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7.11:

Cinetiche Enzimatiche

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Enzyme Kinetics

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– [Istruttore] All’interno di una cellula diverse condizioni ambientali, come la concentrazione del substrato, possono influenzare notevolmente la velocità con cui gli enzimi catalizzano le reazioni chimiche. Questo processo, chiamato cinetica enzimatica, può essere rappresentato graficamente con la velocità di reazione sull’asse y e la condizione variabile, concentrazione del substrato in questo esempio, sull’asse x. La velocità della reazione è la velocità alla quale il prodotto è formato e può raggiungere una velocità massima, nota come V max, che si estende quando tutti gli enzimi disponibili sono legati ai substrati. Pertanto la velocità di reazione è limitata dalla concentrazione di enzimi disponibili per il legame. Questo grafico può anche rivelare la velocità con cui aumenta la velocità di reazione. La variabile viene riflessa da “Km”, la concentrazione del substrato a metà della V max e rappresenta l’affinità dell’enzima o la tendenza a legarsi al substrato. Un enzima con un Km basso ha un’alta affinità perché raggiunge la massima velocità di reazione a una bassa concentrazione di substrato. In modo simile, un numero di km elevato corrisponde a una bassa affinità perché l’enzima richiede una maggiore concentrazione di substrato per massimizzare la sua velocità di reazione.

7.11:

Cinetiche Enzimatiche

Gli enzimi accelerano le reazioni abbassando l’energia di attivazione dei reagenti. La velocità alla quale l’enzima trasforma i reagenti in prodotti è chiamata velocità di reazione. Diversi fattori influenzano il tasso di reazione, compreso il numero di reagenti disponibili. La cinetica enzimatica è lo studio di come un enzima cambia il tasso di una reazione.

Gli scienziati in genere studiano la cinetica enzimatica con una quantità fissa di enzimi nell’ambiente controllato di una provetta. Quando più reattore, o substrato, viene aggiunto a una quantità fissa di enzima, il tasso di reazione aumenta come l’enzima può fare più prodotto. Di conseguenza, quando il tasso di reazione è rappresentato graficamente rispetto alla concentrazione di substrato, aumentando il substrato aumenta il tasso di reazione. Tuttavia, una volta occupati tutti i siti attivi dell’enzima, il tasso di reazione altipiani. La concentrazione di substrato al quale viene raggiunto il tasso massimo di reazione è chiamata Vmax. Il numero di molecole enzimatiche presenti limita Vmax. Se la quantità di enzima è aumentata, Vmax aumenta, ma l’aggiunta di più substrato non ha alcun effetto.

Il grafico del tasso di reazione rispetto alla concentrazione del substrato può rivelare altre importanti caratteristiche della cinetica di un enzima. La concentrazione di substrato alla quale la velocità di reazione è a metà del Vmax (cioè, 1/2 Vmax) è chiamata costante di Michaelis (Km). Km è una rappresentazione dell’affinità tra un enzima e un substrato. Gli enzimi con un Km inferiore richiedono meno substrato per raggiungere Vmax e quindi hanno una maggiore affinità per il loro substrato. È interessante notare che, per molti enzimi, il valore di Km è molto vicino alla concentrazione cellulare del substrato. Vicino a Km, lievi cambiamenti nella concentrazione di substrato possono avere un impatto significativo sul tasso di reazione, quindi piccoli cambiamenti nella disponibilità di substrato cellulare possono influenzare la funzione di un intero percorso biologico.

Non tutti gli enzimi producono il grafico a forma di substrato iperbolico noto come cinetica Michaelis Menten. La cinetica Michaelis Menten presuppone che l’enzima catalizzi un singolo substrato. Gli enzimi regolati all’origine hanno più siti attivi e tendono a produrre un grafico a forma di sigmoide quando il tasso di reazione viene tracciato rispetto alla concentrazione di substrato.

Suggested Reading

Johnson, Kenneth A. “A Century of Enzyme Kinetic Analysis, 1913 to 2013.” FEBS Letters 587, no. 17 (September 2, 2013): 2753–66. [Source]

Suarez, R. K., J. F. Staples, J. R. B. Lighton, and T. G. West. “Relationships between Enzymatic Flux Capacities and Metabolic Flux Rates: Nonequilibrium Reactions in Muscle Glycolysis.” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 94, no. 13 (June 24, 1997): 7065–69. [Source]