 C; 1H RMN (12, <a href="http://showme.physics.drexel.edu/mirza/Software/JCAMP/Exp203A11-HNMR.html">espectro</a> ) (500 MHz, δppm, CDCl3) 1,33 (s, 9H), 1,45 (s, 9H), 4,21 (m, 2H), 4,49 (d, J = 18Hz, 1H), 4,50 ( d, J = 18Hz, 1H), 5,47 (s, 1H), 5,60 (s, 1H), 5,62 (s, 1H), 5,89 (s, 1H), 6,10 (s, 1H), 7,19 (s, 1H) , fenilo 7,21 a 7,37 (m, 5H); 13C RMN (13, <a href="http://showme.physics.drexel.edu/mirza/Software/JCAMP/Exp02060822080933CNMR.html">espectro</a> ) (500 MHz, δppm, CDCl3) 28.3, 28.6, 42.3, 42.8, 51.7, 62.9, 79.5, 107.7, 110.4, 128.5, 128.7, 129.6, 134.7 , 141.9, 149.8, 155.7, 168.4 170.2; IR (14, <a href="http://showme.physics.drexel.edu/mirza/Software/JCAMP/ugiproductpaper03IR.html">espectro</a> ) (Ʋmax cm-1 ATR): 1645,1673,1699, 3331, FAB-HRMS (15, <a href="http://showme.physics.drexel.edu/mirza/Exp099Chighres.JPG">espectro</a> ) (calculado para C24H33N3O5 m / z 444,2498 [M + H], obtenido 444,2517). Análisis de Datos Los datos de rendimiento precipitado se analizó mediante el factor individual o de dos factores (con repeticiones), análisis de varianza (ANOVA) las herramientas disponibles en Microsoft Excel. (16) Para aquellas variables que son estadísticamente significativas en el análisis de ANOVA, la mínima diferencia significativa de Fisher (LSD) se utilizó la prueba para determinar los parámetros experimentales específicas presentan diferencias significativas en el rendimiento del precipitado Ugi (17). Todas las pruebas de significación se realizaron en el nivel de confianza del 95%. Resultados y Discusión La Figura 1 resume el efecto de la composición de los disolventes en el rendimiento del precipitado Ugi. Un ANOVA de un solo factor indica una diferencia significativa en el rendimiento promedio para los cuatro solventes estudió en una concentración de reactivo de 0,2. Prueba de Fisher LSD indica que los rendimientos precipitado obtenido en metanol y etanol no son estadísticamente diferentes al nivel de confianza del 95% (representado por la barra sobre los nombres de los disolventes en la figura), el rendimiento de precipitado Ugi es significativamente mayor en etanol y metanol que en acetonitrilo, que a su vez es significativamente mayor que en THF. <img src="/files/ftp_upload/old/942_2008_9_26_0/942_Figure-01.png" alt="Figura 1"> Figura 1: Resumen del efecto de la composición de los disolventes en el rendimiento de Ugi precipitado a un Reagent concentración de 0,2 M. Los disolventes indicados incluyen 40% de metanol a esta concentración. Teniendo en cuenta el efecto de la concentración de los reactivos, los datos del Cuadro 1 muestran una precipitada caída en el rendimiento fue encontrado al pasar de 0,2 a 0.07M con metanol, etanol y acetonitrilo como disolvente, los rendimientos fueron similares en metanol en el 0,2 y el 0,4 M concentraciones. Tenga en cuenta que las reacciones son generalmente Ugi ejecutar en el rango de 0.5-2M (2). Sin embargo, cuando se utiliza un controlador automático de líquido, puede ser difícil para empezar con las soluciones de reactivo mucho más concentrada que 2M, lo que coloca un límite superior práctico en la concentración final en alrededor de 0,5. Los resultados de este estudio de optimización sugieren cautela en la interpretación del éxito o el fracaso de las reacciones por debajo de 0,2 M Ugi, ya que los efectos no lineales son al parecer en el juego. La figura 2 resume el efecto de la composición del disolvente y el exceso de reactivos en el rendimiento de precipitado Ugi a una concentración de 0,2 M de reactivo. Los resultados de dos factores ANOVA indican un solvente y el efecto estadísticamente significativo exceso de reactivo. Además, existe una interacción estadísticamente significativa entre ambas variables. Los detalles de la interacción que se descubran en la figura 2, que muestra que el rendimiento de precipitado se ve afectada por el disolvente utilizado. Una vez más en cuenta que las barras sobre los factores de la figura indican los rendimientos no son estadísticamente diferentes al nivel de confianza del 95%. Para el etanol y el metanol los mejores rendimientos se obtienen con la imina o isonitrilo en exceso, mientras que para el acetonitrilo, mejoró los resultados significativamente se obtienen con la amina, aldehído o isonitrilo en exceso. Como se señaló anteriormente en la discusión de los resultados en la Tabla 1, el rendimiento global de precipitado es baja para el THF como disolvente, y sólo un exceso de imina conduce a una mejoría estadísticamente significativa en el rendimiento de precipitado. Estos diferentes patrones de mejor rendimiento para los cuatro solventes es lo que lleva a efecto de interacción estadísticamente significativa, y puede ser un indicador de la interacción de los diferentes productos Ugi con los solventes diferentes. A pesar de los resultados numéricos en la Tabla 1 muestra los mejores rendimientos se obtuvieron en metanol 0,4 M con 1,2 equivalentes de imina exceso de acetonitrilo 0,2 M / metanol y 0,2 M de etanol / metanol mezclas también proporcionan rendimientos significativos. Tenga en cuenta especialmente que todas las mezclas de THF / metanol a 0,2 M dio resultados muy pobres. La reacción de Ugi se ha realizado con éxito en una variedad de disolventes, incluso el THF (2). Tenga en cuenta que los bajos rendimientos de aquí no implica que la reacción de Ugi no tuvo lugar en las mezclas de THF, sólo que el precipitado no se formó. <img src="/files/ftp_upload/old/942_2008_10_13_5/942_Figure-02.png" alt="Figura 2" width="335" height="325"> Figura 2: Resumen del efecto de la composición del disolvente y el exceso de reactivos en el rendimiento de Ugi precipitado a una concentración de 0,2 M de reactivo. Los disolventes indicados incluyen 40% de metanol a esta concentración. Figura 3 se resume el efecto de la concentración de los reactivos y el exceso de reactivo en el rendimiento de Ugi precipitar utilizando metanol como disolvente. Los resultados de dos factores ANOVA indican una concentración estadísticamente significativa y el efecto exceso de reactivo. Como se describió anteriormente, el rendimiento de precipitado en las concentraciones de reactivos de 0,2 M y 0,4 M de son significativamente mayores que en 0.07M (pero no se diferencian unos de otros). Además, existe una interacción estadísticamente significativa entre las dos variables en estudio. Tenga en cuenta que el patrón de la mejora en el rendimiento de precipitado con la identidad del reactivo en exceso suele ser el mismo en las concentraciones de reactivos más alto. <img src="/files/ftp_upload/old/942_2008_9_26_2/942_Figure-03.png" alt="Figura 3" width="384" height="255"> Figura 3: Resumen del efecto de la concentración y el exceso de reactivos en el rendimiento de Ugi precipitado en metanol solvente. En general, los resultados descritos en las figuras 2 y 3 demuestran que hubo interacción entre la concentración de reactivo opción solvente, y la identidad del reactivo en exceso, pero en general eran más sutiles que los efectos directo solvente y la concentración. Otros han encontrado similares resultados al optimizar una reacción Ugi (18). Conclusión El experimento de optimización encuentra el mayor rendimiento de las 48 carreras que el 66% de metanol 0,4 M con 1,2 eq. de imina. Esto es muy por encima del rendimiento del 49% obtenido de la reacción inicial en la concentración equimolar de 0,4 M en metanol. Una buena reproducibilidad de los rendimientos precipitado se obtiene en estos experimentos replican, lo que permite efectos de la interacción sutil para ser identificado positivamente.

