Summary

टमाटर विश्लेषक: एक उपयोगी सॉफ्टवेयर आवेदन के लिए दो - आयामी ऑब्जेक्ट्स से सटीक और विस्तृत morphological और वर्णमिति डाटा एकत्रित

Published: March 16, 2010
doi:

Summary

टमाटर विश्लेषक (टीए) एक प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य और सटीक तरीके में दो आयामी आकार और रंग की विशेषताओं quantifies. टमाटर फल के उच्च गुणवत्ता छवियों digitalized, इन छवियों और कई अनुप्रयोगों इस सॉफ्टवेयर के माध्यम से उत्पन्न डेटा का उपयोग कर के morphological और रंग विश्लेषण प्राप्त करने के लिए एक कदम दर कदम प्रक्रिया का वर्णन कर रहे हैं.

Abstract

Measuring fruit morphology and color traits of vegetable and fruit crops in an objective and reproducible way is important for detailed phenotypic analyses of these traits. Tomato Analyzer (TA) is a software program that measures 37 attributes related to two-dimensional shape in a semi-automatic and reproducible manner1,2. Many of these attributes, such as angles at the distal and proximal ends of the fruit and areas of indentation, are difficult to quantify manually. The attributes are organized in ten categories within the software: Basic Measurement, Fruit Shape Index, Blockiness, Homogeneity, Proximal Fruit End Shape, Distal Fruit End Shape, Asymmetry, Internal Eccentricity, Latitudinal Section and Morphometrics. The last category requires neither prior knowledge nor predetermined notions of the shape attributes, so morphometric analysis offers an unbiased option that may be better adapted to high-throughput analyses than attribute analysis. TA also offers the Color Test application that was designed to collect color measurements from scanned images and allow scanning devices to be calibrated using color standards3.

TA provides several options to export and analyze shape attribute, morphometric, and color data. The data may be exported to an excel file in batch mode (more than 100 images at one time) or exported as individual images. The user can choose between output that displays the average for each attribute for the objects in each image (including standard deviation), or an output that displays the attribute values for each object on the image. TA has been a valuable and effective tool for indentifying and confirming tomato fruit shape Quantitative Trait Loci (QTL), as well as performing in-depth analyses of the effect of key fruit shape genes on plant morphology. Also, TA can be used to objectively classify fruit into various shape categories. Lastly, fruit shape and color traits in other plant species as well as other plant organs such as leaves and seeds can be evaluated with TA.

