Name: 합성 및 특성 1, 2-Dithiolane의 수정 자가 조립 펩 티 드 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-08-20T13:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 54 s
Description: 학습하세요 1,2-dithiolane 변형 펩티드 합성 및 초분자 구조 특성화 방법을 레진에서 단일 정제 단계로 효율적으로 수행하는 기술을. 이 프로토콜은 초분자 화학 분야에서 표면 반응성 연구에 필수적인 자가조립 메커니즘을 이해하는 데 기여합니다.

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저자 박사 B. 엘렌 Scanley 그녀의 기술 교육에 대 한 감사 하 고 사용 하 여 도움말에서 가장 코네티컷 주립 대학 및 대학 (CSCU) 센터에 나노기술 및 박사 크레이지 Mukerji 웨슬리언 대학에서 그녀의 CD에 대 한 접근 하 고 싶습니다. 분 광 광도 계입니다. 페어필드 대학, NASA 코네티컷 공간 그랜트 협회에서 과학 연구소 및 국립 과학 재단 그랜트 수 체-1624774에서 보고 작업 부분에 지원 한다.

1. 합성 및 1, 2-Dithiolane의 정화 수정 펩 티 드
<ol><li>Dithiolane 선구자, 3-(acetylthio)-2의 합성-(acetylthiomethyl) propanoic 산19.
	<ol>
<li>3의 1 g 추가-브로 모-2-(bromomethyl) 프로 산 (1 equiv.) 최소한의 55 ° c.에 감동과 25 mL 둥근 바닥 반응 플라스 크를 1 M NaOH (약 4 mL)에 녹 격 막으로 반응 플라스 크를 밀봉 하 고 질소 분위기에서 장소.</li>
		<li>칼륨 thioacetate의 1.49 g를 포함 하는 솔루션을 준비 (3.2 equiv.) 4 ml 이온된 수의 및 2 M 황산의 3 mL (H2등4) 만드는 thioacetic 산 현장에.</li>
		<li>플라스틱 일회용 10 mL 주사기로 thioacetic 산 성 솔루션을 당겨 하 고 주사기에 바늘을 놓습니다. 추가 혼합물 dropwise 반응 플라스 크에는 septa 통해 바늘과 피어 싱으로. 55 ° c.에 반응을 밤새 계속</li>
		<li>메탄올과 dichloromethane (1:9)의 혼합물을 사용 하 여 실리 카 젤 60 F254 접시에 얇은 층 크로마토그래피 (TLC)에 의해 반응을 모니터링 합니다. Bromocresol 녹색 얼룩에 의해 반응 진행을 시각화. 제품에는 Rf = 0.57.</li>
		<li>반응이 완전 하 고 실내 온도에 냉각 후 시 어 지 다 pH 1 2 M H2에 혼합 그래서4. 노란 기름 솔루션에서 분리합니다.</li>
		<li>감기 클로 프롬 (40 mL x 3)와 함께 제품을 압축을 풉니다. 유기 레이어를 결합 하 고 황산 마그네슘에 건조. 감소 된 압력 하에서 클로 프롬을 제거 합니다.</li>
		<li>그림 1B 와 C에서 같이 핵 자기 공명 (NMR) 분광학에 의해 절연된 제품, 1의 id를 확인 합니다. 다음과 같은 결과: 1H NMR, CDCl3, 300 MHz: d = 10.1 (b, 1 시간), 3.2 (m, 4 시간), (m, 1 시간) 2.9, 2.4 (s, 6 H); 13 C NMR, CDCl3, 75 MHz: d 195.1 (채널3C운영 체제-) = 177.6 (-C우), 45.1 (-CH2S-), 30.5 (CH), 29.2 (-SCOCH3). 참고: 제품 노란색 오일 이며, 83%의 전반적인 수확량을 있다. 더 정화 없이 제품을 사용 합니다.</li>
	</ol></li>
	<li>SPPS과 Dithiolane 전조의 수 지에 결합 참고: 아래 설명 된 단단한 단계 펩 티 드 합성 자동된 펩타이드 합성기, 권장된 제조업체의 프로토콜 다음에 실시 됐다. 특수 아미노산을 사용 하는 경우 설정 및 시 약 또는 다른 상업적인 악기에 대 한 적응 수 있습니다.<ol>
<li>그리고 링크 아 미드 4-methylbenzhydrylamine (MBHA) 수 지 (0.1 m m o l)의 0.156 g 밖으로 무게는 반응 용기에. 합성의 시작 이전에 적어도 15 분 동안 dimethylformamide (DMF)에서 수 지를 팽창.</li>
		<li>4 해당 각 fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc)의 밖으로 무게 순서에 0.152 g의 아미노산 (0.4 mmol) 보호 N, N, N', N'-tetramethyl-O-(1H-benotriazol-1-yl) 우라늄 hexafluorophosphate (0.4 mmol, HBTU)에 대 한 시퀀스에 있는 각 아미노산의 산. 각 카트리지는 보호 Fmoc 아미노산 및 HBTU 포함 되어 있습니다.</li>
		<li>모든 사전 합성 신디사이저에 대 한 검사를 실행 한 후 (리필 시 약, 시 약 라인 플러시 및 가압 모든 시 약 병), c에서 회전 목마에 아미노산 카트리지를 놓고 ' n ' 종점 방향. 마지막 N 맨끝 Fmoc deprotection 단계에 대 한 최종 아미노산 위치 후 빈 카트리지를 놓습니다.</li>
		<li>표준 권장된 설정을 사용 하 여 펩 티 드를 음성 합성.<ol>
<li>DMF (5 분 x 2)에서 20 %piperidine 5 mL와 수 지에서 Fmoc 그룹 deprotect</li>
			<li>커플링 단계 전에 DMF (6 x 5 mL)와 수 지를 세척.</li>
			<li>단일 결합 단계에 대 한 보호 Fmoc 아미노산을 HBTU 사용 DMF에 0.4 M N-methylmorpholine의 4 mL을 추가 합니다. 30 아미노산 Fmoc 보호 솔루션 활성화 솔루션 반응 배를 전송 하기 전에 s. 참고: 자동된 펩타이드 합성기는 수 지와 혼합 솔루션 버블링 N2 가스에 의해 모든 30의 커플링 반응 하면서 20 분 걸립니다 장소. 수동 펩 티 드 합성에 대 한 연결 단계 동안 낮은 속도로 궤도 셰이 커에 반응 배를 놓습니다.</li>