<ol><li>Marcaccini, S., Torroba, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+use+of+the+Ugi+four-component+condensation%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Protocols%22%5BJournal%5D)">The use of the Ugi four-component condensation.</a> Nature Protocols. 2, 632-63 (2007).</li>
<li>Domling, A., Ugi, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multicomponent+reactions+with+isocyanides+Angew%5BTitle%5D)+AND+%22Chem.+Int.+Eng.+Ed%22%5BJournal%5D)">Multicomponent reactions with isocyanides Angew.</a> Chem. Int. Eng. Ed. 39, 3168-31 (2000).</li>
<li>Domling, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recent+Developments+in+Isocyanide+Based+Multi-Component+Reactions+in%5BTitle%5D)+AND+%22Applied+Chemistry%2C+Chem.+Rev.%22%5BJournal%5D)">Recent Developments in Isocyanide Based Multi-Component Reactions in.</a> Applied Chemistry, Chem. Rev.. 106, (2006).</li>
<li>Bradley, J. -C. http://usefulchem.blogspot.com/2008/01/we-have-anti-malarial-activity.html. , Forthcoming.</li>
<li>Sanudo, M., Marcaccini, M., Basurto, S., Torroba, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Synthesis+of+3-Hydroxy-6-oxo%5B1%2C2%2C4%5Dtriazin-1-yl+Alaninamides%2C+a+New+Class+of+Cyclic+Dipeptidyl%5BTitle%5D)+AND+%22Ureas+J.+Org.+Chem.%22%5BJournal%5D)">Synthesis of 3-Hydroxy-6-oxo[1,2,4]triazin-1-yl Alaninamides, a New Class of Cyclic Dipeptidyl.</a> Ureas J. Org. Chem.. 71, 4578-45 (2006).</li>
<li>Bradley, J. -C., Mirza, K. B. UsefulChem EXP201 http://usefulchem.wikispaces.com/EXP201. , Forthcoming.</li>
<li>Bradley, J. -C., Mirza, K. B. EXP202 http://usefulchem.wikispaces.com/EXP202. , Forthcoming.</li>
<li>Bradley, J. -C., Mirza, K. B. EXP203 http://usefulchem.wikispaces.com/EXP203. , Forthcoming.</li>
<li>p, m from compound UC-099C from EXP099 http://usefulchem.wikispaces.com/EXP099. , Forthcoming.</li>
<li>Bradley, J. -C., NMR, H. spectrum 203A11 from UsefulChem EXP203 http://usefulchem.wikispaces.com/EXP203. , Forthcoming.</li>
<li>C NMR spectrum 206A from UsefulChem EXP206 http://usefulchem.wikispaces.com/EXP206. , Forthcoming.</li>
<li>IR spectrum from compound UC-099C from EXP099 http://usefulchem.wikispaces.com/EXP099. , Forthcoming.</li>
<li>FAB-MS from compound UC-099C from EXP099 http://usefulchem.wikispaces.com/EXP099. , Forthcoming.</li>
<li>Analysis details available at http://usefulchem.wikispaces.com/space/showimage/EXP201-203_KO-A.xls. , Forthcoming.</li>
<li>Montgomery, D. C. Design and Analysis of Experiments. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMontgomery%2C+DC+%22Nature+Protocols%22">Nature Protocols</a>. , 6th ed., Holt, Rinehart, and Winston. Hoboken, NJ. (2005).</li>
<li>Tye, H., Whittaker, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+a+Design+of+Experiments+approach+for+the+optimisation+of+a+microwave+assisted+Ugi+reaction%5BTitle%5D)+AND+%22Org.+Biomol.+Chem.%22%5BJournal%5D)">Use of a Design of Experiments approach for the optimisation of a microwave assisted Ugi reaction.</a> Org. Biomol. Chem.. 2, 813-813 (2004).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Furfurilamina</td><td>Reactivo</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>F20009</td><td></td></tr><tr><td>Benzaldehído</td><td>Reactivo</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>12010</td><td></td></tr><tr><td>Boc-glicina</td><td>Reactivo</td><td>TCI America</td><td>B1185</td><td></td></tr><tr><td>t-butilisocianuro</td><td>Reactivo</td><td>TCI America</td><td>B1274</td><td></td></tr></tbody></table>

