Name: Beeldverwerking en flowcytometrie-gebaseerde analyse van de Cel standpunt en de celcyclus in 3D Melanoom Sferoïden (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2015-12-28T14:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 44 s
Description: Leer beeldverwerking en flowcytometrie voor celcyclusanalyse in 3D melanoomsferoïden met FUCCI. Deze methode identificeert en isoleert levende cellen uit specifieke sferoïdegebieden voor kankeronderzoek.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

We danken mevrouw Danae Sharp en mevrouw Sheena Daignault voor hun technische assistentie. We danken Dr. Atsushi Miyawaki, RIKEN, Wako-city, Japan, voor het verstrekken van de FUCCI-constructen, Dr. Meenhard Herlyn en mevrouw Patricia Brafford, The Wistar Institute, Philadelphia, voor het verstrekken van cellijnen, de Imaging and Flow Cytometry Facility bij het Centenary Institute voor uitstekende technische ondersteuning. We danken de heer Chris Johnson en Dr. Andrew Barlow voor hun technische ondersteuning voor de Volocity-software. N.K.H. is een Cameron-fellow van het Melanoma and Skin Cancer Research Institute, Australië. K.A.B. is een fellow van het Cancer Institute New South Wales (13/ECF/1-39). W.W. is een fellow van het Cancer Institute New South Wales (11/CDF/3-39). Dit werk werd ondersteund door projectsubsidies RG 09-08 en RG 13-06 (Cancer Council New South Wales), 570778 en 1051996 (Priority-driven collaborative cancer research scheme/Cancer Australia/Cure Cancer Australia Foundation), 08/RFG/1-27 (Cancer Institute New South Wales), en APP1003637 en APP1084893 (National Health and Medical Research Council).

