Name: הליך ואסטרטגיות אופטימיזציה מפתח שיטה אוטומטית נימי מתכלה מבוסס על Electrophoretic (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-09-10T14:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 32 s
Description: למד שיטת אימונואסיי אוטומטית מבוססת אלקטרופורזה קפילרית לכימות חלבונים מדגימות ביולוגיות. השיטה מציעה חלופה מהירה ויעילה ל-Western blot עם פחות חלבון נדרש ותוצאות תוך שלוש שעות.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

המחברים רוצה להודות קית Tarpley אותנו לאיכות הסביבה במשרד ראש צוות פיתוח, מחקר, פיתוח-Research Triangle Park (ORD-RTP) גרפיקה ומדיה מדביק, ועריכה של וידאו הדרכה. כן נרצה להודות דבורה פריטצ'ט מ ProteinSimple לשיחות מועיל לגבי אופטימיזציה של הנתונים שלנו,. JM Guynn נתמכה על ידי המכון אוק רידג המדע, החינוך תוכנית מחקר/השתתפות ב לנו מסוכנות ההגנה על הסביבה.

הערה: להבטיח כי כל ריאגנטים ודוגמאות מוכנות על פי היצרן &#39; פרוטוקול s, המפורטות להלן. בבקשה ללבוש ציוד למיגון אישי תקין במהלך הליך זה, אשר כוללת nitrile כפפות, חלוק המעבדה, סגור-נעל בטיחות משקפי מגן. טבלת חומרים ספציפיים, ראגנטים וציוד נדרש מסופק בנפרד. ריכוז החלבון הכולל של דגימות צריך להיקבע מראש באמצעות מתודולוגיות הוקמה התואמים המאגר lysate בשימוש, כגון ברדפורד assay 11.
 1-הכנת ודוגמאות מן הלהקה רגיל כפי שסופקו על ידי היצרן <ol><li>כדי להכין את הפתרון עובד 400 מ של dithiothreitol (DTT), להוסיף מים µL יונים 40 צינור נקי המכיל מניות שסופקו מהיצרן. חשוב להימנע מהחדרה בועות לפתרון על ידי ערבוב הפתרון עם איטית ועדינה pipetting.</li>
	מאגר מדגם <li>µL להוסיף 20 10 X ו- µL 20 של הפתרון DTT מוכן 400 מ ל הצינור ורוד המכיל פלורסנט 5 X מיקס מאסטר (ראה את הטבלה של חומרים). 
	הערה: מיקס מאסטר (מ מ) חתום על ידי היצרן עם כיסוי רדיד, חייב להיות נעוץ טיפ פיפטה. מערבבים בעדינות על-ידי pipetting איטי כדי להימנע שכשוך DTT פיפטה.</li>
	<li>הבא, מוסיפים מים µL יונים 16, 2 µL של מסופקים 10-מאגר דוגמאות, ו- 2 µL של הפתרון DTT מוכן 400 מ ל הצינור הסולם biotinylated לבן המסופקים על ידי היצרן. מערבבים בעדינות ולהעביר לתוך צינור 0.6 מ"ל עבור denaturing.</li>
	<li>הכנת 0.1 x דוגמת המאגר על ידי דילול 10 שסופקו X מטריים פתרון עם מים. להכין מספיק 0.1 x דוגמת המאגר כדי לדלל את כל הדגימות.</li>
	<li>לחשב את כמות 0.1 x מדגם מאגר זה מתווסף מדגם, אשר יהיה תלוי הריכוז הרצוי הסופי של החלבון הכולל. לערבב 1 חלק 5 x מ מ פלורסנט עם 4 חלקים מדולל הדגימה כדי להשיג ריכוז החלבון הסופי הרצוי.
	<ol><li>חישוב כרכים כלהלן: (i) כרך ה' x מ מ פלורסנט = (ריכוז החלבון הסופי הרצוי) / 5; (ii) כמות חלבון מניות = (ריכוז החלבון הסופי הרצוי x הנפח הכולל הדרוש) / חלבון מלאי ריכוז; (iii) נפח 0.1 x מדגם מאגר = הנפח הכולל - 5 x מ מ נפח - חלבון מניות נפח.</li>
	</ol></li></ol> 2. דנטורציה של הסולם ודוגמאות <ol><li>biotinylated הסולם בתוך גוש חום 95 ° C עבור 5 דק וורטקס צינורות מיד לאחר דגירה, ודוגמאות המקום מוכן לבצע סיבוב ~ 5 s שולחן צנטריפוגה, ובמקום על קרח 
	הערה: חלבונים מסוימים עשויים לדרוש תנאים denaturing עדינה (למשל, 70 o C 10 דקות) כדי למנוע צבירת חלבון ולשפר את ההעברה המטריצה נימי. לשקול אפשרות זו אם יש כבד מריחת משקלים מולקולרית גבוהה יותר (ראה וידאו לדוגמה).</li>
</ol> 3. הכנת נוגדנים <ol><li>כפי שנקבע על ידי אופטימיזציה (ראה תוצאות נציג או וידאו), להכין את dilution(s) הרצוי של נוגדן ראשוני (למשל, 1:50, 1: 100) בהנוגדן שסופקו Diluent 2. 
	הערה: נוגדנים משמשות בדרך כלל בריכוזים גבוהים עבור המבוסס על נימי מתכלה מאשר עבור סופג המערבי המסורתי. הנוגדן משני המסופק הוא מוכן לשימוש ללא דילול.</li>
</ol> 4. הכנת הלומינול-S, מי חמצן <ol><li>להכין תערובת של 1:1 של הלומינול-S מי חמצן-</li>
	<li>מערבולת לערבב ולאחסן על קרח 
	הערה: חשוב כי תערובת זו הוא מוכן טרי כל assay ניסיוני. מיקס הכולל 250ul יש צורך להפעיל את צלחת מלאה.</li>
</ol> 5. הכנת צלחת assay <ol><li>כפי שמוצג באיור 1, טען דגימות של ריאגנטים המוכן מעל המשקולת וזמינותו. ראה הוראות מפורטות להלן עבור כל שורה. כדי למזער את אידוי מן הבארות, להבטיח כי המכסה צלחת מוחלף בין תוספות ריאגנט.</li>
	<li>בשורה A, pipet 5 µL של הסולם Biotinylated לתוך A1 היטב. עבור השורה שנותרה, pipet הכין דגימות (5 µL כל) לתוך בארות A2-A25. 
	הערה: זה הכרחי כי A1 מכיל טוב תמיד הסולם, כמו נימי הראשון במחסנית ממוטבת עבור הפעלת בתקן זה.</li>
	<li>בשורה B, pipet 10 µL של נוגדן Diluent 2 לבאר כל (B1-B25).</li>
	<li>בשורה C, pipet 10 µL של נוגדן Diluent 2 לתוך C1 היטב. בשורה הנותרים C בארות, pipet 10 µL של נוגדן ראשוני (בארות C2-C25).</li>
	<li>בשורה D, pipet 10 µL של Streptavidin-HRP לתוך D1 היטב. בשורה הנותרים D בארות, pipet 10 µL של נוגדנים משניים (בארות D2-D25).</li>
	<li>בשורה E, pipet 10 µL של המיקס הלומינול-חמצן טרי כל טוב (E1-E25).</li>
	<li>לבסוף, להוסיף מאגר לשטוף µL 500 לכל תא לכל השורות top 3 של מאגר בארות. 
	הערה: חשוב למזער את היווצרות בועה pipetting בעדינות, לא גירוש האחסון הסופי מהקצה כמו בועות עשויה להפריע נימי לטעון ולהפעיל.</li>
	<li>פעם הבארות כל נטענים, centrifuge את הצלחת-1000 g x עבור 5 דקות בטמפרטורת החדר, כדי להסיר את הבועות ולהבטיח את הנוזל הוא בחלק התחתון של הבארות. פופ בועות גלוי עם טיפ קטן פיפטה או מחט נקי (לדוגמה, סטרילי 25 מד &#34; נציג העליון &#34; מחט).</li>
</ol> <img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55911/55911fig1.jpg" /> איור 1 . תבנית pipetting לצלחת assay. קודי הצבע מייצג נכונה ריאגנטים ודוגמאות (סה כ עד 24) הוסיף לצלחת וזמינותו. להוסיף biotinylated הסולם (כתום), ובכן A1 הכין דגימות מבארות A2 עד A25 (תכלת), 2 Diluent נוגדנים לבארות B1 B25 ו- C1 (אור ירוק), נוגדן ראשוני כדי בארות C2 עד C25 (כחול), streptavidin-HRP כדי D1 טוב (ורוד כהה), נוגדנים משניים כדי בארות D2 עד D25 (ירוק כהה), ולערבב הלומינול-חמצן בארות E1 עד E25 (סגול). מאגר שטיפת מתווסף בשלוש השורות הראשונות של אמצע צלחת גדולה יותר וולס (כחול כהה). <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55911/55911fig1large.jpg" target="_blank"> אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.</a>
 6. הפעלת המכשיר מתכלה נימי <ol><li>ודא כי המכשיר והמחשב הנלווה מופעלים. אין לחמם את הזמן הדרוש.</li>
	<li>פתח את התוכנה מכשור במחשב. ראשית, בחר &#34; Assay &#34; טאב בצד ימין של החלון, &#34; Assay חדש &#34; תחת &#34; תפריט קובץ &#34; בצד השמאל. בחר את גודל, גודל טווח (למשל, 12-230 kDa) ואת מחסנית סוג (למשל, נימי 25) שבו נעשה שימוש עבור וזמינותו מסוים. 
	הערה: אחד במאי גם קלט assay פרמטרים, כולל ריכוז חלבון, סוג נוגדן של דילול, אם רצונך בכך, אך אלה אינם נדרשים להתחיל וזמינותו.</li>
	<li>פתח את הדלת על המכשיר על-ידי לחיצה על הכפתור בראש החלונית ' תפוז '.</li>
	<li>הסר בזהירות את מחסנית נימי מאריזתו. בלי לגעת הנימים זכוכית עצמם, למקם את המחסנית בעל מחסנית. ודא מחסנית ישיבה על ידי התבוננות את התאורה הפנימית לשנות מ orange לכחול.</li>
	<li>להחזיק את הצלחת בחוזקה על הספסל, לקלף בזהירות את החותם אידוי מן החלק התחתון של הלוח. פופ בועות לראות בבארות מטריקס אלה ההפרדה עם משכל אורח/ים ילד/pipet עצה או מחט נקי (לדוגמה, סטרילי 25 מד &#34; נציג העליון &#34; מחט).</li>
	<li>למקם את הצלחת assay על לוחית, להבטיח שהוא מתיישב, וסגור את הדלת מכשיר.</li>
	<li>לחץ &#34; התחלה &#34; כפתור בתוכנה. 
	הערה: אם אין לחצן ' התחל ' מופיע, הקשר עם המכשיר אבד. לבחור מכשיר בתפריט השמאלי העליון, ולאחר מכן חבר. מוקפץ אמור להופיע עם המספר הסידורי כלי; בחר באפשרות זו ולאחר מכן לחץ על התחבר. לחצן התחל עכשיו אמור להופיע.</li>
	<li>בסיום המרוץ, למחוק את הצלחת. הסר את מיכל הדיו ומניחים במיכל החדים עבור סילוק, יחד עם מזרקים זה אולי שומש כדי יבעבע. להשאיר את הכוח כדי למנוע בעיות התחברות אם המכשיר נמצא בשימוש באופן קבוע (למשל, אחת לשבוע לפחות).</li>
</ol> 7. ניסוי ניתוח <ol><li>לפני ניתוח, להבטיח איכות הבדיקות הבאות מבוצעות.
	<ol><li>תקנים פלורסנט אימות על-ידי בחירה &#34; תקנים להראות &#34; סמל. בדוק כי הסטנדרטים מזוהים כראוי &#34; תצוגת גרף &#34; טאב. אם הם אינם נכונים, ללכת &#34; תצוגה יחידה &#34; סמל, לחץ לחיצה ימנית על הפסגה נכונה ובחר &#34; תקן כוח &#34;, או לחץ לחיצה ימנית על הפסגה שגוי ובחר &#34; לא תקן &#34;. בצע בדיקה זו עבור כל נים חדשים.</li>
		<li>אימות הסולם biotinylated על ידי לחיצה על &#34; דגימות &#34; ו &#34; תצוגה יחידה &#34; סמלים. בחר את הסולם בכרטיסיה הניסוי. אם לשיא מזוהה באופן שגוי, לחץ לחיצה ימנית על זה &#34; תצוגת גרף &#34; ובחר &#34; הסר שיא &#34;. 
		הערה: לדוגמה, הסולם biotinylated המשמש עבור ערכת kDa 12-230 צריך להראות 12, 40, 66, 116, 180 ו- 230 kDa שנקודות פסגות. אם שלב זה לא מבוצע, שינוי גודל של הפסגות מדגם באופן שגוי יחושבו, הפקת תוצאות כדין.</li>
		<li>תצוגה וניתוח פסגות לדוגמה. להפיק נתונים מהטבלה ' פסגות ', כולל משקל מולקולרי, באזור השיא, שיא גובה אות רעש (S/N), כנדרש לצורך חישובים ניסיוני.</li>
	</ol>
	</li>
</ol>