optimización de la reacción de ugi mediante la síntesis en paralelo y manejo de líquidos automatizados

Optimization of the Ugi Reaction Using Parallel Synthesis and Automated Liquid Handling

La optimización de una reacción de Ugi participación de la mezcla de furfurylamine, benzaldehído, boc glicina-y t-butylisocyanide se describe. Por triplicado, corre de 48 experimentos paralelos se presentan, variando la concentración, disolvente y el exceso de algunos de los reactivos. El aislamiento del producto fue alcanzado por una simple filtración y el procedimiento de lavado. El mayor rendimiento obtenido fue del 66% de metanol 0,4 M con 1,2 eq. de imina. Esto es muy por encima del rendimiento del 49% obtenido de la reacción inicial en la concentración equimolar de 0,4 M en metanol. Soluciones de metanol con una concentración de reactivo de 0,4 o 0,2 M dio mejores rendimientos, mientras que todos los sistemas de disolvente a 0.07M un mal desempeño. En mezclas de 0,2 M, metanol y etanol / metanol (60/40) fueron estadísticamente igual de buenos, mientras que THF / metanol (60/40) era pobre y acetonitrilo / metanol (60/40) fue intermedio. Una buena reproducibilidad de los rendimientos precipitado se obtiene en estos experimentos replican, lo que permite efectos de la interacción sutil para ser identificado positivamente.

