Une méthode rapide et Quantitative pour Modification post-traductionnelle et variante compatible cartographie des Peptides aux génomes

10.8K vues

Cité par 3

09:10 min

22 mai 2018

10.3791/57633-v

22 mai 2018

10.8K vues
 ,  ,  ,  , 

Nous présentons ici l’outil proteogenomic PoGo et protocoles de modification poteau-de translation, quantitative, rapide et variante a permis la cartographie des peptides identifiés par le biais de la spectrométrie de masse sur les génomes de référence. Cet outil est utile pour intégrer et visualiser des proteogenomic et des études protéomiques personnelle s’interfaçant avec des données de génomique orthogonale.

Explorer plus de vidéos

Logiciel PoGo

Chapters in this video

0:05

Titre

0:51

Cartographie de peptides à l'aide de PoGoGUI

2:36

Visualisation dans l'Integrative Genomics Viewer

3:57

Cartographie sur un génome de référence de peptides identifiés via une base de données de variants personnalisée

4:44

Cartographie de peptides provenant de fichiers multiples à l'aide de PoGoGUI

5:48

Génération d'un Track Hub à partir de peptides cartographiés et visualisation d'un Track Hub dans le navigateur de génome UCSC

6:50

Résultats : Cartographie de peptides sur des génomes permettant l'identification de modifications post-traductionnelles et de variants

8:21

Conclusion

Related Videos