<ol><li>Bradley, H. L., Sabnis, H., Pritchett, D., Bunting, K. D. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBradley%2C+HL+%22Hematopoietic+stem+cell+protocols%22">Hematopoietic stem cell protocols</a>. 1185, Springer. (2014).</li>
<li>Guo, L., Eldridge, S., Furniss, M., Mussio, J., Davis, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+Human+Induced+Pluripotent+Stem+Cell-Derived+Cardiomyocytes+%28hiPSC-CMs%29+to+Monitor+Compound+Effects+on+Cardiac+Myocyte+Signaling+Pathways%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Chem+Biol%22%5BJournal%5D)">Use of Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes (hiPSC-CMs) to Monitor Compound Effects on Cardiac Myocyte Signaling Pathways.</a> Curr Protoc Chem Biol. 7 (3), 141-185 (2015).</li>
<li>Chen, J. Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Absolute+quantitation+of+endogenous+proteins+with+precision+and+accuracy+using+a+capillary+Western+system%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Biochem%22%5BJournal%5D)">Absolute quantitation of endogenous proteins with precision and accuracy using a capillary Western system.</a> Anal Biochem. 442 (1), 97-103 (2013).</li>
<li>Chen, J. Q., Wakefield, L. M., Goldstein, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Capillary+nano-immunoassays%3A+advancing+quantitative+proteomics+analysis%2C+biomarker+assessment%2C+and+molecular+diagnostics%5BTitle%5D)+AND+%22J+Transl+Med%22%5BJournal%5D)">Capillary nano-immunoassays: advancing quantitative proteomics analysis, biomarker assessment, and molecular diagnostics.</a> J Transl Med. 13, 182(2015).</li>
<li>Liu, S., et al. <a target="_blank" href="https://www.omicsonline.org/the-application-of-a-novel-nanovolume-capillary-electrophoresis-based-protein-analysis-system-in-personalized-translational-medicine-research-1948-593X.S3-004.pdf">The Application of a Novel Nanovolume Capillary Electrophoresis- Based Protein Analysis System in Personalized & Translational Medicine Research.</a> J Bioanal Biomed. S3 (004), (2013).</li>
<li>ProteinSimple Western. <a target="_blank" href="http://www.proteinsimple.com/documents/042-889_Rev1_Size_Assay_Development_Guide.pdf">Size Assay Development Guide, Revision 1</a>. , (2014).</li>
<li>Eaton, S. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+guide+to+modern+quantitative+fluorescent+western+blotting+with+troubleshooting+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">A guide to modern quantitative fluorescent western blotting with troubleshooting strategies.</a> J Vis Exp. (93), (2014).</li>
<li>Eslami, A., Lujan, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Western++blotting%3A+sample+preparation+to+detection%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Western blotting: sample preparation to detection.</a> J Vis Exp. (44), (2010).</li>
<li>Silva, J. M., McMahon, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+fastest+Western+in+town%3A+a+contemporary+twist+on+the+classic+Western+blot+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">The fastest Western in town: a contemporary twist on the classic Western blot analysis.</a> J Vis Exp. (84), e51149(2014).</li>
<li>Thorn, C. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Doxorubicin+pathways%3A+pharmacodynamics+and+adverse+effects%5BTitle%5D)+AND+%22Pharmacogenet+Genomics%22%5BJournal%5D)">Doxorubicin pathways: pharmacodynamics and adverse effects.</a> Pharmacogenet Genomics. 21 (7), 440-446 (2011).</li>
<li>Ernst, O., Zor, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Linearization+of+the+bradford+protein+assay%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Linearization of the bradford protein assay.</a> J Vis Exp. (38), (2010).</li>
<li>Taira, N., Yoshida, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Post-translational+modifications+of+p53+tumor+suppressor%3A+determinants+of+its+functional+targets%5BTitle%5D)+AND+%22Histol+Histopathol%22%5BJournal%5D)">Post-translational modifications of p53 tumor suppressor: determinants of its functional targets.</a> Histol Histopathol. 27 (4), 437-443 (2012).</li>
<li>Thompson, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phosphorylation+of+p53+on+key+serines+is+dispensable+for+transcriptional+activation+and+apoptosis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Phosphorylation of p53 on key serines is dispensable for transcriptional activation and apoptosis.</a> J Biol Chem. 279 (51), 53015-53022 (2004).</li>
<li>Currier, J. M., Cheng, W. Y., Menendez, D., Conolly, R., Chorley, B. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Developing+a+Gene+Biomarker+at+the+Tipping+Point+of+Adaptive+and+Adverse+Responses+in+Human+Bronchial+Epithelial+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Developing a Gene Biomarker at the Tipping Point of Adaptive and Adverse Responses in Human Bronchial Epithelial Cells.</a> PLoS One. 11 (5), e0155875(2016).</li>
<li>Moser, A. C., Hage, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Capillary+electrophoresis-based+immunoassays%3A+principles+and+quantitative+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Electrophoresis%22%5BJournal%5D)">Capillary electrophoresis-based immunoassays: principles and quantitative applications.</a> Electrophoresis. 29 (16), 3279-3295 (2008).</li>
<li>Shintani, H. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aShintani%2C+H+%22Handbook+of+Capillary+Electrophoresis+Applications%22">Handbook of Capillary Electrophoresis Applications</a>. , 1, Springer. Netherlands. (1997).</li>
<li>Wes reagents and consumables :: ProteinSimple. , 
 <a target="_blank" href="https://www.proteinsimple.com/consumables_sw_wes.html">https://www.proteinsimple.com/consumables_sw_wes.html</a> (2017).</li>
<li>Simple Western Size Assay Buffer Compatibility. , 
 <a target="_blank" href="http://www.proteinsimple.com/documents/SW_Buffer_Compatibility_Table_rev_D.pdf">http://www.proteinsimple.com/documents/SW_Buffer_Compatibility_Table_rev_D.pdf</a> (2017).</li>
</ol>

