Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove

21.7: Peptid Bağları
İÇİNDEKİLER

JoVE Core
Chemistry

A subscription to JoVE is required to view this content. You will only be able to see the first 20 seconds.

Education
Peptide Bonds
 
TRANSKRİPT

21.7: Peptid Bağları

Bir peptit bağı, bir dehidrasyon reaksiyonu yoluyla amino asitleri kovalent olarak bağlar. Bir amino asidin karboksil grubu ile başka bir amino asidin amino grubu birleşerek bir su molekülü açığa çıkarır. Ortaya çıkan bağ, peptit bağıdır. Bu tür bağlantıların oluşturduğu ürünler peptitlerdir. Bu büyüyen zincire daha fazla amino asit katıldıkça ortaya çıkan zincir bir polipeptittir. Her polipeptidin bir ucunda serbest amino grubu vardır. Bu uçta N-terminali veya amino-terminali bulunur ve diğer uçta serbest bir karboksil grubu C- veya karboksil-terminali bulunur. Polipeptit ve protein terimleri bazen birbirinin yerine kullanılırken, bir polipeptit teknik olarak bir amino asit polimeridir, protein terimi ise polipeptit veya bir araya gelmiş ve sıklıkla peptit olmayan prostetik gruplara, ayrı bir şekle ve benzersiz bir işleve sahip olan bir polipeptitler için kullanılır.

Peptit Bağlarının Kimyası

Bir peptit bağı, rezonans nedeniyle katı bir düzlemsel yapıya sahiptir. Bu rezonans, karbonil grubunda bulunan çift bağlar ile tek bir bağ olan karbon ve azot arasındaki peptit bağı arasındaki elektronların paylaşımını içerir. Bu, rezonans olmadığında beklenen uzunluktan farklı olarak çift bağın uzunluğunun artması ve tek bağın uzunluğunun kısalmasıyla sonuçlanır.

Peptit bağları iki olası konformasyonda meydana gelebilir: cis ve trans. Cis konfigürasyonunda, peptit bağıyla bağlanan her iki amino asidin alfa karbonları bağın aynı tarafındadır; ve trans konfigürasyonunda, peptit bağıyla bağlanan iki amino asidin alfa karbonları bağın zıt taraflarındadır. Cis konfigürasyonu genellikle prolin, amino grubunu bağın oluşumuna katkıda bulunduğunda meydana gelir; bununla birlikte, prolinlerin yalnızca yaklaşık %10'unun önünde cis bağları bulunur.

Sert yapısından dolayı peptit bağları etrafında rotasyon mümkün değildir. Bununla birlikte, alfa karbonu sırasıyla azot ve karbon atomlarına bağlayan bağlar etrafında rotasyon meydana gelebilir.

Bu metin bu kaynaktan uyarlanmıştır: Openstax, Biology 2e, Chapter 3.4: Proteins.

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter