Utilisation Tomoauto: Un protocole pour la tomographie à haut débit automatisé cryo-électronique

L’objectif global de cette procédure est d’aider les utilisateurs à établir un pipeline de collecte et de traitement à haut débit de la cryotomographie électronique. Cette méthode peut aider à répondre à des questions clés dans le domaine de la cryo-tomorgraphie électronique, telles que : comment traiter les données collectées avec des détecteurs de nouvelle génération et traiter une énorme quantité de données produites par un logiciel de collecte automatisé en série d’inclinaisons ? Le principal avantage de cette technique est que l’utilisateur peut configurer plusieurs progiciels de manière unifiée, afin de trouver un pipeline efficace pour le traitement automatisé des séries d’inclinaisons, ce qui permet de consacrer plus de temps à l’analyse des tomogrammes.

En général, les personnes qui découvrent la cryo-ET auront du mal car de nombreuses étapes fastidieuses sont nécessaires pour traiter des données massives générées par le microscope électronique. Nous avons eu l’idée de ce développement il y a cinq ans, lorsque nous avons dû passer manuellement par des centaines d’étapes pour obtenir une reconstruction 3D d’une bactérie. À l’avance, consultez le protocole de texte sur la préparation des minicellules Shigella flexneri.