המחברים מצהירים כי יש להם אינטרסים כלכליים אין מתחרים. כתב יד זה נבדקו על ידי נבחרת בריאותם של מעבדת המחקר השפעות סביבתיות ואושרו לפרסום. התוכן ואינם משקפים בהכרח של המשרד לאיכות הסביבה אותנו ולא עושה איזכור שמות מסחריים או מוצרים מסחריים מהווים המלצה או המלצה לשימוש.

במשך עשורים, היו מתמשכת ההתעניינות בפיתוח שיטות מתכלה electrophoretic המבוסס על נימי עקב נמוך ריאגנט ולדגום ההוצאה, ירד עיבוד זמן בהשוואה לשיטות מסורתיות וגבוה תאימות ל להפוך לאוטומטיות הליך ה-4,15. ישנם מספר פרוטוקולים שונים עבור הפרדת חלבונים אשר נעזרו נימים, כולל פולימר electrophoretic, electrokinetic, ניפוי, ושיטות לגירויי כאב, אשר לבודד חלבונים לפי מאפיינים שונים (בהתאמה, מטען אלקטרוסטטי, שיווי משקל המחיצה, ניפוי מאפיינים של מטריקס הפרדת, ו pH)16. כאן, אנו מתארים של השיטה אלקטרופורזה נימי נוגדן מבוסס (או מתכלה), באמצעות פולימר ניפוי הפרדה, יש כבר אוטומטי ומסחרית המאומץ3. היתרונות של מערכת זו כולל קלות שימוש, מבצע, ריאגנטים סטנדרטית ו זמינים מסחרית, מדידות אמין, רגיש הדורשים פחות ריאגנט ודוגמאות לעומת מבחני חלבון מסורתיים כגון, תספיג חלבון מקושרים-אנזים מתכלה, ועוד פורמטים3,4,5. זה נרשמה בהערכות קודמות של טכנולוגיה זו כי הטווח בגודל של חלבון זה יכול להיות מוערך יש היה מוגבל על-ידי הפרדה זמין מטריקס4ההנפקות אולם האחרונות הרחיבו את טווח מדידה 2 440 kDa17 . בנוסף, כמה מאגרי lysate ידועים להיות תואם ל- assay18, ולכן מבחר ריאגנטים ניסיוני המשמש יש לקחת בחשבון מראש.
היתרון העיקרי של הליך אוטומטי עם רכיבים זמינים מסחרית היא עקביות של תוצאות באמצעות שיטות מתוקננת, ריאגנטים. פעולה זו מקטינה את הסיכוי לכשל assay על ידי מיכון שלבים קריטיים בתוך השגרה. עם זאת, חשוב לציין כי פרקטיקות מסוימות חייב להיות דבקה במהלך פרוטוקול כדי למזער בעיות מיכשור וציוד נימי מבוסס על electrophoretic. קודם, זה קריטי כי התערובת הלומינול-S/מי חמצן מוכן טרי ומיד לפני צלחת טעינה. תזמון עקבי תגרום לומינסנציה עקבי אחרי הסוכן חמצון נוסף, אשר תגרום המידות עקבית עבור וזמינותו נוגדנים מסוימים לאחר assay. יתר על כן, חשוב כי ריאגנטים שפג תוקפו שאינם משמשים, אשר משפיע בעיקר את העוצמה של סוכן חמצון. בנוסף, חשוב כי סדר טעינה של דגימות, נוגדנים, וחומרים אחרים אך ורק לאחר מכן (ראה איור 1). כל ריאגנט pipetted מהמקום יביא כשל assay, ריצה מבוזבז.
מלבד השלבים הקריטיים, בעיות העיקרי חוו עם הטכניקה ניתן בדרך כלל להתגבר באמצעות אופטימיזציה. אכן, תנאים אלה ספציפיים לכל שילוב מערכת/נוגדן מודל, לכן צריך להיות נחוש מדעית עבור כל assay חדש. במאמר זה, אנו מתמקדים שלושה הליכים אופטימיזציה נפוצות: זמן החשיפה טיטור lysate, דילול נוגדן ראשוני. היכולת להפיק תוצאות הניתנות למדידה תלוי ניתוח של מועד החשיפה כאשר המצע הלומינול לא להיות במהירות תיגמר, כתוצאות המצע דלדול לאובדן של האות. טיטור lysate קובע את הטווח הדינמי ליניארי של כל assay, שיכול להיות שונה עם מערכות מודל שונה, כמו גם נוגדנים שונים, אפילו בשביל חלבון לאותו היעד. נוגדן דילולים שבחרת ליד קולח ריכוזי או להבטיח שינויים אות לא יושפעו על ידי מחסור נוגדן חינם, אלא רק על ידי כמות חלבון זמין היעד epitope שונות. שיקולים אחרים במהלך תהליך אופטימיזציה עשויים לכלול זמן הדגירה נוגדן ודגימת לערום/זמן טעינה. ברוב המקרים הגדרות ברירת המחדל עבור הכלי מציעים את האיזון הטוב ביותר של רזולוציה ורגישות. עם זאת, במקרים מסוימים, רזולוציה נמוכה או רגישות ניתן לשפר באמצעות התאמת הפרמטרים האלה.
ראגנטים נימי electrophoretic מבוססי שיטות מספקים מדידות חלבון מהיר, יעיל, ו לשחזור. שיטות אלה כבר נעזרו בעיקר בהגדרות מחקר ופיתוח, מרקם של טכנולוגיות אלה יש פוטנציאל השירות יישומים קליניים ולניהולו. לדוגמה, זיהוי subpopulations רגישים חשיפה לרעלים סביבתיים או חולים עם התקדמות המחלה יכול להיות מבוסס על חלבון סמנים ביולוגיים נמדד מטריצות נגישים, כגון דם, שתן ורוק. ריאגנט של ירידה במחיר מבצע, מספר מטרות שניתן המוערך בו זמנית מגביר ודוגמאות, שנראה סביר מתכלה נימי electrophoretic המבוסס על שיטות המשמשות עבור סוגים אלה של יישומים.