1. Fucci Transductie en Cultuur van de Cel <ol><li> Fucci transductie <ol><li> Maak cellijnen stabiel tot expressie de Fucci construeert mKO2-hCdt1 (30-120) en MAG-hGem (1-100) 15 met behulp van lentivirus co-transductie zoals eerder beschreven 7. Opmerking: Het Fucci systeem is nu in de handel verkrijgbaar. </li><li> Genereren sub-klonen met heldere fluorescentie door eencellige sorteren. Sorteer enkele cellen positief voor zowel AG en KO (geel) van fluorescentie-geactiveerde celsortering in een 96-putjes plaat zoals hierboven beschreven 7,16. </li></ol></li><li> Melanoom celcultuur <ol><li> Culture C8161 humane melanoomcellen zoals eerder beschreven 7,17. </li></ol></li></ol> 2. 3D Sferoïde Formation (zoals eerder beschreven 3,9) <ol><li> Agarose plaat voorbereiding <ol><li> Ontbinding van 1,5% agarose (of nobel agar) in 100 ml Hank&#39;s gebalanceerde zoutoplossing (HBSS) of fosfaat Buffered zoutoplossing (PBS) door het koken in de magnetron 3-5 minuten met wervelende. Zorg ervoor dat de agar volledig is opgelost. </li><li> Onmiddellijk afzien 100 ul van de agarose oplossing per goed op een vlakke bodem 96-well weefselkweek plaat met behulp van een multi-channel pipet. Opmerking: Agarose kan stollen in de tips na een korte tijd, om dit probleem te verhelpen uiteinden worden gewijzigd tussen platen als die met verscheidene agarose plaat. </li><li> Laat 96-well plaat op een vlak oppervlak te harden agarose gedurende tenminste 1 uur. </li></ol></li><li> Voorbereiding cel en overlay op agarose <ol><li> Kweek cellen ongeveer 80% confluentie in een T75 fles. Wassen met 10 ml HBSS. </li><li> Los cellen met behulp van 1,5 ml 0,05% trypsine / ethyleendiaminetetraazijnzuur (EDTA) en resuspendeer in 10 ml normaal medium. </li><li> Tellen cellen met een hemocytometer 18 of andere geautomatiseerde telmethode. </li><li> Resuspendeer cellen tot een uiteindelijke concentratie van 25.000 cellen / ml in normal medium. </li><li> Overlay agarose putjes met 200 ul van de celsuspensie voor een laatste aantal 5.000 cellen per putje. </li><li> Terug platen aan de celkweek incubator (5% CO2 en 37 ° C) tot sferoïden gevormd gedurende ongeveer 3 dagen. Opmerking: De tijd die een sferoïde vorming varieert tussen verschillende cellijnen. Sommige cellijnen niet sferoïden deze methode helemaal te vormen. </li><li> Afbeelding bolvormige morfologie met een omgekeerde microscoop met een 4X doelstelling en een fase contrast filter. Een cellijn die met succes vormt bolletjes zullen compact, ruwweg bolvormige cel aggregaten te produceren, en er mag slechts één bolvormige per goed. Opmerking: Optie: Nadat sferoïden zijn gevormd, kunnen ze worden getransplanteerd in collageen of andere matrix voor verdere analyse van de groei en invasie 3,7,17. Om sferoïden van collageen verwijderen behandelen met 500 gl van 2 mg / ml collagenase bij 37 ° C totdat het collageen genoeg voor de koba opgelostOIDs komen vrij in het medium (ongeveer 30 min). Verwijder voorzichtig sferoïden met een pipet 1 ml. </li><li> Voor snijden / imaging fix sferoïden (hetzij geïsoleerd van collageen en gekweekt gedurende 3-5 dagen agarose) in 10% neutraal gebufferde formaline (NB: formaline worden gebruikt in een zuurkast) gedurende ten minste 2 uur bij kamertemperatuur (RT) of overnacht (O / N) bij 4 ° C. Sferoïden worden bewaard in HBSS bij 4 ° C gedurende enkele dagen. </li></ol></li></ol> 3. Sferoïde Vibratome Sectioning <ol><li> Los in een 500 ml glazen fles in een magnetron 5 g laag smeltpunt agarose in 100 ml HBSS. Gebruik een matig vuur instelling met wervelende. VOORZICHTIG: Houd het deksel los wanneer de oplossing te koken, zodat de druk kan worden vrijgegeven. Gebruik beschermende hittebestendige handschoenen om de handen te beschermen tegen brandwonden bij het hanteren van het hete glazen fles. </li><li> Wacht totdat de agarose koelt iets - dus de fles kan worden aangeraakt zonder te verbranden handen. </li><li> Pour approximately 2 ml agarose in de bodem van een Coulter teller beker of dergelijke plastic mold. Onmiddellijk zuigen vaste sferoïde (zie paragraaf 2.2.8) met een pipet 1 ml in het kleinste volume van de vloeistof mogelijk. Sferoïde toe te voegen aan de agarose. Een paar sferoïden (tot 10) kunnen worden toegevoegd per kopje. </li><li> Bedek de sferoïden met 2 ml meer van agarose. Doe dit snel om de agarose uitharden voorkomen voordat de tweede laag wordt toegevoegd. </li><li> Laat de agarose uitharden bij kamertemperatuur in het donker gedurende minimaal 3 uur. Op dit moment koppen worden bewaard gedurende korte tijd bij 4 ° C met 2-3 ml HBSS bedekt om uitdroging te voorkomen. </li><li> Verwijder agarose uit de beker. Knip de agarose met de sferoïden zodat deze past op het vibratome metalen blok en sferoïden zijn dicht bij de top van de agarose. Sferoïden kunnen worden gezien als kleine witte voorwerpen in de agarose. Super lijm de agarose aan het blok. </li><li> Vul het vibratome met gedestilleerd water en monteer het blok in de vibratome. Stel devibratome tot 100 micrometer secties met lage snelheid (stand 2) en hoge trillingen (instelling 8) snijden. Stel het snijblad hoek 16 °. Zet vibratome, zet de vibratome licht gesneden gedeelten van de bovenkant van de agarose tot 100 urn bolvormige delen worden gesneden. Plaats gesneden spheroïde secties in HBSS in een 24-well plaat. </li><li> Kies middelste secties voor beeldanalyse. Mount secties op dia&#39;s door de overdracht van de sectie plat op de dia met een pincet. Vul een 10 ml spuit met vacuüm vet; voeg een dunne lijn van vacuüm vet rond de randen van het deel teneinde te voorkomen dat de fixeermiddelen worden uitgevoerd buiten de randen van de schuif en te verzegelen het gedeelte onder het dekglaasje. Bedek de sectie met montage medium en een dekglaasje. Verzegelen randen van dekglaasje met nagellak. WINKEL glijdt bij 4 ° C voor de beeldvorming. </li></ol> 4. Confocale Image Acquisition <ol><li> Neem een ​​z-slice afbeelding van een midden Fucci spheroïde sectie met behulp van een 10Xof 20X objectief 7 zoals eerder beschreven. Zorg ervoor dat er geen overlap of overspraak optreedt tussen de Kusabira Orange2 en Azami Green. Als het vergelijken van beeldanalyse tussen meerdere sferoïde secties, houden laservermogen en andere instellingen hetzelfde tussen de monsters. </li></ol> 5. Hoechst Dye Diffusion Assay voor Flow sorteren <ol><li> Overdracht levende sferoïden (3-5 dagen na zaaien agarose) naar een 15 ml buis. Laat sferoïden zwaartekracht naar de bodem van de buis. Meerdere sferoïden kunnen worden gekleurd per buis. Ongeveer 20 sferoïden zijn nodig om voldoende aantallen cellen te verkrijgen voor flowcytometrie. </li><li> Verwijder overtollig medium en voeg 1 ml van 10 M Hoechst verdund in normaal medium. Sferoïden Incubeer bij 37 ° C gedurende ongeveer 1 uur. Gebruik zachte tikken om de bolletjes mengen of twee keer tijdens incubatie. Opmerking: De incubatietijd worden gevarieerd te veranderen hoeverre de Hoechst kleurstof dringt in de sferoïden. Dit zal variëren op basis vande bolvormige grootte, dichtheid en cellijn. Voor sommige grote / dichte sferoïden er een maximum kleurstofpenetratie die minder dan 100% bedragen. </li><li> Was de sferoïden voorzichtig met 5 ml HBSS met behulp van de zwaartekracht bezinken. <ol><li> Optioneel: Voor beeldvorming van kleurstofpenetratie: Bevestig sferoïden met 10% neutraal gebufferd formaline gedurende ten minste 2 uur bij kamertemperatuur of O / N bij 4 ° C. Bereid vibratoomcoupes, zet op objectglaasjes en het confocale beeld zoals beschreven in stappen 3 en 4 hierboven. </li></ol></li><li> Cellen voorbereiden voor stroming cytometrie, trypsinize sferoïden met 1 ml 0,05% trypsine / EDTA bij 37 ° C gedurende ongeveer 30 min bij tikken elke 10 min de sferoïden splitsen. Opmerking: Sferoïden zijn moeilijk te krijgen in enkele celsuspensie, kan het nodig zijn voorwaarden waaraan moet worden geoptimaliseerd. Levensvatbaarheid van C8161 4 dagen oude sferoïden na dit proces is ongeveer 95%. </li><li> Stain cellen met een infrarood levend / dood kleuring