La reacción de Ugi ha demostrado ser una manera conveniente de crear rápidamente diversas bibliotecas de compuestos. Se trata de la reacción de una amina, aldehído, un ácido carboxílico y un isonitrilo normalmente en metanol a temperatura ambiente. En este video, nosotros utilizamos un 48 ranura Mettler-Toledo MiniBlock equipados con tubos de filtración y un manejador de Mettler-Toledo MiniMapper líquido automatizado fue utilizado para entregar los reactivos y disolventes. Los parámetros de interés fueron la concentración, la composición del disolvente y el exceso de algunos de los reactivos.

Optimización de la reacción de Ugi mediante la síntesis en paralelo y manejo de líquidos automatizados

Se describe la optimización de una reacción de Ugi que implica la mezcla de furfurilamina, benzaldehído, Boc-glicina e isocianuro de t-butilo. Ejecuciones por triplicado...

La reacción UI implica la mezcla de cuatro componentes: un aldehído y una amina, un ácido carboxílico y un isonitrilo ISO. Es una reacción conveniente para generar bibliotecas diversas y se ha utilizado en el pasado para sintetizar compuestos antimaláricos. La reacción UGI particular que se demostrará aquí implica la reacción del aldehído Ole Amin, la glicina B y el isonitrilo de T butilo.Esta reacción produce un producto UI como precipitado cuando se lleva a cabo a una concentración de 0,5 M en metanol. Hola, soy Jean Floyd Bradley. Mi laboratorio está ubicado en el departamento de química de la Universidad Drexel.Hola, soy el estudiante de posgrado del Dr. Bradley, haha Meza. Hoy presentamos la optimización de una reacción yugi utilizando las tecnologías mini mapper y mini block de Mettler Toledo. Primero, debemos programar el mini mapper para realizar el manejo de líquidos.En segundo lugar, realizaremos el aislamiento del producto mediante filtración paralela. Y finalmente, llevaremos a cabo la caracterización utilizando técnicas de IR y NMR. Comencemos, pues.El bloque mini es una herramienta fabricada por Metler Toledo que permite realizar reacciones en paralelo. Este bloque mini consta de una matriz de seis por ocho tubos con un filtro en la base. Estos tubos pueden contener aproximadamente 3,5 mililitros de disolvente.Una válvula en la parte inferior del bloque mini se mantendrá cerrada durante la adición de los reactivos y luego se abrirá más adelante. Cuando esté listo para la etapa de filtración, variará tres parámetros para esta reacción y observará el efecto sobre el rendimiento del producto aislado. Primero, el exceso de uno o dos reactivos se variará a lo largo de cada fila.Luego, el disolvente y la concentración variarán entre filas. Al planificar experimentos, es útil utilizar una hoja de cálculo en línea compartida, como Google Docs, que luego puede copiarse cómodamente al software mini mapper. Esta configuración permite una especie de colaboración colectiva en el diseño experimental, en la que personas de todo el mundo podrían planificar partes del experimento sin necesidad de saber cómo operar el dispensador de líquidos.El primer paso consiste en pesar los tubos vacíos con una precisión de 0,1 miligramos. Luego, el bloque miniatura se sella, cierra y monta en la plataforma del manipulador de líquidos. En este experimento se utilizan cuatro botellas de reactivo y cuatro botellas de disolvente.El manipulador de líquidos utiliza un brazo robótico equipado con una jeringa y puede transferir cualquier fuente a cualquier destino en el soporte mediante la bomba de jeringa. La configuración actual emplea una jeringa de 10 mililitros que puede dispensar con precisión un mínimo de 100 microlitros. Para conservar los reactivos, añada ya sea 100 o 120 microlitros de cada solución de reactivo preparada.En metanol a una concentración de dos M, la reacción se lleva a cabo en cinco pasos. Primero, se añade el disolvente a cada tubo. Así es como se variará la concentración y la composición del disolvente.Luego se añade la solución inmune a todos los tubos, seguida por el aldehído, el ácido y, por último, el nitrilo ISO. Esto tarda aproximadamente una hora en completarse. A continuación, se retira el bloque pequeño del manipulador de líquidos.Puede observarse claramente que hay soluciones transparentes en cada tubo. Esto es importante porque debe asegurarse de que todos los reactivos sean solubles