			<li>솔루션 배수와 DMF (3 x 5 mL)와 수 지를 세척.</li>
			<li>1.2.4.1 1.2.4.4 통해 단계를 반복 하 여 C에서 각 보호 Fmoc 아미노산에 대 한 ' n '-관심의 펩 티 드를 합성 하 종점 방향.</li>
		</ol>
</li>
		<li>마지막 N 맨끝 deprotection 단계 후 일회용 fritted 주사기에 수 지를 전송 합니다. DMF (3 x 5 mL)와 dichloromethane (DCM, 3 x 5 mL) 수 지를 세척. 참고: 수 지 DCM 진공 desiccator 세척 후 저장할 수 있습니다. 수 지 커플링 이전 저장 된 경우 커플링 반응 전에 DMF에 수 지를 확인 합니다.</li>
		<li>N, N-diisopropylethylamine (DIPEA)의 HBTU의 4 등가물와 10 1, DMF의 5 mL의 4 항목을 추가 하 여 dithiolane 전조 (1)-수 지 펩 티 드의 N-말단에 결합. 미리 fritted 주사기를 포함 하는 수 지를 추가 하기 전에 10 분 동안 커플링 혼합물을 활성화 합니다.</li>
		<li>흔들어 2 h에 대 한 커플링 반응. 2 시간 후 DMF (3 x 5 mL)와 수 지를 세척 하 고 하룻밤 떨고와 커플링 반응 반복 합니다.</li>
		<li>두 번째 연결 후 DCM (3 x 5 mL)와 DMF (3 x 5 mL) 수 지를 세척. 참고: 수 지 저장할 수 있습니다 진공에서이 시점에서 분열까지.</li>
	</ol></li>
	<li>Thioacetate Deprotection 및 수 지에서 펩 티 드 분열
	<ol>
<li>N-말단 dithiolane 전조에서 thioacetate 그룹 deprotect, 10 mL 전자 레인지 반응 관에 말린된 수 지를 전송를 DMF의 2 개 mL를 추가 합니다. 팽창, 선박, 작은 자석 볶음 바를 추가 하 고 다시 15 분 동안 자석 교 반 속도가 낮은 중단에 수 지를 수 있습니다.</li>
		<li>수산화 암모늄 농도의 2 개 mL를 추가, 실리콘 격 막과 반응 배 모자 고 반응 배 감동으로 45 분 75 ° C의 전자 레인지 설정을 사용 하 여 전자 레인지 반응 합니다.</li>
		<li>전자 레인지 반응 완료 후 깨끗 한 일회용 fritted 주사기에 수 지를 전송 합니다. DMF (2 x 5 mL)와 메탄올 (MeOH, 2 x 5 mL) 씻으십시오.</li>
		<li>5 mL의 전체 볼륨에 대 한 메탄올 (1:4)에 집중된 수산화 암모늄의 솔루션을 추가 합니다. Dithiolane 링에서 이황화 결합의 intramolecular 산화를 증가 하룻밤 흔들어 둡니다.</li>
		<li>워시 MeOH (2 x 5 mL)와 DCM (3 x 5 mL) 수 지. 참고: 말린된 수 지 저장할 수 있습니다 진공 desiccator에이 시점에서.</li>
		<li>부드럽게 1.5 h에 대 한 동요와 주사기를 포함 하는 수 지에 분열 칵테일을 추가 합니다. 사용 분열 칵테일 95 %trifluoroacetic 산 (TFA), 2.5 %triisopropylsilane (팁), 그리고 2.5% 물 5 mL의 총 볼륨입니다. 주의: 화학 연기 후드만 작동 합니다. TFA는 휘발성과 부식성. 참고: 시퀀스 펩 티 드와 아미노산 sidechain 보호 그룹의 대부분 위의 절단 칵테일 솔루션은 충분 한; 그러나, 다른 분열 칵테일 보호 그룹 (Arg, Trp, 메트로, Cys 포함 된 특정 펩 티 드) 또는 다른 수 지 화학20특정 아미노산 사이드 체인에 대 한 필요할 수 있습니다.</li>
		<li>Fritted 주사기에서 dropwise 추가 의해 원유 펩 티 드 25 mL 50 mL 원뿔 튜브에 차가운 diethyl 에테르로 침전. 펩 티 드 흰색 고체로 침전. 펠 릿 10 분 대 한 1300 x g에서 원심 분리 하 여 펩타이드는 신중 하 게 쓰레기 수 거에 대 한 별도 용기에 diethyl 에테르를 가만히 따르다.</li>
		<li>Diethyl 에테르의 또 다른 25 mL 원뿔 튜브를 추가 하 고 다시 침전 vortexing에 의해 일시 중단. 10 분 동안 1300 x g에서 원심 분리를 반복 하 고 다시 diethyl 에테르를 가만히 따르다. 진공에서 펠 릿 건조.</li>
	</ol></li>
	<li>1, 2-Dithiolane의 정화 수정 펩 티 드 참고: 역 상 HPLC에 의해 원유 펩 티 드를 정화. 수집 및 결합 하는 펩 티 드 봉우리 고 TOF MALDI 질량 분석에 의해 질량을 확인 합니다.<ol>
<li>최소한의 양의 0.1% 이기에 원유 펩 티 드 펠 릿 분해 TFA. 펩 티 드의 hydrophobicity 및 집계 성향, 가용성에 원조를 40 ° C에서 샘플을 열 부드럽게. 참고: 잠재적인 이황화 교환 반응21,,2223을 방지 하기 위해 높은 온도 및 펩 티 드의 쥡니다 피하십시오.</li>
		<li>원유 펩 티 드의 1 mL HPLC 정화를 준비 하려면 추가할 집중된 펩 티 드의 400 μ 이기에 H2O 0.1 %TFA 필터의 600 μ 22 μ m 주사기 필터를 통해 HPLC 유리병에. 추가 5% 소 프로 파 놀 펩타이드 집계 및 강 수를 방지 하기 위해 추가할 수 있습니다.</li>
		<li>정화 C-18 반 대리점 열을 사용 하 여 20 분 세트 15-55% 이기의 선형 그라데이션을 통해 3 mL/min의 유량과 펩 티 드 222에 UV 검출기 (아 미드 백본) 및 330 nm (이황화 결합). 수집 하 고 (그림 2A)의 봉우리를 결합.</li>
