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DOI: 10.3791/54967-v
Huan-Huan Wei*1, Yuanlong Liu*1, Yang Wang2, Qianyun Lu1, Xuerong Yang1, Jiefu Li1, Zefeng Wang1
1Key Laboratory of Computational Biology, CAS-MPG Partner Institute for Computational Biology,Shanghai Institutes for Biological Sciences (SIBS), 2Institute of Cancer Stem Cell, Second Affiliated Hospital, Cancer Center,Dalian Medical University
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
This report details a bioengineering method for designing Artificial Splicing Factors (ASFs) that modulate gene splicing in mammalian cells. This flexible technique can be adapted to manipulate various aspects of RNA metabolism.
Este relatório descreve um método de bioengenharia para conceber e construir novos factores de splicing artificial (ASFS) que modulam especificamente a splicing de genes alvo em células de mamífero. Este método pode ser expandido para manipular vários fatores artificiais para manipular outros aspectos do metabolismo do ARN.
O objetivo geral deste protocolo é projetar fatores de splicing artificiais que possam manipular especificamente o splicing alternativo de um determinado alvo. Este método pode ajudar a responder a questões-chave no campo do processamento de RNA, como a regulação e a má regulação do splicing alternativo em células cancerígenas. A principal vantagem dessa técnica é sua flexibilidade.
Podemos projetar fatores artificiais que promovem ou inibem diferentes tipos de splicing alternativo em qualquer gene. Demonstrando este procedimento estarão Huan-Huan, um pesquisador associado do meu laboratório, e Qianyun, um pós-doutorado em meu laboratório. O DNA PUF do tipo selvagem é usado como modelo para gerar o andaime de domínio PUF personalizado.
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