volgens protocol van de fabrikant. Wassen met HBSS bevestig met 1ml 10% neutrale gebufferde formaline gedurende ongeveer 30 min. Cellen worden bewaard in HBSS bij 4 ° C gedurende enkele dagen voor stroomanalyse. </li></ol> 6. Flowcytometrie Analyse van Hoechst Stained Fucci Sferoïden <ol><li> Zorgen cellen niet samen samengeklonterd door ze door een cel zeef. Resuspendeer de Hoechst gekleurd Fucci sferoïden in ijskoude FACS wassen (PBS met 5% foetaal kalfsserum) bij een concentratie van 1-5 x 10 6 cellen / ml. Breng 200 pi monster 5 ml ronde bodem buizen. </li><li> Bereid de volgende enkele kleur controlemonsters zoals beschreven in 6.1:-un gekleurde melanoomcellen; hechtende melanoom cellen gekleurd met Hoechst 10 pM gedurende 1 uur; Azami Green Alleen expressie melanoomcellen; en Kusabira Orange enige expressie melanoomcellen. Opmerking: Single kleur controles kunnen in formaline worden vastgesteld en opgeslagen in FACS wassen met 0,1% natriumazide bij 4 ° C gedurende weken of zelfs maanden. </li><li> Run single celsuspensies ona flowcytometrie analyser met de juiste lasers en enkele kleur / unstained controles zoals eerder beschreven 7,16. </li><li> Gebruik cytometrie commerciële software zoals FlowJo analyseren de binnenste vs. buitenste bolvormige cellen als volgt: <ol><li> Verwijder puin door gating op de belangrijkste cel populatie in Forward Verspreid Licht (FSC) versus Side Verspreid Licht (SSC). </li><li> Verwijder doubletten door gating op enkele cellen met FSC (Area) vs. FSC (Hoogte) </li><li> Gate voor levende cellen door gating op de live / dead lage bevolking. </li><li> Definieer Hoechst hoog cellen, gated basis van de positieve signaal van de hechtende cellen gekleurd met Hoechst, als &quot;buiten&quot; cellen. </li><li> Definieer Hoechst lage of negatieve cellen, gated basis van het signaal van de niet-gekleurde controle, &quot;binnenste&quot; cellen. </li><li> Na gating voor de binnenste en buitenste populaties kunnen cellen verder worden omheind voor Fucci rood (G1), geel (vroege S), groen (S / G2 / M) of negatief (vroege G1). Opmerking: Compensation met behulp van de enkele kleur controles kunnen worden verplicht om de Fucci rood, geel, groen en negatieve populatie goed te definiëren. </li></ol></li><li> Nadat de test is geoptimaliseerd en Hoechst penetratie gevalideerd via confocale microscopie, werking cellen zonder bevestigen op een flow cel sorteerder zoals eerder beschreven 7,16 voor verdere analyse van levende cellen subpopulaties. </li></ol> 7. Image Analysis van Fucci Sferoïde Secties <ol><li> Open software bijvoorbeeld. Volocity, kies de kwantificering enige configuratie. </li><li> Maak een nieuwe bibliotheek. Importeer de Fucci spheroïde confocale image-bestand in de software door de ruwe data bestand te slepen uit de confocale in de bibliotheek. U kunt ook de opdracht Bestand&gt; Importeren. </li><li> Ga naar het tabblad metingen om een ​​beeldanalyse-protocol op te bouwen. Het protocol is gebouwd door het slepen en neerzetten van de juiste commando&#39;s in de juiste volgorde als volgt in het protocol venster. </li><li> Vinden objstudiepunten in het groene kanaal: Sleep de voorwerpen te vinden commando (in &#39;Finding&#39;) in het protocol venster selecteert u de juiste kanaal in de vondst objecten protocol.Add een open opdracht (te vinden in de &#39;Processing&#39;), dan moet een aparte ontroerende voorwerpen commando (gevonden in &#39;Processing&#39; - dit zal cellen scheiden). Objecten op grootte &lt;50 micrometer te sluiten (te vinden in &#39;filteren&#39; - dit kleine, niet-mobiele objecten uit te sluiten). Opmerking: Variabelen zoals de vondst voorwerpen drempel aantal open iteraties, de grootte van de voorwerpen te scheiden en de grootte van voorwerpen uit te sluiten moeten handmatig worden geoptimaliseerd tot het object maskers overeen met de afbeelding. </li><li> Vind objecten in het rode kanaal: Herhaal vinden voorwerpen zoals hierboven voor het rode kanaal. Groene en rode protocollen mogelijk moeten apart worden ingesteld. Let op: Als gevolg van kernen zijn in G2, groene kernen zijn vaak iets groter. </li><li> Bevestigen objecten gevonden zijn accuraat: Bevestig de rode en groene objecten overeenkomen met derood en groen kernen in het beeld door het uitschakelen en op de groene en rode kanalen (met behulp van de huid tonen of kanaal commando) tijdens de weergave van de rode en groene maskers gevonden door het protocol. Feedbackopties (metingen&gt; feedbackopties) worden gebruikt om het uiterlijk van het object maskers wijzigen. </li><li> Vind gele objecten (vroege S-fase cellen): Voor gele cellen vinden, voeg een kruisen rood met groene cellen commando (te vinden in &#39;De combinatie van&#39;). Uitsluiten objecten op grootte (&lt;50 pm, gevonden in &#39;Filtering&#39;) naar een kleine, niet-mobiele objecten te sluiten. </li><li> Vinden uitsluitend rode voorwerpen (G1 fase cellen): Uitsluitend rode kernen vinden, trek de gele cellen van de rode bloedcellen (te vinden in &#39;De combinatie van&#39;). Objecten uit te sluiten door de grootte &lt;50 micrometer, (te vinden in &#39;Filtering&#39;) naar een kleine, niet-cellulaire voorwerpen gemaakt te verwijderen. </li><li> Vinden uitsluitend groene objecten (S / G2 / M-fase cellen): Herhaal dit voor het groene kanaal uitsluitend groene vinden. Neete: Als er nog niet-cellulaire voorwerpen blijven een commando filter populatie kan worden toegevoegd aan de exclusieve groene of rode Exclusief protocollen (in &#39;Filtering) alleen behouden objecten met een vormfactor groter dan 0,25. Dit zal niet-cirkelvormige objecten te verwijderen. </li><li> Vind de sferoïde overzicht: Vind de spheroïde omtrek met een vondst objecten commando (in &#39;Finding&#39;) met de groene of rode kanaal (wat meer cellen heeft rond de rand van de sferoïde). Een veel lagere (in de vondst objecten variabelen) moeten worden gebruikt om de omtrek te sferoïde vergelijking met individuele cellen. <ol><li> Gebruik een goede opdracht om objecten (te vinden in de &#39;Processing&#39;) mee, vul dan gaten in objecten (te vinden in &#39;Processing&#39;), gebruik dan een fijne zeef (te vinden in &#39;Filtering&#39;) aan het geluid van objecten te verwijderen. Tenslotte sluiten objecten grootteklasse kleinere objecten &lt;30.000 urn (afhankelijk van de sferoïde grootte) te verwijderen. Aantekening: Dit protocol moet handmatig worden geoptimaliseerd tot de bolvormige omtrek nauwkeurig is. Een afbeelding brightfield kan eveneens worden gebruikt - dit is echter gewoonlijk minder nauwkeurig met een sferoïde gedeelte en invert commando (in het &quot;combineren&quot;) moet worden gebruikt. </li></ol></li><li> Meet afstanden kernen sferoïde overzicht: Meten van afstanden (in betrekking &#39;) vanaf het geel, uitsluitend groene en rode populaties uitsluitend uit de cel zwaartepunt aan de rand van de bolvormige outline.To de minimum afstanden visualiseren, die moet worden uit de cel naar de dichtstbijzijnde spheroïde rand, zet tonen afstanden in het tabblad relaties in feedback opties (Metingen&gt; Beoordeling opties&gt; Relaties). </li><li> Sla het protocol. Dit protocol kan opnieuw worden toegepast op andere foto&#39;s met behulp van de metingen&gt; Herstel protocol commando. </li><li> Maak een metingen artikel (Metingen&gt; Zorg Measurement Item). De gegevens kunnen worden geanalyseerd met de analysefuncties. <ol><li> Ga naar het tabblad analyse van de metingen punt. Ga naar het menu Analysis (Analyse&gt; Analyseren) en het analyseren van de minimale afstand van de cel zwaartepunt (rood, groen of geel) aan de rand sferoïde, samengevat door de graaf en georganiseerd door de bevolking. </li><li> Om het aantal cellen die op een bepaalde afstand van de rand tellen maakt een filter (Analyse&gt; Filter). De filter minimumafstand in figuur 2 is gebaseerd op Hoechst penetratie (bijvoorbeeld minimale afstand kleiner is dan 80 geeft het &quot;buitenste&quot; populatie). Als alternatief, exporteren ruwe data naar een spreadsheet voor verdere analyse. </li></ol></li></ol>