		<li>MALDI TOF 질량 분석기 reflectron 모드 (그림 2B)에 의해 펩 티 드 제품 질량을 확인 합니다. 분석, 2, 5-dihydroxybenzoic 산 (DHB) 매트릭스의 0.5 μ MALDI 격판덮개에 수집 된 피크의 0.5 μ 혼합 (10 mg/mL DHB 50% 이기, 0.1 %TFA). 참고: 일반적인 adducts MALDI TOF에서 질량 분석 포함 나트륨 및 칼륨 소금 adduct ([M + 나]+ [M + k]+) 봉우리. 권장 분석 전에 샘플 담 소금 adduct 봉우리 주요 [M + H]+ 의 신호를 억제. 또한, [M + O]+ 의 산화 피크 감지 1, 2-dithiolane 수정 펩 티 드에. DHB 매트릭스를 사용 하 여 MALDI 이온화에서 레이저 유도 된 산화에 대 한 보고서 샘플 농도, 용 매, 및 레이저 강도 포함 하 여 요인 제한 MALDI 유발 산화 유물24수정할 수 있습니다 제안 합니다.</li>
		<li>정확한 질량의 MALDI TOF 확인, 후 플래시 동결 후 펩 티 드를 lyophilize. 어셈블리까지 진공에서 동결 건조 된 펩 티 드 분말을 유지.</li>
	</ol></li>
</ol>2. 특성화 Supramolecular의 자기 조립 구조
<ol><li>
녹말 체 섬유의 형성
	<ol>
<li>자기 집합 솔루션을 준비 하려면 분석 균형을 사용 하 여 펩 티 드 분말의 1 밀리 그램으로 무게. 20% 이기와 10 mM (4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic 산 (HEPES) 1 mg/mL의 펩 티 드 어셈블리 혼합물의 최종 농도에 1.5 mL microcentrifuge 튜브 혼합 (pH 7.5)로. 소용돌이 어셈블리 솔루션 고 떠나 실 온에서 조립.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
녹말 체 섬유의 분 광 특성
	<ol>
<li>며칠 마다 퓨 리에 변환 적외선 (FTIR) 분광학을 통해 펩 티 드 어셈블리 프로세스를 따릅니다. 1670 c m-1 을 중심으로 광범위 한 피크 샘플17unassembled 펩 티 드에서 발생 하는 IR 서명입니다. 펩 티 드 어셈블리 샘플은 보통 1 ~ 2 주 사라지고 성숙에 도달 하는 광범위 한 unassembled 피크에 대 한 가져가 라.<ol>
<li>ATR 다이아몬드 크리스탈에 박막으로 어셈블리 솔루션의 8-10 μ의 약 수를 건조. 드라이 필름 양식으로 1640에서 1630 cm-1 에 크고 넓은 물 피크의 실종을 모니터링 합니다.</li>
			<li>2 cm-1 해상도 50 검사 평균 1500-1800 c m-1 에서 IR 스펙트럼을 취득 합니다. 취득 하 고 각 샘플 스캔 이전 배경 검사를 뺍니다. Β-시트 어셈블리에 대 한 IR 서명을 1625 및 1635 c m-1 (그림 3A)25,26사이 예리한 피크입니다.</li>
		</ol>
</li>
		<li>원형이 색 성 (CD)에 의해 β 시트 풍부한 supramolecular 구조로 펩 티 드 어셈블리를 특징. Peltier 온도 조절 시스템 CD spectropolarimeter를 사용 하 여 스펙트럼을 기록 합니다.<ol>
<li>30 μ를 0.1 m m 경로 길이 microcuvette에서 어셈블리 솔루션의 플라스틱 참고: 셀 홀더 클램프 및 악기의 짧은 경로 길이 셀 위치에 필요 합니다.</li>
			<li>각 스펙트럼에 대 한 다음 매개 변수를 CD 악기 설정: 스캔 300의 파장 180 nm, 100/min의 스캐닝 비율, 밴드 너비 1 nm, 25 ° C, 평균 3 검사의 nm.</li>
			<li>버퍼 (20% 이기/10 mM HEPES, pH 7.5)의 스펙트럼을 수집 하 고 각 샘플 스캔 컨트롤에서 뺍니다. Β-시트의 CD 서명을 한 타원 최소 중심 약 220 nm (그림 3B)27이다.</li>
		</ol>
</li>
	</ol>
</li>
	<li>
녹말 체 섬유의 현미경 검사 법
	<ol>
<li>Β-시트 풍부한 supramolecular 구조로 성숙 펩 티 드 샘플에 대 한 2 ~ 3 주가 소요 됩니다. 참고: 어셈블리 수 수 몇 군데 뿐만 아니라 어셈블리 프로세스의 이전 단계에서 전송 전자 현미경 (TEM)을 사용 하 여.<ol>
<li>10 μ 가장 탄소 격자의 표면에 펩 티 드 어셈블리 솔루션의 플라스틱 참고:을 격자 표면에 피 펫 팁을 건드리지 않도록 주의 합니다. 높은 정밀도, 자동 닫기 핀셋 준비 도중 가장 그리드를 개최 하는 데 사용 됩니다.</li>
			<li>어셈블리 격자 표면에 흡착 수 있도록 1-2 분 기다립니다. 격자의 가장자리에 필터 종이 만져 초과 샘플을 제거 합니다.</li>
			<li>이온을 제거 된 물 100 μ 상용 4 %uranyl 아세테이트 솔루션에 추가 하 여 2 %uranyl 아세테이트 얼룩을 준비 합니다. 플라스틱 격자 표면에 2 %uranyl 아세테이트 얼룩의 10 μ 그리고 2-3 분 동안 품 어. 부 화 후는 격자의 가장자리에 필터 종이 만져 초과 얼룩을 제거 합니다.</li>
			<li>밤새 진공 desiccator에 가장 격자 배치 합니다. 진공에서 영상까지 저장 합니다.</li>
			<li>가장 (그림 3C)와 함께 준비 된 샘플 이미지. 현미경 검사 법에 대 한 일반 매개 변수는 다음과 같습니다: 9300 X에서에서 23 일 까지의 배율에서 이미지 000 X, 텅스텐 필 라 멘 트 120의 가속 전압 kV. 참고: ImageJ supramolecular 구조의 획득된 가장 이미지28의 평균 섬유 폭을 측정 하는 사용할 수 있습니다. 주의: 사용 하기 전에 모든 관련 안전 데이터 시트 (SDS)를 참조 하십시오. 여러 화학 물질 합성, 정화, 사용 그리고 설명된 1, 2-dithiolane의 수정 자가 조립 펩 티 드의 부식성 또는 독성 화학 증기 두건에서 사용 해야 합니다. 항상 적절 한 개인 보호 장비 (안전 안경, 연구실 코트, 전체 길이 바지, 폐쇄 발가락 신발 포함)를 사용 하 여 실험실에서 작업 하는 경우.</li>
		</ol>
</li>
	</ol>
</li>
</ol>

