ويرد وصف لطريقة متوازية للغاية لقياس الانقسام الموقع محددة من الحمض النووي في مستوى جزيء واحد. يوضح هذا البروتوكول الأسلوب باستخدام NdeI قيد endonuclease. يمكن بسهولة تعديل هذه الطريقة لدراسة أي عملية تؤدي إلى شق الحمض النووي في الموقع.