Protocol

टमाटर एनालाइज़र सॉफ्टवेयर (टीए) के लिए एक निश्चित आकार और छवि संकल्प, डॉट्स प्रति इंच (पिक्सेल) (डीपीआई) में मापा की वस्तुओं की पहचान करने के लिए डिज़ाइन किया गया है. सॉफ्टवेयर स्वचालित रूप से स्कैन की गई छवि में फल की सीमाओं को निर्धारित करता है. वस्तु सीमा समोच्च अनुरेखण, सटे एक छवि में एक वस्तु की सीमा का वर्णन अंक की एक सूची में जो परिणाम के माध्यम से निर्धारित किया जाता है. सभी फल आकार माप सीमाओं पर आधारित गणना कर रहे हैं. रंग परीक्षण "मॉड्यूल टमाटर विश्लेषक रंग टेस्ट" के लिए सॉफ्टवेयर के द्वारा मान्यता प्राप्त सीमाओं के अंदर रंग मापदंडों मात्रा ठहराना करने के लिए डिज़ाइन किया गया है. R (लाल), जी (हरा), और बी (नीला): रंग माप RGB रंग अंतरिक्ष पर आधारित हैं. प्रत्येक पिक्सेल के लिए औसत मूल्यों आरजीबी रंग परीक्षण मॉड्यूल के द्वारा लिया जाता है और तब जो एल का उपयोग करता है CIELAB रंग अंतरिक्ष अनुवादित * एक *, ख के लिए एक तरीका है कि मानव दृश्य धारणा approximates में रंग का वर्णन * रंग परीक्षण मॉड्यूल ह्यू और Chroma रंग डिस्क्रिप्टर एक * और ख के आधार पर की गणना *. टमाटर फल और आकारिकी और रंग विशेषताएँ टीए सॉफ्टवेयर पैकेज का उपयोग कर के बाद अर्द्ध स्वचालित विश्लेषण के डिजिटलीकरण के लिए एक कदम दर कदम प्रोटोकॉल में वर्णित है. प्रोटोकॉल आठ चरणों में विभाजित है: 1) चयन और संयंत्र सामग्री, 2 की तैयारी) छवि संग्रह, 3) सॉफ्टवेयर अधिष्ठापन 4) छवि विश्लेषण और टीए रंग टेस्ट, 5 के लिए अंशांकन) विशेषताओं के मैनुअल समायोजन, 6) उपयोगकर्ता परिभाषित सेटिंग्स, 7) और निर्यात डेटा सहेजा जा रहा है, और 8) डेटा विश्लेषण के उदाहरण. 1. चयन और संयंत्र सामग्री की तैयारी फलों को साफ एवं सूखा होना चाहिए. मांसल फल अतिपक्व नहीं हो सकता है क्योंकि नरम आकार विरूपण कारण जब फल काटने चाहिए. एक तेज दाँतेदार चाकू या एक नई धार के साथ फल काटो. विश्लेषण और मूल्यांकन किया जा विशेषताएँ के प्रकार पर निर्भर करता है, फल केंद्र के माध्यम से हो या longitudinally transversely में कटौती करनी चाहिए. रंग विश्लेषण longitudinally या transversely फल के रूप में के रूप में अच्छी तरह से अन्य विशिष्ट सुविधाओं को उजागर करने के लिए डिज़ाइन वर्गों में कटौती करने के लिए लागू किया जा सकता है. यदि फल बहुत रसदार है ऊतक या कागज तौलिये के साथ सोख्ता द्वारा फल के आंतरिक भाग सूखी. 2. छवि संग्रह फल और कटौती नीचे की ओर के साथ स्कैनर पर जगह कट. ऊपर एक शासक और फल के नीचे एक लेबल निकालें. शासक कि सही स्कैन संकल्प चयनित किया गया है सत्यापित करने के लिए प्रयोग किया जाता है, और फल विशेषताओं की सही माप के लिए महत्वपूर्ण है. उच्च throughput डेटा का विश्लेषण के लिए, यह आवश्यक है एक समय में केवल एक संयंत्र (या जीनोटाइप) से फल और फल है कि या तो longitudinally या transversely कटौती नहीं बल्कि एक ही स्कैन पर दोनों का मिश्रण है स्कैन स्कैन करने के लिए. प्लेस फल करीब एक साथ, लेकिन आसन्न फल छू होने से बचें. इसके अलावा बड़े स्कैनर पर फलों के बीच खाली स्थान से बचें. यदि वस्तुओं बहुत दूर एक दूसरे से अलग हैं, छवि एडोब फ़ोटोशॉप या जिम्प के रूप में इमेजिंग सॉफ्टवेयर प्रादेशिक सेना के साथ विश्लेषण करने से पहले का उपयोग कर चालाकी से किया जाना चाहिए. चूंकि टीए सॉफ्टवेयर छवि संकल्प का उपयोग करता है के लिए सही आकार को मापने के लिए, स्कैन संकल्प के उचित चयन बाद में विश्लेषण के लिए महत्वपूर्ण है. एक नियम के रूप में, अगर वस्तुओं के बीच 1 और 8 सेमी हैं, 200 या 300 डीपीआई (पिक्सल / इंच) पर स्कैन. यदि वस्तुओं> 8 सेमी, 100 डीपीआई पर स्कैन. बीज के रूप में बहुत छोटा (<1 सेमी) वस्तुओं के लिए, 750 डीपीआई या उच्च पर स्कैन. जब बैच विश्लेषण की योजना बनाई है (नीचे देखें) और फल आकार अत्यधिक परिवर्तनशील विभिन्न पौधों के बीच नहीं है, यह सभी एक ही प्रयोग के लिए एकत्र किया जा छवियों के लिए एक स्कैनर रिज़ॉल्यूशन सेटिंग का चयन करने के लिए सुविधाजनक है. रंग परीक्षण के लिए 200 डीपीआई स्कैनर का संकल्प सेट अगर फल <8 सेमी. यदि फल> 8 सेमी, 100 डीपीआई पर स्कैन. इसके अलावा, स्कैनर में उपलब्ध रंग की सबसे बड़ी संख्या में उत्पादन छवि का आकार निर्धारित किया है. ऑब्जेक्ट्स को एक काले या बहुत अंधेरा छाया है कि विश्लेषण के साथ हस्तक्षेप करेगा रोकने की पृष्ठभूमि के साथ स्कैन किया जाना चाहिए. एक अंधेरे पृष्ठभूमि स्कैनर पर एक गत्ता बॉक्स रखकर प्राप्त किया जा सकता है इतना है कि सभी प्रकाश स्क्रीन से प्रतिबंधित है. यदि एक सफेद पृष्ठभूमि का उपयोग किया है, टीए कार्य करने के लिए विफल क्योंकि आवेदन एक अंधेरे पृष्ठभूमि का उपयोग के लिए अनुकूलित है. छवि प्रारंभिक छवि सहेजने से पहले () स्कैन करने के लिए बड़े खाली स्थान से बचने के बाद उत्पन्न किया जाना चाहिए. यदि इस स्तर पर छवि फसली नहीं है, यह एडोब फ़ोटोशॉप या जिम्प के रूप में इमेजिंग सॉफ्टवेयर का उपयोग कर के प्रादेशिक सेना के साथ विश्लेषण करने से पहले फसली होना चाहिए. रंग विश्लेषण के लिए, स्कैनर की जरूरत है अगर उपयोगकर्ता का इरादा रखता है calibrated किया जा सार्वभौमिक एल आरजीबी मूल्यों अनुवाद करेंगे * एक * और ख पैमाने *. रंग परीक्षक की स्कैनिंग (चित्रा 1) के पहले या दौरान फल की स्कैनिंग हो जाना चाहिए. स्कैन रंग परीक्षक फल छवियों के रूप में में एक ही फ़ोल्डर में बचाया जाना चाहिए. स्कैनर अंशांकन आवश्यक है क्योंकि स्कैनर कैसे वे रंग घ कब्जा अलगअता और प्रकाश स्रोत समय पर दोहराया उपयोग के साथ बदल सकते हैं. रंग मानकों को प्राप्त करने और स्कैनिंग रंग. मानकों ब्याज की फसल में मनाया रंगों की व्यापक रेंज पर आधारित चुना जाना चाहिए . इस उदाहरण के लिए, हम एक मानक गायन 24 रंग चार्ट (ColorChecker, X-संस्कार, Grand Rapids, एमआई, चित्रा 1) के लिए चुना. रंग परीक्षक स्कैन के रूप में आप फल स्कैन होगा. स्कैनर अंशांकन खंड 4.7 में विस्तार से बताया है. एक JPEG फ़ाइल के रूप में स्कैन की गई छवि सहेजें. नोट: जब स्कैनर पर छवि संग्रह चरण के दौरान वस्तुओं को रखने सावधान और सटीक . वस्तुओं गठबंधन कर रहे हैं बेहतर है, कम मैनुअल समायोजन आवश्यक हो सकता है जब प्रादेशिक सेना में फल का विश्लेषण करेंगे. निम्न और उच्च गुणवत्ता छवियों के उदाहरण चित्रा 2 में दिखाया जाता है. 