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저자는 공개 없다.

이 문서는 모두 종합의 세부 사항 및 N 맨끝 1, 2-dithiolane 수정 자가 조립 펩타이드의 정화와 결과 supramolecular 구조의 특성을 설명합니다. 여기에서 보고 된 1, 2-dithiolane 펩타이드의 합성 장점이, dithiolane 선구자, 3-(acetylthio)-2 생산 하기 위해 한 단계 합성을 포함 하 여-(acetylthiomethyl) propanoic 산, 고 수 지에의 deprotection 반응 전자 레인지는 히드라 진 독성 deprotection 안전한 대안 보고 이전29수산화 암모늄을 이용 하 여 산화 1, 2-dithiolane moiety를 그룹을 보호 하는 선구자 thioacetate. (그림 1A) 1, 2 dithiolane 펩 티 드의 전반적인 단단한 단계 펩 티 드 합성 시퀀스 길이 및 구성, Fmoc 보호 부자연 스러운 아미노산, 및 C 터미널 수 지 화학에 맞게 사용 하...

단단한 단계 펩 티 드 합성에 참여 하는 강력한 펩 티 드 결합 형성 화학 고 제어 시퀀스 길이 구성 능력 자체는 무 겁 게 연구 분야 supramolecular 구조로 조립 펩 티 드. 펩타이드 자기 조립된 구조, 입체 사이드 체인을 포함 하 여 있고 정전기 상호 작용, 수소 결합, 소수 성 효과1, 안정화 및 제어 하는 요소는 디자인 규칙의 집합으로 제공 합니다. 이러한 기본적인 디자인 규칙에 대 한 연구 진행을 계속, 펩 티 드에 논리적인 다음 단계 자기 조립 포함 한다 펩 티 드 기반 구조와 기능의 다양성을 확대. 펩 티 드를 자체 조립 하는 동안은 많은 생물 의학 응용 프로그램에 대 한 펩 티 드 순서 또는 어셈블리 조건2,3,4, 개발 전략을 조정 하 여 사용 된 다양 한 소재 펩 티 드 nanofibers5,6,7,,89 조립 후 수정 상대적으로 미개척된 지역에 남아 있다.
Supramolecular 구조의 표면에 동적 이황화 exchange thiol 화학 잠재력이 새로운 고 기능성 바이오 소재를 하나의 영역입니다. Liposome 시스템10,11, 블록 공중 합체12,13에서 것과 같이 1, 2 dithiolane moieties (일반적으로 리 포 산 (la) 또는 asparagusic 산 (aa)의 파생)의 보고 표면14,15에서 앵커를 조직. 여기, 우리 보고 합성과 자기 조립 펩 티 드에는 N-1, 2-dithiolane 기능 그룹16, 수정 된 Alzheimer의 질병과 관련 된 Aβ 펩 티 드의 nucleating 코어에서 파생 된의 17. 결과 supramolecular 섬유는 지금 녹말 체 섬유18supramolecular 표면에 이황화 교환 및 thiol 반응성 연구 실험 플랫폼 역할을 합니다.

