Name: Bio-strato Interferometria per Cinetica di interazioni proteina-proteina e allosterici effetti Ligand di misura (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-02-18T14:15:00.000+00:00
Duration: 13 min 57 s
Description: Scopri la bio-strato interferometria per misurare la cinetica delle interazioni proteina-proteina e gli effetti allosterici dei ligandi. Questo metodo utilizza biosensori con rivestimento di streptavidina per analizzare l'ATP sintasi di tipo F e la sua subunità ε.

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Ringraziamo FortéBio per fornire grafica utilizzata in Figura 1. Questo lavoro è stato sostenuto da NIH concedere GM083088 a TMD

<html> 1. Programmare lo strumento per la BLI Assay Accendere lo strumento almeno un&#39;ora di anticipo per permettere alla lampada di riscaldarsi, questo è necessario per minimizzare il rumore e la deriva in segnale ottico durante l&#39;esperimento. Impostare la temperatura desiderata tramite la scheda strumento per preriscaldare il supporto piastra del campione. Quindi impostare il disegno sperimentale nel software di acquisizione dati. Selezionare &quot;Nuovo Kinetics Experiment&quot; nella scheda Wizard Experiment. Questo presenta un menu a schede con tutti i passi che devono essere definiti. 1.1. Definizione Piatto Definire le colonne da utilizzare sul piatto del campione a 96 pozzetti. Assegnare colonne per contenere tampone, proteina immobilizzata o partner di legame. Per ogni associazione bene, immettere la concentrazione di partner di legame da utilizzare. Nota: la definizione piastra mostrata nella figura 2 ha opzioni per saggi distinti. 1.2. Assay Definizione ONTENUTO &quot;&gt; Definisci tutti i passi necessari per il saggio., tra cui (i) Baseline (vari), (ii) Caricare, (iii) di associazione e (iv) dissociazione dei partner di legame. Poi, come descritto di seguito, collegare i singoli passaggi del test con colonne di pozzetti sulla piastra del campione selezionando la fase di test e quindi fare doppio clic sulla rispettiva colonna. Questo programma i sensori devono essere spostati da una colonna di pozzi a quella successiva durante il dosaggio. <ol><li> Baseline Iniziare con una breve fase basale (≥ 60 sec), con sensori in tampone di saggio (Figura 2, colonna 1), stabilire segnali BLI iniziali nella piastra a 96 pozzetti. </li><li> Loading (immobilizzare la proteina biotinilato sui sensori) Assegnare sensori per pozzetti che conterranno la proteina biotinilato (Figura 2, colonna 2). Utilizzare la funzione di soglia per raggiungere un livello predeterminato di legame (vedi introduzione). Impostare l&#39;opzione di soglia in modo che tutti i sensori saranno mossad alla colonna successiva di pozzi quando uno qualsiasi dei sensori raggiunge la soglia. </li><li> Baseline Includere un altro passo basale in tampone (figura 2, colonna 3, in genere&gt; 5 min) per lavare via le proteine ​​biotinilate nonimmobilized dai sensori e stabilire nuovi segnali di base stabili,. Per base saggi di legame / dissociazione solo (come in figura 3), comprende un passaggio aggiuntivo basale (60 sec) con sensori a nuovi pozzi di tampone (Figura 2, colonna 4) prima della fase di associazione. </li><li> Association (del partner di legame alla proteina immobilizzata) Per una dissociazione saggio base legante / (come in figura 3), selezionare un intervallo di concentrazioni di partner di legame da utilizzare per diversi sensori / pozzetti (Figura 2, colonna 5). Regolare il tempo di passaggio in modo che almeno una concentrazione di saturazione del partner di legame deve avvicinarsi segnale vincolante equilibrio. Per unsaggio per testare effetti allosterici di piccoli ligandi sulla dissociazione del complesso proteina-proteina (come in Figura 5), per selezionare una singola