3. सॉफ्टवेयर स्थापना टमाटर विश्लेषक (टीए) संस्करण 2.2.0.0 से डाउनलोड किया जा सकता http://www.oardc.osu.edu/vanderknaap/tomato_analyzer.htm . टमाटर विश्लेषक उपयोगकर्ता मैनुअल और टमाटर विश्लेषक रंग टेस्ट मैनुअल भी इस वेबसाइट से उपलब्ध हैं. प्रादेशिक सेना एक विंडोज़ ऑपरेटिंग सिस्टम (संस्करण 2000 या उच्च) की आवश्यकता है. 4. छवि विश्लेषण और टीए रंग टेस्ट के लिए अंशांकन छवियों के साथ फ़ोल्डर और नहीं "मेरे दस्तावेज़" फ़ोल्डर में या एक दूरस्थ सर्वर पर हार्ड ड्राइव पर रखा जाना चाहिए. अन्यथा, प्रादेशिक सेना एक ही फ़ोल्डर में छवियों समायोजित मूल छवियों के रूप में नहीं बचा होगा. सुनिश्चित करें कि विस्तार के साथ समायोजित छवियों टीएमटी मूल रूप में एक ही फ़ोल्डर में jpg छवियों (6.1.1 कदम देखें). आइकन पर डबल क्लिक करके के रूप में आप किसी भी अन्य सॉफ्टवेयर अनुप्रयोग टीए प्रोग्राम लॉन्च करें. उपयोगकर्ता डीपीआई और माप इकाइयों "स्कैनर डीपीआई" "सेटिंग्स" मेनू से चयन करके उपयुक्त सेटिंग्स के लिए सेट करना होगा. डीपीआई सेटिंग छवि फ़ाइल के रूप में ही तो जा सकता है कि आकार माप (ऊंचाई, चौड़ाई, परिणिति, क्षेत्र) सही कर रहे हैं चाहिए. संवाद बॉक्स में "इकाइयों" डेटा निर्गम के लिए इकाइयों (सेमी, मिमी, में, या पिक्सेल) निर्धारित करता है. एक ही संवाद बॉक्स में, चमक समायोजित किया जा करने के लिए जब वस्तुओं अपेक्षाकृत अंधेरे हैं की आवश्यकता हो सकती है. नोट: डीपीआई और इकाइयों मैनुअल समायोजन करने के बाद या छवि विश्लेषण के बाद भी समायोजित किया जा सकता है. इस उपयोगकर्ता के लिए "सेटिंग" मेनू से चयन "मापन सहेजा गया" से मापा जा विशेषताएँ चुन सकते हैं. इस विश्लेषण के दौरान या बाद किसी भी समय किया जा सकता है. विशेषताएँ दस श्रेणियों (यानी मूल मापन, फलों का आकार सूचकांक, blockiness, Homogenity, समीपस्थ फलों एंड आकृति, दूरस्थ फलों एंड आकृति विषमता, आंतरिक सिड़, अक्षांशीय धारा और मौरफोमैटरिक्स) में वर्गीकृत कर रहे हैं. व्यक्तिगत विशेषताओं या एक पूरे माप समूह या समूह या विशेषता पर क्लिक करके चुना जा सकता है deselected. एक माप समूह के सभी गुण "+" पर क्लिक करके दिखाया जा सकता है. चयनित गुण के रूप में 3 चित्र में दिखाया गया है स्क्रीन के नीचे दायें कोने में खिड़की में श्रेणी के द्वारा प्रदर्शित कर रहे हैं. आरंभ करने के लिए, "खोलें छवि" बटन पर क्लिक करें और पॉप – अप संवाद बॉक्स से छवि फ़ाइल का चयन करें. चयनित छवि बाईं विंडो में प्रदर्शित किया जाएगा. खोला छवि का विश्लेषण करने के लिए, "विश्लेषण" बटन पर क्लिक करें. जब समाप्त हो, प्रत्येक फल की परिधि के साथ एक पीली लाइन पर प्रकाश डाला जाएगा और डेटा के निचले – दाएँ डेटा विंडो में प्रदर्शित किया जाएगा. सॉफ्टवेयर स्वचालित रूप से एक शासक या लेबल के रूप में बहुत बड़े या छोटे वस्तुओं, अचयनित होगा. deselected वस्तुओं के साथ एक नीली रेखा पर प्रकाश डाला जाएगा. अतिरिक्त फल सही उनकी छवि पर क्लिक करके deselected किया जा सकता है है. केवल पीले रंग में उल्लिखित मदों डेटा विंडो में प्रदर्शित किया जाएगा और निर्यात (चित्रा 3). नीले रंग में उल्लिखित आइटम विश्लेषण में शामिल नहीं किया जाएगा. व्यक्तिगत वस्तुओं के ऊपरी – दाएँ विंडो में माउस के साथ उन पर छोड़ दिया क्लिक करके प्रदर्शित कर रहे हैं. नोट: रंग परीक्षण मॉड्यूल के डेटा के निचले सही डेटा विंडो में नहीं दिखाए जाते हैं . रंग विश्लेषण के लिए रंग परीक्षक का विश्लेषण. रंग परीक्षक और एकत्रित एल * * एक, ख * मूल्यों स्कैन रंग परीक्षक छवि खोलें और विश्लेषण के रूप में फल के लिए वर्णित. सुनिश्चित करें कि टीए एक ऑब्जेक्ट (पीले सीमा) विश्लेषण करने के लिए हर पैच के रूप में पहचानता है. यदि आप एक मानक रंग परीक्षक का उपयोग कर रहे हैं, सॉफ्टवेयर गहरा swaths पहचान करने में सक्षम नहीं किया जा सकता है. ये रंग अंशांकन में शामिल नहीं किया जाएगा. सेटिंग्स मेनू के तहत, "रंग टेस्ट" का चयन करें. संवाद बॉक्स प्रकट होगा. यकीन है कि सुधार मूल्यों ढलान (बाएँ बक्से) और y-अंत: खंड (सही बक्से 0) के लिए के लिए 1 के लिए सेट कर रहे हैं. न्यूनतम नीले मान 0 पर सेट किया जाना चाहिए, और पैरामीटर 1 और 2 पर ध्यान नहीं दिया जा सकता है. रंग परीक्षण संवाद बॉक्स के भीतर विश्लेषण बटन पर क्लिक करें. एक नई विंडो वें बचाने के लिए दिखाई देगा"सीएसवी" दस्तावेज़ है जो Excel में खोला जा सकता है है के रूप में ई उत्पादन. निर्देशिका और डेटा फ़ाइल के लिए नाम निर्दिष्ट करें. एल * * एक, ख मूल्यों *, रंग और प्रत्येक रंग पैच के लिए chroma के लिए और गणना उत्पादन डेटा फ़ाइल आरजीबी मूल्यों में शामिल होंगे. अंशांकन के लिए सुधार मूल्यों के निर्धारण प्लॉट एल * एक * b colorimeter मूल्यों के लिए एल * * और ख * जो रंग परीक्षक के निर्माता से या तालिका 1 में उपलब्ध हैं के खिलाफ प्रत्येक रंग पैच के लिए मान *. प्रतीपगमन समीकरण निर्धारित और ढलान और प्रत्येक पैरामीटर के लिए y-अंत: खंड रिकॉर्ड. संवाद बॉक्स में, ढलान की व्युत्क्रम और y-अंत: खंड एल * के लिए मूल्य *, और ख के हस्ताक्षर के रिवर्स दर्ज करें *. ये मान "रंग टेस्ट" सेटिंग्स के लिए सुधार मूल्यों के रूप में उपयोग किया जाता है. रंग परीक्षण कि पिक्सल है कि रंग चुना मूल्यों की निर्दिष्ट श्रेणियों में गिरावट का अनुपात (%) की रिपोर्ट दो मापदंडों को परिभाषित करने के लिए उपयोगकर्ता की अनुमति देता है. टमाटर के विश्लेषण के लिए, उदाहरण के लिए, 1 पैरामीटर के लिए निचले और ऊपरी मान क्रमश: 70 और 100 हैं, जो अवांछनीय पीले और हरे रंग पीला चमड़े के रंग के अनुरूप. 2 पैरामीटर के लिए निचले और ऊपरी मान 0 और 50 हैं और वांछित लाल रंग के अनुरूप. इन मूल्यों के लिए सेटिंग्स सहेजें. इन मूल्यों कि जब तक कार्यक्रम बंद कर दिया है विश्लेषण कर रहे हैं किया जा रहा है सभी छवियों को लागू किया जाएगा. स्कैन छवियों के लिए, विकल्प "2 डिग्री सेल्सियस प्रदीपक" का चयन करें. "प्रदीपक 10 D65 °" विकल्प केवल प्राकृतिक प्रकाश में अधिग्रहीत छवियों के लिए लागू किया जाता है. परिणाम दृश्य (चित्रा 3 देखें): निचले – दाएँ डेटा विंडो में डेटा की