en todos los disolventes. Por lo general, se necesitan unos 30 minutos para que se forme el primer precipitado.El bloque pequeño se monta en un agitador y se deja mezclar durante la noche. Después de aproximadamente 16 horas, se retira el bloque pequeño del agitador y se puede observar que la mayoría de los tubos tienen precipitado. Ahora, el bloque pequeño se monta en una base de recolección y se abre la válvula de todos los tubos de filtro simultáneamente.Se aplica vacío y el precipitado se retiene en el filtro de cada tubo. Luego se cierra la válvula y se añade un mililitro de metanol a cada tubo. Utilizando una pipeta micrométrica, el mini bloque se coloca en el agitador durante 15 minutos.Este paso de lavado se repite una vez más. Después del último lavado, se deja el vacío durante 30 minutos. Luego, los tubos se transfieren a un desecador bajo alto vacío durante una hora.Después de que los tubos están secos, se pesan nuevamente y la cantidad de precipitado se determina restando el peso vacío. Desafortunadamente, existe suficiente variabilidad entre los tubos como para que cada uno deba pesarse vacío. Se analiza una muestra de cada sistema de disolvente mediante RMN para asegurar que todos los productos sean puros; se añaden 700 microlitros de cloroformo desacetilado a un tubo de reacción para disolver el precipitado.A continuación, la solución se transfiere a un tubo de RMN, un equipo NMR Varian Unity de 500 megahercios. Se utiliza un instrumento Innova NMR para obtener un espectro de RMN de protones. Una vez que se ha iniciado sesión en el equipo, se inicia el software de RMN, se expulsa el estándar de referencia del instrumento, se coloca la muestra en el portamuestras y se inserta en el equipo.A continuación, la muestra se bloquea, se ajusta el shim y se establecen los parámetros de giro para un protón. Se cargan las RMN y luego se obtiene un espectro en formato J Camp DX, que puede visualizarse en línea con un navegador estándar. Los espectros pueden alojarse en un servidor local o cargarse en ChemSpider, de modo que los investigadores que busquen esta molécula puedan utilizar los datos inmediatamente.Para analizar más a fondo la muestra, se realiza espectroscopía IR utilizando un instrumento PerkinElmer FTIR Spectrum 1000. Se inicia sesión en el software. Se retira, se limpia y se frota la placa superior del A TR con una toallita de papel impregnada con jabón de etanol.Se coloca un portaobjetos de vidrio limpio sobre el A TR y se atornilla, y se ajusta el medidor de fuerza a aproximadamente 90 unidades. Después de recopilar un espectro de fondo, se obtiene el espectro de la muestra y se procesa para una corrección de A TR. El espectro IR también se obtiene como un archivo J Camp DX para visualización en línea.La gran diferencia entre realizar una reacción en un matraz de fondo redondo y llevarla a cabo en paralelo es que permite al químico orgánico formular nuevas preguntas y cuestionar supuestos de manera sistemática. Incorporar la manipulación automática de líquidos en este proceso libera al químico para dedicar más tiempo a pensar en el proyecto a un nivel general y menos en los detalles de cada ejecución experimental. Esperamos que este video les dé algunas ideas sobre sus propias reacciones. Gracias por ver.

optimization-ugi-reaction-using-parallel-synthesis-automated-liquid

Research

Investigación

JoVE Journal

Biology

Biología

Aquí, se presenta un flujo de trabajo automatizado para modular montaje de "dispositivo" de ADN usando un método de montaje modular de clonación ADN sobre robots de manipulación de líquidos. El protocolo utiliza una herramienta de software intuitivo para la generación de listas de líquido controlador para combinatoria ADN dispositivo biblioteca generación, demostramos con dos plataformas de manejo de líquidos.

Automatizado de montaje robotizada manipulación líquido de dispositivos modulares de la DNA

Este manuscrito describe un enfoque genérico para el diseño a medida de los medios de cultivo microbianos. Esta opción está activada por un flujo de trabajo iterativo combinando Kriging experimental diseño y microbioreactor tecnología suficiente rendimiento de cultivo, que se apoya en la robótica de laboratorio para aumentar la fiabilidad y rapidez en los medios de comunicación para manejo de líquidos preparación.