concentrazione di partner di legame (~ 10 volte superiori alle stime K D) per l&#39;utilizzo in tutti i pozzetti di associazione. </li><li> Dissociazione (del partner di legame) Per una dissociazione saggio di base legante / solo (come nella figura 3), designa i sensori per tornare alla colonna 4 (Figura 2), gli stessi pozzetti tampone quale usato per la linea di base supplementare prima Association. Per un saggio per testare effetti allosterici di piccoli ligandi, invece designare sensori per spostarsi colonna 6 (figura 2), in cui ciascun pozzetto può contenere tampone più diversi ligandi allosterici. </li></ol> 1.3. Assegnazione del sensore Indicare le posizioni nel cassetto sensore che conterrà i sensori prewetted per il saggio. Identificare eventuali posizioni vuote in quanto l&#39;esperimento FAIl se non sensori sono raccolti. 1.4. Recensione Experiment Visualizza tutti i passi previsti per verificare gli errori e tornare a correggerli. 1.5. Eseguire Experiment Inserire i dettagli necessari, compresa l&#39;ubicazione dei file di dati. Immettere la temperatura desiderata per l&#39;esperimento. Se sensori richiedono ancora prewetting, selezionare l&#39;opzione di ritardare di iniziare l&#39;esperimento. Infine, una volta tutta la preparazione del campione è completa (fase 2) e sia il piatto del campione e il vassoio del sensore vengono caricati nello strumento, fare clic sul pulsante Vai per eseguire il test. 2. Preparazione del campione <ol><li> Preparare un tampone appropriato. Buffer utilizzato per esperimenti mostrati nelle figure 3 e 5: MOPS 20 mm (3 - (N-morfolino) acido propanosulfonico), Tris (Tris (idrossimetil) ammino-metano) (aggiunti per aggiustare il pH a 8,0), 50 mM KCl. Includi BSA (albumina sierica bovina, acidi grassi liberi, 0.5mg / ml finale) nel tampone per tutte le fasi del test e per tutte le diluizioni della proteina biotinilato o partner di legame per minimizzare il legame non specifico di proteine ​​ai sensori. </li><li> Diluire la proteina biotinilato (ε) in tampone a una concentrazione adeguata (vedi introduzione). </li><li> Preparare diluizioni del partner di legame (F 1 (-ε)) in tampone di saggio (vedi Consigli per il range di concentrazioni da utilizzare). </li><li> Prewet sensori rivestite di streptavidina per almeno 10 minuti per rimuovere il loro rivestimento protettivo saccarosio. Rimuovere il rack sensore contenente dal vassoio sensore e inserire una piastra a 96 pozzetti a fondo del cassetto, scorrevole un angolo del piatto nella tacca di orientamento sul vassoio. Da utilizzare per la colonna di sensori, aggiungere 200 ml di tampone di saggio per pozzetto in quella colonna della piastra a 96 pozzetti. Ritorno il rack di sensori per il vassoio con l&#39;orientamento corretto (con le schede negli slot). </li><li> Come assegnato durante la programmazione nella Fase 1, riempire pozzi of piatto del campione con tampone di saggio o le diluizioni appropriate proteine, come in Figura 2. Evitare l&#39;introduzione di bolle, in quanto possono causare rumore nel segnale ottico. Includere uno o più pozzi di riferimento che omettono (i) di proteine ​​biotinilato o (ii) partner di legame. </li><li> Aprire lo sportello dello strumento e inserire il vassoio sensore sul palco (a sinistra), con le schede del vassoio inseriti nelle fessure del palcoscenico. Inserire la piastra del campione nel supporto piastra (a destra), fare in modo che la piastra è seduto piatta e con l&#39;orientamento corretto, come indicato sul porta targa. Chiudere la porta e avviare il test dal programma di acquisizione dati (fase 1.5). </li></ol> 3. Elaborazione dati <ol><li> Dopo che il test è stato eseguito, aprire il software di analisi dei dati e caricare la cartella contenente i dati. Fare clic sulla scheda &quot;Processing&quot; per