Screening for Functional Non-coding Genetic Variants Using Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA) and DNA-affinity Precipitation Assay (DAPA)

Daniel E. Miller; Zubin H. Patel; Xiaoming Lu; Arthur T. Lynch; Matthew T. Weirauch; Leah C. Kottyan

doi:10.3791/54093

전기 영동 이동성 분석 (EMSA) 및 Shift 키를 사용하여 기능 비 코딩 유전자 변형에 대한 심사 DNA 화성...

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Screening for Functional Non-coding Genetic Variants Using Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA) and DNA-affinity Precipitation Assay (DAPA)

전기 영동 이동성 분석 (EMSA) 및 Shift 키를 사용하여 기능 비 코딩 유전자 변형에 대한 심사 DNA 화성 강수 분석 (DAPA)

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11:35 min

August 21, 2016

DOI: 10.3791/54093-v

Daniel E. Miller¹, Zubin H. Patel^1,2,3, Xiaoming Lu^1,3, Arthur T. Lynch¹, Matthew T. Weirauch*^1,4, Leah C. Kottyan*¹

¹Center for Autoimmune Genomics and Etiology,Cincinnati Children's Hospital, ²Medical Scientist Training Program,University of Cincinnati, ³Immunology Graduate Program,University of Cincinnati, ⁴Divisions of Biomedical Informatics and Developmental Biology,Cincinnati Children's Hospital

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

우리는 전사 인자(TF) DNA 결합에 영향을 미치는 비암호화 유전적 변이를 식별하기 위한 전략적 계획과 프로토콜을 제시합니다. 유전자형 의존성 TF DNA 결합의 전기영동 이동성 이동 분석(EMSA) 및 DNA 친화성 침전 분석(DAPA) 분석을 위한 자세한 실험 프로토콜이 제공됩니다.

이 실험 전략의 전반적인 목표는 질병과 관련된 비코딩 변이체의 기능을 조사하는 것입니다. 이 방법은 실제로 아미노산 염기서열을 변경하지 않는 유전적 변이가 여전히 질병 표현형에 어떻게 기여하는지와 같은 유전체학의 주요 질문에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 기능 활성에 대한 유전적 변이를 평가하기 위한 간소화된 프로세스를 제공하고 영향을 받는 조절 단백질 및 경로에 대한 통찰력을 제공한다는 것입니다.

이 기술은 후보 원인 변이가 있는 모든 질병의 조사에 도움이 될 수 있습니다. 이러한 변이체를 분석하는 절차는 연구되는 표현형에 관계없이 보편적이기 때문입니다. 이 방법은 인간의 질병에 대한 통찰력을 제공할 수 있지만 모든 유기체의 돌연변이에도 적용할 수 있습니다.

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