<ol><li>LaBarbera, D. V., Reid, B. G., Yoo, B. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+multicellular+tumor+spheroid+model+for+high-throughput+cancer+drug+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Expert+opinion+on+drug+discovery%22%5BJournal%5D)">The multicellular tumor spheroid model for high-throughput cancer drug discovery.</a> Expert opinion on drug discovery. 7, 819-830 (2012).</li>
<li>Beaumont, K. A., Mohana-Kumaran, N., Haass, N. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modeling+Melanoma+In+Vitro+and+In+Vivo%5BTitle%5D)+AND+%22Healthcare%22%5BJournal%5D)">Modeling Melanoma In Vitro and In Vivo.</a> Healthcare. 2, 27-46 (2014).</li>
<li>Smalley, K. S., Lioni, M., Noma, K., Haass, N. K., Herlyn, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+three-dimensional+tumor+microenvironment+models+for+anticancer+drug+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Expert+opinion+on+drug+discovery%22%5BJournal%5D)">In vitro three-dimensional tumor microenvironment models for anticancer drug discovery.</a> Expert opinion on drug discovery. 3, 1-10 (2008).</li>
<li>Reid, B. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live+multicellular+tumor+spheroid+models+for+high-content+imaging+and+screening+in+cancer+drug+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Current+chemical+genomics+and+translational+medicine%22%5BJournal%5D)">Live multicellular tumor spheroid models for high-content imaging and screening in cancer drug discovery.</a> Current chemical genomics and translational medicine. 8, 27-35 (2014).</li>
<li>Kunz-Schughart, L. A., Freyer, J. P., Hofstaedter, F., Ebner, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+use+of+3-D+cultures+for+high-throughput+screening%3A+the+multicellular+spheroid+model%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+biomolecular+screening%22%5BJournal%5D)">The use of 3-D cultures for high-throughput screening: the multicellular spheroid model.</a> Journal of biomolecular screening. 9, 273-285 (2004).</li>
<li>Hirschhaeuser, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multicellular+tumor+spheroids%3A+an+underestimated+tool+is+catching+up+again%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+biotechnology%22%5BJournal%5D)">Multicellular tumor spheroids: an underestimated tool is catching up again.</a> Journal of biotechnology. 148, 3-15 (2010).</li>
<li>Haass, N. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Real-time+cell+cycle+imaging+during+melanoma+growth%2C+invasion%2C+and+drug+response%5BTitle%5D)+AND+%22Pigment+cell+%26+melanoma+research%22%5BJournal%5D)">Real-time cell cycle imaging during melanoma growth, invasion, and drug response.</a> Pigment cell & melanoma research. 27, 764-776 (2014).</li>
<li>Lucas, K. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modulation+of+NOXA+and+MCL-1+as+a+strategy+for+sensitizing+melanoma+cells+to+the+BH3-mimetic+ABT-737%5BTitle%5D)+AND+%22Clinical+cancer+research+%3A+an+official+journal+of+the+American+Association+for+Cancer+Research%22%5BJournal%5D)">Modulation of NOXA and MCL-1 as a strategy for sensitizing melanoma cells to the BH3-mimetic ABT-737.</a> Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research. 18, 783-795 (2012).</li>
<li>Smalley, K. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiple+signaling+pathways+must+be+targeted+to+overcome+drug+resistance+in+cell+lines+derived+from+melanoma+metastases%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+cancer+therapeutics%22%5BJournal%5D)">Multiple signaling pathways must be targeted to overcome drug resistance in cell lines derived from melanoma metastases.</a> Molecular cancer therapeutics. 5, 1136-1144 (2006).</li>
<li>Thoma, C. R., Zimmermann, M., Agarkova, I., Kelm, J. M., Krek, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((3D+cell+culture+systems+modeling+tumor+growth+determinants+in+cancer+target+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Advanced+drug+delivery+reviews%22%5BJournal%5D)">3D cell culture systems modeling tumor growth determinants in cancer target discovery.</a> Advanced drug delivery reviews. 69-70, 29-41 (2014).</li>
<li>Santini, M. T., Rainaldi, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-dimensional+spheroid+model+in+tumor+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Pathobiology+%3A+journal+of+immunopathology%2C+molecular+and+cellular+biology%22%5BJournal%5D)">Three-dimensional spheroid model in tumor biology.</a> Pathobiology : journal of immunopathology, molecular and cellular biology. 67, 148-157 (1999).</li>
<li>Sutherland, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+and+environment+interactions+in+tumor+microregions%3A+the+multicell+spheroid+model%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Cell and environment interactions in tumor microregions: the multicell spheroid model.</a> Science. 240, 177-184 (1988).</li>
<li>Haass, N. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamic+tumour+heterogeneity+in+melanoma+therapy%3A+how+do+we+address+this+in+a+novel+model+system%3F%5BTitle%5D)+AND+%22Melanoma+Manag%22%5BJournal%5D)">Dynamic tumour heterogeneity in melanoma therapy: how do we address this in a novel model system?</a> Melanoma Manag. 2, 93-95 (2015).</li>
<li>Desoize, B., Jardillier, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multicellular+resistance%3A+a+paradigm+for+clinical+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Critical+reviews+in+oncology%2Fhematology%22%5BJournal%5D)">Multicellular resistance: a paradigm for clinical resistance.</a> Critical reviews in oncology/hematology. 36, 193-207 (2000).</li>
<li>Sakaue-Sawano, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualizing+spatiotemporal+dynamics+of+multicellular+cell-cycle+progression%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Visualizing spatiotemporal dynamics of multicellular cell-cycle progression.</a> Cell. 132, 487-498 (2008).</li>
<li>Basu, S., Campbell, H. M., Dittel, B. N., Ray, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Purification+of+specific+cell+population+by+fluorescence+activated+cell+sorting+%28FACS%29%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+visualized+experiments+%3A+JoVE%22%5BJournal%5D)">Purification of specific cell population by fluorescence activated cell sorting (FACS).</a> Journal of visualized experiments : JoVE. , (2010).</li>
<li>Smalley, K. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Up-regulated+expression+of+zonula+occludens+protein-1+in+human+melanoma+associates+with+N-cadherin+and+contributes+to+invasion+and+adhesion%5BTitle%5D)+AND+%22The+American+journal+of+pathology%22%5BJournal%5D)">Up-regulated expression of zonula occludens protein-1 in human melanoma associates with N-cadherin and contributes to invasion and adhesion.</a> The American journal of pathology. 166, 1541-1554 (2005).</li>
<li>Using a Hemacytometer to Count Cells | Protocol. , JoVE. Cambridge, MA. Available from: 
 <a target="_blank" href="http://www.jove.com/science-education/5048/using-a-hemacytometer-to-count-cells">http://www.jove.com/science-education/5048/using-a-hemacytometer-to-count-cells</a> (2015).</li>
<li>Wang, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeting+glutamine+transport+to+suppress+melanoma+cell+growth%5BTitle%5D)+AND+%22International+journal+of+cancer.+Journal+international+du+cancer%22%5BJournal%5D)">Targeting glutamine transport to suppress melanoma cell growth.</a> International journal of cancer. Journal international du cancer. 135, 1060-1071 (2014).</li>
<li>Lorenzo, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live+cell+division+dynamics+monitoring+in+3D+large+spheroid+tumor+models+using+light+sheet+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+division%22%5BJournal%5D)">Live cell division dynamics monitoring in 3D large spheroid tumor models using light sheet microscopy.</a> Cell division. 6, 22(2011).</li>
<li>Pampaloni, F., Ansari, N., Stelzer, E. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-resolution+deep+imaging+of+live+cellular+spheroids+with+light-sheet-based+fluorescence+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+and+tissue+research%22%5BJournal%5D)">High-resolution deep imaging of live cellular spheroids with light-sheet-based fluorescence microscopy.</a> Cell and tissue research. 352, 161-177 (2013).</li>
<li>Durand, R. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+Hoechst+33342+for+cell+selection+from+multicell+systems%5BTitle%5D)+AND+%22The+journal+of+histochemistry+and+cytochemistry+%3A+official+journal+of+the+Histochemistry+Society%22%5BJournal%5D)">Use of Hoechst 33342 for cell selection from multicell systems.</a> The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society. 30, 117-122 (1982).</li>
<li>Laurent, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multicellular+tumor+spheroid+models+to+explore+cell+cycle+checkpoints+in+3D%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+cancer%22%5BJournal%5D)">Multicellular tumor spheroid models to explore cell cycle checkpoints in 3D.</a> BMC cancer. 13, 73(2013).</li>
<li>LaRue, K. E., Khalil, M., Freyer, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microenvironmental+regulation+of+proliferation+in+multicellular+spheroids+is+mediated+through+differential+expression+of+cyclin-dependent+kinase+inhibitors%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+research%22%5BJournal%5D)">Microenvironmental regulation of proliferation in multicellular spheroids is mediated through differential expression of cyclin-dependent kinase inhibitors.</a> Cancer research. 64, 1621-1631 (2004).</li>
<li>Kyle, A. H., Huxham, L. A., Baker, J. H., Burston, H. E., Minchinton, A. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tumor+distribution+of+bromodeoxyuridine-labeled+cells+is+strongly+dose+dependent%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+research%22%5BJournal%5D)">Tumor distribution of bromodeoxyuridine-labeled cells is strongly dose dependent.</a> Cancer research. 63, 5707-5711 (2003).</li>
<li>Minchinton, A. I., Tannock, I. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Drug+penetration+in+solid+tumours%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+reviews.+Cancer%22%5BJournal%5D)">Drug penetration in solid tumours.</a> Nature reviews. Cancer. 6, 583-592 (2006).</li>
<li>Giesbrecht, J. L., Wilson, W. R., Hill, R. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Radiobiological+studies+of+cells+in+multicellular+spheroids+using+a+sequential+trypsinization+technique%5BTitle%5D)+AND+%22Radiation+research%22%5BJournal%5D)">Radiobiological studies of cells in multicellular spheroids using a sequential trypsinization technique.</a> Radiation research. 86, 368-386 (1981).</li>
</ol>