visualizzare un menu graduale Processing (a sinistra) e dati cinetici prime, con ogni sensore (AH) assegnato un colore diverso (vediFigura 3). </li><li> In &quot;Selezione dati&quot;, fare clic sul pulsante &quot;Selezione sensore&quot;. Sul &quot;Map Sample Piatto&quot;, designa i pozzetti per 1 o 2 sensori di controllo (G, H in analisi della figura 3) come pozzi di riferimento. Dal menu Processing, selezionare la casella &quot;sottrazione&quot; e selezionare &quot;Reference Wells&quot; per sottrarre segnale di riferimento (singolo o media) dal segnale di ogni altro sensore. </li><li> Allineare tutte le tracce di Y = 0 tramite il passo &quot;Allinea asse Y&quot;. Selezionare &quot;Baseline&quot;, come il passo di allineamento (questa è l&#39;ultima linea di base prima della fase Association). Per &quot;Intervallo di tempo&quot;, inserire gli ultimi 10 secondi di quella basale (cioè 50-60 sec per 60 sec di base, come nella figura 3). </li><li> Seleziona la casella &quot;Inter-step di correzione&quot; per ridurre al minimo i turni di segnale tra le fasi associazione e dissociazione. Selezionare adeguamento alla Baseline o dissociazione. </li><li> Selezionare la funzione di filtraggio Savitzky-Golay nella maggior parte dei casi e fare clic su &quot;dati di processo!&quot; per procedere. Ispezionarei dati definitivi elaborati (in basso pannello di destra). Con saggi destinati ad analisi di dati globale (come in figura 4), ​​se le tracce di segnale mostrano un significativo spostamento tra associazione e di dissociazione passi, modificare la selezione di dissociazione o Baseline per la &quot;correzione Inter-passo&quot; e rielaborare i dati prima di procedere al Data Analisi. </li></ol> 4. Analisi dei dati Fare clic sulla scheda &quot;Analisi&quot; in Analisi dei dati per iniziare. Nota: l&#39;esempio di seguito sono i passaggi per l&#39;analisi globale di molteplici curve di legame / dissociazione (come nella figura 3). <ol><li> Per &quot;Passo a Analizza&quot;, scegli associazione e dissociazione. Per il &quot;Modello&quot;, selezionare 1:1. Nota: sono disponibili altre opzioni limitate. </li><li> Per il &quot;Lato&quot;, scegli Globale (Full). Per il &quot;Raggruppamento&quot;, selezionare colore (come sul grafico). Selezionare &quot;R max disgiunta da sensore&quot; per consentire il montaggio indipendente di R max (risposta del segnale massimo su saturando vincolante della partner alla proteina immobilizzata). Nota: lo facciamo per la maggior parte dei saggi, come sensori variano leggermente la quantità di proteina immobilizzata (vedi figura 3, Loading). </li><li> Sul tavolo dimostrato, assicurarsi che tutte le tracce di sensori da analizzare hanno lo stesso colore, in modo che saranno analizzati come un insieme globale. Se necessario, selezionare uno o più sensori tracce di omettere dal raccordo globale: sotto la colonna &quot;Include&quot;, fare clic destro sulla posizione del sensore desiderata e selezionare &quot;Escludi Wells&quot;. </li><li> Fare clic su &quot;Curve Fit!&quot; per avviare l&#39;analisi di regressione non lineare. Esaminare i risultati di montaggio, tra cui (i) sovrapposizione delle curve di regressione con dati tracce dei sensori (come in figura 4), ​​(ii) appezzamenti di residui di montaggio, e (iii) una tabella con i valori dei parametri determinati (costanti di velocità, R max, K D) e le statistiche (errori standard per i parametri, Chi-quadrato, R 2). </li><li> In &quot;Esporta dati&quot;, salvare i risultati montaggio facendo clic su &quot;Esporta tabella di. Csv File&quot;. Per grapHing o ulteriori analisi dei dati / curve a muro con altri software, fare clic su &quot;Esporta Montaggio risultati&quot; per salvare i dati di ogni sensore e la curva montato in un file di testo. </li></ol>

