Name: 약물 치료 후 간세포암 오르가노이드의 생성 및 단세포 전사체 분석 (동영상) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-05-26T13:25:00.000+00:00
Duration: 8 min 18 s
Description: 학습하세요 간세포암 오르가노이드 생성 및 약물 처리 후 단세포 RNA 시퀀싱을 통한 전사체 변화 분석 방법을. 이 프로토콜은 항암제 반응 연구에 필수적인 도구입니다.

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	<li>Villanueva, A. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hepatocellular+carcinoma.">Hepatocellular carcinoma.</a> N Engl J Med. 380 (15), 1450-1462 (2019).</li><li>Bray, F., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Global+cancer+statistics+2018:+GLOBOCAN+estimates+of+incidence+and+mortality+worldwide+for+36+cancers+in+185+countries.">Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries.</a> CA Cancer J Clin. 68 (6), 394-424 (2018).</li><li>Sung, H., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Global+cancer+statistics+2020:+GLOBOCAN+estimates+of+incidence+and+mortality+worldwide+for+36+cancers+in+185+countries.">Global cancer statistics 2020: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries.</a> CA Cancer J Clin. 71 (3), 209-249 (2021).</li><li>Safri, F., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Heterogeneity+of+hepatocellular+carcinoma:+from+mechanisms+to+clinical+implications.">Heterogeneity of hepatocellular carcinoma: from mechanisms to clinical implications.</a> Cancer Gene Ther. 31 (8), 1105-1112 (2024).</li><li>Zhang, X. F., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Targeting+cell-state+plasticity+driven+by+FOXM1/CEBPB+axis+disrupts+developmental+heterogeneity+and+therapeutic+resistance+in+hepatocellular+carcinoma.">Targeting cell-state plasticity driven by FOXM1/CEBPB axis disrupts developmental heterogeneity and therapeutic resistance in hepatocellular carcinoma.</a> J Hepatol. 84 (2), 370-384 (2026).</li><li>Thorel, L., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Patient-derived+tumor+organoids:+a+new+avenue+for+preclinical+research+and+precision+medicine+in+oncology.">Patient-derived tumor organoids: a new avenue for preclinical research and precision medicine in oncology.</a> Exp Mol Med. 56 (7), 1531-1551 (2024).</li><li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+decade+of+liver+organoids:+advances+in+disease+modeling.">A decade of liver organoids: advances in disease modeling.</a> Clin Mol Hepatol. 29 (3), 643-669 (2023).</li><li>Li, L., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Human+primary+liver+cancer+organoids+reveal+intratumor+and+interpatient+drug+response+heterogeneity.">Human primary liver cancer organoids reveal intratumor and interpatient drug response heterogeneity.</a> JCI Insight. 4 (2), e121490 (2019).</li><li>Yang, H., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pharmacogenomic+profiling+of+intra-tumor+heterogeneity+using+a+large+organoid+biobank+of+liver+cancer.">Pharmacogenomic profiling of intra-tumor heterogeneity using a large organoid biobank of liver cancer.</a> Cancer Cell. 42 (4), 535-551.e8 (2024).</li><li>Xing, L., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RNA-based+therapies+in+hepatocellular+carcinoma:+state+of+the+art+and+clinical+perspectives.">RNA-based therapies in hepatocellular carcinoma: state of the art and clinical perspectives.</a> Hepatoma Res. 10, 24 (2024).</li><li>Aissa, A. F., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Single-cell+transcriptional+changes+associated+with+drug+tolerance+and+response+to+combination+therapies+in+cancer.">Single-cell transcriptional changes associated with drug tolerance and response to combination therapies in cancer.</a> Nat Commun. 12 (1), 1628 (2021).</li><li>Zhang, C. Y., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+and+optimization+of+a+human+hepatocellular+carcinoma+patient-derived+organoid+model+for+potential+target+identification+and+drug+discovery.">Development and optimization of a human hepatocellular carcinoma patient-derived organoid model for potential target identification and drug discovery.</a> J Vis Exp. (198), e65785 (2023).</li><li>Wang, Q., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Breakthroughs+and+challenges+of+organoid+models+for+assessing+cancer+immunotherapy:+a+cutting-edge+tool+for+advancing+personalised+treatments.">Breakthroughs and challenges of organoid models for assessing cancer immunotherapy: a cutting-edge tool for advancing personalised treatments.</a> Cell Death Discov. 11 (1), 222 (2025).</li><li>Yang, C., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+methods+of+different+tumor+organoids+and+their+application+in+tumor+drug+resistance+research.">Modeling methods of different tumor organoids and their application in tumor drug resistance research.</a> Cancer Drug Resist. 8, 32 (2025).</li><li>Denisenko, E., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Systematic+assessment+of+tissue+dissociation+and+storage+biases+in+single-cell+and+single-nucleus+RNA-seq+workflows.">Systematic assessment of tissue dissociation and storage biases in single-cell and single-nucleus RNA-seq workflows.</a> Genome Biol. 21 (1), 130 (2020).</li><li>Yip, S., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Give+them+vasculature+and+immune+cells:+how+to+fill+the+gap+of+organoids.">Give them vasculature and immune cells: how to fill the gap of organoids.</a> Cells Tissues Organs. 212 (5), 369-382 (2023).</li><li>Zhou, C., et al. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standardization+of+organoid+culture+in+cancer+research.">Standardization of organoid culture in cancer research.</a> Cancer Med. 12 (13), 14375-14386 (2023).</li></ol>