PerkinElmer droeg bij aan de publicatiekosten.

Semi-automatische beeldanalyse geïdentificeerd de bolvormige innerlijke G1 gearresteerd regio en uitdijende buitenste lagen. Deze werkwijze kan worden toegepast voor levende sferoïden behulp van een optische sectie of in vaste bolvormige gedeelten, veranderingen in niet alleen de celcyclus maar merkerexpressie (via immunofluorescentie), celdood of celmorfologie in de verschillende regio&#39;s te identificeren. Cel beweeglijkheid binnen de verschillende bolvormige regio kan ook worden gekwantificeerd - als live-confocale...

Multicellulaire sferoïden 3D zijn bekend als een tumormodel decennia, maar het is pas onlangs aan dat zij vaker gebruik als een in vitro model voor vele vaste kankers zijn gekomen. Ze worden steeds vaker gebruikt in high-throughput drug discovery schermen als intermediair tussen complexe, kostbare en tijdrovende in vivo modellen en de eenvoudige, goedkope 2D monolaag model 1-6. Studies in 2D cultuur zijn vaak niet in staat om te worden gerepliceerd in vivo. Bolvormige modellen van vele soorten kanker kunnen de groeikenmerken, drug gevoeligheid, geneesmiddelpenetratie, cel-cel interacties, beperkte beschikbaarheid van zuurstof en voedingsstoffen en ontwikkeling van necrose die wordt gezien in vivo bij vaste tumoren 6-11 nabootsen. Sferoïden ontwikkelen van een necrotische kern, een zwakke of G1 aangehouden regio rond de kern, en prolifererende cellen op de omtrek van de sferoïde 7. De ontwikkeling van deze regio&#39;sis afhankelijk van de celdichtheid, proliferatiesnelheid en de omvang van de sferoïde 12. Er is verondersteld dat de cellulaire heterogeniteit waargenomen in de verschillende sub-gebieden kunnen bijdragen tot kankertherapie weerstand 13,14. Daarom is de mogelijkheid om cellen te analyseren in deze gebieden afzonderlijk is cruciaal inzicht tumorgeneesmiddel responsen. De fluorescentie ubiquitinatie celcyclus indicator (Fucci) is gebaseerd op de rode (Kusabira Orange - KO) en groene (Azami Green - AG) fluorescerende tagging van CDT1 en geminin, die worden afgebroken in verschillende fasen van de celcyclus 15. Zo celkernen verschijnen rood in G1, geel in de vroege S en groen in S / G2 / M-fase. We beschrijven hier twee complementaire methoden beide met Fucci de celcyclus identificeren, samen met het gebruik van beeldverwerkingssoftware of kleurstofdiffusie flowcytometrie test om te bepalen of cellen in de G1 aangehouden midden of buitenste proliferatin verblijfG ring, en de afstand van de individuele cellen van de rand van de sferoïde. Deze methoden werden ontwikkeld in onze eerdere publicatie waarin we aangetoond dat melanoomcellen in hypoxische gebieden in het midden van het bolvormige of / en in aanwezigheid van gerichte therapieën kunnen in G1 arrest voor langere tijd blijft en opnieuw kan voer de celcyclus bij gunstiger voorwaarden ontstaan ​​7.