נימי immunoassays electrophoretic ביטוי חלבון lysates תא באמצעות מערכות הפרדה גודל או תשלום וכולן מספקות כמה יתרונות על פני immunoassays המסורתי. לדוגמה, כאשר לעומת תספיג, ההליך ממוכנת המבוססת על נימי מבטלת את הצורך ג'ל, העברת התקנים, ושוטף ידני. בנוסף, כמות החלבון הנדרש המוחלט נמצא כ 10 פעמים פחות, ביצוע מערכות מבוססות נימי אידיאליות לשימוש עם סוגי תאים נדיר או מדגם מוגבל1,2. תוצאות מתקבלים קצת כמו 3 שעות באמצעות מערכות אוטומטיות, בעבר הוכחו להיות כמותיים יותר לשחזור מאשר המערבית הקונבנציונלית כתם הליכים3,4,5. תהליך מבוסס-גודל מבחני מורכב טעינה בדגימות המכיל נתרן גופרתי dodecyl (מרחביות), dithiothreitol (DTT), ומתויגים fluorescently משקל מולקולרי סמני לתוך עמודות נימי המכיל סידור בערימה והפרדה מטריצות. מתח חלה על הנימים מפריד את החלבונים הדגימות בהתאם לגודל, אור UV עוצר את החלבונים מופרדים לקיר נימי. נים זה אז חיסונית-שנבדק עם במטרה העיקרית נוגדן וחזרת peroxidase (HRP)-נוגדנים משניים מצומדת. הלומינול ותחמוצת המימן לעודד דור אור chemiluminescent, אשר נמדדת מצלמה בשילוב התקן (CCD) תשלום, ניתח quantitate חלבון.
למרות בקלות יחסית המהירות של פלטפורמת מיכשור וציוד electrophoretic אוטומטית מבוססת-נימי, אופטימיזציה של assay תנאים כגון ריכוז חלבון, דילול נוגדן זמן החשיפה חשובה להשגת מדויק, לשחזור תוצאות. באופן כללי, הפרוצדורות הבאות יש לבצע כדי למטב וזמינותו של מערכות אלה:
1) מסך צריכה להתבצע להעריך ולבחור נוגדנים עבור האות וספציפיות אל המטרה חלבון. אם הוא זמין, חלבון מטוהרים או היעד epitope ניתן להשתמש כדי להעריך ירידה לפרטים; עם זאת, עדיין חשוב להעריך את פוטנציאל אות לא ספציפית הכוללת חלבון הטרייה מערכת מודל.
2) הבא, הטווח הדינמי של וזמינותו צריך להיקבע. במצב אידיאלי, לסמן הכפלה (נמדד בעזרת שיא) נצפית כמו ריכוז מדגם מוכפל; עם זאת, בפועל, שינוי ביחס אות קלט באופן צפוי (למשל, לינאריות מתאים) מספיקה על כימות חלבון. בנוסף, מיטוב זה מגדיר את ריכוז חלבון קליטה גבוהה אך עדיין בתוך הטווח. ליניארית עבור דגם ניסיוני.
3) לקבוע ריכוז נוגדן אופטימלית באמצעות ריכוז חלבון קבוע נבחר אופטימיזציה בשלב 2. ריכוז נוגדן גודלת, האות מגדיל עד זה מישורים-רוויה. ריכוז נוגדן ליד רמת רוויה זו נדרשת עבור מדידה מדויקת של ריכוז חלבון.
התהליך המשמש כדי למטב את ריכוז חלבון נוגדן דילולים, פעמים חשיפה וזמינותו גודל אוטומטי המבוסס על נימי6 הוכח באמצעות תמציות התא כולו מבודד BEAS-2B, אדם SV-40 טרנספורמציה הסימפונות שורת תאים אפיתל. בידוד חלבון של תמציות תאים או רקמות יכול להתבצע באמצעות מספר פרוטוקולים שפורסמו7,8,9 , לא יכוסו כאן. התוצאות של ניסוי הניסיון להשתמש בתנאים אופטימליים גם דיווחו על סך ובעלות phosphorylated (סרין 15, סרין 20) p53 בתרבויות נחשפים דוקסורוביצין (נפוץ כימותרפיות סוכן אשר מעוררת אפופטוזיס תא10) ב- 1.2, 1.8, ו 2.4 מדיה µg/mL עבור 4 h לפני הקציר. האזורים שיא p53 הם מנורמל ל ɑ-טובולין, אשר משמש פקד הטעינה.

