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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 프로토콜은 방사성 표지 된 아미노산 섭취 분석을 제시하며, 이는 일차 세포 또는 분리 된 뼈에서 아미노산 소비를 평가하는 데 유용합니다.
뼈 발달과 항상성은 골 형성 조골 세포의 분화와 활성에 달려 있습니다. 조골 세포 분화는 순차적으로 증식에 이어 단백질 합성과 궁극적으로 골 매트릭스 분비를 특징으로합니다. 증식과 단백질 합성에는 지속적인 아미노산 공급이 필요합니다. 그럼에도 불구하고 조골 세포의 아미노산 소비에 대해서는 알려진 바가 거의 없습니다. 여기에서는 방사성 표지 된 아미노산을 사용하여 아미노산 소비를 측정하도록 설계된 매우 민감한 프로토콜에 대해 설명합니다. 이 방법은 조골 세포 증식 또는 분화, 약물 또는 성장 인자 치료 또는 다양한 유전자 조작과 관련된 아미노산 흡수의 변화를 정량화하는 데 최적화되어 있습니다. 중요하게도, 이 방법은 시험관 내 또는 생체 외 분리된 뼈 축에서 배양된 세포주 또는 일차 세포에서 아미노산 소비를 정량화하기 위해 상호 교환적으로 사용될 수 있습니다. 마지막으로, 우리의 방법은 포도당 및 기타 방사성 표지 된 영양소뿐만 아니라 아미노산의 수송을 측정하기 위해 쉽게 적용 될 수 있습니다.
아미노산은 각 아미노산에 특이적인 가변 측쇄를 가진 아미노(-NH2) 및 카르복실(-COOH) 작용기를 포함하는 유기 화합물입니다. 일반적으로 아미노산은 단백질의 기본 구성 성분으로 잘 알려져 있습니다. 보다 최근에는 아미노산의 새로운 용도와 기능이 해명되었습니다. 예를 들어, 개별 아미노산은 생체 에너지학에 기여하거나, 효소 보조 인자로서 기능하거나, 활성 산소 종을 조절하거나, 다른 아미노산 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10을 합성하는 데 사용되는 중간 대사 산물을 생성하기 위해 대사 될 수 있습니다. . 많은 연구에서 아미노산 대사가 다양한 맥락에서 세포 다 능성, 증식 및 분화에 중요하다는 것을 보여줍니다 3,6,11,12,13,14,15,16,17.
조골세포는 콜라겐 유형 1이 풍부한 세포외 뼈 기질을 생성하고 분비하는 분비 세포입니다. 뼈가 형성되는 동안 높은 단백질 합성 속도를 유지하기 위해 조골 세포는 아미노산의 지속적인 공급을 요구합니다. 이러한 요구를 충족시키기 위해 조골 세포는 적극적으로 아미노산을 획득해야합니다. 이와 일치하여 최근 연구는 조골 세포 활동 및 골 형성 15,16,17,18,19,20에서 아미노산 흡수 및 대사의 중요성을 보여줍니다.
조골 세포는 세 가지 주요 공급원으로부터 세포 아미노산을 얻습니다 : 세포 외 환경, 세포 내 단백질 분해 및 de novo 아미노산 생합성. 이 프로토콜은 세포 외 환경으로부터의 아미노산 흡수 평가에 초점을 맞출 것이다. 아미노산 흡수를 측정하는 가장 일반적인 방법은 방사성 표지 (예 : 3H또는 14C) 또는 중위 동위 원소 표지 (예 : 13C) 아미노산에 의존합니다. 중위원소 분석은 아미노산 흡수 및 대사를 보다 철저하고 안전하게 분석할 수 있지만 샘플을 준비하고 유도체화하는 데 하루가 걸리고 샘플 수에 따라 질량분석기에서 분석하는 데 며칠이 걸리기 때문에 완료하는 데 며칠이 걸리기 때문에 완료하는 데 더 많은 시간이 소요됩니다(21,22). 이에 비해 방사성 표지 된 아미노산 섭취 분석은 하류 대사에 대한 정보가 아니지만 저렴하고 비교적 빠르며 실험시작 23,24에서 2-3 시간 내에 완료 될 수 있습니다. 여기에서는 생체 외 배양 된 1 차 세포 또는 세포주 또는 개별 뼈 샤프트에서 방사성 표지 된 아미노산 흡수를 평가하도록 설계된 쉽게 수정할 수있는 기본 프로토콜에 대해 설명합니다. 이러한 두 프로토콜의 적용은 다른 방사성 표지된 아미노산 및 다른 뼈 관련 세포 유형 및 조직으로 확장될 수 있다.
