Vi præsenterer en protokol til måling af forbrug af ilt og ekstracellulære forsuring i Drosophila melanogaster larve og voksen hjerner. En metabolisk analyzer er udnyttet med en tilpasset og optimeret protokol. Mikro-væv begrænsninger var er et afgørende element i denne protokol og designet og skabt specielt til deres brug i denne analyse.