<table><tbody><tr><td>Wes instrument</td><td>ProteinSimple (סנטה קלרה, קליפורניה)</td> <td>004-600</td><td></td></tr><tr><td>P53 DO-1 נוגדן ראשוני</td><td>Santa Cruz Biotechnology, Inc.</td><td>SC-126</td><td></td></tr><tr><td>זרחני p53 (SER 15) נוגדן ראשוני</td><td>טכנולוגיית איתות תאים</td><td>9286</td><td></td></tr><tr><td>p53 זרחני (SER 20)</td><td>נוגדן ראשוני טכנולוגיית איתות תאים</td><td>9287</td><td></td></tr><tr><td>נוגדן ראשוני אלפא-טובולין</td><td>טכנולוגיית איתות תאים</td><td>3873</td><td>משמש כבקרת טעינה</td></tr><tr><td>תוכנת מצפן</td><td>ProteinSimple (סנטה קלרה, קליפורניה)</td><td></td><td>מסופק עם ערכת המאסטר של Wes</td></tr><tr><td>12-230 kDa</td><td>ProteinSimple (סנטה קלרה, קליפורניה)&nbsp;</td><td>PS MK02 (מאז הוחלף בערכה חדשה #)</td><td></td></tr><tr><td></td><td>www.proteinsimple.com/consumables_sw_wes.html</td><td>כולל חלק מס': מאגר כביסה (60 מ"ל) 042-202 10X מאגר דגימה (440 &mu; L) 042-195 מיקרופלטות מלאות מראש (8) PS-PP01 מחסניות נימיות (8) PS-CC01 מדלל נוגדנים II (20 מ"ל) 042-203 לומינול-S (1.5 מ"ל) 042-233 מי חמצן (1.5 מ"ל) 042-234 סטרפטווידין-HRP (132 &mu; L) 042-414 חבילה סטנדרטית (8): סולם ביוטיניל, תערובת מאסטר פלואורסצנטית 5X, DTT, וצינור ריק של 0.6 מ"ל PS-ST01 נוגדן משני נגד ארנב 042-206 או נוגדן משני נגד עכבר 042-205</td><td></td></tr><tr><td><חזק>שם&nbsp; </td><td>Company</td><td>Catalog Number</td><td>Comments</td></tr><tr><td>תרבית תאים, טיפול וקציר</חזק> (תוך שימוש בפרוטוקולים המומלצים על ידי הספק; פרוטוקולים שאינם כלולים בכתב היד)</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>תאי BEAS-2B</td><td>אוסף תרביות סוג אמריקאי (ATCC, Manassas, VA)</td><td>CRL-9609</td><td></td></tr><tr><td>מדיום גידול קרטינוציטים, KGM Gold</td><td>Lonza Ltd (באזל, שוויץ)</td><td>192152</td><td>לתרבית תאים</td></tr><tr><td>קרטינוציט מדיום בסיסי, KBM Gold</td><td>Lonza Ltd (באזל, שוויץ)</td><td>192151</td><td>מדיום נטול סרום למינון כימי</td></tr><tr><td>דוקסורוביצין</td><td>סיגמא-אולדריץ' (סנט לואיס, מיזורי)</td><td>D1515</td><td></td></tr><tr><td>Coomassie Blue Bradford Astests</td><td>ThermoFisher Scientific (וולת'ם, מסצ'וסטס)</td><td>23200</td><td>לכימות חלבון</td></tr><tr><td>ערכת תמצית גרעינית</td><td>מוטיב פעיל (קרלסבד, קליפורניה)</td> <td>D1515</td><td>המשמש להכנת ליזטים</td></tr><tr><td></td><td></td> של תאים שלמים <td>כולל:</td><td></td></tr> <tr><td></td><td></td><td>מאגר ליזה AM1</td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td>1M דיתיותרייטול (DTT)</td><td></td></tr> <tr><td></td><td></td><td>קוקטייל</td><td></td></tr><tr><td></td><td></td> מעכב פרוטאז <td>10X PBS& נ.ב.פ;</td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td>מעכבי</td><td></td> פוספטאז</tr></tbody></table>

הליך ואסטרטגיות אופטימיזציה מפתח שיטה אוטומטית נימי מתכלה מבוסס על electrophoretic

Procedure and Key Optimization Strategies for an Automated Capillary Electrophoretic-based Immunoassay Method

טכנולוגיות חדשות לנצל המבוסס על נימי immunoassays מבטיח הערכה כמותית יותר ויותר חלבון בהשוואה immunoassays המסורתי. בדומה מבחני נוגדן מבוססי חלבונים אחרים, אופטימיזציה של פרמטרים המבוסס על נימי מתכלה, כגון ריכוז חלבון, דילול נוגדן זמן החשיפה עם זאת, תנאי מוקדם חשוב לדור של אמין ובעל משמעות נתונים. מדידות חייב ליפול בתוך הטווח. ליניארית של וזמינותו איפה לשינויים אות יחסי ישירות לשינויים בריכוז lysate. תהליך בחירת המתאים ריכוזי lysate נוגדנים דילולים, פעמים חשיפה בשורה תאי אפיתל הסמפונות אדם, BEAS-2B, הוא הפגין כאן. ליניאריות assay מוצג על טווח של תאים כל תמצית חלבון ריכוזים עם נוגדנים p53 וα-טובולין. דוגמה של האות שחיקה נתפסת בבית את הריכוזים הגבוהים ביותר עם חשיפה ארוכה פעמים, מעגל דילול של נוגדן α-טובולין מוצג הוכחת רוויה. בנוסף, מדווחים תוצאות ניסויית דוגמה עבור תאים שטופלו דוקסורוביצין באמצעות פרמטרים אופטימליים.