प्रत्येक पंक्ति छवि में एक विशेष वस्तु से मेल खाती है है . डेटा छवि में वस्तुओं के रूप में उसी क्रम में प्रदर्शित होता है. पहली पंक्ति के ऊपरी बाएँ हाथ कोने में ऑब्जेक्ट के लिए मूल्यों को दिखाता है और पिछले डेटा पंक्ति वस्तु के लिए छवि के निचले सही कोने में मान दिखाता है. एक पंक्ति पर क्लिक करने के लिए दाईं तरफ शीर्ष विंडो में इसी फल प्रदर्शित के लिए. वैकल्पिक रूप से, एक फल पर क्लिक करें और इसी डेटा पंक्ति पर प्रकाश डाला जाएगा. निचले – दाएँ विंडो में विशेषता टैब पर क्लिक करके यह संभव है को देखने के लिए कैसे विशेषता प्रत्येक विशेष फल के लिए किया जा रहा है मापा जाता है. उदाहरण के लिए, बाहर का अंत कोण पर क्लिक करके, बाईं विंडो में फल पर सॉफ्टवेयर के द्वारा मापा कोण दिखाया जाएगा. यह सुविधा बहुत उपयोगी है जब वस्तुओं है कि अधिक सटीक माप के लिए मैनुअल समायोजन की आवश्यकता की पहचान. चित्रा 4 छवि रंग परीक्षण मॉड्यूल के साथ विश्लेषण से पता चलता है. लेकिन, परिणाम डेटा विंडो में नहीं देखा जाता है. डेटा केवल एक Excel फ़ाइल में पहुँचा जा सकता है है के बाद विश्लेषण में सहेजा जाता है. 5. विशेषताओं के मैनुअल समायोजन कभी कभी फल और प्रॉक्सिमल और डिस्टल समाप्त होता है की सीमा टीए द्वारा सही ढंग से नहीं पाए जाते हैं. इसके अलावा, अगर फल स्कैनर पर एक कोण पर रखा जाता है, छवि के लिए सही माप प्राप्त करने के लिए समायोजित किया जाना चाहिए. इन और अन्य सुविधाओं के प्रारंभिक विश्लेषण के बाद छवियों के मैनुअल समायोजन के माध्यम से सुधारा जा सकता है. उपलब्ध समायोजन "संशोधन" मेनू बटन के तहत दिखाई देते हैं और शामिल हैं: घुमाएँ, सीमा, समीपस्थ अंत, बाहर का अंत, ऑटो घुमाने के लिए, दीर्घवृत्त समायोजित करने के लिए, दूरस्थ फलाव समायोजित करने के लिए, फली सीमा, डिफ़ॉल्ट फली सीमा समायोजित करें. नोट: यदि समायोजन करने के लिए बनाया जा रहे हैं, पहले सीमा समायोजित करने के लिए, रोटेशन के द्वारा पीछा किया. अन्य सभी समायोजन इन दो समायोजन के बाद किसी भी क्रम में किया जा सकता है. एक मेनू में संशोधन के तहत चयनित समायोजन चयनित रहता है जब तक एक अलग समायोजन को चुना है. यह टुकड़ा छवि पर क्लिक करें और संशोधन बटन पर क्लिक करके स्लाइस की एक अनुक्रम पर एक ही समायोजन प्रदर्शन करने के लिए उपयोगकर्ता की अनुमति देता है. नीचे, विभिन्न फल विशेषताओं पर मैनुअल समायोजन कर रहे हैं विस्तृत. सीमा बाईं विंडो में फल पर वाम क्लिक करें. यह ऊपरी दाएँ विंडो में दिखाई देगा. "संशोधन" बटन के बगल में तीर पर क्लिक करें और ऊपरी – दाएँ विंडो में ड्रॉप डाउन सूची से "सीमा" का चयन करें. गलत सीमा के प्रारंभ बिंदु और अंत बिंदु पर क्लिक छोड़ दिया द्वारा संशोधित किया जा सीमा स्थान चुनें. एक परिणाम के रूप में, सीमांकित सीमा को हटा दिया जाएगा. एक नई सीमा को जोड़ने के लिए, प्रारंभ बिंदु अंत बिंदु की ओर से क्लिक छोड़ दिया. वांछित समोच्च का पालन करें क्लिक करना जारी रखें. राइट क्लिक पिछले एक संशोधन पूर्ववत जाएगा. एकाधिक संशोधनों लगातार सही क्लिकों द्वारा पूर्ववत किया जा सकता है है. नई सीमा की पुष्टि करने के लिए, "Enter" कुंजी दबाएँ. अन्यथा, "Esc" इस कार्रवाई रद्द करने के लिए कुंजी दबाएँ. मूल सीमा स्थापित करने के लिए लौटने के लिए "रीसेट सीमा" पर क्लिक करें. घुमाएँ. यह सुविधा जब एक वस्तु पूरी तरह खड़ी नहीं है प्रयोग किया जाता है. बाईं विंडो में उचित फल पर क्लिक करें. यह ऊपरी – दाएँ विंडो में दिखाई देगा. "संशोधन" बटन के बगल में तीर पर क्लिक करें और चुनें "घुमाएँ"ड्रॉप डाउन सूची से. अक्ष के ऊपरी – दाएँ विंडो में प्रदर्शित किया जाएगा. अक्ष के अंत में हरी वर्ग खींचें और फल के अनुसार बारी बारी से होगा. खिड़की के अंदर डबल क्लिक करें या प्रेस दर्ज करें "" करने के लिए खत्म कुंजी. "रीसेट रोटेशन" पर क्लिक करें मूल संरेखण पर लौटने. प्रॉक्सिमल अंत समायोजित करें . अगर वहाँ प्रॉक्सिमल अंत की स्थिति में एक त्रुटि है, इस सुविधा से प्राप्त माप गलत हो जाएगा. एक फल है कि समायोजन की आवश्यकता है इतना है कि यह सही पर विंडो में दिखाई देता है चुनें. अगला, "समीपस्थ फल अंत आकार" टैब और "समीपस्थ कोण सूक्ष्म या स्थूल डेटा निर्गम अनुभाग में चयनित फल नीचे का चयन करें. समीपस्थ कोण अब बाईं तरफ के छवि में प्रत्येक फल के लिए दिखाया जाएगा. इस तरह, कोण है कि असामान्य लग रहे हैं पहचाना जा सकता है. प्रॉक्सिमल अंत की स्थिति बदलने के लिए, इन चरणों का पालन करें: बाईं विंडो में वांछित फल पर क्लिक करें. यह ऊपरी दाएँ विंडो में दिखाई देगा. "संशोधन" बटन के बगल में तीर पर क्लिक करें और "ड्रॉप डाउन सूची से समीपस्थ अंत" का चयन करें. ऊपरी – दाएँ विंडो में क्लिक करें, और सही स्थिति के लिए शिखर सूचक खींचें. डबल क्लिक करें या "Enter" कुंजी प्रेस करने के लिए खत्म. बाहर का अंत समायोजित करें . वस्तु के बाहर का अंत की स्थिति मैन्युअली भी बदला जा सकता है. कुशलता फल है कि बाहर का अंत समायोजन की आवश्यकता को खोजने के, प्रॉक्सिमल अंत के लिए के रूप में एक ही प्रक्रिया का पालन. बाईं विंडो में वांछित फल पर क्लिक करें. यह ऊपरी – दाएँ कोने में दिखाई देगा. "संशोधन" बटन के बगल में तीर पर क्लिक करें और "ड्रॉप डाउन सूची से बाहर का अंत" का चयन करें. ऊपरी – दाएँ विंडो में क्लिक करें, और सही स्थिति के लिए शिखर सूचक खींचें. डबल क्लिक करें या "Enter" कुंजी प्रेस करने के लिए खत्म. दूरस्थ अंत फलाव. इस समारोह के उपयोगकर्ता टिप की सीमा पर endpoints परिभाषित करने के लिए अनुमति देता है. "दूरस्थ फलों एंड आकार" टैब के तहत, स्तंभ लेबल "बाहर का अंत फलाव" और चयन को समायोजित करने के लिए ऑब्जेक्ट का चयन करें. संशोधन "बटन करने के लिए अगले तीर क्लिक करें और चुनें" ड्रॉप डाउन मेनू से दूरस्थ फलाव समायोजित ". बताते हैं कि सीमा के साथ वांछित पदों के लिए दिखाई देते हैं खींचें. प्रेस करने के लिए खत्म करने के लिए कुंजी दर्ज करें. एक लाइन टिप क्षेत्र और टिप क्षेत्र पुनर्गणना के cutoff दिखा दिखाई देगा. परिणाम बाहर का अंत फलाव स्तंभ में दिखाई देगा. यदि टिप क्षेत्र वांछित स्थिति में नहीं है, "संशोधन" बटन के तहत "रीसेट दूरस्थ फलाव" का चयन अंक अपने प्रारंभिक पदों के लिए रीसेट