<table><tbody><tr><td>Hoechst 33342</td><td>Life Technologies</td><td>H3570</td><td></td></tr><tr><td>agarose low melting point</td><td>Life Technologies</td><td>16520-050</td><td>Voor secties</td></tr><tr><td>noble agar&nbsp;</td><td>Sigma</td><td>A5431</td><td>Voor het maken van sferoïden</td></tr><tr><td>agarose voor sferoïden</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP1356-100</td><td>Voor het maken van sferoïden</td></tr><tr><td>0.05% trypsin/EDTA</td><td>Life Technologies</td><td>25300-054</td><td></td></tr><tr><td>HBSS</td><td>Life Technologies</td><td>14175-103</td><td></td></tr><tr><td>10% formalin</td><td>Sigma</td><td>HT5014-1CS</td><td>VOORZICHT: Schadelijk, corrosief. Gebruik persoonlijke beschermingsmiddelen, adem niet dampen in (open in een afzuigkast).</td></tr><tr><td>live/dead near IR</td><td>Life Technologies</td><td>L10119</td><td></td></tr><tr><td>vibratome</td><td>Technical Products International, Inc</td><td></td><td></td></tr><tr><td>coulture cup</td><td>Thermo-Fisher Scientific</td><td>SIE936</td><td>Vorm voor het secteren van sferoïden</td></tr><tr><td>hemocytometer</td><td>Sigma</td><td>Z359629</td><td></td></tr><tr><td>96-well tissue culture plate</td><td>Invitro</td><td>FAL353072</td><td></td></tr><tr><td>collagenase</td><td>Sigma</td><td>C5138&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>confocal microscope</td><td>Leica</td><td>TCS SP5</td><td></td></tr><tr><td>Flow cytometer analyser</td><td>Becton Dickinson</td><td>LSRFortessa</td><td></td></tr><tr><td>volocity</td><td>PerkinElmer</td><td></td><td>Beeldvormingssoftware</td></tr><tr><td>flowjo</td><td>Tree Star</td><td></td><td>Flowcytometrie software</td></tr><tr><td>Vaccuum grease</td><td>Sigma</td><td>Z273554</td><td></td></tr><tr><td>Mounting media</td><td>Vector Laboratories</td><td>H1000</td><td></td></tr><tr><td>FUCCI (commercial constructs)</td><td>Life Technologies</td><td>P36238</td><td>Alleen voor tijdelijke transfectie</td></tr><tr><td>Cell strainer 70 &#956;m</td><td>In Vitro</td><td>FAL352350</td><td></td></tr><tr><td>Round bottom 5 ml tubes (sterile)</td><td>In Vitro</td><td>FAL352003</td><td></td></tr><tr><td>Round bottom 5 ml tubes (non-sterile)</td><td>In Vitro</td><td>FAL352008</td><td></td></tr></tbody></table>

beeldverwerking en flowcytometrie-gebaseerde analyse van de cel standpunt en de celcyclus in 3d melanoom sferoïden

Imaging- and Flow Cytometry-based Analysis of Cell Position and the Cell Cycle in 3D Melanoma Spheroids

Driedimensionale (3D) tumor-sferoïden worden in kankeronderzoek gebruikt als een nauwkeuriger model van de in vivo tumormicro-omgeving, in vergelijking met traditionele tweedimensionale (2D) celcultuur. Het sferoïdmodel kan de effecten van cel-cel interactie, hypoxie en nutriëntendeprivatie, en drugpenetratie nabootsen. Een kenmerk van dit model is de ontwikkeling van een necrotisch centrum, omgeven door een ring van G1-geremde cellen, met proliferende cellen op de buitenste lagen van de sferoïd. Van belang in het kankerveld is hoe verschillende regio's van de sferoïd reageren op medicamenteuze therapieën evenals genetische of omgevingsmanipulatie. We beschrijven hier het gebruik van het fluoresceine ubiquitinatie celcyclus indicator (FUCCI) systeem samen met cytometry en beeldanalyse met behulp van commerciële software om de celcyclusstatus van cellen te karakteriseren met betrekking tot hun positie binnen melanoom-sferoïden. Deze methoden kunnen worden gebruikt om veranderingen in celcyclusstatus, gen/eiwitexpressie of celviabiliteit in verschillende subregio's van tumor-sferoïden te volgen over tijd en onder verschillende condities.

Er zijn verschillende methoden voor het produceren van bolvormige tumoren, dit protocol gebruikt de niet-hechtende groei methode, waarbij cellen gekweekt op agar of agarose 3,7,9. Figuur 1 toont een voorbeeld van een melanoom C8161 sferoïde na 3 dagen op agar. C8161 sferoïden vormen normaal formaat bolvormige deeltjes met een diameter van 500 - 600 urn (gemiddelde = 565, SD = 19, n = 3) na 3 dagen. Andere melanoom cellijnen die sferoïden zullen vormen, omvatten: WM793, WM983C, WM983B, WM164, ...

We beschrijven twee complementaire methoden met behulp van de fluorescentie ubiquitinatie celcyclus indicator (FUCCI) en beeldanalyse of flowcytometrie om cellen in de binnenste G1-gearresteerde en buitenste proliferatieve regio's van 3D-sferoïden te identificeren en isoleren.

Beeldverwerking en flowcytometrie-gebaseerde analyse van de Cel standpunt en de celcyclus in 3D Melanoom Sferoïden

Three-dimensional (3D) tumor spheroids are utilized in cancer research as a more accurate model of the in vivo tumor microenvironment, compared to ...