Protocolo genérico para la optimización de la producción de proteína heteróloga utilizando tecnología Microbioreactor automatizada

Una pantalla de alto rendimiento de pequeñas moléculas sintéticas se llevó a cabo en las especies de plantas modelo Arabidopsis thaliana. Este protocolo, desarrollado para un robot de manejo de líquidos, aumenta la velocidad de pantallas genética química hacia delante, acelerando el descubrimiento de nuevas moléculas pequeñas que afectan a la fisiología vegetal.

Optimizar el uso de un Robot de manipulación de líquidos para llevar a cabo un alto rendimiento adelante química genética pantalla de Arabidopsis thaliana

Emisión de positrones tomografía (PET) de los sitios que participan en múltiples ensayos de investigación clínica temprana necesitan capacidades de fabricación robusto y versátil del radiotrazador. Con la radiosonda [18F] clofarabina como ejemplo, ilustramos cómo automatizar la síntesis de un radiotrazador utilizando un radiosynthesizer flexible, basada en cassette y validar la síntesis para uso clínico.

Automatización de un protocolo de emisión de positrones la tomografía (PET) radiosonda síntesis de producción clínica

Este protocolo demuestra cómo utilizar el software Auto-CHO para la síntesis jerárquica y programable de oligosacáridos. También describe el procedimiento general para los experimentos de determinación de RRV y la glicosilación de una olla de SSEA-4.

Síntesis jerárquica y programable de oligosacáridos de una olla

Aquí, presentamos un procedimiento detallado para ejecutar un Diseño de Experimento en un microbiorreactor automatizado seguido de cosecha celular y cuantificación de proteínas usando una columna de Proteína A.

Optimización de procesos mediante microbiorreactores automatizados de alto rendimiento en el cultivo de células de ovario de hámster chino

Este protocolo sirve como un tutorial completo para la mezcla estandarizada y reproducible de materiales viscosos con una novedosa tecnología de automatización de código abierto. Se proporcionan instrucciones detalladas sobre el funcionamiento de una estación de trabajo de código abierto recientemente desarrollada, el uso de un diseñador de protocolos de código abierto y la validación y verificación para identificar mezclas reproducibles.

Una plataforma tecnológica de código abierto para fabricar modelos de cultivo 3D basados en hidrogel de manera automatizada y estandarizada

El etiquetado isotópico de precursor combinado y el etiquetado isobárico (cPILOT) es una estrategia mejorada de multiplexación de muestras que es capaz de aumentar el número de muestras que se pueden analizar simultáneamente con las etiquetas isobáricas disponibles. La incorporación de una plataforma robótica ha aumentado considerablemente el rendimiento experimental, la reproducibilidad y la precisión cuantitativa.

Multiplexación automática de muestras mediante el etiquetado isotópico de precursor combinado y el etiquetado isobárico (cPILOT)

Este método describe el uso de una nueva metodología de alto rendimiento, basada en reacciones químicas de gotitas, para la optimización rápida y económica de radiofármacos utilizando cantidades de nanomoles de reactivos.

Optimización de reacciones radioquímicas utilizando matrices de gotitas

La síntesis dirigida de nuevos marcos metal-orgánicos (MOF) es difícil, y su descubrimiento depende del conocimiento y la creatividad del químico. Los métodos de alto rendimiento permiten explorar campos de parámetros sintéticos complejos de forma rápida y eficiente, acelerando el proceso de búsqueda de compuestos cristalinos e identificando tendencias sintéticas y estructurales.

Descubrimiento y optimización de la síntesis de compuestos metal-orgánicos basados en fosfonato de Al(III) isorreticular utilizando métodos de alto rendimiento

Este protocolo proporciona un método para la optimización global sistemática de biosensores codificados genéticamente a través de la generación y evaluación de bibliotecas genéticas asistidas por automatización. Esto se combina con metodologías de diseño de experimentos para agilizar la experimentación y permitir la selección de componentes genéticos para ajustar los biosensores a resultados de diseño específicos.

Muestreo eficiente del espacio de diseño de biosensores codificados genéticamente habilitado con un diseño de experimentos y flujo de trabajo de automatización

Aprende a optimizar la reacción de Ugi mediante síntesis en paralelo y manejo de líquidos automatizado con MiniMapper y MiniBlock. Este método mejora el rendimiento y permite caracterizar productos por RMN e IR.

Optimización de la reacción de Ugi mediante la síntesis en paralelo y manejo de líquidos automatizados

Explorar más videos