זמן החשיפה - שחיקה אות הקובע
האות שחיקה עשויה להתרחש כאשר המצע הלומינול ותחמוצת המימן תיגמר מהר מדי. זה יכול להיקבע על ידי בחינת הנתונים בזמנים חשיפה chemiluminescence שונים. התוכנה ניתוח, כנס ל "ערוך – &#62; ניתוח – &#62; תמונות". חשיפות בטווח שבין 5 ל 480 s. ציר ה-y ב- electropherogram דוחות אות/שעה, כך נתוני החשיפה כל אחד צריך מקדם אות/זמן דומה. מקדם זה מקטין עם חשיפות ברצף זמן רב יותר אם הלומינול הופך להיות דלה, כפי שניתן לראות עם הנוגדן דו-1 p53 (איור 2). בגלל המחסור המצע, assay זה יכול להיחשב מדיד עד ריכוז µg/µL 0.2 רק ב 5-30 s החשיפות. לכן, בדוגמה זו, 15 s היה נחוש בדעתו להיות הזמן חשיפה אופטימלית נתונים ניתוח p53.
טיטור lysate - קביעת טווח דינמי ליניארי
חשוב מדידות להילקח בטווח דינמי ליניארי של כל assay, איפה לשינויים האות כפי שנמדד לפי אזור שיא ביחס לשינויים בכמות החלבון במדגם. שימוש בזמן חשיפה אופטימלית נבחר s 15 בסעיף הקודם, וזמינותו ליניאריות הוכח p53 וגם ɑ-טובולין מעל גדול יותר מגוון 15-fold של ריכוז (איור 3). מניסיוננו, ערך2 R של &#62; 0.9 של רגרסיה ליניארית להתאים נחשב מקובל עבור טווח דילול של חלבון מטוהרים של כמות ידוע (אם וזמינותו מדידה כמותית מוחלטת) או לטעום lysate של חלבון המטרה לא ידוע (אם וזמינותו הוא מידה כמותית יחסית).
אופטימיזציה של דילול נוגדן
באמצעות נוגדנים ב קולח ריכוזים מסייעת להבטיח כי כל שינוי האות נמדד רק בשל שינויים בכמות החלבון. בתור הדגמה, שתי שורות תא BEAS-2B, התא כולו תמציות (0.2 µg/µL הכוללת חלבון נטען לתוך וזמינותו) היו שנבדק עם ריכוזים נוגדן ɑ באופן סדרתי מדולל-טובולין הנע בין 1:25 - 1:800 (איור 4). האות chemiluminescent (כאן, נמדד כשטח שיא) הייתה להתוות נגד דילול נוגדן. רוויה נצפתה ליד 1:50 מתחילה העקומה מישור בולט דילול.
משפט ניסיוני - דוקסורוביצין הטיפול בתאים BEAS-2B
שימוש assay מיטבי בתנאים, תרבית תאים BEAS-2B טופלה עם שלושה ריכוזים שונים של דוקסורוביצין (1.2, 1.8 ו 2.4 µg/mL) במשך 4 שעות (איור 5, טבלה 1). הפעלה של p53 דרך שינויים post-translational שמתווכת תגובות הסלולר מספר, כולל מעצר מחזור התא, הזדקנות ביולוגית של אפופטוזיס12. באופן ספציפי, זירחון של סרין 15 יוחסה להפעלה תעתיק של p53, וכתוצאה מכך אפופטוזיס לאחר טיפול דוקסורוביצין13. בהפגנה הזו, ɑ-טובולין מנורמל שיא האזורים מוצגים כמו קיפול של שליטה. מעניין, 3.5 לעלייה p53 זרחון על סרין 4-fold נצפו עליות 15 ו- 2-fold רמת p53 phosphorylated-סרין 20 לאחר 4 שעות חשיפה דוקסורוביצין. תוצאות אלו מצביעות על ההפעלה של p53; עם זאת, אין מנה-תגובה נתפסת עבור הריכוזים שבחרת (לעומת זאת, המנה הנמוכה ביותר נבדק elicited התגובה הגבוהה ביותר). סה כ p53 לא להפגין מענה ברור טיפול במערכת מודל. הבחנו בעבר הפעלה של p53 זירחון בהיעדרו של רמות גבוהות של p53 הכולל תנאים דומים שטופלו אבץ BEAS-2B תאים14.
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55911/55911fig2v3.jpg"> 
איור 2 . חשיפה השוואה התמונה כדי לזהות אות שחיקה. ליין צפיות הצג הפחתת ריכוז חלבון עבור BEAS-2B lysates שנבדק עם p53 נוגדנים דו-1 לדילול שבערך. המקדמים של אות chemiluminescence, המדווח פסגת הגולן בתוכנה כלי נגינה, הן נקודות המגע המוצגים. בניגוד הגולן שיא, עוצמות הלהקה ויזואלית אוטומטית שנוצר, על ידי המכשיר כדי לסייע צפייה של להקות, הן לא דומות מהחלונית אחד למשנהו. שימו לב לירידה chemiluminescence אות כמו זמן החשיפה עולה, עם האות תחילתן (פיצול פיק)-שתי החשיפות הארוך, המציינת את המצע דלדול. <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55911/55911fig2v3large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55911/55911fig3v3.jpg"> 
איור 3 . טיטור lysate מציג תצוגות ליין. טיטור lysate מציג את ליין צפיות (א) BEAS-2B lysate כאשר נחקר עם שבערך p53 דו-1 או 1:50 ɑ-טובולין. שלא כמו ערכי אזור הפסגה, עוצמות הלהקה חזותי באופן אוטומטי שנוצר, על ידי המכשיר כדי לסייע צפייה של להקות, הן לא דומות מהחלונית אחד למשנהו. ניתוח של רגרסיה ליניארית (B) מאשרת שמבחני הם לינארית מעל הטווח כולו נבדק, מ 0.01 µg 0.20/µL, µg 0.025 כדי 0.40/µL, עם ערכי R2 0.999 ו- 0.985, בהתאמה. ריכוז החלבון הכולל באמצע הטווח. ליניארית נבחרו כדי להכיל פוטנציאל וריאציה חלבון המטרה בשני הכיוונים (לדוגמה, µg/µL 0.2 עבור α-טובולין). <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55911/55911fig3v3large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55911/55911fig4.jpg"> 
איור 4 . Α-טובולין נוגדן דילול ' עקומות ' עבור שתי נפרד BEAS-2B חלבון lysates עם או בלי בסיס נורמליזציה. Depar מובהקמכשור מ ליניאריות נתפסת 1:50 (0.02) דילול, המציינת את הרוויה. 1:50 ולכן נבחר דילול אופטימלית עבור זה הנוגדן. <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55911/55911fig4large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55911/55911fig5.jpg"> 
איור 5. השפעת הטיפול דוקסורוביצין (DXN) 4 שעות על סך של סרין phosphorylated ביטוי חלבון p53 של תאים BEAS-2B. שיא אזורים מנורמל ל α-טובולין, התווה קיפול של שליטה (CTL). <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55911/55911fig5large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.</a>
<img alt="Table 1" src="/files/ftp_upload/55911/55911tbl1.jpg"> 
טבלה 1. השפעת הטיפול דוקסורוביצין (DXN) 4 שעות על סך של סרין phosphorylated ביטוי חלבון p53 של תאים BEAS-2B. <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55911/55911tbl1large.jpg" target="_blank">אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של השולחן הזה.</a>

ראגנטים מבוסס-נים באמצעות פלטפורמה מסחרית כדי למדוד את היעד חלבונים מן ההכנות חלבון הכולל הוא הפגין. בנוסף, הפרמטרים וזמינותו של זמן החשיפה, לריכוז החלבון נוגדן דילול הממוטבות מערכת מודל של התרבות תאים.

הליך ואסטרטגיות אופטימיזציה מפתח שיטה אוטומטית נימי מתכלה מבוסס על Electrophoretic

New technologies that utilize capillary-based immunoassays promise faster and more quantitative protein assessment compared to traditional immunoassays. ...