जाएगा. यदि कोई टिप क्षेत्र में पाया गया, लेकिन मौजूद नहीं करना चाहिए, चयन संशोधित "बटन से" हटा दें दूरस्थ फलाव "अंक फल के नीचे ले जाने के लिए," बाहर का अंत फलाव "स्तंभ के लिए 0.0 के एक मूल्य में जिसके परिणामस्वरूप. ऑटो घुमाएगी. इस समारोह में विशेष रूप से टमाटर के बीज के लिए विकसित इतना है कि वे स्वचालित रूप से बताया एक ही दिशा का सामना करना पड़ रहा अंत के साथ गठबंधन किया जा सकता है. इस समय, ऑटो घुमाएगी समारोह फल जैसे अन्य वस्तुओं पर काम नहीं करता. दीर्घवृत्त समायोजित. इस समारोह में उपयोगकर्ता आकार और / या आंतरिक दीर्घवृत्त को स्थानांतरित करने के लिए आंतरिक फल क्षेत्रों को परिभाषित करने के लिए अनुमति देता है. इस विशेषता आंतरिक सिड़ समारोह और फलों प्रादेशिक सेना की आकृति सूचकांक आंतरिक विशेषता के लिए प्रयोग किया जाता है. आंतरिक सिड़ टैब का चयन करें, और तब टैब में स्तंभों में से किसी का चयन. "सेटिंग्स" मेनू से एक "डिफ़ॉल्ट अंडाकार आकार" का चयन करें. किसी ऑब्जेक्ट का चयन करें, और "संशोधित" बटन पर क्लिक करें. चुनें "दीर्घवृत्त समायोजित" ड्रॉप डाउन मेनू से. दो अंक दीर्घवृत्त के शीर्ष पर और बायें अंक का प्रतिनिधित्व दिखाई देगा. उन दोनों का आकार बदलता है और फिर केंद्रों दो नए अंक के लिए सम्मान के साथ दीर्घवृत्त चल रहा है. एक बार इन बातों को अपने वांछित पदों के लिए निर्धारित किया गया है, Enter कुंजी दबाएं. दीर्घवृत्त दोबारा किया जाएगा. यदि स्थिति स्वीकार्य है, फिर प्रेस दर्ज करें और स्तंभों में मानों को अद्यतन किया जाएगा. यदि आंतरिक दीर्घवृत्त reshaped किया जा रहा बिना स्थानांतरित किया जा जरूरत है, वस्तुओं, जहां अंक थे के केंद्र पर क्लिक करें. दो लाइनें और तीन हरी अंक दिखाई देगा. फल का एक नया स्थान पर यह आकार बदलने के बिना दीर्घवृत्त ले जाने के केंद्र में लगभग तैनात बिंदु हटो. के लिए खत्म करने के लिए Enter दबाएँ. फली सीमा समायोजित करें . इस समारोह में फली क्षेत्र को परिभाषित करने के लिए उपयोगकर्ता की अनुमति देता है और जब फली क्षेत्र "और" फली मोटाई अक्षांशीय अनुभाग टैब "" में चयनित कर रहे हैं "समायोजित किया जा जरूरत है. नोट: अधिक परिपक्व फल है कि के लिए, यह मुश्किल या असंभव हो फल की शेष से फली भेद सकता है. किसी ऑब्जेक्ट का चयन करें, और मुझे "संशोधन" ड्रॉप डाउन पर क्लिक करेंपरमाणु. "डिफ़ॉल्ट फली सीमा" का चयन करें और डिफ़ॉल्ट है कि फली सबसे अच्छा फिट बैठता है. आगे समायोजन के लिए, ड्रॉप डाउन मेनू "संशोधन" से "फली सीमा समायोजित करें" का चयन करें. ऊपरी – दाएँ विंडो में, फली सीमा स्थान की जरूरत है कि संशोधित किया जा है का चयन करें. यह गलत सीमा के प्रारंभ बिंदु और अंत बिंदु पर क्लिक छोड़ दिया द्वारा पूरा किया है. एक परिणाम के रूप में, सीमांकित सीमा को हटा दिया जाएगा. सबसे अच्छा परिणाम के लिए, सीमा की छोटी संभव अनुभाग किसी भी एक समय पर चुना जाना चाहिए. एक नई सीमा को जोड़ने के लिए, पहला बिंदु दूसरा बिंदु से वापस करने के लिए क्लिक करें छोड़ दिया. वांछित समोच्च का पालन करें क्लिक करना जारी रखें. राइट क्लिक पिछले एक संशोधन पूर्ववत जाएगा. एकाधिक संशोधनों लगातार सही क्लिकों द्वारा पूर्ववत किया जा सकता है है. नोट: बहुत अधिक फली सीमा संशोधनों कार्यक्रम के दुर्घटनाग्रस्त में परिणाम हो सकता है. नई सीमा की पुष्टि करने के लिए, "Enter" कुंजी दबाएँ. अन्यथा, "Esc" इस कार्रवाई रद्द करने के लिए कुंजी दबाएँ. अपनी मूल स्थिति के लिए सीमा वापसी "रीसेट फली सीमा" का चयन करें. रंग विश्लेषण के लिए, जब फल छवि के किनारे पर मांस की सीमा नहीं है (उदाहरण के लिए, फलों के कंधे पर एक अनुप्रस्थ काट, अनुप्रस्थ कटौती के रूप में चित्रा 4 में दिखाया ऊपर फल की त्वचा दिखाने), उपयोगकर्ता "सेटिंग्स" मेनू के तहत "रंग टेस्ट" संवाद बॉक्स खोलने के लिए की जरूरत है. इस संवाद बॉक्स में, न्यूनतम नीले मूल्य से 30 करने के लिए सेट किया और बचाया जरूरत है. यदि फल <3 सेमी रहे हैं, 20 के लिए न्यूनतम नीले मान सेट. इस मान की आवश्यकता हो सकती है आगे समायोजित अगर टीए सही सीमाओं ढूँढने मुसीबत है. 6. प्रयोक्ता – परिभाषित सेटिंग्स कुछ विशेषताओं के लिए उपयोगकर्ता के लिए सेटिंग्स का चयन करें जिस पर माप लिया जाना चाहिए की जरूरत है. इस से पहले या बाद में विश्लेषण किया जा सकता है और निर्भर करता है कि क्या एक प्रयोग के लिए एक ही सेटिंग के रूप में पहले या प्रयोग किया गया है कि क्या उपयोगकर्ता खोजपूर्ण विश्लेषण करने के क्रम में नई विश्लेषण के लिए उपयुक्त सेटिंग को परिभाषित करना चाहता है पर दोहराया जा रहा है. बाहर का और प्रॉक्सिमल अंत blockiness की स्थापना. Blockiness उपयोगकर्ता चयनित फल के बाहर / प्रॉक्सिमल अंत करने के लिए चौड़ाई (चित्रा 5A) मध्य निकटतम ऊंचाई के अनुपात में चौड़ाई के अनुपात के रूप में गणना की है. इस उपयोगकर्ता का चयन करें या वस्तु पर स्थान जहां माप लिया जाता है बदल देता है. ऊपरी और निचले पदों blockiness "blockiness स्थिति" में "सेटिंग" बटन के अंतर्गत एक नया मान दर्ज करके बदला जा सकता है. सूक्ष्म और स्थूल कोण की स्थापना. ये सेटिंग्स फल (चित्रा 5B) की छोर से विभिन्न पदों पर कोण की गणना के लिए इस्तेमाल किया जाता है. मैक्रो सेटिंग आमतौर पर से सीमा के साथ 5 से 40% और सूक्ष्म सेटिंग सीमा के साथ 2 से 10% के लिए प्रयोग किया जाता है कोण के लिए प्रयोग किया जाता है. Morphometric अंकों की संख्या. इस समारोह में भरी हुई छवि में प्रत्येक वस्तु की सीमा के साथ अंक पाता है. बाहर का और प्रॉक्सिमल समाप्त होता है छवि में हर वस्तु के लिए मील का पत्थर अंक के रूप में उपयोग किया जाता है. सीमा के साथ मापा अंकों की संख्या के द्वारा "सेटिंग्स" मेनू के तहत "# morphometric अंकों की" चुना जा सकता है. के बीच 4 और 30 अंक का चयन किया जा सकता है. सॉफ्टवेयर स्वचालित रूप से आधे में चयनित अंक की संख्या को विभाजित और समान रूप से उन्हें बाहर का और प्रॉक्सिमल समाप्त होता है के बीच फल के प्रत्येक पक्ष पर वितरित. 7. डेटा सहेजना और निर्यात डेटा सहेजें टीए द्वारा एक छवि और छवि विश्लेषण के मैनुअल समायोजन के बाद, "सहेजें फलों" बटन पर क्लिक करें. मैनुअल समायोजन और deselected वस्तुओं सहित सभी