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</ol>

Gli autori dichiarano di non avere conflitti di interesse.

Strumenti attualmente disponibili per BLI permettono di throughput e di flessibilità nella saggi per interazioni biomolecolari. Vari campioni di soluzione vengono dispensati in pozzetti della micropiastra nero, e una serie di sensori BLI parallele sono programmati per muoversi avanti e indietro tra colonne di pozzetti sulla piastra. I campioni vengono mescolati agitando orbitale durante tutta la seduta. Il sistema utilizzato qui ha 8 sensori e utilizza una piastra campione di 96-bene, ma un altro sistema utilizza 16 sen...

Interazioni proteina-proteina sono importanti per molti processi biologici e metodi ottici label-free come Surface Plasmon Resonance (SPR) sono stati utilizzati in vitro per studiare la cinetica di legame e di dissociazione 1. La maggior parte dei metodi di label-free immobilizzare uno biomolecole su una superficie del sensore e utilizzare un segnale ottico per rilevare un partner di legame dalla soluzione in quanto si associa con la biomolecola immobilizzata 1. Mentre SPR è un metodo altamente sensibile, è soggetta a interferenze dovute a variazioni dell&#39;indice di rifrazione della soluzione scorre sopra il sensore 2. Anche se non è così sensibile come SPR, Bio-strato Interferometria (BLI) è meno influenzata dai cambiamenti nella composizione del campione 1,3. BLI utilizza biosensori in fibra ottica che hanno un rivestimento biocompatibile proprietaria alla punta. Il sistema utilizzato here (Octet-RED96) contiene otto spettrofotometri. La luce bianca viene convogliata ad una fila di sonde che si muovono su un braccio robotico. Sensori in fibra ottica are raccolto dalle sonde e spostata in una piastra a 96 pozzetti contenenti campioni. Una delle molecole bersaglio è immobilizzato sulla superficie del biosensore. Poi sensori vengono spostati pozzetti contenenti il ​​partner di legame in soluzione. BLI monitora associazione del partner di legame con la molecola immobilizzata, quindi controlla dissociazione dopo aver spostato i sensori di soluzione senza il partner di legame. Il legame di molecole di superficie biosensore comportano modifiche interferenza ottica tra le onde luminose che riflettono indietro ai spettrofotometri da una superficie interna e dall&#39;interfaccia esterna tra il sensore e la soluzione. Questi cambiamenti di interferenza possono essere quantificate e utilizzati per determinare i tassi cinetiche di legame e di dissociazione, come riassunto nell&#39;animazione della figura 1. Abbiamo applicato BLI per misurare le interazioni tra il complesso catalitico di ATP sintasi batterica e la sua subunità ε, che può auto-inibire l&#39;enzima. ATP synthase è un nanomotor rotativo membrana integrato che catalizza la sintesi e idrolisi di ATP 4. Il complesso catalitico (F 1) può essere isolato in forma solubile che funziona come un ATPasi. Subunità ε ha due domini: il dominio N-terminale (NTD) è necessaria per il corretto montaggio e l&#39;accoppiamento funzionale dell&#39;enzima, ma non interagire direttamente con le subunità catalitiche, il dominio C-terminale (CTD) in grado di inibire l&#39;enzima interagendo con più subunità catalitiche 5,6. Questo regolamento ε-mediata è specifico per ATP sintasi batteriche e non è osservata nel omologo mitocondriale. ATP sintasi è emerso come un bersaglio per farmaci antibatterici, come dimostrato dalla recente approvazione della FDA di bedaquiline per il trattamento della tubercolosi farmaco-resistente 7. Così, il targeting ruolo inibitorio di ε per la scoperta della droga potrebbe produrre antibatterici che non inibiscono la mitocondriale ATP sintasi. Con l&#39;isolato complesso catalitico (F 1), εdiventa una subunità dissociabile. Tuttavia, con ε vincolato a F 1, il εCTD può subire un drastico cambiamento conformazionale, parzialmente inserito nella cavità centrale dell&#39;enzima e formando uno stato inibitorio che difficilmente dissociare direttamente 6,8. Usiamo BLI per misurare cinetica di F 1 / ε associazione e la dissociazione e, indirettamente, per esaminare gli effetti allosterici di catalizzatore sito ligandi sulla conformazione di ε. Nel nostro sistema, ε è stato scelto per l&#39;immobilizzazione sulla superficie del sensore dal segnale BLI (come SPR) è sensibile alla massa dei leganti in superficie molecole. La subunità ε è piccolo (~ 15 kDa) rispetto alla principale F 1 complesso (~ 347 kDa). Così, un segnale BLI più grande sarà il risultato di legame di F 1 a ε immobilizzato. Per monitorare F 1 dissociazione, che può essere molto lento, ε deve essere fortemente immobilizzato. Così abbiamo scelto di biotinylateE immobilizzarlo sul biosensori rivestite di streptavidina. Le proteine ​​possono essere biotinilati (i) modifica casuale di lisine superficie 9, (ii) reazione di un unico cisteina nativa o attrezzata con biotina-maleimmide reagente 10 o (iii) geneticamente aggiungendo uno specifico peptide biotina-accettore che viene enzimaticamente biotinilato durante espressione in vivo della proteina marcata 11. Nel nostro sistema, ε è biotinilato utilizzando il metodo (iii) 8. Una volta ε biotina-tag è immobilizzato su sensori streptavidina, BLI può misurare l&#39;associazione e dissociazione di F 1, che è stato impoverito di subunità ε (F 1 (-ε)). Per gli esperimenti qui descritti, saggi preliminari sono stati condotti per determinare ragionevole quantità di proteina biotinilato per immobilizzare sui sensori. Questo può variare, a seconda del peso molecolare della proteina e il suo partner di legame, ma l&#39;obiettivo è quello di determinare una quantità minima di proteina immobilizzata tcappello prevede (i) accettabile segnale-rumore per il legame cinetica con una bassa concentrazione del partner di legame (di seguito K D) e (ii) una distorsione minima di cinetica di legame con concentrazione quasi saturazione del partner di legame. Inoltre, stechiometria biotinilazione può variare (ma evitare&gt; 1 mol biotina / proteine ​​mol), per cui alcuni dosaggio iniziale può essere necessario per ogni nuovo lotto di proteine ​​biotinilato per confermare che un segnale coerente BLI può essere raggiunto durante l&#39;immobilizzazione sulla streptavidina-rivestito sensori.

