Back to chapter

13.7:

Редактирование

JoVE Core
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Core Biology
Proofreading

Languages

Share

Во время репликации ДНК, нуклеотиды обычно добавлены к новой цепочке, в последовательности, дополняющей шаблон. С аденином, связывающимся с тиамином и цитозином, связывающимся с гуанином. Однако нуклеотиды могут быть неправильно сопряжены.Например, аденин с цитозином. Эти ошибки можно предотвратить или исправить во время репликации сериями корректирующих шагов, предпринятых ДНК-полимеразой, ферментом, который синтезирует ДНК. Во-первых, ДНК-полимераза имеет более высокий уровень сродства для правильно спаренных нуклеотидов, и это снижает вероятность появления неверных пар.Во-вторых, когда нуклеотиды начинают спариваться с шаблоном, ДНК-полимераза подвергается изменениям конформации, что приводит к неправильному сопряжению нуклеотидов, которые, скорее всего, будут диссоциировать, обеспечивая правильный выбор нуклеотидов, которые необходимо добавить. В-третьих, если неверному нуклеотиду удаётся добавиться к растущей цепочке ДНК, он не будет сопряжён правильно с шаблоном из-за структурных проблем. Это неправильное сопряжение на конце 3-штрих растущей цепи приведёт к тому, что синтез ДНК будет приостановлен.Конец 3-штрих будет затем передвинут к специфическому сайту экзонуклеазы на ДНК-полимеразе для удаления нуклеотидов в 3-штрих в направлении к 5-штрих. На этом этапе экзонуклеолитической корректуры, неправильно сопряжённый конец будет удалён, а затем заменён на правильные нуклеотиды.

13.7:

Редактирование

Обзор

Синтез новых молекул ДНК начинается, когда полимераза ДНК соединяет нуклеотиды в последовательности, которая дополняет цепь ДНК-шаблона. Полимераза ДНК имеет более высокое сродство к правильной базе, чтобы обеспечить правильную репликацию ДНК. Полимераза ДНК, кроме того, корректируется во время репликации, используя домен экзонуклеазы, который отсекает неправильные нуклеотиды от зарождающейся нити ДНК.

Ошибки во время репликации исправляются ферментом полимеразы ДНК

Геномная ДНК синтезируется в направлении от 5′ до 3′ Каждая клетка содержит ряд полимераз ДНК, которые играют различные роли в синтезе и исправлении ошибок в ДНК; Дельта полимеразы ДНК и эпсилон обладают способностью корректирования при репликации ядерной ДНК. Эти полимеразы «читают» каждую базу после того, как она добавляется в новую нить. Если вновь добавленная база неверна, полимераза меняет направление (движется от 3′ до 5′) и использует экзонуклеолитический домен, чтобы отрезать неправильную базу. Впоследствии он заменяется правильной базой.

Мутации в домене экзонуклеазы ДНК полимеразы связаны с раками

Проверка важна для предотвращения мутаций в недавно синтезированной ДНК, но что происходит, когда механизм корректирования не удается? Когда мутация изменяет область экзонуклеазы полимеразы ДНК, она теряет способность удалять неправильные нуклеотиды. Вследствие этого мутации могут быстро накапливаться по всему геному. Этот тип мутации был связан с различными видами рака.

Некачественные ДНК полимеразы могут генерировать мутировавшие последовательности ДНК

Модифицированные полимеразы ДНК используются в лабораторных науках для полимеразной цепной реакции (ПЦР), метода in vitro для изготовления многих копий конкретных фрагментов ДНК. В то время как полимеразы высокой точности используются, когда важно, чтобы конечный продукт был совершенным, некоторые методы, такие как подверженные ошибкам ПЦР, стремятся генерировать мутации в участке ДНК нарочно. Эти методы используют полимеразы, которые скомпрометировали способность корректирования.

Suggested Reading

Barbari, Stephanie R., and Polina V. Shcherbakova. "Replicative DNA polymerase defects in human cancers: Consequences, mechanisms, and implications for therapy." DNA Repair 56 (2017): 16-25. [Source]