<table><tbody><tr><td>[Leu15]-가스트린 I 인간</td><td>머크</td><td>G9145</td><td></td></tr><tr><td>1.5 mL 마이크로튜브</td><td>머크</td><td>AXYMCT150LC</td><td></td></tr><tr><td>1X 적혈구 용해 버퍼</td><td>써모피셔 사이언티브</td><td>00-4333-57</td><td></td></tr><tr><td>2.0ml 내부 나사산 냉동 바이알</td><td>둥지</td><td>607001</td><td></td></tr><tr><td>A8301 (TGFb 억제제)</td><td>토크리스 생명과학</td><td>2939</td><td></td></tr><tr><td>AFP 다클론 항체</td><td>단백질 기술</td><td>14550-1-AP</td><td></td></tr><tr><td>항알부민 항체 [ALB/2144]</td><td>ABCAM</td><td>AB236492</td><td></td></tr><tr><td>항-HNF-4-알파 항체 [EPR16885] - ChIP 등급</td><td>ABCAM</td><td>AB181604</td><td></td></tr><tr><td>항전알부민 항체 [EPR3219]</td><td>ABCAM</td><td>AB92469</td><td></td></tr><tr><td>항-소크스9 항체 [EPR14335-78]</td><td>ABCAM</td><td>AB185966</td><td></td></tr><tr><td>비타민 A 제외 B27 보충제(503)</td><td>써모피셔 사이언티브</td><td>12587010</td><td></td></tr><tr><td>세포 회복 용액, 100 mL</td><td>코닝</td><td>354253</td><td>재도금 또는 후속 처리 전에 기저막 매트릭스를 용해하고 오가노이드를 회수하는 데 사용되는 시약입니다</td></tr><tr><td>세포티터-글로&레그; 그리고 nbsp; 3D 세포 생존 가능성 분석</td><td>프로메가</td><td>G9681</td><td></td></tr><tr><td>CHIR99021</td><td>머크</td><td>SML1046</td><td></td></tr><tr><td>크롬 넥스트 GEM 단일셀 3' GEM, 라이브러리 & 젤 비드 키트 v3.1</td><td>10배 유전체학</td><td>CG000227</td><td></td></tr><tr><td>코닝 셀 스트레이너, 40 & 뮤; m, 블루, S, IND, 1/50</td><td>코닝</td><td>431750</td><td></td></tr><tr><td>Costar 24-웰 투명 평평 바닥 초저 부착 다중 웰 플레이트, 개별 포장, 멸균</td><td>코닝</td><td>3473</td><td></td></tr><tr><td>컬트렉스 감소 성장 인자 BME, 타입 2 경로 정리(BME)</td><td>머크</td><td>3533-005-02</td><td>3차원 오가노이드 배양과 돔 형성을 지원하는 세포외 기질</td></tr><tr><td>DMSO</td><td>머크</td><td>C6164</td><td>약물 재고 용액 및 차량 제어에 사용되는 용매</td></tr><tr><td>둘벡코의 개조 이글 미디엄/햄의 F-12</td><td>써모피셔 사이언티브</td><td>12634028</td><td>고급 DMEM/F-12</td></tr><tr><td>E7080 (렌바티닙)</td><td>셀렉</td><td>S1164</td><td>오가노이드 치료 및 치료적 교란에 사용되는 티로신 키나제 억제제</td></tr><tr><td>태아 소 혈청 가치 FBS</td><td>깁코</td><td>A5256701</td><td></td></tr><tr><td>포스콜린</td><td>토크리스 생명과학</td><td>1099</td><td></td></tr><tr><td>글루타맥스 보충제</td><td>써모피셔 사이언티브</td><td>35050061</td><td></td></tr><tr><td>헤마톡실린 및 이오신 염색 키트</td><td>비요타임</td><td>C0105S</td><td></td></tr><tr><td>HEPES, 1 M</td><td>써모피셔 사이언티브</td><td>15630080</td><td></td></tr><tr><td>라이카 DM6 B 형광 모터화 현미경</td><td>라이카</td><td>해당 없음</td><td></td></tr><tr><td>N2 보충 자료 (1003)</td><td>써모피셔 사이언티브</td><td>17502048</td><td></td></tr><tr><td>N-아세틸시스테인</td><td>머크</td><td>A0737-5MG</td><td></td></tr><tr><td>니코티나마이드</td><td>머크</td><td>N0636</td><td></td></tr><tr><td>Nunc 15 mL 원뿔형 멸균 폴리프로필렌 원심분리관</td><td>써모피셔 사이언티브</td><td>339651</td><td></td></tr><tr><td>페니실린/스트렙토마이신 (10,000 U/mL)</td><td>써모피셔 사이언티브</td><td>15140122</td><td></td></tr><tr><td>인산 완충 식염수</td><td>GENOM BIO</td><td>GNM20012</td><td>오가노이드 세척 및 후속 처리를 위한 샘플 준비에 사용되는 완충제입니다</td></tr><tr><td>재조합 인간 EGF</td><td>페프로텍</td><td>AF-100-15</td><td></td></tr><tr><td>재조합 인간 FGF10</td><td>페프로텍</td><td>100-26</td><td></td></tr><tr><td>재조합 인간 HGF</td><td>페프로텍</td><td>100-39</td><td></td></tr><tr><td>재조합 인간 노긴</td><td>페프로텍</td><td>120-10C</td><td></td></tr><tr><td>로 키나제 억제제 Y-27632 이하이드로클로라이드</td><td>머크</td><td>Y0503</td><td>해동 또는 통과 후 오가노이드 생존을 촉진하는 데 사용되는 ROCK 억제제</td></tr><tr><td>R-스포딘1-조건 매질</td><td>(Broutier 외)</td><td>해당 없음</td><td>세포주 분비</td></tr><tr><td>트리판 블루 스테인, 0.4% 멤브레인 필터링, 0.85% 생리식염수로 준비</td><td>깁코</td><td>15250061</td><td></td></tr><tr><td>TrypLE Express 효소 (1x), 페놀 레드 없음</td><td>써모피셔 사이언티브</td><td>12604013</td><td>트립신 대체물</td></tr><tr><td>Wnt-3a 조건 매체</td><td>(Broutier 외)</td><td>해당 없음</td><td>세포주 분비</td></tr></tbody></table>