<table><tbody><tr><td>링크 아미드 MBHA 수지, 고부하</td><td>Gyros Protein Technologies</td><td>RAM-5-HL</td><td>피부 및 눈과의 접촉을 피하십시오.</td></tr><tr><td>N, N-Dimethylformamide</td><td>Fisher Scientific</td><td>D119-4</td><td>가연성 액체 및 증기를 흡입하지 마십시오. 눈과 피부에 자극적; 개인 보호 장비를 사용하십시오. 화염으로부터 멀리 두십시오</td></tr>. <tr><td>Fmoc-L-Val-OH</td><td>Gyros Protein Technologies</td><td>FLA-25-V</td>는 <td>개인 보호 장비를 착용하십시오; 흡입하지 마십시오</td></tr>. <tr><td>Fmoc-L-Leu-OH</td><td>Gyros Protein Technologies</td><td>FLA-25-L</td>은 <td>개인 보호 장비를 착용하십시오;</td></tr><tr><td>Fmoc-L-Lys(Boc)-OH</td><td>Gyros Protein Technologies</td><td>FLA-25-KBC</td>를 흡입하지 마십시오. <td>개인 보호 장비를 착용하십시오; 흡입하지 마십시오.</td></tr><tr><td>Fmoc-L-Phe-OH</td><td>Gyros Protein Technologies</td><td>FLA-25-F</td><td>개인 보호 장비를 착용하십시오;</td></tr><tr><td>Fmoc-L-Ala-OH</td><td>Gyros Protein Technologies</td><td>FLA-25-A</td>를 흡입하지 마십시오. <td>개인 보호 장비를 착용하십시오;</td></tr><tr><td>Fmoc-L-Gln(Trt)-OH</td><td>Gyros Protein Technologies</td><td>FLA-25-QT</td>를 흡입하지 마십시오. <td>개인 보호 장비를 착용하십시오; 흡입하지 마십시오.</td></tr><tr><td>N, N, N &prime; , N &prime; - 테트라 메틸 -O- (1H- 벤조 트리아졸 -1- 일) 우로늄 헥사 플루오로 포스페이</td>트 <td>자이로 단백질 기술</td><td>26432</td><td>피부, 눈 및 호흡기 자극을 일으키는 원인; 흡입하지 마십시오; 후드 아래 또는 통풍이 잘되는 곳에서 사용</td></tr><tr>DMF <td>Gyros Protein Technologies</td><td>PS3-MM-L</td><td>의 0.4 M N- 메틸 모르 폴린</td><td>가연성이 높은; 개인 보호 장비를 착용하십시오. 열을 피하고 용기를 단단히 닫아 두십시오. 흡입하거나 삼키지 마십시오. </td></tr><tr>DMF <td>Gyros Protein Technologies</td><td>PS3-PPR-L</td><td>에서 20% 피페리딘을</td> 취급한 후 피부를 철저히 씻으십시오<td>. 심한 눈과 피부 화상을 유발합니다. 가연성 액체 및 증기; </td></tr><tr><td>디클로로 메탄</td>을 흡입하지 마십시오 <td>Fisher Scientific</td><td>D37-4</td><td>암을 유발할 수 있습니다. 흡입하지 마십시오. 개인 보호 장비를 착용하십시오. 후드 아래에서만 사용하십시오. 접촉한 경우 최소 15분 동안 물로 상승하여 의사의 진료를 받으십시오</td></tr><tr><td>아세토니트릴</td><td>Fisher Scientific</td><td>A998-4</td><td>가연성; 눈에 자극적임; 개인 보호 장비를 사용하십시오. 흄 후드 아래에서만 사용하십시오. 화염이나 뜨거운 표면에서 멀리 보관하십시오. 접촉한 경우에 적어도 15 분 동안 물로 헹구고 의사의 진료를 받으십시오</td></tr><tr><td>trifluoroacetic 산</td><td>피셔 사이언티픽</td><td>A116-50</td><td>심한 화상을 일으키는 원인이 되; 흡입하지 마십시오; 수생 생물에 해롭습니다; 개인 보호 장비를 사용하십시오; 흄 후드 아래에서만 사용하십시오; 접촉한 경우 적어도 15분 동안 물로 헹구고 즉시 치료를 받으십시오</td></tr><tr><td>4% 우라닐 아세테이트</td><td>전자 현미경 과학</td><td>22400-4</td><td>흡입하지 마십시오. 수생 생물에 해로운</td></tr><tr><td>4-(2-Hydroxyethyl)piperazine-1-ethanesulfonic acid</td><td>Acros Organics</td><td>AC172571000</td><td>흡입하지 마십시오; 실외나 환기가 잘 되는 곳에서 사용하십시오</td></tr>. <tr><td>질소 가스</td><td>TechAir</td><td></td><td>압력이 가해지면 내용물이 폭발할 수 있습니다. 가열하면 폭발할 수 있습니다</td></tr>. <tr><td>3-bromo-2-(bromomethyl)propionic acid</td><td>Alfa Aesar</td><td>AAA1963014</td><td>흡입하지 마십시오; 피부와 눈에 자극을 일으키며; 부식성</td></tr><tr><td>수산화나트륨</td><td>Fisher Scientific</td><td>S318-100</td><td>개인 보호 장비를 사용하십시오; 오직 흄 후드 아래에서만 사용하십시오; 만약 접촉하면 적어도 15분 동안 헹구고 치료를 받으십시오</td></tr>. <tr><td>티오아세트산 칼륨</td><td>Acros</td><td>Organics AC221300250</td><td>피부와 눈에 자극을 일으키며; 흡입하지 마십시오; 개인 보호 장비를 사용하십시오</td></tr><tr>.<td>황산</td><td>Fisher Scientific</td><td>SA213</td><td>화상을 일으킵니다. 물에서 멀리 유지하십시오. 가연성 물질로부터 멀리하십시오. 흡입하지 마십시오. 개인 보호 장비를 사용하십시오. 접촉하는 경우 적어도 15 분 동안 헹구고 의사의 진료를 받으십시오</td></tr><tr><td>chloroform-d</td><td>Acros Organics</td><td>AC320690075</td><td>가능한 암 위험; 피부와 눈을 자극; 흡입하지 마십시오; 개인 보호 장비를 사용하십시오. 흄 후드 아래에서만 사용하십시오. 