Het algemene doel van deze methode is om cellen uit een multicellular steroid te identificeren, te karakteriseren en te isoleren met betrekking tot hun celcyclusstatus en positie binnen het steroid in vergelijking met 2D-celkweek. Het 3D OID-model recapituleert de biologie van kanker in vivo, aangezien het de tumorarchitectuur en de micro-omgeving ervan nabootst. Door sferoïden te combineren met flowcytometrie en beeldvormingstechnieken, kan deze methode cruciale vragen in het kankeronderzoek beantwoorden, zoals de wijze waarop de tumormicro-omgeving de gevoeligheid voor medicijnen, celmotiliteit en proliferatie beïnvloedt.Het belangrijkste voordeel van deze methode is dat het real-time visualisatie van de celcyclus mogelijk maakt en de zuivering van levende cellen uit een specifieke steroïde regio toelaat. Ter demonstratie van de procedure zal een onderzoeksassistent uit ons laboratorium de voorbereidingen treffen voor de vorming van 3D-steroïden door 1,5% agarose in 100 milliliters Hank's balanced salt solution (HBSS) drie tot vijf minuten in de magnetron te verhitten, waarbij de fles af en toe wordt geschud om te garanderen dat de agarose volledig is opgelost. Pipetteer vervolgens onmiddellijk 100 µL van de agarose-oplossing in elke put van een 96-well tissue culture plate met een platte bodem. Incubeer de plaat één uur bij kamertemperatuur om de agarose te laten stollen.Verwijder vervolgens een celkweek van melanomcellen die de FCI-constructen tot een confluentie van 80% tot expressie brengen uit de celkweekincubator. Was de cellen met 10 milliliters HBSS. Voeg 1,5 milliliters 0,05% EDTA toe en incubeer de cellen vervolgens gedurende ongeveer twee minuten bij 37 graden Celsius.Zodra de cellen zijn losgekoppeld, worden ze gesuspendeerd in 10 milliliter celkweekmedium. Tel de cellen handmatig met behulp van een hemocytometer en een omgekeerde microscoop en verdun ze tot 25 000 cellen per milliliter in celkweekmedium. Pipetteer vervolgens 200 microliter van de celsuspensie over elke put van de 96-wells aros-plaat.Incubeer de plaat bij 37 °C en 5% CO2 gedurende ongeveer drie dagen om celsferoïden te vormen. Beeld na incubatie de sferoïden af met een geïnverteerde microscoop met een Forex-objectief en een fasecontrastfilter. De sferoïden moeten verschijnen als compacte, ruwweg bolvormige celaggregaten om de celsferoïde voor te bereiden op sectiebehandeling en beeldvorming.Gebruik een pipet van één milliliter om ze over te brengen naar een falcon-buis. Laat het steroïde vervolgens bezinken op de bodem van de conische buis. Verwijder daarna het medium via vacuümsuictie en fixeer de sferoïden door ze gedurende ten minste twee uur bij kamertemperatuur te incuberen in 10% neutraal gebufferde formaline.SP kan vervolgens in HBSS bij vier graden Celsius gedurende enkele dagen worden bewaard na het doorsnijden en afbeelden van de cel. Open de software voor beeldanalyse en kies de configuratie voor enkel kwantificering. Maak vervolgens een nieuwe bibliotheek aan en importeer het confocale beeldbestand van de sferoïde door het rawdata-bestand naar de bibliotheek te slepen.Ga vervolgens naar het tabblad met metingen om een protocol voor beeldanalyse op te stellen door commando's in de juiste volgorde naar het protocolvenster te slepen. Om objecten in het groene kanaal te vinden, sleept u het commando 'find objects' uit de sectie 'finding' naar het protocolvenster en selecteert u het juiste kanaal. Voeg een 'open'-commando toe, te vinden onder 'processing', en voeg vervolgens een apart commando 'touching objects' toe om de cellen te scheiden.Voeg tenslotte in het filtergedeelte een commando toe om objecten op basis van grootte in of uit te sluiten. Stel een commando in voor objecten kleiner dan 50 µm om kleine niet-cellulaire objecten uit te sluiten. Sleep vervolgens een nieuw 'find objects'-commando naar het protocolvenster.Volg dezelfde stappen, selecteer het rode kanaal en pas alle daaropvolgende commando's toe. Zodra de objecten zijn gevonden, gebruikt u de commando's 'kanaal verbergen' of 'kanaal tonen' om visueel te controleren of de rode en groene objecten overeenkomen met de rode en groene kernen. Klik indien nodig op 'metingen' en vervolgens op 'feedbackopties' om het uiterlijk van de objectmaskers aan te passen.Om nu gele objecten te vinden die corresponderen met cellen in de vroege S-fase, gebruikt u het commando 'intersect' in de sectie 'combining' en kiest u voor 'intersect red objects with green objects'. Sluit opnieuw objecten uit met een grootte van minder dan 50 micrometers. Om cellen in de G1-fase te identificeren, gebruikt u het commando 'subtract' in de sectie 'combining' en kiest u voor 'subtract yellow object from red objects' om uitsluitend rode objecten te vinden.Trek op dezelfde manier de gele objecten af van de groene objecten om uitsluitend groene objecten te identificeren die correleren met SG twee en MPH-fasecellen voor zowel de uitsluitend rode als de uitsluitend groene objecten. Verwijder indien nodig niet-cellulaire objecten door een filter population-commando uit de filteringsectie toe te passen met een vormfactor groter dan 0,25. Bepaal vervolgens de S-sferoïde-omtrek.Gebruik een 'find objects'-commando uit het gedeelte 'finding' in zowel het groene als het rode kanaal. Gebruik een 'closed'-commando uit het gedeelte 'processing' om de individuele cellen samen te voegen tot één object. Voeg vervolgens een 'fill holes in objects'-commando toe om gaten in de sfeer op te vullen.Gebruik vervolgens een fijn filter om ruis uit het Sphero-object te verwijderen. Voltooi het bepalen van de omtrek van de sferoïde door de optie 'objecten uitsluiten op basis van grootte' te kiezen om objecten kleiner dan 30 000 micrometer te verwijderen. Zodra alle objecten zijn gedefinieerd, voegt u 'afstanden meten' toe vanuit de bijbehorende sectie om de afstand van elke OID tot de rand van de S-sferoïde-omtrek te bepalen.Voer dit uit voor elk van de gele, uitsluitend rode en uitsluitend groene populaties. Om de minimale afstanden van de cel tot de dichtstbijzijnde rand van de S-sferoïde te visualiseren, opent u het tabblad met metingen en selecteert u feedbackopties, gevolgd door relaties. Kies vervolgens voor toon afstanden.Sla ten slotte het protocol op om de door het protocol gecreëerde gegevens te bewaren. Kies het item make measurement in het gedeelte measurement. Selecteer vervolgens om de gegevens te interpreteren het measurement-item, ga naar het tabblad analysis in het gedeelte measurement en kies Analyze onder het analysis-menu om de cellen te tellen die zich op een bepaalde afstand van de rand van het steroïde bevinden.Maak een filter door 'filter' te selecteren in het tabblad analyse. Toon bijvoorbeeld alleen gegevens waarbij de afstand tot de rand van de sfeer minder dan 100 microns is. Om de ruwe gegevens te exporteren, selecteert u 'export' in het tabblad bestand en slaat u de gegevens vervolgens op als kommagescheiden of tab-beperkte tekst.Deze gegevens kunnen worden geopend in een spreadsheetprogramma voor verdere analyse. Celsferen gegenereerd uit C 8 1 16 1. Humane melanomcellen die waren getransduceerd met het Fuji-systeem werden gefixeerd en in coupes gesneden.Er werd confocale beeldvorming uitgevoerd voor AZA green, dat cellen in de S- en M-fase van de celcyclus markeert, en Berra orange, dat cellen in de G1-fase markeert. Wanneer deze beelden over elkaar worden gelegd, kunnen belangrijke kenmerken, zoals een necrotische kern, zoals verwacht worden waargenomen. Rode G1-gearresteerde cellen overheersen dichter bij deze necrotische kern, terwijl rode en groene prolifererende cellen in een gradiënt toenemen richting de buitenrand van het sferoïde, waar de toegang tot zuurstof en voedingsstoffen het grootst is.Na semi-geautomatiseerde beeldanalyse kunnen de fucci-celmaskers en de omtrek van de S-sferoïde worden gedefinieerd. Beeldverwerkingssoftware werd gebruikt om de rode en groene cellen in de binnenste of buitenste regio van de S-sferoïde te kwantificeren. Deze analyse toonde aan dat cellen die zijn gearresteerd in de G1-fase verrijkt zijn in de binnenste regio, terwijl prolifererende cellen overheersen dichter bij de rand van de sferoïde.Zodra deze techniek onder de knie is, kan deze in één tot twee weken worden uitgevoerd, een tijdsbestek dat het kweken van het organoïde, de beeldvorming en de analyse omvat. Na deze procedure kunnen de organoïden in een collageenmatrix worden geïmplanteerd en vervolgens via TimeLapse-microscopie worden afgebeeld. Ze kunnen vervolgens worden onderworpen aan eiwit- of RNA-analyse, wat kan helpen bij het beantwoorden van vragen zoals of de positie in het organoïde en de toegang tot zuurstof en voedingsstoffen de fenotypes van kankercellen kunnen veranderen.