약물 치료 후 간세포암 오르가노이드의 생성 및 단세포 전사체 분석

Generation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hepatocellular Carcinoma Organoids following Drug Treatment

Hepatocellular carcinoma is a major cause of cancer-related mortality worldwide and is characterized by marked intratumoral heterogeneity, which ...

generation-single-cell-transcriptomic-analysis-hepatocellular

Research

연구

JoVE Journal

Cancer Research

암 연구

이 프로토콜은 종양 내 이질성을 포착하기 위해 다중 매개변수, 단일 오가노이드 약물 반응을 정량화하고 시각화하기 위한 중간 및 고처리량 오가노이드 약물 스크리닝 및 현미경에 구애받지 않는 자동 이미지 분석 소프트웨어를 위한 반자동 방법을 설명합니다.

벌크 및 단일 오가노이드 분석을 위한 광시야 라이브 셀 이미징을 사용한 다중 파라미터 종양 오가노이드 약물 스크리닝

당사는 오가노이드 배양의 모든 단계를 포괄하는 간세포 암종(HCC) 오가노이드 형성에 대한 기존 프로토콜에 대한 포괄적인 개요와 개선을 제공합니다. 이 시스템은 잠재적인 치료 표적을 식별하고 약물 후보 물질의 효과를 평가하는 데 유용한 모델 역할을 합니다.

