Beskrivs här är en förenklad standard operativ förfarande för mikrobiomet profilering med 16s rRNA potenta sekvensering och analys med hjälp av fritt tillgängliga verktyg. Detta protokoll kommer att hjälpa forskare som är nya på mikrobiomet fältet samt de som kräver uppdateringar om metoder för att uppnå bakteriell profilering med en högre upplösning.