<table><tbody><tr><td>Ottetto-RED96</td><td>Pall/Fort&eacute; Bio</td><td>30-5048</td><td></td></tr><tr><td>Siero Bovino Albumina Sigma</td><td></td><td>A6003-10G</td><td>Biosensore senza acidi grassi</td></tr><tr><td>/Palla di streptavidina</td><td>/Fort&eacute; Bio</td><td>18-5019</td><td>Vassoio da 96 sensori</td></tr><tr><td>Piastra per microtitolazione</td><td>Greiner Bio-one</td><td>655209</td><td>Nero, Polipropilene</td></tr><tr><td>Software di acquisizione dati</td><td>Pall/Fort&eacute; Bio</td><td>Versione 6.4</td><td>Versioni più recenti disponibili</td></tr><tr><td>Software di analisi dei dati</td><td>Pall/Fort&eacute; Bio</td><td>Versione 6.4</td><td>Versioni più recenti disponibili</td></tr></tbody></table>

bio-strato interferometria per cinetica di interazioni proteina-proteina e allosterici effetti ligand di misura

Bio-layer Interferometry for Measuring Kinetics of Protein-protein Interactions and Allosteric Ligand Effects

Descriviamo l&#39;uso di Bio-strato interferometria per studiare le interazioni inibitorie della subunità ε con il complesso catalitico di Escherichia coli ATP sintasi. Batterica di tipo F ATP sintasi è l&#39;obiettivo di un nuovo antibiotico approvato dalla FDA per combattere la tubercolosi resistente ai farmaci. Capire specifici batteri-auto-inibizione della ATP sintasi dal dominio C-terminale della subunità ε potrebbe fornire un nuovo mezzo per indirizzare l&#39;enzima per la scoperta di farmaci antibatterici. Il dominio C-terminale di ε subisce un drastico cambiamento conformazionale quando le transizioni tra gli stati di enzimi attivi e inattivi, e ligandi catalitica-portale possono influenzare quale delle conformazioni di ε è predominante. Le cinetiche di saggio misura di ε legante / dissociazione con il complesso catalitico, e indirettamente meaSures lo spostamento di ε enzima legato alla e dalla conformazione inibitorio apparentemente nondissociable. Il segnale interferometria Bio-strato non è eccessivamente sensibili composizione della soluzione, in modo che possa essere utilizzato anche per monitorare gli effetti dei ligandi allosterici catalitica-portale sulle variazioni conformazionali di ε.