המטרה הכללית של הליך זה היא להדגים בדיקת אימונו-ספירה באמצעות אלקטרופורזה קפילרית באמצעות פלטפורמה מסחרית. פלטפורמה זו תבדיל ותכמת חלבונים מטרה מדגם ביולוגי שניתן להפיקו מרקמות תרביות תאים ומנוזלים ביולוגיים. התהליך בוחן חלבונים על בסיס גודל הנע בין 2 ל-440 kilodaltons.היתרונו של הליך אוטומטי זה על פני הליכים מסורתיים, כגון Western blot, הוא שבדיקות אימונו-אלקטרופורזה קפילריות מבטלות את הצורך בג'לים, במכשירי העברה ובשטיפות ידניות. כמו כן, כמות החלבון המוחלטת הנדרשת נמוכה פי 10 בקירוב, מה שהופך את ההליך לאידיאלי עבור סוגי תאים נדירים או דגימות מוגבלות. בנוסף, התוצאות מתקבלות תוך שלוש שעות בלבד באמצעות מערכות אוטומטיות, ונמצאו כי הן כמותיות וניתנות לשחזור יותר מאשר הליכי Western blot קונבנציונליים.הכינו את הדגימות והריאגנטים מהערכה, כולל בופר לדגימה, dithiothreitol, תערובת מאסטר פלואורסצנטית וסולם ביוטינילי (biotinylated ladder), בהתאם להוראות היצרן המצורפות למוצר. הכינו את דגימות החלבון בשיטה המועדפת עליכם. כאן בידלנו תמצית תאים שלמה מתרביות תאי BEAS-2B.דללו את דגימות החלבון עם בופר דגימה. ערבבו חלק אחד של תערובת מאסטר פלואורסצנטית בריכוז 5X עם ארבעה חלקים של דגימה מדוללת כדי להגיע לריכוז החלבון הסופי הרצוי. דוגמה לחישוב מוצגת להכנת 70 µL בריכוז חלבון סופי של 0.2 µg/µL, החל מריכוז חלבון במלאי של 1.2 µg/µL.תערובת המאסטר (Master mix) מהווה 1/5 מהנפח הכולל, ובמקרה זה, 14 microliters. כדי לחשב את נפח מלאי החלבון הדרוש, הכפילו את הריכוז הסופי הרצוי בנפח הכולל וחלקו בריכוז מלאי החלבון. החסירו את נפחי תערובת המאסטר והמלאי מהנפח הכולל כדי לחשב את נפח באפר הדגימה.בצעו דנטורציה לדגימות שהוכנו ולסולם המדדים (ladder) על ידי חימום ב-95 °C למשך חמש דקות. שימו לב, חלק מהחלבונים עשויים לדרוש תנאי דנטורציה עדינים יותר. לדוגמה, 70 °C למשך 10 דקות כדי למנוע אגרגציה של חלבונים ולשפר את הנדידה.שקלו אפשרות זו במידה ומופיע מריחה (smearing) משמעותית במשקלים מולקולריים גבוהים. הכינו את דילול הנוגדנים הרצוי במדלל המסופק. שימו לב כי נוגדים משמשים בדרך כלל בריכוזים גבוהים יותר עבור בדיקות אימונו-סריקה מבוססות קפילרות מאשר עבור Western blotting מסורתי.הכינו תערובת ביחס של אחד לאחד של לומינול ופרוקסיד באופן טרי לפני כל שימוש. העבירו באמצעות פיפט את הדגימות והריאגנטים ללוחית הבדיקה בנפחים המופיעים בתבנית. קידוד הצבעים מייצג את הטעינה הנכונה של הריאגנטים והדגימות ללוחית הבדיקה.העבירו בפיפט סולם ביוטינילי (biotinylated ladder) לבאר A1, ודגימות שהוכנו לבארים A2 עד A25. העבירו את מדלל הנוגדנים המסופק לבארים B1 עד B25 ולבאר C1. העבירו נוגדן ראשוני לבארים C2 עד C25. העבירו Streptavidin HRP לבאר D1. העבירו נוגדן שני לבארים D2 עד D25.והוסיפו תערובת לומינול-פרוקסיד לבארים E1 עד E25. הוסיפו בופר שטיפה לשלוש השורות הראשונות של הבארים הגדולות יותר בלוח האמצע. הפעילו את מכשיר האימונוסיי של קפילריה ופתחו את התוכנה הנלווית.טען את מחסנית הנימיים ואת לוחת הבדיקה למכונה בהתאם להוראות היצרן והפעל את הריצה. עם סיום הריצה, ודא שהסטנדרטים הפלואורסצנטיים זוהו כהלכה ותקן אותם במידת הצורך. בנוסף, ודא שסולם הביוטינין מראה את שיאי הגודל הנכונים עבור הערכה שבה נעשה שימוש.ראו את המדריך המהיר של היצרן או את מדריך המוצר לקבלת פרטים נוספים. אופטימיזציה של תנאי הבדיקה, כגון זמן חשיפה, ריכוז חלבון ודילול נוגדנים, חשובה להשגת תוצאות מדויקות וניתנות לשחזור. תנאים אלו ספציפיים לכל שילוב של מערכת מודל ונוגדן, ולכן יש לקבעם באופן אמפירי עבור כל בדיקה חדשה.היכולת להפיק תוצאות כמותיות תלויה בניתוח של זמן חשיפה שבו מצע הלומינול אינו מתכלה במהירות, שכן דלדול המצע מוביל לאובדן אות או לשריפת אות. ניתן לקבוע זאת על ידי בחינת הנתונים בזמני חשיפה שונים של כימילומינצנציה, כפי שמוצג באיור 2. זמני החשיפה במכשיר שבו נעשה שימוש נעו בין 5 ל-480 שניות.תצוגות הנתיבים הראו ריכוזי חלבון פוחתים עבור תמציות BEAS-2B שנסרקו עם נוגדן p53 DO-1 בדילול של 1:500. מקדמי אות הכמילומינצנציה, המדווחים כגבהי שיאים בתוכנת המכשיר, מופיעים כסמיכות (superimposed). עוצמות הפסים החזותיות מכווננות אוטומטית על ידי המכשיר ואינן ניתנות להשוואה בין פאנל אחד למשנהו.מקדם האות פוחת עם חשיפות ארוכות יותר באופן רצית, במידה והלומינול מתכל, כפי שניתן לראות כאן. האות מתחיל להיעלם והפיסגה מתפצלת בשתי החשיפות הארוכות ביותר. בשל כך, נבחר זמן חשיפה קצר של 15 שניות לצורך ניתוח הנתונים.יש לאפטימיזציה של כמות החלבון הכוללת עבור כל בדיקה ומערכת מודל ספציפיות. להערכה כמותית, יש לבצע את המדידות בתוך הטווח הדינמי הליניארי של כל בדיקה, שבו שינויים באות, כפי שנמדדו על ידי שטח הפסגה, פרופורציונליים לשינויים בכמות החלבון בדגימה.טיטראציה של ליסאט מציגה את תצוגת הנתיבים של ליסאט BEAS-2B כאשר נסרו עם 1 עד 500 p53 DO-1 או 1 עד 50 נוגדן alpha-Tubulin. ניתוח רגרסיה ליניארית מאשר שהבדיקות הן ליניאריות לאורך כל הטווח שנבדק. ריכוזי חלבון כולל במרכז הטווח הליניארי נבחרו כדי להתאים לשונות פוטנציאלית בריכוז חלבון המטרה בשני הכיוונים.כשיקול אופטימיזציה סופי, יש לבחון את הדילול המתאים של הנוגדן הראשוני. שימוש בנוגדנים בריכוזים רוויים מסייע להבטיח שכל שינוי שנמדד באות נובע אך ורק משינויים בכמות החלבון. שני דגימות חלבון של BEAS-2B, המיוצגות על ידי הנקודות הכחולות והכתומות, נבדקו עם דילולים סדרה של נוגדן alpha-Tubulin.אות הכמילומנסינציה, שנמדד כשטח שיא, שורטט אל מול דילול הנוגדן. רוויה נצפתה סביב דילול של 1:50, שם העקומה מתחילה להגיע למישור (plateau) ניכר. לכן, נבחר דילול של 1:50 כדילול האופטימלי עבור נוגדן זה.לאחר צפייה בסרטון זה, עליכם להרגיש בנוח בהכנת דגימות, טעינת דגימות וביצוע אנליזה במכשיר ה-ProteinSimple Wes לבדיקה אימונולוגית מבוססת קפילריה. לאחר שתשלטו בפרוצדורה זו, ניתן לבצע את כל הריצה תוך שלוש שעות עבור 25 דגימות. בעת ניתוח ריצה, חשוב לבצע בקרת איכות עבור כל קפילריה ודגימה.שלב זה כולל אימות של סטנדרטים פלואורסצנטיים בסולם ביוטינילי (biotinylated ladder). אם שיאים זוהו באופן שגוי, יש להשתמש בתוכנת הניתוח כדי לזהות בעיקר את השיאים הנכונים ולהסיר שיאים שזוהו באופן שגוי. כפי שנעשה בכל הטכניקות של ביולוגיה מולקולרית במעבדה, יש להשתמש בציוד מיגון אישי מתאים כדי להגן על עצמכם ועל הדגימות שלכם.זה כולל חלוק מעבדה, כפפות, משקפי מגן ונעליים סגורות. חשוב לזכור שיש לבצע אופטימיזציה עבור כל מטרה חדשה שנמדדת או כאשר נעשה שימוש במקורות דגימה שונים. שלבי תיקוף ומעקב כוללים הערכה של ספציפיות הנוגדן והאות באמצעות חלבון מטוהר או epitope.בחינה של הטווח הדינמי של הבדיקה באמצעות סדרה של דילול דגימות, ואופטימיזציה של דילול הנוגדנים על ידי הערכת רוויית האות על פני טווח ריכוזי נוגדנים. לאחר האופטימיזציה, פרוצדורה זו של אימונו-קפילריה אמורה לספק שיטה מהירה וכמותית יותר למדידת חלבון המטרה מדגימות ביולוגיות בהשוואה לשיטות מסורתיות כגון Western blot.