본원에 기재된 모든 마우스 절차는 달라스에 있는 텍사스 대학교 사우스웨스턴 메디컬 센터의 동물 연구 위원회에 의해 승인되었다. 방사선 프로토콜은 달라스에 있는 텍사스 대학교 사우스웨스턴 의료 센터의 방사선 안전 자문 위원회의 승인을 받았습니다.
1. 세포의 아미노산 흡수 (프로토콜 I)
2. 새로 분리 된 뼈 조직의 아미노산 흡수 (프로토콜 II)
아미노산 수송은 기질 특이성, 동역학, 이온 및 pH 의존성을 포함하는 수많은 특성에 기초하여 별개의 수송 시스템으로 분류된 많은 막 결합 아미노산 수송체에 의해 조절된다25. 예를 들어, 글루타민 흡수는 Na + 의존성 수송 시스템 A, ASC, γ + L 및 N 또는 Na + 독립적 시스템 L에 의해 매개될 수 있습니다. Na+-의존성 시스템은 Li+를 Na+(시스템 N)로 대체하는 능력 또는 아미노산 유사체 2-(메틸아미노)이소부티르산(MeAIB)(시스템 A)에 대한 민감도로 구별됩니다. 이 실험의 목적은 각 수송 시스템에 기인하는 글루타민 소비량을 정의하는 것이 었습니다. L-[3,4-3H]글루타민 흡수는 120mM NaCl을 함유하는 정상 KRH, 120mM 염화콜린을 함유하는 Na+ 유리 KRH, 5mM MeAIB를 함유하는 정상 KRH 또는 120mM LiCl을 함유하는 Na+ 유리 KRH의 합류성 ST2 세포에서 측정되었다. 총 방사능(분당 카운트)은 세포 수로 정규화되었다. Na+ 제거로 글루타민 흡수가 90% 감소했습니다. 이는 시스템 L이 글루타민 흡수의 10%를 차지하는 반면 ST2 세포에서 글루타민 흡수의 90%는 Na+ 의존적임을 나타냅니다(그림 2). Li+의 존재는 Na+ 유리 조건에 비해 글루타민 흡수를 2% 증가시켰지만 5mM MEAIB는 글루타민 흡수에 영향을 미치지 않았습니다. 이 데이터는 대부분의 글루타민 흡수가 시스템 ASC 및 γ + L에 의해 매개되는 반면 시스템 N과 시스템 A는 각각 Na + 의존성 글루타민 흡수의 약 2 % 및 0 %를 담당한다는 것을 나타냅니다.
우리는 생체 외 뼈축에서 아미노산 흡수를 특성화하기 위해 프로토콜 I을 수정했습니다. 이 실험에서 우리는 프로토콜 II를 따라 3 일 된 (p3) 마우스에서 분리 된 긴 뼈에서 아르기닌 흡수 동역학을 특성화했습니다. 이를 위해 먼저 p3 마우스에서 두 상완골을 모두 해부했습니다. 골단을 제거하고 골수를 뽑아 내고 정상화를 위해 각 상완골의 무게를 측정했습니다. 반대쪽 상완골은 음성 대조군으로 지정되었으며 세포 활동을 죽이기 위해 끓였습니다. 실험적이고 끓인 상완골을 방사성 표지 된 4μCi / mL L- [2,3,4-3 H]- 아르기닌과 함께 최대 2 시간 동안 배양 하였다. 아르기닌 흡수는이 실험 과정에서 선형 방식으로 증가했습니다 (그림 3A). 비교를 위해, 끓인 상완골은이 실험에서 아르기닌 흡수의 동적 증가를 나타내지 않았지만 오히려 뼈 매트릭스에서 프로브의 흡착에 기인 한 기저 방사능을 가졌다. 표준화되고 보정된 아르기닌 흡수는 도 3B에 도시되어 있다.