접촉하는 경우 최소 15 분 동안 헹굼 부위를 헹구고 의사의 진료를 받으십시오</td></tr><tr><td>클로로포름</td><td>Fisher Scientific</td><td>C298-4</td><td>가능한 암 위험; 피부와 눈을 자극; 흡입하지 마십시오. 개인 보호 장비를 사용하십시오. 흄 후드 아래에서만 사용하십시오. 적어도 15분 동안 헹굼 부위에 접촉하고 의사의 주의를 끌 경우</td></tr><tr><td>N,N-디이소프로필에틸아민</td><td>아크로스 유기물</td><td>AC367841000</td><td>고인화성; 수생 생물에 해롭습니다; 개인 보호 장비를 착용하십시오;</td></tr><tr><td>수산화 암모늄</td>을 삼키지 마십시오 <td>Fisher Scientific</td><td>A669S-500</td><td>부식성;</td></tr><tr><td>메탄올</td>을 흡입하지 마십시오 <td>Fisher Scientific</td><td>A452-4</td><td>가연성 액체 및 증기; 개인 보호 장비를 사용하십시오. 흡입하지 마십시오. 적어도 15 분 동안 헹굼 부위를 접촉하고 의사의 진료를 받으십시오</td></tr><tr><td>트리 이소 프로필 실란</td><td>시그마 알드리치</td><td>233781</td><td>가연성; 개인 proctective 안전 장비를 사용하십시오. 용기를 단단히 닫아 두십시오</td></tr><tr><td>디 에틸 에테르</td><td>피셔 과학</td><td>E138-1</td><td>매우 가연성; 피부와 눈에 자극적임; 개인 보호 장비 사용</td></tr><tr><td>2,5-dihydroxybenzoic acid</td><td>Sigma Aldrich</td><td>39319-10x10MG-F</td><td>는 흡입하지 마십시오.피부와 눈을 자극</td></tr><tr><td>알파 시아 노 -4- 하이드 록시 신남산 알파 시아 노 -4- 하이드 록시 신남산 알파</td><td>시아</td><td>AAJ67635EXK</td><td></td></tr><tr><td>c18 지퍼 팁</td><td>Millipore</td><td>ZTC18S096</td><td></td></tr><tr><td>tris (2- 카르 복시 에틸) 포스핀 하이드로 클로</td>라이드 <td>Thermo Scientific</td><td>PI20490</td><td></td></tr><tr><td>실리카겔 60 F254 코팅 알루미늄 백업 TLC 시트</td><td>EMD Millipore</td><td>1.05549.0001</td><td></td></tr><tr><td>얇은 벽 정밀 NMR 튜브</td><td>Bel-Art</td><td>663000585</td><td>5mm O.D.</td></tr><tr><td>모든 플라스틱 Norm-Ject 주사기</td><td>Air Tite</td><td>AL10</td><td></td></tr><tr><td>일회용 바늘</td><td>BD PrecisionGlide</td><td>BD 305185</td><td>사용한 바늘은 날카로운 물건에 폐기됩니다 쓰레기통</td></tr><tr><td>일회용 프릿 주사기 Torviq</td><td></td><td>SF1000LL</td><td>10mL 프릿 주사기가 보고서에 사용되었지만 대규모 합성에 필요한 경우 더 큰 주사기를 사용할 수 있습니다.</td></tr><tr><td>탄소 그리드</td><td>테드 펠라, Inc.</td><td>CF200-CU</td> 그리드 자동 폐쇄 핀셋<td>의 반짝이는 구리 쪽이 아닌 탄소 그리드 쪽에서 샘플과 염색을 준비하십시오</td></tr><tr><td></td><td>전자 현미경 과학</td><td>78318-3X</td><td>매우 날카로운 팁, 길이: 120mm</td></tr><tr><td>0.1mm 짧은 경로 길이 셀</td><td>Starna Cells, Inc.</td><td>20/C-Q-0.1</td><td>깨지기 쉬운</td></tr><tr><td>10mL 용기 캡</td><td>CEM</td><td>909210</td><td></td></tr><tr><td>10mL 압력 용기</td><td>CEM</td><td>908035</td><td></td></tr><tr><td>Aeris Semi-Prep HPLC 컬럼</td><td>Phenomenex</td><td>00F-4632-N0</td><td>150 x 10mm</td></tr><tr><td>셀 홀더</td><td>Starna Cells, Inc.</td><td>CH-2049</td><td>짧은 경로 길이 세포를 사용할 때 필요</td></tr>, <tr><td>PS3 펩타이드 합성기</td><td>, Gyros Protein Technologies</td><td></td><td></td></tr>, <tr><td>DiscoverSP 마이크로파 반응기</td>, <td>CEM</td><td></td><td></td></tr><tr><td>원심 분리기</td>, <td>HERMLE</td><td>Z 206 A</td><td>, 고정 6x50 mL 로터를 사용,</td></tr><tr><td>HPLC</td>, <td>Shimadzu</td><td></td>, <td>UV 검출기</td></tr>, <tr><td>핵 자기 공명 분광계</td>, <td>Avance, Bruker</td><td></td><td>300MHz</td></tr><tr><td>MALDI-TOF 질량 분석기</td><td>Axima Confidence, Shimadzu</td><td></td><td></td></tr><tr><td>동결 건조기</td><td>Millrock Technology</td><td>BT85A</td><td></td></tr><tr><td>푸리에 변환 적외선 분광계</td><td>알파 텐서, Bruker</td><td></td><td></td></tr><tr><td>전송 전자 현미경</td><td>Tecnai Spirit, FEI</td><td></td><td>Gatan Orius 광섬유 CCD 디지털 카메라와 함께 사용됩니다. CSCU Center for Nanotechnology</td></tr><tr><td>Circular Dichroism Spectropolarimeter</td><td>J-810, JASCO</td><td></td>에서 액세스 6<td>셀 펠티에 온도 컨트롤러와 함께 사용됩니다. Wesleyan University에서 액세스할 수 있습니다.</td></tr></tbody></table>