वर्तमान जानकारी, मूल छवि के रूप में एक ही नाम और एक टीएमटी विस्तार के साथ एक नई फ़ाइल में सहेजा जाएगा. हर समय एक फ़ाइल चयनित है, एक ही नाम के साथ बचाया टीएमटी फ़ाइल स्वचालित रूप से, क्योंकि यह मूल फ़ाइल से जुड़ा हुआ है खोला जाएगा. हालांकि, टीएमटी फाइल jpg छवि फ़ाइल (खंड 4.1 देखें) के रूप में एक ही फ़ोल्डर में संग्रहित किया जाना चाहिए. यदि सॉफ्टवेयर टीएमटी और JPG फ़ाइलों को उसी फ़ोल्डर में स्टोर नहीं करता, C ड्राइव छवि फ़ोल्डर चाल है. मूल छवि फ़ाइल के लिए किसी भी समायोजन के बिना, वापस लौटने के लिए, बस जुड़े टीएमटी फ़ाइल को नष्ट. एक विकल्प का चयन करने के लिए "विश्लेषण" और मूल छवि reanalyze है. हालांकि, पता है कि अभी भी छवि के रूप में एक ही नाम के साथ किसी भी टीएमटी अगली बार है कि फ़ाइल खोला है जब तक, ज़ाहिर है, समायोजन टीएमटी फ़ाइल में सहेजे जाते हैं छवि के साथ संबद्ध किया जाएगा. डेटा निर्यात करें उपयोगकर्ता एक व्यक्तिगत छवि के लिए "निर्यात" बटन का चयन करके डेटा निर्यात कर सकते हैं. डेटा एक Excel फ़ाइल को निर्यात किया जाएगा और प्रत्येक फल, औसत और मानक विचलन के लिए विशेषता मान प्रदर्शित. प्रादेशिक सेना आवेदन भी दो या दो से अधिक छवियों ("बैच विश्लेषण" समारोह) से विशेषता मान निर्यात कर सकते हैं. स्टेशन के लिएआर टी बैच विश्लेषण, "खोलें छवि" बटन पर क्लिक करें. छवि फ़ाइलों का चयन बैच विश्लेषण किया. एकाधिक फ़ाइलों "Shift" या "Ctrl" कुंजी का उपयोग करते हुए अतिरिक्त फ़ाइलों का चयन करने के लिए चयन कर रहे हैं. बाद फ़ाइलों का चयन कर रहे हैं, "खोलें" कुंजी पर क्लिक करें. उपयोगकर्ता बैच विश्लेषण उत्पादन के प्रकार का चयन करने के लिए कहा जाएगा: "औसत", "औसत और मानक विचलन" या "छवि प्रति व्यक्तिगत माप". निर्यात के दो तरीके का एक उदाहरण चित्रा 6 में दिखाया गया है. एक्सेल फ़ाइल है कि बनाया जाएगा के लिए एक नाम चुनें और "सहेजें" कुंजी पर क्लिक करें. सॉफ्टवेयर स्वचालित रूप से फ़ाइलों को खोलने और बैच विश्लेषण शुरू. यदि छवि फ़ाइलों को पहले से विश्लेषण किया है और प्रादेशिक सेना द्वारा बचाया, बचाया. टीएमटी फाइलें बैच विश्लेषण के लिए खोला जाएगा. यदि फ़ाइलें पहले नहीं किया गया विश्लेषण किया है, सॉफ्टवेयर मैनुअल समायोजन और deselections के बिना छवियों का विश्लेषण प्रदर्शन करेंगे. टीए 600 डीपीआई पर कम से कम 100 छवियों के एक बैच विश्लेषण प्रदर्शन कर सकते हैं. रंग विश्लेषण के लिए बैच विश्लेषण. सेटिंग मेनू के अंतर्गत "रंग टेस्ट" विकल्प खोलें. बैच विश्लेषण की जाँच करें और विश्लेषण क्लिक करें. विश्लेषण छवियों का चयन करने के लिए एक नई विंडो दिखाई देगा. अगले विंडो में निर्देशिका और डेटा फ़ाइल के लिए नाम निर्दिष्ट करें. सहेजें पर क्लिक करें. आउटपुट फ़ाइल प्रत्येक छवि के नाम (फ़ाइल नाम के आधार पर) और औसत छवि पर प्रत्येक फल के लिए रंग मूल्यों शामिल होंगे. उत्पादन में शामिल मानकों हैं: 1 पैरामीटर, पैरामीटर 2, आर, जी, और बी के मूल्यों, चमक, एल * * और ख * मूल्यों के रूप में के रूप में अच्छी तरह से रंग और chroma मूल्यों. रंग परीक्षण मॉड्यूल 100 फल के कंप्यूटर हार्डवेयर पर निर्भर करता है छवियों के एक बैच विश्लेषण कर सकते हैं. 8. डेटा विश्लेषण के उदाहरण टीए द्वारा उत्पन्न उत्पादन में कई अनुप्रयोगों के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है. आनुवंशिक अध्ययन में, उत्पादन के लिए कई छाँट कर अलग अलग खेती टमाटर (. Lycopersicum) किस्मों और जंगली प्रजातियों के बीच पार से व्युत्पन्न आबादी में फल आकार (मात्रात्मक विशेषता loci) QTL का पता लगाने के लिए प्रयोग किया जाता है एस pimpinellifolium परिग्रहण LA1589 1,4,5. प्रादेशिक सेना भी आकार 6 श्रेणियों में वर्गीकृत फल और टमाटर फल रंग "पीला कंधे" 3 शारीरिक विकार के कारण मलिनकिरण का विश्लेषण करने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है. इसके अलावा, सॉफ्टवेयर 7 पत्तियों और 8,9 बीज के रूप में अन्य संयंत्र अंगों का विश्लेषण करने के लिए इस्तेमाल किया गया है. 9. प्रतिनिधि परिणाम प्रादेशिक सेना के उत्पादन में व्यापक रूप से विभिन्न अनुप्रयोगों के लिए इस्तेमाल किया गया है. फल आकार QTL अध्ययन में, फल छवियाँ (एक छवि में 8 से 10 संयंत्र प्रति फल) प्रत्येक जनसंख्या में 96 से 130 पौधों की कुल से एकत्र किए गए थे. बाद में, इन छवियों को टीए 4,5 द्वारा विश्लेषण किया गया . Phenotypes और जीनोटाइप के बीच सहयोग का पता लगाने के लिए, समग्र अंतराल मानचित्रण का उपयोग 10,11 QTL विश्लेषण प्रदर्शन किया गया और प्रत्येक 12 जनसंख्या में विशेषताओं के सबसेट के लिए multitrait समग्र अंतराल मानचित्रण द्वारा. एक परिणाम के रूप में, टमाटर जीनोम को नियंत्रित फल आकार के कई क्षेत्रों की पहचान की गई. इन क्षेत्रों में से कुछ कई आबादी में उपस्थित थे, जबकि दूसरों को एक आबादी के लिए अद्वितीय थे. जबकि कुछ फल आकार क्विंटल (जैसे ovate, सूरज, और fs8.1) पिछले मानचित्रण अध्ययन से जाने जाते थे, कई अन्य loci नव की खोज की थी. कुल में, 17 से 36 क्विंटल फल आकार विशेषताओं को नियंत्रित तीन segregating 2,4 आबादी में पाया गया. टीए द्वारा उत्पन्न डेटा भी प्रधान घटक विश्लेषण (पीसीए) का उपयोग विश्लेषण किया गया है. एक अध्ययन में, पन्द्रह आकार विशेषताएँ पीसीए अधीन थे, और पहले तीन प्रमुख घटक (पीसी) बाद में लक्षण के रूप में मैप किए गए थे. डेटा दिखाने कि पीसी क्विंटल विशेषता क्विंटल है कि 4 घटक के लिए योगदान दे रहे थे के साथ छा. Segregating आबादी भी QTL मौरफोमैटरिक्स साथ QTL आकार विशेषताओं के साथ की पहचान करने के लिए पहचान की तुलना करने के लिए इस्तेमाल किया गया. फिर, QTL मौरफोमैटरिक्स QTL को नियंत्रित फल और 2 मामलों के 93% में आकार विशेषताएँ के साथ मेल खाना करने के लिए दिखाया गया है. इन परिणामों को स्पष्ट रूप से और फल आकारिकी विश्लेषण में प्रादेशिक सेना द्वारा उत्पादित डेटा की वैधता reproducibility दिखा. प्रादेशिक सेना की एक अन्य आवेदन एक फल के आकार के वर्गीकरण प्रणाली टमाटर उद्देश्य फल आकार माप पर आधारित cultivars की पहचान की रचना है. 