Vincolante in tempo reale e la cinetica di dissociazione BLI sono mostrato in Figura 3. Questo esperimento è stato fatto con tampone di saggio in associazione e di dissociazione. Questo esperimento è stato avviato con una fase basale 10 min poiché i sensori sono stati prewet solo brevemente. Successivamente, ε biotinilato è stato caricato sui sensori. Nessuna dissociazione rilevabile di ε si è verificato in tutti i passaggi rimanenti come si è visto dalla curva di riferimento (G) che non aveva partner d...

I protocolli che seguono descrivono saggi cinetici di interazioni proteina-proteina con Bio-strato Interferometria. F-tipo ATP sintasi, che è coinvolto nel metabolismo energetico cellulare, può essere inibita dalla sua subunità ε nei batteri. Abbiamo adattato Bio-strato interferometria per studiare le interazioni del complesso catalitico con il dominio C-terminale inibitorio di ε.

Bio-strato Interferometria per Cinetica di interazioni proteina-proteina e allosterici effetti Ligand di misura

We describe the use of Bio-layer Interferometry to study inhibitory interactions of subunit &#949;&#160;with the catalytic complex of Escherichia ...

L'obiettivo generale del seguente esperimento è misurare la cinetica delle proteine, delle interazioni proteiche e gli effetti allosterici di piccoli ligandi su tali interazioni utilizzando la interferometria a strato biologico, BLI. Questo viene ottenuto preparando una delle proteine con biotina specifica e immobilizzandola sulla superficie di biosensori rivestiti con streptavidina in parallelo.Come secondo passaggio, alla proteina legata al sensore viene esposto un buffer contenente il suo partner di legame, e il legame viene misurato in tempo reale attraverso il suo effetto sull'interferenza ottica alla superficie del sensore. Successivamente, ciascun sensore viene trasferito in un buffer privo del partner di legame al fine di misurare in tempo reale la dissociazione della proteina. Complessi proteici.I risultati ottenuti permettono la determinazione delle costanti cinetiche di legame e dissociazione delle proteine interagenti e quindi la loro affinità di legame. Ulteriori risultati mostrano che la BLI può rilevare gli effetti di piccoli ligandi sulla velocità di dissociazione del complesso proteina-proteina. Il vantaggio principale di questa tecnica rispetto ai metodi esistenti

bio-layer-interferometry-for-measuring-kinetics-protein-protein

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Noi applichiamo un'etichetta priva di analisi di interazioni proteina utilizzando X100 Biacore per la struttura-funzione di analisi del legame di mutanti diversi cistatina B di papaina attraverso la caratterizzazione cinetica. Calibrazione senza analisi concentrazione (ACCP) misura la concentrazione di proteine ​​con attività di legame mantenuto senza la necessità di una curva standard. Abbiamo dimostrato che la conferma delle concentrazioni utilizzando ACCP aumenta l'affidabilità delle analisi...

L&#39;importanza della concentrazione della proteina corretta per Cinetica e determinazione affinità nella struttura-funzione di analisi

In questo video, dimostriamo la tecnologia dell'interferometria a biostrato (BLI) per rilevare le interazioni intermolecolari tra ligandi e analiti bersaglio in tempo reale. Il BLI misura i cambiamenti nel modello di interferenza della luce bianca riflessa da uno strato di ligandi immobilizzati sulla superficie di un biosensore mentre interagiscono con gli analiti in soluzione.

Tecnologia di interferometria a biostrati per rilevare le interazioni tra ligando e analita

Il protocollo qui descrive le interazioni della proteina canale dello ione di hEAG1 purificato con la piccola molecola lipidica ligando fosfatidilinositolo 4, 5-bisfosfato (PIP2). La misurazione dimostra che BLI potrebbe essere un metodo potenziale per lo screening di romanzo della piccolo-molecola ioni canale ligando.