합성 및 특성 1, 2-dithiolane의 수정 자가 조립 펩 티 드

Synthesis and Characterization of 1,2-Dithiolane Modified Self-Assembling Peptides

이 보고서는 N-터미널 1, 2-dithiolane의 합성에 초점을 맞추고 수정 자가 조립 펩 티 드 및 그 결과의 특성은 자기 supramolecular 구조를 조립. 합성 경로 dithiolane 선구자 분자, 3-(acetylthio)-2의 수 지에 결합 된 단단한 단계 펩 티 드 종합의 이용-(acetylthiomethyl) propanoic 산, 그리고 전자 레인지를 이용한 thioacetate는 펩 티 드의 deprotection 1, 2-dithiolane를 수 지에서 최종 분열 하기 전에 N-말단 펩 티 드를 수정. 1, 2-dithiolane 펩타이드, Alzheimer의 질병과 관련 된 Aβ 펩 티 드의 nucleating 코어에서 파생 된의 고성능 액체 크로마토그래피 (HPLC) 정화 후 펩 티 드 크로스-β 녹말 체 섬유에 조립 자체에 표시 됩니다. 푸리에 변환 적외선 분광학 (IR FT), 원형이 색 성 분광학 (CD) 및 전송 전자 현미경 (TEM) 녹말 체 섬유의 특성 프로토콜 표시 됩니다. 잘 특징이 자가 조립 펩 티 드를 1, 2 dithiolane moiety와 N 맨끝 수정 방법 지금 모델 시스템 조립 후 수정 전략을 개발 하 고에 동적 공유 화학 탐험 탐험 하실 수 있습니다. supramolecular 펩타이드 nanofiber 표면입니다.

Dithiolane 선구자 분자의 초기 단계 합성 이외에도 1, 2-dithiolane 수정 펩 티 드 종합의 나머지 고체 지원 (그림 1A)에서 발생합니다. 3의 변환-브로 모-2-(bromomethyl) 프로 산 3-(acetylthio)-2-(acetylthiomethyl) propanoic 산, dithiolane 전조 1H에 의해 확인 되 고 전에 13C NMR (그림 1B 와 C)는 자유에 결합 여전히 수 지에 펩 티 드의 N-말단 아민. 수산화 암모늄과 thiols에 thioacetate의 deprotection 전자 레인지 반응 기를 사용 하 여 수행 되 고 1, 2-dithiolane 수정 펩 티 드 수 지에서 죽 습 하기 전에 1, 2-dithiolane 메탄올에서 하룻밤 산화 ...

1, 2-dithiolane의 합성에 대 한 프로토콜 펩 티 드와 펩 티 드에서 자기 조립 결과 supramolecular 구조의 특성 수정.

합성 및 특성 1, 2-Dithiolane의 수정 자가 조립 펩 티 드

This report focuses on the synthesis of an N-terminus 1,2-dithiolane modified self-assembling peptide and the characterization of the resulting ...

초분자 구조의 기능을 증가시키는 구조가 성장함에 따라 1, 2-디티올란기를 자가 조립 펩타이드와 통합하는 이 방법은 초분자 표면의 반응성에 대한 주요 질문에 답하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 1, 2-디티올란 전구체 분자의 결합 및 탈보호가 최종 변형 펩타이드의 단일 정제 단계만으로 수지에서 발생한다는 것입니다. 어셈블리가 최종 초분자 구조로 성숙하는 데 걸리는 시간이 다양하기 때문에 초분자 어셈블리에 대한 특성화 방법과 결과를 시각적으로 시연하는 것이 중요합니다.디티올란 전구체를 합성하려면 먼저 섭씨 55도의 둥근 바닥 반응 플라스크에 약 4ml의 1몰 수산화나트륨에 3-브로모-2-프로프리온산 1g을 교반하면서 용해합니다. 모든 시약이 용액에 현탁되면 반응 플라스크를 격막으로 밀봉하고 플라스크를 질소 분위기 아래에 놓습니다. 다음으로, 1.49g의 티오 아세테이트 칼륨과 3 밀리리터의 2 몰 황산을 4 밀리리터의 탈 이온수에 첨가하여 현장에서 티오 아세트산을 생성합니다.티오 아세트산 용액을 일회용 플라스틱 10 밀리리터 주사기에 흡입하고 주사기에 18 게이지 바늘을 장착 한 다음 바늘로 격막을 뚫어 혼합물을 반응 플라스크에 적가하고 섭씨 55도에서 밤새 반응을 계속합니다. 다음날 아침, 메탄올과 디클로로메탄의 혼합물을 사용하여 실리카겔 60 F254 플레이트에서 박층 크로마토그래피로 반응을 모니터링하고 브로모크레졸 녹색 염색에 의한 반응 진행을 시각화합니다. 완료된 반응이 실온으로 냉각되면 2몰 황산과의 혼합물을 pH 1로 산성화합니다.노란색 오일은 용액에서 분리한 다음 40밀리리터의 차가운 클로로포름을 3회 첨가하여 제품을 추출하고 황산마그네슘 위에서 건조하기 위해 유기층을 결합하여 감압된 압력에서 클로로포름을 제거해야 합니다. 제품은 전체 수율이 83%인 황색 오일이어야 하며 추가 정제 없이 사용할 수 있습니다. 디티올란 전구체를 수지 펩타이드의 N-말단에 결합하려면 5밀리리터의 디메틸포름아미드에 4개의 등가물, 4개의 당량의 HBTU 및 10개의 DIPEA에 당량의 디티올란 전구체를 추가합니다.커플링 혼합물을 실온에서 10분 동안 사전 활성화시킨 후 샘플을 N-terminus-resin-contained fritted syringe에 추가합니다. 커플링 반응을 2시간 동안 흔든 다음 새 디메틸포름아미드를 5밀리리터로 3회 세척하고 커플링 반응을 반복하고 밤새 흔듭니다. 두 번째

synthesis-characterization-12-dithiolane-modified-self-assembling

Research

연구

JoVE Journal

Chemistry

화학

기본 장비 및 상용 시약과 관련된 단순하고 일반적인 수동 peptoid 합성 방법은 peptoids 쉽게 대부분의 실험실에서 합성 수있게 설명되어 있습니다. amphiphilic peptoid의 36mer의 합성, 정제 및 특성은 물론 높은 주문한 nanosheets로의 자기 조립과 같이 설명되어 있습니다.