350 ~ विविध मूल और फल आकारिकी के टमाटर accessions के जर्मप्लाज्म संग्रह मूल्यांकन किया गया था. लगभग प्रत्येक संयंत्र से आठ फल digitalized और प्रादेशिक सेना के साथ विश्लेषण थे. दो मौजूदा वर्गीकरण प्रणाली IPGRI 13, और UPOV 14, मूल्यांकन और फल छवियों के हमारे संग्रह में दृश्य तुलना का उपयोग करने के लिए तुलना में थे. हम कई श्रेणियों के संयोजन के द्वारा और दो ​​नए 6 लोगों को बनाने के द्वारा इन दोनों प्रणालियों के morphological वर्गीकरण संशोधित . जनसंपर्कoposed श्रेणियों, फ्लैट, गोल, लंबे, आयताकार, obovoid, दीर्घवृत्ताभ, दिल, और oxheart हैं. आठ नए 13 IPGRI और UPOV 14 सिस्टम से अनुकूलित श्रेणियों अलग पहचाना नेत्रहीन हैं, और प्रादेशिक सेना माप का उपयोग कर परीक्षण किया. प्रत्येक परिग्रहण से 37 विशेषताओं के टीए उत्पादन पीसीए और रैखिक discriminant विश्लेषण (LDA) के अधीन किया गया था करने के लिए माप है कि सबसे अच्छा प्रत्येक फल आकार श्रेणी को परिभाषित है, और भी आकलन सही कैसे discriminator विशेषताएँ प्रत्येक परिग्रहण के दृश्य वर्गीकरण समझा की पहचान. इस फल के आकार के वर्गीकरण प्रणाली के एक संभव आवेदन प्ररूपी डेटा पर आधारित क्लस्टर accessions के लिए प्रादेशिक सेना के उत्पादन का उपयोग हो सकता है, और विभिन्न फल आकार श्रेणियों के बीच संघों की पहचान है. प्रादेशिक सेना में रंग टेस्ट मॉड्यूल रंग colorimeter (CR300) के साथ एक जन्मजात backcross (IBC) एस के बीच पार से व्युत्पन्न आबादी में उठाए गए मापों की तुलना में था lycopersicum प्रसंस्करण cultivars 3. एल * * और b * colorimeter से मानों रंग प्रादेशिक सेना के साथ तीन अलग अलग स्कैनर से प्राप्त मान के बराबर थे. हालांकि, हार्डवेयर, सॉफ्टवेयर, या nonstandardized आरजीबी मूल्यों के लिए तीन स्कैनर के बीच मतभेद के कारण मनाया गया. नतीजतन, सुधार मान दर्ज करने के लिए एक विकल्प के रंग टेस्ट में लागू किया गया था स्कैनर अंशांकन की अनुमति. एक आनुवंशिक अध्ययन में प्रादेशिक सेना से रंग टेस्ट का उपयोग कर, रंग और रंग की एकरूपता के लिए आनुवंशिक विचरण काफी की तुलना में जब उन मानों पर colorimeter से प्राप्त किया गया अधिक था. इन मतभेदों को एक पूरी सतह के टीए मापने रंग मापदंडों के कारण कर रहे हैं जबकि colorimeter सिर्फ सतह पर कुछ बिंदुओं का विश्लेषण करती है. अन्त में, प्रादेशिक सेना परीक्षण किया था और आलू, ककड़ी, muskmelon, और 3 स्ट्रॉबेरी जैसे अन्य फसलों में रंग और रंग एकरूपता का विश्लेषण करने में सक्षम था. चित्रा 1 रंग टेस्ट मॉड्यूल रंग अलग अलग स्कैनर से और अलग अलग समय पर प्राप्त मान जांचना के लिए मानक रंग परीक्षक. चित्रा 2 उच्च गुणवत्ता छवियों digitalized प्रादेशिक सेना के समुचित कार्य के के लिए आवश्यक हैं . ए) एक कम गुणवत्ता छवि का एक उदाहरण है. टीए छवि भर में वस्तुओं को खोजने का प्रयास करेंगे. जब यहाँ दिखाया जैसे बड़े खाली स्थान हैं, टीए ठीक से काम नहीं या क्रैश हो सकता है. कुछ फल नहीं सूखी blotted थे, और स्कैनर स्क्रीन पर रस सही फल सीमा को पहचानने से प्रादेशिक सेना को रोकने जाएगा. इसके अलावा, जब फल की सबसे गलत तरीके से खड़ी उन्मुख, कई विशेषताओं को सही ढंग से नहीं किया जा गणना करेंगे. इन गरीब गुणवत्ता छवियों काफी नीचे व्यापक मैनुअल समायोजन है कि विश्लेषण करने के लिए पहले किया जा होगा की वजह से फलों के आकार के विश्लेषण के धीमी है. बी) एक उच्च गुणवत्ता छवि का एक उदाहरण है. फल खड़ी उन्मुख कर रहे हैं सही ढंग से, स्थान करीब जबकि छू और नहीं एक दूसरे सूखी blotted. चित्रा 3 टीए सॉफ्टवेयर के स्क्रीन शॉट. शीर्ष विंडो कई उपलब्ध उपकरणों (यानी, खुला छवि, फल, निर्यात डेटा, फिट आकार, विश्लेषण और संशोधन को बचाने के लिए) के लिए बटन से पता चलता है. ऊपरी – दाएँ विंडो में वस्तु मैनुअल समायोजन के लिए चयनित किया गया है और डेटा के निचले – दाएँ विंडो में प्रदर्शित होते हैं. इस फल के लिए मान ग्रे में निचले सही डेटा विंडो में डाला जाता है. बाईं विंडो में पीले में उल्लिखित वस्तुओं विश्लेषण में शामिल किया जाएगा है जबकि नीले रंग में उल्लिखित वस्तुओं विश्लेषण में शामिल नहीं किया जाएगा. चित्रा 4. रंग टेस्ट आवेदन – एक छवि टमाटर विश्लेषक के लिए इस्तेमाल किया. चित्रा 5 उपयोगकर्ता – परिभाषित सेटिंग्स. ए) blockiness विशेषताओं. ऊपरी स्थिति प्रॉक्सिमल अंत blockiness और त्रिकोण विशेषताओं की गणना करने के लिए प्रयोग किया जाता है. ऊपरी स्थिति के लिए सेटिंग निर्धारित करता है जहाँ X मापा जाता है (= आंकड़ा में 10%) है. कम स्थिति के लिए बाहर का अंत blockiness और त्रिकोण विशेषताओं की गणना करने के लिए प्रयोग किया जाता है. लोअर स्थिति के लिए सेटिंग निर्धारित करता है जहां Y (= आंकड़ा में 90%) मापा जाता है. इन पदों के लिए मान फल के ऊपर से ऊंचाई के प्रतिशत के बराबर है. ) कोण मैक्रो विशेषताएँ बी. हरे रंग की लाइनों के अंत जहां कोण मापा जाएगा (आंकड़ा में काले वर्ग) से सीमा के साथ प्रतिशत (= आंकड़ा में 20%) का प्रतिनिधित्व करते हैं. सॉफ्टवेयर + / उपयोग ढलान – चयनित मूल्य के 5% का निर्धारण करेगा. चयनित मूल्य के 2% – सॉफ्टवेयर माइक्रो कोण के लिए + / उपयोग ढलान का निर्धारण करेगा. चित्रा 6 उत्पादन निर्यात उपकरण के साथ छवि से प्राप्त आंकड़ों का एक उदाहरण 3 चित्र में दिखाया. ए) आउटपुट प्रत्येक फल, औसत और मानक विचलन के लिए विशेषता मान प्रदर्शित. बी) आउटपुट औसत विशेषता मान और 10 टमाटर किस्मों के लिए मानक विचलन प्रदर्शित.   एल * * b * 1 37.986 13.555 14.059 2 65.711 18.13 17.81 3 49.927 -4.88 -21.925 4 43.139 -13.095 21.905 5 55.112 8.844 -25.399 6 70.719 -33.397 -0.199 7 62.661 36.067 57.096 8 40.02 10.41 -45.964 9 51.124 48.239 16.248 10 30.325 22.976 -21.587 11 72.532 -23.709 57.255 12 71.941 19.363 67.857 13 28.778 14.179 -50.297 14 55.261 -38.342 31.37 15 42.101 53.378 28.19 16 81.733 4.039 79.819 17 51.935 49.986 -14.574 18 51.038 -28.631 -28.638 19 96.539 -0.425 1.186 20 81.257 -0.638 -0.335 21 66.766 -0.734 -0.504 22 50.867 -0.153 -0.27 23 35.656 -0.421 -1.231 24 20.461 -0.079 -0.973 तालिका 1. एल * * एक, ख * रंग परीक्षक के हर पैच के लिए मूल्यों (चित्रा 1 देखें) . रोशन का स्रोत D50 था और पर्यवेक्षक कोण 2 ° था.