Catturare la cinetica di interazione di una proteina di canale ionico con piccole molecole mediante il saggio di interferometria di Bio-strato

Qui presentiamo un protocollo per controllare il montaggio e lo smontaggio della tossina antrace tramite interferometria biolayer (BLI). A seguito di montaggio/smontaggio sulla superficie del biosensore, i complessi di grande proteina vengono rilasciati dalla superficie per la visualizzazione e l'identificazione dei componenti dei complessi utilizzando la microscopia elettronica e spettrometria di massa, rispettivamente.

L'analisi di complessi proteici dinamico montato su e rilasciato da Biolayer interferometria biosensore utilizzando la microscopia elettronica e spettrometria di massa

Le interazioni dei fattori di trascrizione (TF) con la polimerasi dell'RNA sono di solito studiate utilizzando saggi pulldown. Applichiamo una tecnologia di interferometria biostrato (BLI) per caratterizzare l'interazione di GrgA con la mistidiaRNA polimerasi. Rispetto ai test pulldown, BLI rileva l'associazione e la dissociazione in tempo reale, offre una maggiore sensibilità ed è altamente quantitativa.

Applicazione dell'interferometria biostrato (BLI) per lo studio delle interazioni tra proteine e proteine nella trascrizione

Questo articolo descrive un protocollo per lo studio delle interazioni DNA-proteina utilizzando un sistema di interferometria a biostrato (BLI) basato su streptavidina. Delinea i passaggi e le considerazioni essenziali per l'utilizzo della cinetica di legame di base o avanzata per determinare l'affinità di legame all'equilibrio (KD) dell'interazione.

Analisi delle interazioni DNA-proteina con l'interferometria a biostrato basata su streptavidina

Un semplice protocollo per determinare il contenuto di lipidi neutri di cellule algali utilizzando una procedura di colorazione rosso Nilo è descritto. Questa tecnica consente di risparmiare tempo offre un'alternativa ai protocolli di quantificazione lipidi basato gravimetrici tradizionali. E 'stato progettato per la specifica applicazione di monitoraggio delle prestazioni bioprocess.

Una semplice e rapida il protocollo per la misurazione lipidi neutri in cellule algali Uso fluorescenza

La nanoscopia con sonda colloidale può essere utilizzata in una varietà di campi per ottenere informazioni sulla stabilità fisica e sulla cinetica di coagulazione dei sistemi colloidali e aiutare nella scoperta di farmaci e nelle scienze della formulazione utilizzando sistemi biologici. Il metodo descritto all'interno fornisce un mezzo quantitativo e qualitativo per studiare tali sistemi.

Esame quantitativa e qualitativa delle interazioni particella-particella colloidale Uso Probe Nanoscopia

I protocolli presentati descrivono due tecniche basate su enzimoimmunosaggio (ELISA) per l'indagine rapida delle interazioni ligando-recettore: Il primo dosaggio permette la determinazione della costante di dissociazione tra ligando e recettore. Il secondo dosaggio consente una rapida analisi di screening dei peptidi di bloccaggio per le interazioni ligando-recettore.

Un ELISA Based rilegatura e metodo concorrenza di determinare con rapidità interazioni ligando-recettore

Qui presentiamo un metodo per sintetizzare nanoparticelle di solfuro di cadmio (CdS) prive di leganti basate su un copolimero di zolfo unico. Il copolimero di zolfo funziona come solvente ad alta temperatura e fonte di zolfo durante la sintesi delle nanoparticelle e stabilizza le nanoparticelle dopo la reazione.

Sintesi di CdS nanoparticelle libera-ligando all&#39;interno di una matrice zolfo Copolimero

Scopri la bio-strato interferometria per misurare la cinetica delle interazioni proteina-proteina e gli effetti allosterici dei ligandi. Questo metodo utilizza biosensori con rivestimento di streptavidina per analizzare l'ATP sintasi di tipo F e la sua subunità ε.

Bio-strato Interferometria per Cinetica di interazioni proteina-proteina e allosterici effetti Ligand di misura

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