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BIFC-FRET-FLIM 분석체에 의한 MADS 박스 전사 계수의 두 단백제와 칼슘 센서 단백질 간의 삼자 상호 작...
BIFC-FRET-FLIM 분석체에 의한 MADS 박스 전사 계수의 두 단백제와 칼슘 센서 단백질 간의 삼자 상호 작...
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Biology
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JoVE Journal Biology
Determination of Tripartite Interaction between Two Monomers of a MADS-box Transcription Factor and a Calcium Sensor Protein by BiFC-FRET-FLIM Assay

BIFC-FRET-FLIM 분석체에 의한 MADS 박스 전사 계수의 두 단백제와 칼슘 센서 단백질 간의 삼자 상호 작용 결정

Full Text
4,260 Views
14:34 min
December 25, 2021

DOI: 10.3791/62791-v

Neelima Boora*1, Vibha Verma*1, Ridhi Khurana1, Gautam Gawande1, Sanchi Bhimrajka1, Komal Chaprana1, Meenu Kapoor2, Sanjay Kapoor1

1Interdisciplinary Centre for Plant Genomics, Department of Plant Molecular Biology,University of Delhi South Campus, 2University School of Biotechnology,Guru Gobind Singh Indraprastha University

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a novel method to visualize ternary complex formation between three proteins using bimolecular fluorescence complementation (BiFC) combined with fluorescence resonance energy transfer (FRET) and fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM). The approach allows for the observation of protein-protein interactions within live cells, enhancing our understanding of complex biological processes.

Key Study Components

Research Area

  • Protein-protein interactions
  • Fluorescent imaging technologies
  • Cell biology

Background

  • Understanding protein interactions is crucial for studying various biological functions.
  • This method builds on previous work utilizing BiFC for examining protein complexes.
  • The addition of FLIM provides a more detailed analysis of interactions.

Methods Used

  • BiFC-FRET-FLIM assay for visualizing protein interactions
  • Nicotiana benthamiana as the biological model system
  • Fluorescence lifetime measurements to assess interactions

Main Results

  • Successful demonstration of tripartite interactions between selected proteins.
  • Visualization of reconstituted YFP and its application in FRET analysis.
  • Quantification of interaction through changes in fluorescence lifetime.

Conclusions

  • The study effectively illustrates the use of BiFC-FRET-FLIM for examining complex protein interactions.
  • This method is significant for advancing research in molecular biology and protein signaling pathways.

Frequently Asked Questions

What is the significance of using BiFC with FRET-FLIM?
This combination allows researchers to visualize complex protein interactions and quantify them in vivo, improving our understanding of cell signaling.
Which organism was used in this study?
The study utilized Nicotiana benthamiana, a common model in plant molecular biology.
What are the critical steps in carrying out the method?
Key steps include cloning genes of interest, transforming agrobacteria, and performing agroinfiltration into plant tissues.
How does the method validate the tripartite interactions?
The method validates interactions by measuring the fluorescence lifetime changes of the donor molecule in the presence of acceptors.
What potential applications does this method have?
This method can be applied to study various protein interactions, signaling pathways, and cellular processes in live cells.
How long does it take to prepare plants for the analysis?
Plant preparation takes several weeks, including germination and growth stages before agroinfiltration can occur.
Is this method applicable to organisms other than plants?
While this study focuses on plants, similar techniques can be adapted for use in other model organisms.

여기서 우리는 BiFC 기반 FRET-FLIM 분석법에 의한 형광 태그 단백질을 사용하여 3개의 단백질 파트너 간의 삼차 복합 형성을 시각화하는 방법을 제시합니다. 이 방법은 생체 내에서단백질 단백질 상호 작용 복합체를 연구하는 데 유용합니다.

단백질 단백질 상호 작용의 연구 결과는 많은 생물학 프로세스의 규칙의 이해를 제공합니다. 여기서 우리는 Y 존 신발 및 공동에 의해 초기 설명 절차를 보여줍니다. 2007년 저자들이 FRET와 함께 BiFC를 사용하여 3개의 단백질 분자 간의 삼자 상호 작용을 검증한 근로자.

그러나 FRET 측정을 입증하기 위해 이 절차에형형수명 측정을 포함시켰습니다. 삼자 상호 작용을 보여주기 위해, 우리는 단백질을 선택했습니다, 이는 호모메로 알려져 있습니다. 더욱이, 그것은 또한 이 프로토콜에 있는 C 단백질이라고 칭한 단백질의 칼슘 센서와 상호 작용하기 위하여 사내에서 검증되었습니다.

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