23 de maio de 2025
Este protocolo descreve imagens de lapso de tempo de C. elegans baseadas em microfluídica em todo o desenvolvimento pós-embrionário.
No laboratório, trabalhamos em todos os tipos de questões de biologia do desenvolvimento. Eu mesmo trabalho mais no lado técnico, desenvolvendo métodos para melhor abordar essas questões usando técnicas de imagem. O campo de C. elegans adotou com sucesso uma enorme variedade de métodos, desde a edição de genes CRISPR, transcriptômica e proteômica, até a microscopia de super-resolução. C. elegans é um modelo incrível, no entanto, no contexto da observação in vivo em alta resolução, ele vem com seus desafios, exigindo imobilização para melhor resolução, o que por sua vez limita a viabilidade animal. O protocolo apresenta uma solução possível para imagens de C. elegans de longo prazo, permitindo que os pesquisadores adotem o método em seu próprio laboratório e estudem uma ampla variedade de processos dinâmicos de desenvolvimento diretamente in vivo. Dentro do laboratório, o método permitiu a observação detalhada da formação de órgãos, por exemplo, no contexto da morfogênese ou após divisões de células somáticas na idade adulta. Desde então, o método foi adotado por vários laboratórios que estudam uma ampla gama de processos de desenvolvimento.
[Apresentador] Para começar, conecte o dispositivo à estrutura de suporte e monte-o no microscópio vertical. Encha uma seringa com água deionizada e, em seguida, prenda uma agulha de calibre 23 e um pedaço longo de um tubo de 16 polegadas com um pino de aço dobrado oco. Encha a tubulação com água deionizada da seringa e insira o pino de aço no orifício perfurado da entrada da válvula para conectar a tubulação. Remova a seringa e a agulha antes de conectar o tubo ao solenóide fora do chip. Usando o software de imagem, ligue o solenóide e pressurize o dispositivo por vários minutos para expelir todo o ar da válvula. Verifique a conclusão verificando visualmente se a interface ar-água parece escura e desaparece no material PDMS. Desligue o solenóide usando o software de imagem. Em seguida, encha uma seringa de um mililitro com a solução de bactérias filtradas e conecte uma agulha de calibre 30 e um pedaço longo de um tubo de 32 polegadas à agulha. Pressione o êmbolo para encher a agulha e o tubo conectado com a solução bacteriana. Em seguida, usando uma pinça, insira o tubo de um por 32 polegadas diretamente na entrada de alimentos do dispositivo microfluídico e coloque a seringa na bomba da seringa. Pressione o êmbolo da seringa usando o parafuso de aperto manual na parte traseira para encher o dispositivo com líquido. Bloqueie a entrada e a saída do sem-fim com pinos de aço selados e aplique pressão adicional usando o parafuso de fixação para remover qualquer ar restante do dispositivo. Em seguida, remova o pino de aço bloqueado na saída e conecte o recipiente de resíduos à tomada. Empurre a seringa para garantir que o recipiente de resíduos esteja conectado corretamente e que não haja bloqueios no sistema. Remova o segundo pino de aço bloqueado da entrada e empurre a seringa até que uma pequena gota de líquido apareça na entrada do sem-fim. Em seguida, usando uma agulha de calibre 23, conecte um pedaço mais longo de um tubo de 16 polegadas medindo aproximadamente 15 a 20 centímetros a uma seringa de um mililitro cheia de tampão S-basal. Prenda um pino de aço reto de calibre 23 na outra extremidade do tubo. Encha a agulha e o tubo com tampão S-basal da seringa. Agora, insira o pino de aço na extremidade da tubulação no tubo que contém as minhocas e empurre uma pequena quantidade de líquido através da tubulação para garantir que não haja mais ar. Puxe os vermes para dentro do tubo sem puxá-los para dentro da seringa. Em seguida, empurre a seringa conectada aos vermes até que uma pequena gota de líquido apareça no pino de aço e insira o pino de aço na entrada do verme do dispositivo microfluídico. Coloque o dispositivo em um microscópio com baixa ampliação, 5x ou 10x, ou em um microscópio de dissecação. Posicione o dispositivo de modo que a entrada seja visível em um lado do campo de view e a parte de trás da entrada do canal de armadilha seja visível do outro lado. Empurre suavemente o êmbolo da seringa sem-fim. Em seguida, empurre os animais em direção à matriz de canais. Quando um animal estiver de frente para o canal, empurre-o para dentro do canal e repita para outros animais. Depois de capturar animais suficientes, coloque a seringa, ainda presa à entrada do verme, no estágio do microscópio, onde permanecerá durante todo o experimento. Se o carregamento foi realizado em um microscópio de dissecação, transfira o dispositivo para o microscópio de imagem. Agora, ligue a bomba de seringa e execute-a a uma taxa predefinida de um microlitro por hora para 0,5 microlitros. Programe a bomba de seringa de forma que funcione a um microlitro por hora para 0,5 microlitros, após o que a vazão é aumentada em 100 microlitros por hora para 0,5 microlitros, e o padrão de fluxo é repetido ao longo do experimento. Coloque o dispositivo no microscópio stage e certifique-se de que está firmemente preso. Mude para a ampliação de imagem desejada. Identifique os animais e regiões de interesse dentro da matriz de canais de armadilha e configure as condições de imagem desejadas. Imagem nas condições de imagem desejadas, acionando a válvula no chip através do solenóide 10 segundos antes da aquisição da imagem para que os animais sejam mantidos no lugar. O dispositivo microfluídico manteve alta qualidade de imagem em várias modalidades de microscopia, incluindo campo claro, epifluorescência, disco giratório confocal e métodos de super-resolução devido ao uso de uma lamínula de 170 micrômetros de espessura. Desenvolvimento de células epiteliais de Caenorhabditis elegans visualizadas desde o início de L1 até o estágio larval de L2 médio. A indução das células precursoras primárias da vulva desbotada e suas divisões subsequentes do final de L1 ao início do estágio larval de L4 foi evidente. Estágios de formação da vulva desde o início de L3 até a idade adulta. As imagens adquiridas foram aprimoradas por meio de deconvolução e registro de imagens, melhorando a clareza visual As divisões celulares observadas ocorreram de maneira consistente e oportuna em todos os animais, com todas as divisões concluídas dentro das durações típicas do estágio larval. O comprimento das gônadas aumentou de forma constante durante os estágios L2 e L3, com medidas consistentes possibilitadas pela orientação reta dos animais.
Este protocolo descreve um método baseado em microfluídica para aquisição de imagens com lapso de tempo de C. elegans durante todo o desenvolvimento pós-embrionário. Ele aborda os desafios da observação in vivo com alta resolução, mantendo a viabilidade dos animais.
A imagem longitudinal de alta resolução de C. elegans em todos os estágios larvais permite a visualização direta de processos dinâmicos de desenvolvimento em um modelo geneticamente manipulável e transparente. Este método de imobilização microfluídica preserva a viabilidade e a orientação dos animais, apoiando um fenotipagem robusta e quantitativa, essencial para a descoberta inicial e a validação de alvos. A abordagem aumenta a confiança preditiva em pipelines de biologia do desenvolvimento e facilita a padronização entre laboratórios para um impacto escalável em P&D.
Este método de imagem microfluídica integra-se ao continuum de descoberta, desde a verificação inicial de hipóteses até a validação em modelos pré-clínicos, apoiando tanto estudos mecanicistas quanto fluxos de trabalho de triagem quantitativa.