Discussion

संयंत्र अंग आकारिकी और रंग की उच्च throughput और सटीक मूल्यांकन इसकी मात्रात्मक प्रकृति और अक्सर व्यक्तिपरक मात्रा का ठहराव की वजह से मुश्किल है. प्रादेशिक सेना एक उच्च throughput और अर्द्ध स्वचालित तरीके में कई फल morphological और वर्णमिति लक्षण के उद्देश्य और सटीक मापन प्रदान करता है. प्रादेशिक सेना की उपयोगिता अध्ययन है कि टमाटर फल 2,4,5 QTL आकार की पहचान करने के लिए नेतृत्व में प्रदर्शन किया गया. इसके अलावा, cultivars6 के वर्गीकरण और प्रजातियों में से एक समूह के वर्गीकरण 15,16 प्रादेशिक सेना के उत्पादन का उपयोग करने के लिए मूल्यांकन किया गया है. टमाटर फल लम्बी फल 17 में आकार जीन सूरज परिणामों की उच्च अभिव्यक्ति. टीए पत्ती, और cotyledon आकार का उपयोग एक उच्च स्तर पर 7 रवि व्यक्त लाइनों में निर्धारित किया गया था, प्रदर्शन है कि आवेदन प्रभावी ढंग से इस्तेमाल किया जा सकता है अन्य संयंत्र अंगों की आकारिकी को मापने के रूप में अच्छी तरह से. इसके अलावा, टीए महत्वपूर्ण टमाटर और सूरजमुखी 8,9 में बीज के आकार के आनुवंशिक आधार की पहचान करने में किया गया है . अन्त में, रंग टेस्ट प्रादेशिक सेना में लागू मॉड्यूल के और अधिक सटीक और सही, और टमाटर में फलों का रंग विश्लेषण के लिए अन्य तरीकों की तुलना में कम खर्चीला है. सारांश में, प्रादेशिक सेना आकारिकी और संयंत्र अंगों के रंग भिन्नता के उद्देश्य और विश्वसनीय मूल्यांकन के लिए एक महत्वपूर्ण उपकरण बन गया है.

Acknowledgements

इस शोध राष्ट्रीय विज्ञान फाउंडेशन (0227541 DBI) द्वारा समर्थित किया गया था.

References

  1. Brewer, M. T. Development of a controlled vocabulary and software application to analyze fruit shape variation in tomato and other plant species. Plant Physiol. 141 (1), 15-25 (2006).
  2. Gonzalo, M. J. Tomato Fruit Shape Analysis Using Morphometric and Morphology Attributes Implemented in Tomato Analyzer Software Program. Journal of the American Society for Horticultural Science. 134 (1), 77-87 (2009).
  3. Darrigues, A. Tomato analyzer-color test: A new tool for efficient digital phenotyping. Journal of the American Society for Horticultural Science. 133 (4), 579-586 (2008).
  4. Brewer, M. T., Moyseenko, J. B., Monforte, A. J., van der Knaap, E. Morphological variation in tomato: a comprehensive study of quantitative trait loci controlling fruit shape and development. J Exp Bot. 58 (6), 1339-1349 (2007).
  5. Gonzalo, M. J., Knaap, E. v. a. n. d. e. r. A comparative analysis into the genetic bases of morphology in tomato varieties exhibiting elongated fruit shape. Theor Appl Genet. 116 (5), 647-656 (2008).
  6. Rodríguez, G. R. Diversity of SUN, OVATE and FAS in the tomato germplasm and their effect on fruit morphology (in preparation. , .
  7. Wu, S. . Masters Thesis. , (2009).
  8. Orsi, C. H., Tanksley, S. D. Natural variation in an ABC transporter gene associated with seed size evolution in tomato species. PLoS Genet. 5 (1), e1000347-e1000347 (2009).
  9. Yue, B., Cai, X., Yuan, W., Vick, B., Hu, J. Mapping quantitative trait loci (QTL) controlling seed morphology and disk diameter in sunflower (Helianthus annuus L). Helia. 32, 17-35 (2009).
  10. Zeng, Z. B. Theoretical Basis for Separation of Multiple Linked Gene Effects in Mapping Quantitative Trait Loci. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 90 (23), 10972-10976 (1993).
  11. Zeng, Z. B. Precision Mapping of Quantitative Trait Loci. Genetics. 136 (4), 1457-1468 (1994).
  12. Jiang, C. J., Zeng, Z. B. Multiple-Trait Analysis of Genetic-Mapping for Quantitative Trait Loci. Genetics. 140 (3), 1111-1127 (1995).
  13. . . IPGRI Descriptors for Tomato (Lycopersicon spp.). , 47-47 (1996).
  14. . . UPOV Guidelines for the Conduct of Tests for Distinctness, Uniformity, and Stability. TOMATO (Lycopersicon Lycopersicum (L.) Karsten Ex Farw.). , 51-51 (2001).
  15. Depypere, L., Chaerle, P., Mijnsbrugge, K. V., Goetghebeur, P. Stony endocarp dimension and shape variation in Prunus section Prunus. Annals of Botany. 100 (7), 1585-1597 (2007).
  16. Depypere, L., Chaerle, P., Breyne, P., Mijnsbrugge, K. V., Goetghebeur, P., P, . A combined morphometric and AFLP based diversity study challenges the taxonomy of the European members of the complex Prunus L. section Prunus. . Plant systematics and evolution. 279 (1-4), 219-231 (2009).
  17. Xiao, H., Jiang, N., Schaffner, E., Stockinger, E. J., van der Knaap, E. A retrotransposon-mediated gene duplication underlies morphological variation of tomato fruit. Science. 319 (5869), 1527-1530 (2008).

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Rodríguez, G. R., Moyseenko, J. B., Robbins, M. D., Huarachi Morejón, N., Francis, D. M., van der Knaap, E. Tomato Analyzer: A Useful Software Application to Collect Accurate and Detailed Morphological and Colorimetric Data from Two-dimensional Objects. J. Vis. Exp. (37), e1856, doi:10.3791/1856 (2010).

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