procedure-key-optimization-strategies-for-an-automated-capillary

Research

JoVE Journal

Biology

ביולוגיה

סרטון זה מדגים פרוטוקול אימונואסאי של אלקטרופורזה נימית לאיתור סמן ביולוגי חלבוני הקשור לטרשת אמיוטרופית צידית (ALS) מטסיות דם אנושיות. אישור נוכחותו של חלבון הסמן הביולוגי ALS מושג באמצעות הפרדה מבוססת גודל של חלבוני טסיות הדם ואחריה זיהוי כימילומינסנטי.

אלקטרופורזה נימית Immunoassay לזיהוי סמנים ביולוגיים חלבונים

אימונופנוטיפ בדם מלא הוא הכרחי לניטור מערכת החיסון האנושית. עם זאת, מספר הריאגנטים הנדרשים וחוסר היציבות של פלואורוכרומים ספציפיים בקוקטיילים מעורבבים מראש מחייבים הכנת ריאגנטים יומית. כאן אנו מראים כי הכנה אוטומטית למחצה של קוקטייל נוגדנים מכתים עוזרת לבסס אימונופנוטיפ אמין על ידי מזעור השונות בחלוקת ריאגנטים.

גישה אוטומטית-למחצה הכנת קוקטיילי נוגדן עבור ניתוח Immunophenotypic של אדם דם היקפי

כאן, אנו מציגים פרוטוקול אלקטרופורזה מקיף של אזור נימי להערכת הטרוגניות פיזיקוכימית מהותית של נוגדנים חד-שבטיים כתכונה איכותית.

הפרדת אלקטרופורזה הנימים של חד השבטי הנוגדן isoforms באמצעות נימי Neutral

התמקדות לגירויי כאב נימי הוא שיטת התפוקה נוגדן מבוסס, העדינה, גבוהה, המאפשרת אפיון מפורט של חלבונים ו שלהם איזופורמים של דגימות ביולוגיות קטן מאוד. להלן מתאר פרוטוקול זיהוי, כימות של חלבונים ספציפיים, איזופורמים שלהם באופן אוטומטי ו- robotized.

זיהוי רגיש מאוד, כמותית של חלבונים ושל שלהם איזופורמים בשיטה התמקדות לגירויי כאב נימי

כאן אנו מציגים פרוטוקול כדי לתאר את התפתחות ואימות מולקולה בודדת מערך דיגיטלי אליסה assay, אשר מאפשרת הזיהוי לאולטרה רגישות כל סוגי IFN-α בדגימות אנושי.

פיתוח ובדיקת של מולקולה בודדת העדינה מערך דיגיטלי מקושרים-אנזים Immunosorbent Assay עבור אינטרפרון אנושי-α

פרוטוקול מפורט מתואר את ההפרדה, זיהוי של אפיון proteoforms דגימות חלבון באמצעות נימי אזור אלקטרופורזה-ספקטרומטריית electrospray יינון-טנדם ספקטרומטר מסה (CZE-ESI-MS/MS). הפרוטוקול יכול לשמש עבור אפיון ברזולוציה גבוהה proteoforms דגימות חלבון וזיהוי בקנה מידה גדול של proteoforms בדגימות פרוטאום מורכבים.

בקנה מידה גדול פרוטאומיקס מלמעלה למטה באמצעות ספקטרומטר מסה של טנדם אלקטרופורזה של אזור נים

אלקטרונואידים מבוססי מיקרופלואידיג דיגיטלי היא טכניקה העושה שינוי מונחה מתח בזווית המגע לכאורה של droplet מיקרוליטר-נפח כדי להקל על המניפולציה שלה. שילוב זה עם חרוזים מגנטיים פונקציונליזציה מאפשר שילוב של מספר מבצעים ביחידת מעבדה עבור הכנה לדוגמה וזיהוי של פתוגנים באמצעות חיסוני מקושר אנזים (אליסה).

האלקטרו-מערכות מבוססות-פלטפורמת מיקרופלואידיקה דיגיטלית עבור מערכת חיסונית אוטומטית מקושרת אנזימים

בדיקות דם מבוססות עבור מחלות ניווניות חיוניים ליישום מחקרים קליניים בקנה מידה גדול. בדיקת דם אמינה ומאומתת צריך לדרוש נפח דגימה קטן, כמו גם להיות שיטת דגימה פחות פולשנית, במחיר סביר, והניתן לקריאה. נייר זה מדגים כי התפוקה הגבוהה של אלקטרופורזה באמצעות נימי הכוח מספקת את הקריטריונים להתפתחות ביואלית פוטנציאלית.

שימוש של אלקטרופורזה נימי הנוגדנים כדי לחפש בסמנים פוטנציאליים של טרשת Amyotrophic לרוחב בטסיות האדם

התגובה אוגי הוכיחה להיות דרך נוחה במהירות ליצור ספריות מגוונת של תרכובות. היא כוללת את תגובת אמין, אלדהיד, חומצה carboxylic ו isonitrile בדרך כלל מתנול בטמפרטורת החדר. בסרטון הזה, אנו מנצלים 48-חריץ Mettler-טולדו MiniBlock מצויד צינורות סינון מטפל Mettler-טולדו MiniMapper נוזלי אוטומטי היה בשימוש, כדי לספק את ריאגנטים ממס. הפרמטרים של עניין היו ריכוז, הרכב הממס ואת עודף של כמה חומרים כימיים.

אופטימיזציה של התגובה אוגי באמצעות סינתזה במקביל וטיפול נוזלי אוטומטי

שימוש בטכנולוגית microsphere Xmap של Luminex החברה, פתחתי immunoassay Fluorometric Multiplexed (MFIA) לserosurveillance של מיני בעלי חיים שונים במעבדה. MFIA הוא microarray השעיה בי אנטיגן, בקרת רקמה או נוגדנים קשורות קוולנטית לקלקר microspheres צבעים. שיטת בדיקת MFIA כמו גם נושאים שונים לפתרון בעיות מטופלות.

מתודולוגיה multiplexed Fluorometric immunoassay בדיקה ופתרון בעיות

למד שיטת אימונואסיי אוטומטית מבוססת אלקטרופורזה קפילרית לכימות חלבונים מדגימות ביולוגיות. השיטה מציעה חלופה מהירה ויעילה ל-Western blot עם פחות חלבון נדרש ותוצאות תוך שלוש שעות.

הליך ואסטרטגיות אופטימיזציה מפתח שיטה אוטומטית נימי מתכלה מבוסס על Electrophoretic

גלה סרטונים נוספים