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Identification des Sites de facteur de Transcription Olig2 génomique fixation aiguë purifiée cellules PDGFRα + par immunoprécipitation de la chromatine Low-cellule analyse de séquençage
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Journal JoVE Neurosciences
Identifying Transcription Factor Olig2 Genomic Binding Sites in Acutely Purified PDGFRα+ Cells by Low-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Analysis
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Identification des Sites de facteur de Transcription Olig2 génomique fixation aiguë purifiée cellules PDGFRα + par immunoprécipitation de la chromatine Low-cellule analyse de séquençage

DOI:
10.3791/57547-v

•

12:29 min

•

April 16, 2018

•

, , ,
1The Vivian L. Smith Department of Neurosurgery, Center for Stem Cell and Regenerative Medicine,University of Texas Health Science Center

Chapitres

  • 00:04Titre
  • 01:10Purification of PDGFRα Positive Oligodendrocyte Lineage Cells from Mouse
  • 05:03Low-cell ChIP Preparation and ChIP Library Construction for High-throughput Sequencing
  • 09:41Results: Use of ChIP Analysis to Study Genome-wide Binding of the Olig2 in OPCs
  • 11:42Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Nous présentons ici un protocole qui vise à analyser la liaison pangénomique du facteur de transcription oligodendrocyte 2 (Olig2) dans cerveau parfaitement purifiée précurseur oligodendrocytes (OPCs) en effectuant l’immunoprécipitation de la chromatine basse-cellule (ChIP) , préparation de bibliothèque, séquençage haut-débit et des analyses de données bioinformatiques.

Tags

Transcription Factor Olig2PDGFR-α+ CellsChIP-seqLow-cell ChIP-seqOligodendrocyte Precursor CellsImmunopanningGenome-wide Transcriptional RegulationEpigenetic MechanismsCell DifferentiationCell Development

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