imaging-flow-cytometry-based-analysis-cell-position-cell-cycle-3d

Research

JoVE Journal

Medicine

Geneeskunde

Invasie van omliggende normale weefsels is een typerend kenmerk van kwaadaardige tumoren. We bieden hier een eenvoudige, semi-geautomatiseerde microplaattest van invasie in een natuurlijke 3D biomatrix die met een aantal modellen van gevorderde menselijke kankers is geëxemplifeerd.

Driedimensionale (3D) Tumor Spheroid Invasion Assay

Hier presenteren we een protocol voor het genereren van een sferoïde huidmodel voor 3D organotypic melanoom die zowel de architectuur recapituleert en meercellige complexiteit van een orgel/tumor in vivo maar tegelijkertijd herbergt systematische experimentele interventie.

Een 3D Organotypic melanoom sferoïde huidmodel

Optische coherentie tomografie (OCT), een driedimensionale imaging technologie, werd gebruikt om te controleren en te karakteriseren de kinetiek van de groei van meercellige tumor spheroïden. Precieze volumetrische kwantificering van tumor spheroïden met behulp van een voxel tellen aanpak, en label-vrije dood weefsel detectie in de spheroïden op basis van intrinsieke optische demping daarentegen werden gedemonstreerd.

Longitudinale morfologische en fysiologische Monitoring van driedimensionale Tumor spheroïden met behulp van optische coherentie tomografie

Dit protocol beschrijft het genereren van door patiënten afgeleide spheroïden en downstreamanalyses, waaronder de kwantificering van proliferatie, cytotoxiciteits testen, Flowcytometrie, immunofluorescentie kleuring en confocale beeldvorming, om de geneesmiddelen te beoordelen potentiële kandidaten als anti-neoplastische Therapeutics. Dit protocol ondersteunt precisie geneeskunde met identificatie van specifieke geneesmiddelen voor elke patiënt en stadium van de ziekte.

Fysiologisch patiënt afgeleide 3D-Spheroids voor anti-neoplastische geneesmiddelen screening om kanker stamcellen te targeten

Hier presenteren we een aantal eenvoudige methoden voor de evaluatie van de levensvatbaarheid en de dood in 3D kanker cel sferoïden, die de fysisch-chemische gradiënten van in vivo tumoren veel beter dan de 2D-cultuur na te bootsen. Het sferoïde model maakt het dus mogelijk om de effectiviteit van kanker medicijnen te evalueren met een verbeterde vertaling naar in vivo omstandigheden.

Beoordeling van de levensvatbaarheid van cellen en de dood in 3D sferoïde culturen van kankercellen

Het doel van dit protocol is om een 3D in vitro model te vestigen om de differentiatie van met kanker geassocieerde fibroblasten (CAFs) in een tumor bulk-achtige omgeving te bestuderen, die kan worden aangepakt in verschillende analysesystemen, zoals immunofluorescentie, transcriptionele analyse en Life Cell Imaging.

Een 3D-Spheroid-model als een fysiologisch systeem voor de differentiatie van kanker-geassocieerde fibroblasten en invasies in vitro studies

Een nieuwe drie-dimensionale sferoïde model gebaseerd op de heterotypische interactie van tumorcellen en stromal fibroblasten wordt vastgesteld. Hier presenteren we cocultuur van tumorcellen en stromalfibroblasten, time-lapse beeldvorming en confocale microscopie om de vorming van sferoïden te visualiseren. Dit driedimensionale model biedt een relevant platform om tumor-stroma interacties te bestuderen en kankertherapieën te testen.

Een nieuwe Stromal Fibroblast-Gemoduleerde 3D Tumor Sferoïde Model voor het bestuderen van Tumor-Stroma Interactie en Drug Discovery

Hier beschrijven we een gebruiksvriendelijke invasietest voor glioblastoom. Deze test is geschikt voor glioblastoom stamcellen-achtige cellen. Een Fiji macro voor eenvoudige kwantificering van invasie, migratie en proliferatie wordt ook beschreven.

Een 3D Spheroid Model voor Glioblastoom

Hier wordt een protocol gepresenteerd voor de fabricage van een sferoïde beeldvormingsapparaat. Dit apparaat maakt dynamische of longitudinale fluorescentiebeeldvorming van kankercelsferoïden mogelijk. Het protocol biedt ook een eenvoudige beeldverwerkingsprocedure voor de analyse van kankercelinvasie.

Time-Resolved Fluorescentie Beeldvorming en analyse van kankercelinvasie in het 3D Spheroid Model

Tumorsferoïden worden steeds vaker gebruikt om tumorcel-micro-omgevingsinteracties en therapierespons te beoordelen. Het huidige protocol beschrijft een robuuste maar eenvoudige methode voor semi-high-throughput beeldvorming van 3D-tumorsferoïden met behulp van snelle optische clearing.

Snelle optische clearing voor semi-high-throughput analyse van tumorsferoïden

Hier presenteren we een protocol om de interactie van primaire humane monocyt-afgeleide macrofagen met een tumorsferoïde in een driedimensionale (3D) collageen I-matrix te onderzoeken, met de mogelijkheid om de impact van oplosbare en fysische eigenschappen van de micro-omgeving op celinvasie te vergelijken.

Een macrofaag-tumor sferoïde co-invasietest

Leer beeldverwerking en flowcytometrie voor celcyclusanalyse in 3D melanoomsferoïden met FUCCI. Deze methode identificeert en isoleert levende cellen uit specifieke sferoïdegebieden voor kankeronderzoek.

Beeldverwerking en flowcytometrie-gebaseerde analyse van de Cel standpunt en de celcyclus in 3D Melanoom Sferoïden

Meer video's verkennen