잠재적 표적 식별 및 약물 발견을 위한 인간 간세포 암종 환자 유래 오가노이드 모델의 개발 및 최적화

여기에서는 single-cell 및 single-nucleus RNA sequencing을 사용하여 인간 뇌 오가노이드의 생성 및 다운스트림 분석을 위한 포괄적인 프로토콜을 소개합니다.

Generation and Downstream Analysis of single-cell and single-nuclei transcriptomes in brain organoids(뇌 오가노이드에서 단세포 및 단핵체 전사체의 생성 및 다운스트림 분석)

환자 종양에서 생성된 오가노이드를 생쥐 간에 항소적으로 주입합니다. 종양이 없는 간 조직의 절제는 종양이 위치한 간 조직에 재생 환경을 조성합니다.

간 재생이 종양 성장에 미치는 영향을 조사하기 위한 간세포 암 환자 유래 오가노이드 이종이식 모델

탈세포화된 쥐 간의 재세포화된 세포외 기질은 바이러스 또는 바이러스 벡터의 분포 및 전이유전자 발현을 연구하기 위해 인간화된 3차원 생체 외 모델로 사용할 수 있습니다.

인간의 간세포 암 세포주 인 HepG2와 3 차원 간 모델 다시 채워에서 바이러스 성 벡터의 연구

다양 한 질병의 표시 더 순수 관련 모델 개발 및 구현에 약물 발견 프로그램 되. 여기에 설명 된 새로운 모델 시스템 spheroids를 경작 하 고 종양학 신약에 대 한 검색 하는 높은 처리량 1536-잘 접시 기반 시스템에서 상영 될 수 방법을 3 차원 종양을 보여 줍니다.

마약 검사에 대 한 높은 처리량 3 차원 종양 Spheroids의 생성

여기 우리는 머리와 목 편평 상피 세포 암의 orthotopic murine 모델 개발에 대 한 재현 방법 제시. 종양 괴 사, 불 쌍 한 차별화, 꾸벅꾸벅 졸 기 전이 및 면역 침투를 포함 하 여 질병의 임상 관련 histopathological 기능을 보여 줍니다. 부전 실어증, 턱 변위, 및 체중 감소를 포함 한 임상 관련 증상을 개발 하는 종양 방위 쥐.

종양 면역 프로 파일링에 대 한 쥐 및 치료 반응 평가에 편평 세포 암 종 세포의 intramucosal 접종

간질 화학 물질화(TACE)는 간세포 암의 중간 단계에서 환자를 위한 표준 요법이며 일반적으로 대퇴동맥 접근을 통해 수행됩니다. 경피성 접근과 비교하여, 경질 접근 (TRA)은 출혈 합병증의 비율을 감소시키고 참을성 있는 내성을 향상할 수 있습니다. 방사형 동맥 접근을 통해 간질 화학 색전화를 수행하는 방법이 여기에 제시된다.

간세포 암종 환자를 위한 경질 접근 화학색전성

본질적으로 무질서한 도메인은 온코겐융합 전사 인자 기능에 중요합니다. 이러한 단백질을 치료적으로 표적으로 하기 위해서는 이러한 도메인에 의해 사용되는 규제 메커니즘에 대한 보다 상세한 이해가 필요합니다. 여기서는 전사학을 사용하여 유잉 육종에서 본질적으로 무질서한 EWS 도메인의 중요한 구조적 특징을 매핑합니다.

전사 분석을 사용하여 무질서한 온코겐 전사 요인의 구조 기능 관계 매핑

여기에서는 콜레스테롤 과잉이 간 미세 환경 및 면역 세포 환경에 미치는 영향을 연구하기 위해 비 알코올성 지방간 질환 (NAFLD) 관련 간세포 암종 (HCC) 제브라 피쉬 모델을 생성하는 방법을 제시합니다.

제브라피쉬에서 비알코올성 지방간 질환 관련 간세포암의 초기 진행 중 간 미세환경 분석

학습하세요 간세포암 오르가노이드 생성 및 약물 처리 후 단세포 RNA 시퀀싱을 통한 전사체 변화 분석 방법을. 이 프로토콜은 항암제 반응 연구에 필수적인 도구입니다.

약물 치료 후 간세포암 오르가노이드의 생성 및 단세포 전사체 분석

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