RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
DOI: 10.3791/64832-v
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
В настоящем протоколе описан метод валидации поведенческого теста и биоинформатического прогнозирования терапевтической эффективности традиционного монгольского лекарственного средства Зади-5 при депрессии.
Терапевтическая эффективность Zadi-5 в лечении депрессии может быть установлена с помощью поведенческих тестов, в то время как сетевая фармакология может предсказать потенциальные механизмы, лежащие в основе его эффективности. Сетевая фармакология может помочь в изучении традиционных лекарственных средств, которые демонстрируют сложные механизмы действия, и еще больше минимизировать время и затраты, необходимые для исследования. Такие тесты, как тест открытого поля, тест на потребление сахарозы и водный лабиринт Морриса, являются золотым стандартом для оценки аппетита, уровня мотивации, способности к обучению и памяти на животных моделях неврологических расстройств.
Эти тесты являются простыми, объективными и разумными методами оценки. Создание модели на животных имеет решающее значение для понимания патологических механизмов и эффектов нового лекарства в исследовании депрессивного расстройства. Чтобы создать хорошую модель депрессии, исследователи должны правильно упорядочить и скорректировать интенсивность стимулов.
Для начала примените выбранные стимулы депрессии в сочетании с изоляцией в течение 28 дней ко всем крысам, кроме контрольной, и выращивайте крыс в индивидуальных клетках. Чтобы выполнить тест открытого поля, разделите черный ящик на девять квадратных областей равной площади. Оснастите бокс системой анализа видеослежения.
Через сутки после последнего зонда поместите крысу в центральный квадрат и записывайте ее горизонтальную и вертикальную активность в течение трех минут. Затем подсчитайте количество перечеркнутых квадратов со всеми паузами как горизонтальное упражнение, а стояние и груминг — как вертикальное упражнение. После каждого теста очищайте коробку 75%-ным спиртом, чтобы удалить запах крысы для последующих тестов.
Затем проведите тест на потребление сахарозы, взвесив соответствующие бутылки до и после употребления. И рассчитайте 60-минутную норму предпочтения сахарозы в нулевый, седьмой, 14-й, 21-й и 28-й дни, используя это уравнение. Чтобы выполнить тест водного лабиринта Морриса, разделите бассейн на четыре квадранта.
Расположите квадранты от одного до четырех, а скрытую платформу разместите в третьем квадранте, на один сантиметр ниже поверхности воды. Добавьте молоко в бассейн для некоторого уровня непрозрачности. Затем поместите испытуемого-крысу в лабиринт в разных квадрантах, чтобы он искал платформу в течение 120 секунд.
И записывайте время задержки с помощью системы анализа видеоследов Morris Water Maze. Поместите крысу в фиксированное положение в бассейне. Если субъект не может найти скрытую платформу в течение 120 секунд, запишите задержку как 120 секунд.
Затем снимите платформу, поместите крысу в воду и запишите количество пересечений зоны в течение 120 секунд. Просмотрите веб-страницу фармакологии системы традиционной китайской медицины и введите семена семени myristicae, корни al-glandia-radiks и piperis longi fructus в раздел названий трав, чтобы получить названия химических веществ. Установите фармакокинетический индекс пероральной биодоступности (OB) более 30%, а лекарственный индекс — более 0,18.
Выполните поиск активных компонентов в фармакопее китайской медицины, чтобы определить химические названия каждого компонента. Затем выполните поиск по идентифицированным химическим названиям в Pub Chem, чтобы найти изомерные улыбки или чернила. Идентификация белков-мишеней активных компонентов с помощью предсказания SEA, Batman и швейцарской мишени с изомерными улыбками или чернилами и поиск перекрывающихся белков.
Скопируйте данные в файл Excel. Затем выполните поиск и определите потенциальные белковые мишени для депрессии, используя ключевые слова «депрессия» и «депрессивное расстройство» в GeneCards, DisGeNET и DrugBank. Скопируйте данные в файл Excel.
Просмотрите диаграмму Венна и загрузите мишени депрессии в первый список. Затем загрузите мишени для активных компонентов Zadi-5 во втором списке и отправьте. Получите диаграмму Венна и отфильтруйте перекрывающиеся целевые кандидаты.
Создайте электронную таблицу, которая называется сетью. Также создайте электронную таблицу, называемую type. Экспортируйте лист в Cytoscape, чтобы построить сеть, Zadi-5 herbs ingredients disease.
Установите общие целевые объекты в строковой базе данных для анализа их взаимодействий. Установите тип белка как homosapiens. Установите значение порога взаимодействия равным 0,9, чтобы выбрать только экспериментально проверенные типы и не отображать узлы одиноких островов.
Откройте инструмент DAVID и вставьте 86 потенциальных антидепрессантов-мишеней Zadi-5 в стартовую скобку анализа, чтобы изучить соответствующие сигнальные пути. Загрузите документ о пути к бочонку. Выберите гены в пути PI3k-AKT из анализа обогащения и вставьте их в электронную таблицу, чтобы создать тип и сетевой документ.
Экспортируйте тип сетевого документа в Cytoscape, чтобы создать сеть визуализированных составных целевых путей PI3K-AKT. Исследуемая группа животных не показала существенных различий до хронического непрогнозируемого легкого стресса или стимуляции CUMS. После создания модели CUMS вертикальные и горизонтальные баллы группы были ниже, чем в контрольной группе.
По сравнению с модельной группой, вертикальные и горизонтальные баллы в контрольной группе с положительным результатом и в группе Зади-5 были достоверно выше. На нулевой день у испытуемых групп не было существенной разницы в потреблении сахарозы. На 28-й день группы Zadi-5 и контрольная группа с положительным результатом были выше, чем в модельной группе.
В водном лабиринте Морриса задержка группы моделей для поиска платформы была значительно выше по сравнению с контрольной группой. Латентность в контрольной и Зади-5 группах была ниже, чем в модельной группе. Что касается количества пересечений зон, то модельная группа показала меньшее количество пересечений, чем контрольная группа.
В контрольной группах и группе Zadi-5 было выявлено больше скрещиваний, чем в модельной группе. Анализ диаграммы Венна выявил 86 перекрывающихся мишеней Zadi-5 из 1000 белковых мишеней, связанных с депрессией. На основании этих данных были построены мишени для лечения заболеваний ингредиентов трав Зади-5 и анализ сети белок-белкового взаимодействия кандидатов в мишени.
Согласно анализу пути KEG, сигнальный путь PI3K-AKT занял седьмое место. Он был связан со многими сигнальными путями. Соответственно, путь PI3K-AKT считался относительно более важным, чем другие пути обогащения.
Во время этой процедуры очень важно воздерживаться от повторения одного и того же типа стимулов в течение нескольких дней подряд. После анализа компонентов Zadi-5 в онлайн-базах данных качество валидации может быть обеспечено жидкостной хроматографией, масс-спектрометрией и спектроскопией ядерного магнитного резонанса.
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
Related Videos
06:19
Related Videos
107.5K Views
05:42
Related Videos
39.6K Views
07:57
Related Videos
22K Views
07:13
Related Videos
18.5K Views
06:08
Related Videos
9.6K Views
05:47
Related Videos
8K Views
05:56
Related Videos
1.7K Views
06:15
Related Videos
1.2K Views
08:15
Related Videos
526 Views
08:29
Related Videos
16.7K Views