그림 1: 방사성 표지된 아미노산 흡수 분석의 워크플로우. 시험관 내 (프로토콜 I) 및 생체 외 뼈 (프로토콜 II)의 아미노산 흡수 분석의 개략적 개요. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 시험관 내 ST2에서 L-[3,4-3H]-글루타민 흡수의 동역학적 특성. (A) L- [3,4-3 H]- 글루타민 흡수 분석은 ST2 세포에서 나트륨 (Na +), MeAIB 또는 리튬 (Li+)의 존재 (+) 또는 부재 (-)에서 수행됩니다. (B) 글루타민 흡수에 대한 시스템 A, N, L 또는 ASC 및 γ + L의 예상 기여도의 백분율. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 3: 생체 외 L-[2,3,4-3 H]-신생아 상완골의 아르기닌 흡수. (A) L- [2,3,4-3 H]- 아르기닌 흡수는 3 일 된 C57BL / 6 마우스에서 분리 된 생균 및 끓인 상완골에서 2 시간의 시간 과정에 걸쳐 수행되었습니다. (B) 끓인 상완골로 표준화 된 L- [2,3,4-3 H]- 아르기닌 흡수. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 공개하지 않습니다.
이 프로토콜은 방사성 표지 된 아미노산 섭취 분석을 제시하며, 이는 일차 세포 또는 분리 된 뼈에서 아미노산 소비를 평가하는 데 유용합니다.
Karner 연구소는 국립 보건원 R01 보조금 (AR076325 및 AR071967)의 지원을 받고 있습니다.
| 0.25% 트립신 | Gibco | 25200 | |
| 12웰 플레이트 | Corning | 3513 | |
| 1mL 주사기 | BD 정밀 | 309628 | |
| 30G 니들 | BD 정밀 | 305106 | |
| 아르기닌 모노하이드로클로라이드 L-[2,3,4-3H]-, 1mCi | PerkinElmer | NET1123001MC | |
| Beckman LS6500 섬광 카운터 | |||
| 염화칼슘 | 시그마 | C1016 | |
| 염화콜린 | 시그마 | C7077 | |
| D-(+)-포도당 용액 | 시그마 | G8769 | |
| 해부 도구 | , | 집게, 가위, 스케이프 | |
| , DPBS | Gibco | 14190 | |
| 에틸렌디아민테트라아세트산 | 시그마 | E9884 | |
| HEPES(1M) | Gibco | 15630 | |
| L-[3,4-3H(N)]-글루타민 | PerkinElmer | NET551250UC | |
| 액체 섬광 바이알 | Sigma | Z190535 | |
| 리튬 클로라이드 용액, 8M | Sigma | L7026 | |
| 염화마그네슘 | Sigma | M8266 | |
| MEMα | Gibco | 12561 | |
| 마이크로 원심분리기 튜브, 15mL | Biotix | 89511-256 | |
| NP-40 | 시그마 | 492016 | |
| 염화칼 | 륨시그마 | P3911 | |
| 중탄산나트륨 | 시그마 | S6014 | |
| 염화나트륨 | 시그마 | S9888 | |
| 소듐 데옥시콜레이트 | 시그마 | D6750 | |
| 나트륨 도데 실 설페이트 | 시그마 | 436143 | |
| Sonicator | Sonic & 재료 | : VCX130 | |
| 트리스베이스 | 시그마 | 648311 | |
| 울티마 골드 (섬광 용액) | PerkinElmer | 6013329 | |
| α - (메틸 아미노) 이소 부티르산 | 시그마 | M2383 |