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13.7:

Korrekturlesen

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Während der DNA-Replikation werden Nucleotiden normalerweise zu einem neuen Strang in einer Reihenfolge hinzugefügt, die mit der Vorlage übereinstimmt, wobei sich Adenin mit Thymin verbindet und Cytosin mit Guanin. Jedoch können Nukleotiden unrichtig gepaart werden, zum Beispiel Adenin mit Cytosin. Diese Fehler können während der Replikation verhindert oder korrigiert werden durch eine Reihe von Korrekturleseschritten, die von DNA Polymerase durchgeführt werden, dem Enzym, das DNA synthetisiert. Zunächst hat DNA Polymerase eine höhere Affinität für korrekt gepaarte Nukleotiden, was die Wahrscheinlichkeit von inkorrekten Paarungen senkt. Zweitens, während die Nukleotiden anfangen, sich nach Vorlage zu paaren, erlebt DNA Polymerase eine konformative Veränderung, die es wahrscheinlich macht, dass sich unrichtig gepaarte Nukleotiden lösen und somit ermöglichen, dass die korrketen Nukleotiden hinzugefügt werden. Drittens, wenn ein unrichtiges Nukleotid es schafft, einer wachsenden DNA-Kette hinzugefügt zu werden, wird es nicht entsprechend der Vorlage korrekt gepaart werden auf Grund von strukturellen Problemen. Diese unrichtige Paarung am 3-Strich Ende der wachsenden Kette pausiert die DNA-Synthese. Das 3-Strich Ende wird dann zu einer spezifischen Exonukleasestelle der DNA Polymerase übergehen, die Nukleotiden in der 3-Strich bis 5-Strich Richtung entfernt. Bei diesem exonucleolytischen Korrekturleseschritt wird das falsch gepaarte Ende entfernt und dann von den korrekten Nucleotiden ersetzt.

13.7:

Korrekturlesen

Überblick

Die Synthese neuer DNA-Moleküle beginnt, wenn die DNA-Polymerase Nukleotide in einer Sequenz miteinander verbindet, die komplementär zum Matrizenstrang ist. Die DNA-Polymerase hat eine höhere Affinität für die richtige Base, um die Genauigkeit der DNA-Replikation zu gewährleisten. Die DNA-Polymerase führt außerdem während der Replikation mit Hilfe einer Exonuklease-Domäne, die falsche Nukleotide vom entstehenden DNA-Strang abschneidet, Korrekturen durch.

Fehler während der Replikation werden durch das DNA-Polymerase-Enzym korrigiert

Die genomische DNA wird in der 5 bis 3 Richtung synthetisiert. Jede Zelle enthält eine Anzahl von DNA-Polymerasen, die unterschiedliche Rollen bei der Synthese und Korrektur von Fehlern in der DNA spielen. Die DNA-Polymerasen delta und epsilon können die DNA-Sequenzen überprüfen während der Replikation von nuklearer DNA. Diese Polymerasen überprüfen jede Base, nachdem sie an den neuen Strang gefügt wurde. Wenn die neu hinzugefügte Base falsch verknüpft wurde, kehrt die Polymerase die Richtung um (von 3 zu 5) und verwendet eine Exonuklease-Domäne, um die falsche Base abzutrennen. Anschließend wird sie durch die richtige Base ersetzt.

Mutationen in der Exonuklease-Domäne der DNA-Polymerase stehen mit Krebserkrankungen im Zusammenhang

Korrekturlesen ist wichtig, um zu verhindern, dass Mutationen in neu synthetisierter DNA auftreten. Was passiert aber, wenn der Korrekturlesemechanismus ausfällt? Wenn eine Mutation die Exonuklease-Domäne der DNA-Polymerase verändert, verliert sie die Fähigkeit, falsche Nukleotide zu entfernen. Die Folge ist, dass sich Mutationen schnell im gesamten Genom anhäufen können. Diese Art von Mutation wird mit verschiedenen Krebsarten in Verbindung gebracht.

Eine Low-Fidelity-DNA-Polymerase kann mutierte DNA-Sequenzen erzeugen

Modifizierte DNA-Polymerasen werden in der Laborwissenschaft für die Polymerase-Kettenreaktion (PCR) verwendet, eine in vitro Technik zur Herstellung vieler Kopien von bestimmten DNA-Fragmenten. Während High-Fidelity-Polymerasen verwendet werden, wenn es wichtig ist, dass das Endprodukt perfekt ist, versuchen einige Techniken, wie z.B. die fehleranfällige PCR, absichtlich Mutationen in einem DNA-Abschnitt zu erzeugen. Diese Techniken verwenden Polymerasen, die beeinträchtigt in ihrer Fähigkeit des Korrekturlesens sind.

Suggested Reading

Barbari, Stephanie R., and Polina V. Shcherbakova. "Replicative DNA polymerase defects in human cancers: Consequences, mechanisms, and implications for therapy." DNA Repair 56 (2017): 16-25. [Source]