높은 명령으로 Nanosheets에 Peptoid 폴리머 및 자기 조립의 고체 상 합성 Submonomer

이 비디오는 푸리에 변환 적외선 분광법을 사용하여 아밀로이드 펩타이드를 베타 시트가 풍부한 초분자 구조로 자체 조립하는 방법을 보여줍니다. 적외선 빔은 굴절률이 높은 결정을 통과하고 결정과 샘플의 계면을 가로지르는 에너지 흡수를 기록합니다. 샘플 단백질의 2차 구조는 적외선 스펙트럼의 특정 영역에서 특징적인 흡수 피크를 분석하여 식별되며, 이는 초분자 어셈블리의 형성을 식별하는 데 도움이 됩니다.

펩타이드 자기 조립을 연구하기 위한 푸리에 변환 적외선 분광법 기술

이 논문은 자기 조립의 자연 프로세스에 의해 주문한 높은 펩타이드 기반 구조의 형성을 설명합니다. 이 방법은 시판 펩티드 및 일반적인 실험실 장비를 이용한다. 이 기술은 펩티드의 큰 다양성에 적용 할 수 있으며, 새로운 펩티드 어셈블리의 발견으로 이어질 수있다.

짧은 펩타이드의 자기 조립에 의해 주문 생체 고분자 구조의 형성

선물이 thioether/비닐의 건설에 대 한 프로토콜 황화 닿는 헬리컬 펩 티 드 사진 유도 thiol-ene/thiol-yne hydrothiolation를 사용 하 여.

헬리컬 펩 티 드를 통해 사진 유도 Thiol-ene 또는 yne Hydrothiolation Thioether/비닐 황 화물-곁에 건설

이 프로토콜 lysine-티로신-페닐알라닌 (KYF) tripeptide로 안정 된 올레 acids-platinum(II) 공액 nanoemulsion 합성 하는 효율적인 방법을 설명 합니다. 된 KYF는 공액의 자기 조립을 통해 가벼운 합성 조건에서 nanoemulsion 양식.

올레산의 Tripeptide 안정 Nanoemulsion

정보 부호화 된 펩토이드 올리고머의 합성과 동적 공유 반응체 쌍 및 루이스 산성 희토류로 아민과 알데히드를 사용하여 분자 사다리로 이러한 펩토이드의 시퀀스 지시자가 조립하기 위한 프로토콜이 제시됩니다. 다중 역할 시약으로 금속 triflates.

정보 베어링 펩토이드의 합성과 시퀀스 지향 동적 공유자 자체 조립

이 프로토콜은 면역염색에 의한 세포 접착, 오가노이드 형태 및 유전자 발현을 위한 생체 기능성 자기 조립 펩타이드를 평가하는 것을 목표로 합니다. 우리는 결장직장암 세포주를 사용하여 집중적인 테스트를 위한 오가노이드를 얻는 비용 효율적인 방법을 제공할 것입니다.

초단파 자기조립 펩타이드 매트릭스에서 SW1222 세포주의 대장암 오가노이드 제조 및 특성화

이 프로토콜은 환경 조건을 사용하여 펩타이드가 하이드로겔로 자가 조립되도록 하는 세 가지 빠르고 간단한 준비 방법을 제시합니다. 또한 펩타이드 하이드로겔의 특성 분석이 설명되어 이러한 간단한 조건에서 기계적으로 안정적인 펩타이드 하이드로겔을 형성할 수 있음을 보여줍니다.

기계적으로 안정적인 자체 조립 펩타이드 하이드로겔의 제조

펩타이드 차 아미드 (학부모 교사 협의회)를 포함하지만, 펩티드, peptoids 및 N-메틸화 펩티드에 국한되지 않습니다 펩티 도미 메틱의 슈퍼 패밀리입니다. 여기에서 우리는 학부모 교사 협의회의 한 구슬 한 화합물 라이브러리를 합성하는 분할과 풀과 하위 단량체 전략을 결합 합성 방법을 설명합니다.

분할 및 풀 합성 펩타이드 급 아미드 도서관의 특성

여기에 설명 된 프로토콜은 수정 된 뉴 클레오 사이드 트리 포스페이트로 이어지는 복잡한 경로의 방법으로 다양한 장애물을 설명하고 요약하다하는 것을 목표로하고있다. 따라서,이 프로토콜은 이러한 활성화 된 빌딩 블록의 합성과 실제 응용 프로그램의 가용성 모두를 용이하게합니다.

뉴 클레오 사이드 트리 포스페이트 - 합성에서 생화학 적 특성에

학습하세요 1,2-dithiolane 변형 펩티드 합성 및 초분자 구조 특성화 방법을 레진에서 단일 정제 단계로 효율적으로 수행하는 기술을. 이 프로토콜은 초분자 화학 분야에서 표면 반응성 연구에 필수적인 자가조립 메커니즘을 이해하는 데 기여합니다.

합성 및 특성 1, 2-Dithiolane의 수정 자가 조립 펩 티 드

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